stringtranslate.com

Рафаэль Ирисарри (ученый)

Рафаэль Ирисарри — профессор биостатистики в Гарвардской школе общественного здравоохранения имени Т. Х. Чана и профессор биостатистики и вычислительной биологии в Институте онкологии Дана-Фарбера . [1] [3] [4] [5] Ирисарри известен как один из основателей проекта Bioconductor .

Образование

Ирисарри получил степень бакалавра наук по математике в Университете Пуэрто-Рико в Рио-Пьедрас в 1993 году, а затем степень магистра искусств в Калифорнийском университете в Беркли в 1994 году. Он продолжил обучение в Беркли, получив степень доктора философии по статистике в 1998 году. Его докторская диссертация была посвящена использованию статистики для моделирования гармоний в звуковых сигналах и была написана под руководством Дэвида Р. Бриллингера . [2] [6] [7]

Исследования и карьера

Иризарри присоединился к Школе общественного здравоохранения имени Блумберга при Университете Джонса Хопкинса в 1998 году, где его исследования были сосредоточены на геномике и вычислительной биологии . [6] Он работал над анализом и обработкой данных, полученных в ходе экспериментов с микрочипами , и помог разработать метод Robust Multiarray Analysis (RMA) для анализа микрочипов в сотрудничестве со статистиком Терри Спидом и коллегами; [8] этот метод позже был расширен до метода замороженного RMA (fRMA). [9] [10] Он также работал над анализом данных секвенирования следующего поколения .

Иризарри является одним из основателей проекта Bioconductor , проекта разработки программного обеспечения с открытым исходным кодом для анализа геномных данных на языке программирования R. [ 11] [12] [13] Он принимал участие в разработке нескольких наиболее используемых пакетов Bioconductor, включая пакет «affy» для анализа данных микрочипов Affymetrix . [10] [14] [15]

Ирисарри — разработчик и преподаватель онлайн-курса «Анализ данных для наук о жизни» на платформе edX Гарвардского университета ; на этот курс записываются более 30 000 студентов в год. [10] [16]

Награды и почести

Премия президента COPSS 2009 года в области статистики. [17]

Премия Мортимера Шпигельмана 2009 года от Американской ассоциации общественного здравоохранения [18] [19], присуждаемая выдающимся статистикам в области общественного здравоохранения в возрасте до 40 лет.

Премия Бенджамина Франклина 2017 года в области биоинформатики за продвижение бесплатных и общедоступных материалов и методов в области наук о жизни. [20] [21]

В 2020 году он был избран членом Международного общества вычислительной биологии. [22]

Ссылки

  1. ^ ab Публикации Рафаэля Ирисарри, проиндексированные Google Scholar
  2. ^ ab Рафаэль Ирисарри в проекте «Генеалогия математики»
  3. ^ "Rafael Irizarry". Harvard University Department of Physics . Получено 12 августа 2017 г.
  4. ^ "Rafael Irizarry, PhD - DF/HCC". Dana–Farber/Harvard Cancer Center . Получено 12 августа 2017 г.
  5. ^ Циммер, Карл (1 июля 2016 г.). «Проблемы роста в области эпигенетики, некоторые из которых требуют пересмотра». The New York Times . Получено 30 августа 2017 г.
  6. ^ аб Иризарри, Рафаэль. "О". Лаборатория Рафаэля Иризарри .
  7. ^ Irizarry, Rafael (1998). Статистика и музыка: Подгонка локальной гармонической модели к музыкальным звуковым сигналам (PDF) (диссертация). OCLC  892825726. S2CID  58781935. ProQuest  304424980. Архивировано из оригинала (PDF) 2017-08-12 . Получено 12 августа 2017 .}
  8. ^ Певзнер, Джонатан (2015). Биоинформатика и функциональная геномика (3-е изд.). John Wiley & Sons. стр. 488. ISBN 978-1-118-58178-0. Получено 30 августа 2017 г.
  9. ^ Макколл, МН; Болстад, БМ; Иризарри, РА (22 января 2010 г.). «Замороженный надежный многоматричный анализ (fRMA)». Биостатистика . 11 (2): 242–253. doi :10.1093/biostatistics/kxp059. PMC 2830579. PMID 20097884  . 
  10. ^ abc "Объявление лауреата премии Бенджамина Франклина 2017 года". Bioinformatics.org . Получено 12 августа 2017 г. .
  11. ^ "Rafael Irizarry". edX . 20 декабря 2013 . Получено 12 августа 2017 .
  12. ^ Джентльмен, Роберт С .; Кэри, Винсент Дж.; Бейтс, Дуглас М.; Болстад, Бен; Деттлинг , Марсель ; Дюдуа, Сандрин ; Эллис, Байрон; Готье, Лоран; Ге, Юнчао; Джентри, Джефф; Хорник, Курт; Хоторн, Торстен; Хубер, Вольфганг; Иакус, Стефано; Иризарри, Рафаэль; Лейш, Фридрих; Ли, Ченг; Мейхлер, Мартин; Россини, Энтони Дж.; Савицки, Гюнтер; Смит, Колин; Смит, Гордон; Тирни, Люк; Ян, Жан YH; Чжан, Цзяньхуа (2004). «Биопроводник: разработка открытого программного обеспечения для вычислительной биологии и биоинформатики». Геномная биология . 5 (10): R80. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r80 . PMC 545600. PMID  15461798 . 
  13. ^ Мулекар, Мадхури (октябрь 2009 г.). «Статистики удостоены чести за вклад | Новости Amstat». magazine.amstat.org . Получено 30 августа 2017 г. .
  14. ^ Irizarry, Rafael; Gautier, Laurent (2017). "Methods for Affymetrix Oligonucleotide Arrays". Bioconductor . doi :10.18129/B9.bioc.affy . Получено 12 августа 2017 г. .
  15. ^ Готье, Л.; Коуп, Л.; Болстад, Б. М.; Иризарри, Р. А. (10 февраля 2004 г.). «affy — анализ данных Affymetrix GeneChip на уровне зонда». Биоинформатика . 20 (3): 307–315. doi : 10.1093/bioinformatics/btg405 . PMID  14960456.
  16. ^ "Анализ данных для наук о жизни 1: Статистика и R". Harvard Online Learning . 2016-04-10 . Получено 12 августа 2017 г.
  17. ^ "Presidents' Award". Комитет президентов статистических обществ . Архивировано из оригинала 2015-12-06 . Получено 12 августа 2017 .
  18. ^ «Проверка комплексной биологии: как массивы могут дополнить ваши данные следующего поколения». Научные вебинары . 5 декабря 2012 г. Получено 12 августа 2017 г.
  19. ^ "Премия Мортимера Шпигельмана - РАЗДЕЛ СТАТИСТИК APHA". sites.google.com . Получено 30 августа 2017 г. .
  20. ^ "Премия Бенджамина Франклина". Bioinformatics.org . Получено 12 августа 2017 г. .
  21. ^ "Rafael Irizarry Wins 2017 Ben Franklin Award". Harvard TH Chan School of Public Health Department of Biostatistics . 11 апреля 2017 г. Архивировано из оригинала 2017-08-12 . Получено 12 августа 2017 г.
  22. ^ «19 февраля 2020 г.: ISCB поздравляет и представляет стипендиатов 2020 года!». www.iscb.org . Получено 23 июня 2020 г. .