MAP1LC3A

Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens

Связанные с микротрубочками белки 1A/1B легкой цепи 3A представляют собой белок , который у человека кодируется геном MAP1LC3A . ^{[5] [6] [7]} Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.

Функция

MAP1A и MAP1B представляют собой белки, ассоциированные с микротрубочками , которые опосредуют физические взаимодействия между микротрубочками и компонентами цитоскелета . Каждая из MAP1A и MAP1B состоит из субъединицы тяжелой цепи и множества субъединиц легкой цепи. Белок, кодируемый этим геном, является одной из субъединиц легкой цепи и может ассоциироваться либо с MAP1A, либо с MAP1B. ^[7]

MAPLC3A — один из гомологов дрожжевого ATG8 млекопитающих , важного маркера и эффектора аутофагии . ^[8]

Регулирование

MAP1LC3A регулируется несколькими посттрансляционными модификациями . К ним относятся ковалентная связь С-конца с фосфатидилэтаноламином в аутофагических мембранах и фосфорилирование протеинкиназой А , ^[9] которое подавляет его функции аутофагии. Нековалентные взаимодействия важны для функций нацеливания груза при селективной аутофагии. Например, было показано, что он взаимодействует с секвестосомой 1 . ^[10]

Рекомендации

1. GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000101460 - Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027602 - Ensembl , май 2017 г.
3. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Манн СС, Хаммарбек Дж. А. (май 1997 г.). «Локализация гена и экспрессия легкой цепи 3 в процессе развития: общая субъединица ассоциированного с микротрубочками белка 1A (MAP1A) и MAP1B». J Neurosci Res . 43 (5): 535–44. doi :10.1002/(SICI)1097-4547(19960301)43:5<535::AID-JNR3>3.0.CO;2-J. PMID  8833088. S2CID  23515321.
6. Панкив С., Клаузен Т.Х., Ламарк Т., Брех А., Брюун Дж.А., Оутцен Х., Оверватн А., Бьоркой Г., Йохансен Т. (август 2007 г.). «p62/SQSTM1 напрямую связывается с Atg8/LC3, способствуя деградации агрегатов убиквитинированных белков путем аутофагии». J Биол Хим . 282 (33): 24131–45. дои : 10.1074/jbc.M702824200 . ПМИД  17580304.
7. «Ген Entrez: MAP1LC3A, ассоциированный с микротрубочками белок 1, легкая цепь 3 альфа» .
8. Валенте Г., Морани Ф., Никотра Г., Фуско Н., Пераккио С., Титоне Р., Алабисо О., Арисио Р., Кацарос Д., Бенедетто С., Исидоро С. (2014). «Экспрессия и клиническое значение белков аутофагии BECLIN 1 и LC3 при раке яичников». Биомед Рес Инт . 2014 : 462658. doi : 10.1155/2014/462658 . ПМК 4127242 . ПМИД  25136588. 
9. Черра С.Дж., Кулич С.М., Уечи Г., Баласубрамани М., Маунтцурис Дж., Дэй Б.В., Чу CT (август 2010 г.). «Регуляция белка аутофагии LC3 путем фосфорилирования». Дж. Клеточная Биол . 190 (4): 533–9. дои : 10.1083/jcb.201002108. ПМК 2928022 . ПМИД  20713600. 
10. Швец Э, Фасс Э, Шерц-Шуваль Р, Элазар З (август 2008 г.). «N-конец и остаток Phe52 LC3 рекрутируют p62/SQSTM1 в аутофагосомы». Дж. Клеточная наука . 121 (Часть 16): 2685–95. дои : 10.1242/jcs.026005 . ПМИД  18653543.

дальнейшее чтение

• Снасель Й, Пихова I (1997). «Расщепление белков клетки-хозяина протеазой ВИЧ-1». Фолиа Биол. (Прага) . 42 (5): 227–30. дои : 10.1007/BF02818986. PMID  8997639. S2CID  7617882.
• Валлин М., Дейнум Дж., Губар Л., Дэниэлсон У.Х. (1990). «Протеолитическое расщепление белков, связанных с микротрубочками, ретровирусными протеиназами». Дж. Генерал Вирол . 71 (9): 1985–91. дои : 10.1099/0022-1317-71-9-1985 . ПМИД  2212989.
• Шенфельд Т.А., МакКеррачер Л., Обар Р., Валле Р.Б. (1989). «MAP 1A и MAP 1B представляют собой структурно родственные белки, ассоциированные с микротрубочками, с различными паттернами развития в ЦНС». Дж. Нейроски . 9 (5): 1712–30. doi : 10.1523/JNEUROSCI.09-05-01712.1989 . ПМК  6569839 . ПМИД  2470876.
• Манн СС, Хаммарбек Дж.А. (1994). «Молекулярная характеристика легкой цепи 3. Субъединица, связывающая микротрубочки MAP1A и MAP1B». Ж. Биол. Хим . 269 ​​(15): 11492–7. дои : 10.1016/S0021-9258(19)78150-2 . ПМИД  7908909.
• Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000. ПМК  310948 . ПМИД  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых кДНК человека, кодирующих полные белки». Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R. ПМК  311072 . ПМИД  11230166.
• Бонне С., Буше Д., Лазерег С. и др. (2001). «Дифференциальная регуляция связывания белков MAP1A, MAP1B и MAP2, связанных с микротрубочками, путем полиглутамилирования тубулина». Ж. Биол. Хим . 276 (16): 12839–48. дои : 10.1074/jbc.M011380200 . ПМИД  11278895.
• Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20 хромосомы человека». Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D. дои : 10.1038/414865a . ПМИД  11780052.
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M. дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК  139241 . ПМИД  12477932.
• Хэ Х., Данг Ю., Дай Ф. и др. (2003). «Посттрансляционные модификации трех членов семейства MAP1LC3 человека и обнаружение нового типа модификации MAP1LC3B». Ж. Биол. Хим . 278 (31): 29278–87. дои : 10.1074/jbc.M303800200 . ПМИД  12740394.
• Танида И., Соу Ю.С., Эзаки Дж. и др. (2004). «HsAtg4B/HsApg4B/аутофагин-1 расщепляет карбоксильные концы трех гомологов человеческого Atg8 и делипидирует 3-ассоциированные с микротрубочками белки легкой цепи и конъюгаты белка с фосфолипидами, ассоциированные с рецептором GABAA». Ж. Биол. Хим . 279 (35): 36268–76. дои : 10.1074/jbc.M401461200 . ПМИД  15187094.
• Коуно Т., Мизугути М., Танида И. и др. (2005). «Резонансные назначения 1H, 13C и 15N легкой цепи-3 белка, ассоциированного с микротрубочками человека». Дж. Биомол. ЯМР . 29 (3): 415–6. doi :10.1023/B:JNMR.0000032505.99071.ea. PMID  15213446. S2CID  23561733.
• Гёлер Х., Лаловски М., Стельцль У. и др. (2004). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона». Мол. Клетка . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . ПМИД  15383276.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504. ПМК  528928 . ПМИД  15489334.
• Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704. ПМК  528930 . ПМИД  15489336.
• Коуно Т., Мизугути М., Танида И. и др. (2005). «Структура раствора легкой цепи 3 белка, ассоциированного с микротрубочками, и идентификация ее функциональных субдоменов». Ж. Биол. Хим . 280 (26): 24610–7. дои : 10.1074/jbc.M413565200 . ПМИД  15857831.
• Соу Ю.С., Танида И., Комацу М. и др. (2006). «Фосфатидилсерин в дополнение к фосфатидилэтаноламину является мишенью in vitro модификаторов Atg8 млекопитающих, LC3, GABARAP и GATE-16». Ж. Биол. Хим . 281 (6): 3017–24. дои : 10.1074/jbc.M505888200 . ПМИД  16303767.
• Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139. ПМЦ  1347501 . ПМИД  16381901.