stringtranslate.com

Игникоккус

Ignicoccus — род гипертермофильных архей, обитающих в морских гидротермальных источниках . Они были обнаружены в образцах, взятых на хребте Кольбейнсей к северу от Исландии , а также на Восточно-Тихоокеанском поднятии ( 9 градусов с.ш. , 104 градуса з.д. ) в 2000 году. [1]

Систематика

Согласно сравнению генов 16S рРНК , Ignicoccus представляет собой новую, глубоко разветвленную линию в семействе Desulfurococcaceae . [2] Известно три вида: I. islandicus , [1] I. pacificus [1] и I. hospitalis штамм KIN4I. [3]

Структура клетки

Археи рода Ignicoccus имеют крошечные кокковидные клетки диаметром около 2 мкм , которые имеют гладкую поверхность, внешнюю мембрану и не имеют S-слоя . [4]

Они имеют ранее неизвестную структуру клеточной оболочки — цитоплазматическую мембрану, периплазматическое пространство (шириной от 20 до 400 нм, содержащее связанные с мембраной везикулы) и внешнюю мембрану (шириной приблизительно 10 нм, напоминающую внешнюю мембрану грамотрицательных бактерий). Последняя содержит многочисленные плотно, нерегулярно упакованные одиночные частицы (диаметром около 8 нм) и поры диаметром 24 нм, окруженные мельчайшими частицами, расположенными в кольце (диаметром 130 нм) и кластерами до восьми частиц диаметром 12 нм каждая. [4]

Два слоя мембраны, о которых сообщалось ранее, на самом деле являются типом эндомембранной системы, состоящей из цитоплазматических выступов. В I. hospitalis эти структуры содержат эндосимбиотическую архею Nanoarchaeum equitans . [3]

Физиология

Ignicococci живут в диапазоне температур 70–98 °C (оптимум около 90 °C). Они получают энергию путем восстановления элементарной серы до сероводорода, используя молекулярный водород в качестве донора электронов . [2] Также сообщалось об уникальном симбиозе (или паразитизме) с Nanoarchaeum equitans . [2]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [5] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [6].

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc Huber H, Burggraf S, Mayer T, Rachel R, Stetter KO (ноябрь 2000 г.). "Ignicoccus gen. nov., новый род гипертермофильных, хемолитоавтотрофных архей, представленный двумя новыми видами, Ignicoccus islandicus sp nov и Ignicoccus pacificus sp nov. и Ignicoccus pacificus sp. nov". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (6): 2093–2100. doi : 10.1099/00207713-50-6-2093 . PMID  11155984.
  2. ^ abc Huber H, Hohn MJ, Rachel R, Fuchs T, Wimmer VC, Stetter KO (2 мая 2002 г.). "Новый тип архей, представленный наноразмерным гипертермофильным симбионтом" . Nature . 417 (6884): 63–67. Bibcode : 2002Natur.417...63H. doi : 10.1038/417063a. PMID  11986665. S2CID  4395094.
  3. ^ ab Heimerl T, Flechsler J, Pickl C, Heinz V, Salecker B, Zweck J, Wanner G, Geimer S, Samson RY, Bell SD, Huber H, Wirth R, Wurch L, Podar M, Rachel R (13 июня 2017 г.) ). «Сложная эндомембранная система в Archaeon Ignicoccus Hospitalis, использованная Nanoarchaeum equitans». Границы микробиологии . 8 : 1072. дои : 10.3389/fmicb.2017.01072 . ПМК 5468417 . ПМИД  28659892. 
  4. ^ ab Rachel R, Wyschkony I, Riehl S, Huber H (март 2002 г.). «Ультраструктура Ignicoccus: доказательства новой внешней мембраны и почкования внутриклеточных везикул у архея». Archaea . 1 (1): 9–18. doi : 10.1155/2002/307480 . PMC 685547 . PMID  15803654. 
  5. ^ JP Euzéby. "Ignicoccus". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 10 июня 2023 г.
  6. ^ Sayers; et al. "Ignicoccus". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 10 июня 2023 г.
  7. ^ "The LTP" . Получено 10 мая 2023 г. .
  8. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 10 мая 2023 г. .
  9. ^ "LTP_06_2022 Release Notes" (PDF) . Получено 10 мая 2023 г.
  10. ^ "GTDB release 08-RS214". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  11. ^ "ar53_r214.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  12. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки