stringtranslate.com

Магнус Манске

Генрих Магнус Манске (родился 24 мая 1974 года) — немецкий биохимик , ведущий исследователь малярии . Он является старшим научным сотрудником Института Уэллкома Сенгера в Кембридже , Великобритания [1] [3] [4] [5] [6] и разработчиком одной из первых версий программного обеспечения MediaWiki , на котором работает Wikipedia и ряд других сайтов на основе вики .

Ранний период жизни

Манске родился в Кельне , Германия. Он изучал биохимию в Кельнском университете и окончил его в 2006 году, получив степень доктора философии; его диссертация была посвящена инструменту с открытым исходным кодом для молекулярной биологии под названием GENtle . [2] [7]

Карьера

Будучи студентом, Манске был одним из первых авторов интернет-энциклопедии Nupedia , предшественницы Википедии, а позже написал одну из первых версий программного обеспечения MediaWiki, на котором работает Википедия. [8] Манске работает в Кембридже в Институте Уэллкома Сэнгера с апреля 2007 года, [9] [10] [11] [12] [13] но продолжает активно участвовать в разработке инструментов для Википедии [14] и ее родственных проектов Wikidata и Wikimedia Commons . [15]

В 2012 году Манске был соавтором статьи, опубликованной в Nature , в которой были продемонстрированы новые способы определения областей, где развиваются малярийные паразиты, и описаны методы картирования устойчивости к малярийным препаратам. Исследователи разработали метод извлечения ДНК малярийного паразита непосредственно из крови, что сводит к минимуму ошибки при секвенировании. [9] [16]

Разработка MediaWiki

Будучи студентом, Манске был одним из самых активных участников проекта Nupedia , [17] предоставляя контент по биологическим темам [8] и разрабатывая инструменты и расширения для Nupedia. [18] Позже, недовольный ограничениями существующего программного обеспечения, [17] Манске разработал одну из первых версий того, что позже стало MediaWiki . [18] [19] Его новая версия программного обеспечения была установлена ​​в 2002 году. [17]

Программное обеспечение wiki, которое изначально использовалось для Wikipedia, называлось UseModWiki и было написано на Perl . Поскольку проблемы масштабирования начали проявляться по мере роста Wikipedia, летом 2001 года Манске начал работу над заменой UseModWiki, которая будет поддерживаться базой данных и содержать «специфичные для wikipedia функции». [20] 25 января 2002 года Манске выпустил первую версию PHP- движка wiki на основе MySQL , названную Phase II . [21] Одним из нововведений, реализованных Манске в Phase II, было использование пространств имен для разделения различных типов страниц, таких как пространство имен «Talk» или «User», что отличало его от старого программного обеспечения wiki, которое не имело различных пространств имен. [20] Phase II также представил ряд других функций, которые присутствуют до сих пор, включая загрузку файлов, списки наблюдения, автоматические подписи и список вкладов пользователей. [22] [23] Переписывание Манске также упростило интеграцию фотографий в статьи Википедии и создало новую группу пользователей: администраторов, уполномоченных удалять страницы и блокировать вандалов. [17] [24]

Манске был приверженцем открытого исходного кода и, в частности, лицензии GPL , и его работа над ранними версиями MediaWiki была выпущена под лицензией GPL. [25]

Программное обеспечение Фазы II Манске столкнулось с проблемами загрузки, поскольку Википедия продолжала расти, поэтому Ли Дэниел Крокер снова переписал его, что привело к фазе III, которая использовалась с июня 2002 года, а с 2003 года называлась «MediaWiki». [21] Полученное в результате программное обеспечение MediaWiki теперь используется в качестве основной платформы как для Википедии, так и для многих родственных проектов Викимедиа , а также во многих организациях и учреждениях.

Манске продолжил разрабатывать расширения для MediaWiki и инструменты, используемые для создания Wikipedia и родственных ей проектов, включая инструменты для сопоставления членства в категориях, вычисления пересечений категорий и импорта изображений из Flickr в Commons . [26] [27] [28] Манске также разработал расширение Cite, которое привнесло XML-подобный синтаксис в управление цитированием. [29]

Инструменты

Помимо работы над самой MediaWiki, Манске создал инструменты, которые работают с ней, такие как «wiki shoot me», который определяет на карте фотографии, которые необходимо сделать, и позволяет загружать их, или Reasonator, который берет необработанную информацию из Wikidata и представляет ее так, как если бы это была статья в Wikipedia. [30]

Признание

Манске признан создателем первой статьи в немецкой Википедии, посвященной полимеразной цепной реакции , впервые написанной им в 2001 году. [31] [32] [33]

Джимми Уэйлс в 2002 году назвал 25 января Днем Магнуса Манске в честь его вклада в Википедию, заявив, что «Сегодня за ужином каждый википедист должен произнести тост за Магнуса и его многочисленные изобретения». [34]

Ларри Сэнгер в своих мемуарах о ранней истории Википедии подчеркнул вклад Манске в проект и приписал конечный успех Википедии основной группе актеров, в которой Манске сыграл определенную роль: [35]

Wikipedia начиналась с горстки людей, многие из которых были из Nupedia. Влияние нупедианцев было решающим на раннем этапе. Я думаю, особенно о неутомимом Магнусе Манске (который работал над программным обеспечением для обоих проектов), нашем постоянном стороннике Рут Ифчер и очень умном программисте, играющем в покер Ли Дэниеле Крокере — и это лишь некоторые из них... Тем не менее, поскольку проект начинался с этих хороших людей, и мы смогли перенять, объяснить и продвигать хорошие привычки и политику среди новых людей, нупедианские корни проекта помогли создать прочное, функциональное и успешное сообщество.

Манске, наряду с другими, был признан основным участником MediaWiki Ассоциацией передовых вычислительных технологий USENIX в 2010 году, когда MediaWiki и Фонд Викимедиа были удостоены награды STUG (Software Tools User Group). [36]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Публикации Магнуса Манске, проиндексированные Google Scholar
  2. ^ ab Magnus Manske (2006). GENtle, бесплатный многоцелевой инструмент молекулярной биологии (диссертация на соискание ученой степени доктора философии). Кельнский университет. Архивировано из оригинала 7 апреля 2015 г. Получено 27 марта 2016 г.
  3. ^ Магнус Манске на библиографическом сервере DBLP
  4. ^ Публикации Магнуса Манске, проиндексированные Microsoft Academic
  5. ^ Публикации Магнуса Манске, проиндексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
  6. ^ Дауб, Дж.; Гарднер, ПП; Тейт, Дж.; Рамшельд, Д.; Манске, М.; Скотт, WG; Вайнберг, З.; Гриффитс-Джонс, С.; Бейтман, А. (2008). «Википроект РНК: аннотация сообщества семейств РНК». РНК . 14 (12): 2462–2464. doi :10.1261/rna.1200508. PMC 2590952 . PMID  18945806. 
  7. ^ Alastair Kerr (21 июня 2011 г.). "Desktop Sequence Analysis: software review". Блог Bioinformatics Knowledge . Архивировано из оригинала 30 сентября 2018 г. Получено 4 июня 2013 г.
  8. ^ аб Клаудия Ленен (2 февраля 2008 г.). «Der Wikipedia-Pionier aus Köln» [Пионер Википедии из Кёльна]. Кёльнер Штадт-Анцайгер (на немецком языке). Архивировано из оригинала 12 июля 2015 года . Проверено 22 июня 2013 г.
  9. ^ Аб Манске, М.; Миотто, О.; Кампино, С.; Оберн, С.; Альмагро-Гарсия, Дж.; Маслен, Г.; о'Брайен, Дж.; Джимде, А.; Думбо, О.; Зонго, И.; Уэдраого, Ж.Б.; Мишон, П.; Мюллер, И.; Сиба, П.; Нзила, А.; Боррманн, С.; Киара, С.М.; Марш, К.; Цзян, Х.; Су, ХЗ; Амаратунга, К.; Фэрхерст, Р.; Сочит, Д.; Ностен, Ф.; Имвонг, М.; Уайт, Нью-Джерси; Сандерс, М.; Анастази, Э.; Алкок, Д.; и др. (2012). «Анализ разнообразия Plasmodium falciparum при естественных инфекциях путем глубокого секвенирования». Природа . 487 (7407): 375–9. Bibcode :2012Natur.487..375M. doi :10.1038/nature11174. PMC 3738909. PMID  22722859 . 
  10. ^ Manske, HM; Kwiatkowski, DP (2009). «Look Seq: браузерный просмотрщик для данных глубокого секвенирования». Genome Research . 19 (11): 2125–32. doi :10.1101/gr.093443.109. PMC 2775587. PMID 19679872  . 
  11. ^ Manske, HM; Kwiatkowski, DP (2009). "SNP-o-matic". Биоинформатика . 25 (18): 2434–5. doi :10.1093/bioinformatics/btp403. PMC 2735664. PMID  19574284 . 
  12. ^ Робинсон, Т.; Кампино, С.Г.; Оберн, С.; Ассефа, С.А.; Полли, С.Д.; Манске, М.; Макиннис, Б.; Рокетт, КА; Маслен, Г.Л.; Сандерс, М.; Куэйл, МА; Чиодини, ПЛ.; Квятковски, Д.П.; Кларк, Т.Г.; Сазерленд, К.Дж. (2011). «Лекарственно-устойчивые генотипы и мультиклональность у Plasmodium falciparum, проанализированные с помощью прямого секвенирования генома из периферической крови пациентов с малярией». PLOS ONE . 6 (8): e23204. Bibcode : 2011PLoSO...623204R. doi : 10.1371/journal.pone.0023204 . PMC 3154926 . PMID  21853089. 
  13. ^ Логан, Д.У.; Сэндал, М.; Гарднер, П.П.; Манске, М.; Бейтман, А. (2010). «Десять простых правил редактирования Википедии». PLOS Computational Biology . 6 (9): e1000941. Bibcode : 2010PLSCB...6E0941L. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000941 . PMC 2947980. PMID  20941386 .  Значок открытого доступа
  14. ^ "Magnus Manske". Архивировано из оригинала 13 июня 2013 года . Получено 4 июня 2013 года .
  15. ^ "Wikimedia-related tools by Magnus Manske". Архивировано из оригинала 14 декабря 2018 года . Получено 4 мая 2017 года .
  16. ^ «Исследование ДНК; Размещение паразитов на карте мира». China Weekly News . 26 июня 2012 г.
  17. ^ abcd Курт Янссон (14 января 2011 г.). «Зен Яре Википедия – Der kurze Sommer der Anarchie» . Дер Шпигель . Архивировано из оригинала 22 февраля 2014 года . Проверено 25 июня 2013 г.
  18. ^ ab Дженнифер Джолин Андерсон (2011). Википедия: Компания и ее основатели. ABDO. стр. 44. ISBN 978-1-61714-812-5.
  19. ↑ Торстен Кляйнц (16 декабря 2012 г.). «Neues Werkzeug soll Anfänger zur Wikipedia locken». Ди Цайт . Архивировано из оригинала 10 августа 2019 года . Проверено 25 июня 2013 г.
  20. ^ аб Сумана Харихарешвара; Гийом Помье (2012). «МедиаВики». В Эми Браун; Грег Уилсон (ред.). Архитектура приложений с открытым исходным кодом . Кристиан Хермансен. ISBN 978-1-105-57181-7. Архивировано из оригинала 24 сентября 2013 . Получено 27 марта 2016 .
  21. ^ ab Rajeev Kumar. "Wiki Installation and Customization". Архивировано из оригинала 21 июля 2015 г. Получено 4 июня 2013 г.
  22. ^ "Wikipedia:PHP script new features". Wikipedia . 27 января 2002 г. Архивировано из оригинала 7 июня 2020 г. Получено 27 ноября 2016 г.
  23. ↑ Магнус Манске (27 января 2002 г.). «[Wikipedia-l] Список новых функций». Архивировано из оригинала 12 ноября 2015 г. Получено 4 июня 2013 г.
  24. ↑ Эрик Мёллер (9 мая 2003 г.). "Das Wiki-Prinzip". Heise Online . Архивировано из оригинала 2 сентября 2016 г. Получено 25 июня 2013 г.
  25. ^ Н. А. Полукарова (июнь 2007 г.). «Концепция открытого редактирования с точки зрения авторского права». Автоматическая документация и математическая лингвистика . 41 (3): 104–107. doi :10.3103/S0005105507030053. ISSN  1934-8371. S2CID  6463839. Проще говоря, в то время как разработчики проприетарных программ используют свои авторские права, чтобы лишить большинство пользователей большинства их свобод, приверженцы GPL, включая вышеупомянутого Магнуса Манске, используют эти привилегии, чтобы гарантировать эти свободы пользователям.
  26. ^ "Magnus' toys'n'tools". Архивировано из оригинала 10 мая 2014 года . Получено 4 июня 2013 года .
  27. ^ "Инструменты Магнуса на wmflabs". Архивировано из оригинала 14 мая 2020 г. Получено 4 июня 2013 г.
  28. ^ "Tools Directory". Wikimedia Foundation. Архивировано из оригинала 1 февраля 2019 года . Получено 31 января 2019 года .
  29. ^ Матиас Шиндлер; Денни Врандечич (март 2009 г.). "Введение в новые функции Википедии" (PDF) . В Хендлер, Джим; Маргеттс, Хелен (ред.). Труды первой международной конференции по веб-наукам WebSci09 . Афины, Греция. Архивировано (PDF) из оригинала 3 марта 2016 г. . Получено 4 июня 2013 г. .
  30. ^ Врандечич, Денни; Пинчер, Лидия; Креч, Маркус (30 апреля 2023 г.). «Викиданные: создание». Сопутствующие материалы веб-конференции ACM 2023 . Нью-Йорк, штат Нью-Йорк, США: ACM. стр. 615–624. дои : 10.1145/3543873.3585579 . ISBN 978-1-4503-9419-2.
  31. ^ "Немецкая Википедия достигла знаменательной миллионной записи". Deutsche Welle . 28 декабря 2009 г. Архивировано из оригинала 6 июня 2015 г. Получено 25 июня 2013 г.
  32. ^ dpa/mos (28 декабря 2009 г.). «Немецкая Википедия erreicht eine Million Einträge». Ди Цайт . Архивировано из оригинала 25 августа 2016 года . Проверено 8 марта 2017 г.
  33. ↑ Ахим Савалл (28 декабря 2009 г.). «Deutschsprachige Wikipedia erreicht die Millionenmarke». golem.de. Архивировано из оригинала 21 мая 2021 года . Проверено 25 июня 2013 г.
  34. ^ "[Wikipedia-l] Celebration". 25 января 2002 г. Архивировано из оригинала 31 октября 2020 г. Получено 4 июня 2013 г.
  35. ^ Ларри Сэнгер (2008). «Ранняя история Нупедии и Википедии: Мемуары». В Крис ДиБона; Дэнис Купер; Марк Стоун (ред.). Открытые источники 2.0: Продолжающаяся эволюция . O'Reilly Media. стр. 317. ISBN 978-0-596-55389-0.
  36. ^ "STUG award". 6 декабря 2011 г. Архивировано из оригинала 11 января 2012 г. Получено 4 июня 2013 г.

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы по теме Магнус Манске .
На сайте Scholia имеется профиль автора Магнуса Манске .