Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Пропротеиновая конвертаза субтилизин/кексин типа 6 — это протеаза , которая у людей кодируется геном PCSK6 , расположенным в хромосоме 15. [5] [6] Pcsk6 — это кальций-зависимая сериновая эндопротеаза, которая катализирует посттрансляционную модификацию белков-предшественников из их «латентной» формы в расщепленную «активную» форму. [5] Сообщалось, что активная Pcsk6 обрабатывает такие субстраты, как трансформирующий фактор роста β, [7] проальбумин, [8] фактор фон Виллебранда [9] и корин. [10] С клинической точки зрения предполагается, что Pcsk6 играет роль в лево-правой асимметрии, [11] структурной асимметрии мозга, [12] леворукости, [13] [14] [15] прогрессировании опухолей, [16] гемостазе, [9] [8] [7] и сердечно-сосудистых заболеваниях. [10] [17]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству субтилизин -подобных пропротеиновых конвертаз . Членами этого семейства являются пропротеиновые конвертазы, которые перерабатывают латентные предшественники белков в их биологически активные продукты. Этот кодируемый белок является кальций -зависимой сериновой эндопротеазой , которая может расщеплять предшественники белков в их парных участках обработки основных аминокислот. Некоторые из его субстратов - белки, родственные трансформирующему фактору роста бета , [7] проальбумин, [8] фактор фон Виллебранда , [9] и корин. [10] Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [6]
Клиническое значение
Во время развития : на протяжении всего развития пространственная и временная экспрессия pcsk6 регулирует эмбриогенез путем активации факторов дифференциации, связанных с TGFβ, которые включают BMP и Nodal. [7] [18] Повышенные уровни Pcsk6 были обнаружены в материнских децидуальных клетках места имплантации и внеэмбриональной эктодерме . [19] Регулирование правильного градиента Nodal и BMP имеет решающее значение для гаструляции, [20] проксимально-дистальной оси, [21] и установления паттерна лево-правой оси. [22]
Исследования по нокауту гена Pcsk6 в процессе развития показали, что у эмбрионов мышей, у которых отсутствует ген Pcsk6, развивается гетеротаксия, леволегочный изомеризм и/или краниофациальные пороки развития из-за нарушения спецификации передне-задней и лево-правой оси, что является результатом нарушения регуляции сигналов Nodal и BMP. [11]
У людей полиморфизм Pcsk6 VNTR связан со структурной асимметрией лобной и височной долей [12] и степенью доминирования одной из рук. [13] [14]
Сердечно-сосудистые заболевания: Pcsk6 вызывает все больший интерес как индикатор и фактор сердечно-сосудистых заболеваний. Было показано, что у мышей с нокаутом Pcsk6 развивается гипертония, чувствительная к соли, из-за нарушения активации прокорина, необходимого для регуляции артериального давления предсердным натрийуретическим пептидом. [10] У пациента с гипертонией была обнаружена мутация G/A в гене PCSK6, которая привела к замене Asp282Asn (D282N) в каталитическом домене Pcsk6, что, в свою очередь, препятствует процессингу корина. [10] Было обнаружено, что при ремоделировании сосудов Pcsk6 вызывает миграцию гладкомышечных клеток в ответ на PDGFB путем активации MMP14. [17] Когда Pcsk6 был нокаутирован, реакция интимальной гиперплазии на перевязку сонной артерии in vivo была снижена. [17]
Другое: Считается, что этот ген играет роль в прогрессировании опухоли. [6] [16]
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000140479 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000030513 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ ab KIEFER, MICHAEL C.; TUCKER, JEFFREY E.; JOH, RICHARD; LANDSBERG, KATHERINE E.; SALTMAN, DAVID; BARR, PHILIP J. (декабрь 1991 г.). «Идентификация второго гена человеческой субтилизин-подобной протеазы в регионе fes/fps хромосомы 15». DNA and Cell Biology . 10 (10): 757–769. doi :10.1089/dna.1991.10.757. ISSN 1044-5498. PMID 1741956.
- ^ abc "Ген Entrez: PCSK6 пропротеиновая конвертаза субтилизин/кексин типа 6".
- ^ abcd Констам, Дэниел Б. (август 2014 г.). «Регулирование TGFβ и связанных с ним сигналов путем обработки предшественников». Семинары по клеточной и эволюционной биологии . 32 : 85–97. doi : 10.1016/j.semcdb.2014.01.008 . ISSN 1084-9521. PMID 24508081.
- ^ abc Mori, K.; Imamaki, A.; Nagata, K.; Yonetomi, Y.; Kiyokage-Yoshimoto, R.; Martin, TJ; Gillespie, MT; Nagahama, M.; Tsuji, A.; Matsuda, Y. (1999-03-01). "Субтилизин-подобные пропротеинконвертазы, PACE4 и PC8, а также фурин, являются эндогенными проальбуминконвертазами в клетках HepG2". Journal of Biochemistry . 125 (3): 627–633. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022329. ISSN 0021-924X. PMID 10050053.
- ^ abc Rehemtulla, Alnawaz; Barr, Philip J.; Rhodes, Christopher J.; Kaufman, Randal J. (1993-01-26). "PACE4 является членом семейства пропептидаз млекопитающих, который имеет перекрывающуюся, но не идентичную субстратную специфичность с PACE". Biochemistry . 32 (43): 11586–11590. doi :10.1021/bi00094a015. ISSN 0006-2960. PMID 8218226.
- ^ abcde Чэнь, Шэнхань; Цао, Пэнсю; Дун, Нинчжэн; Пэн, Цзяньхао; Чжан, Чуньи; Ван, Хао; Чжоу, Тяньтянь; Ян, Цзюньхуа; Чжан, Юэ; Мартелли, Элизабет Э.; Нага Прасад, Сатьямангла В. (2015-08-10). "PCSK6-опосредованная активация корина необходима для нормального кровяного давления". Nature Medicine . 21 (9): 1048–1053. doi :10.1038/nm.3920. ISSN 1078-8956. PMC 4710517 . PMID 26259032.
- ^ ab Констам, DB; Робертсон, EJ (2000-05-01). "SPC4/PACE4 регулирует сигнальную сеть TGFbeta во время формирования оси". Гены и развитие . 14 (9): 1146–1155. doi :10.1101/gad.14.9.1146. ISSN 0890-9369. PMC 316583. PMID 10809672 .
- ^ ab Berretz, Gesa; Arning, Larissa; Gerding, Wanda M.; Friedrich, Patrick; Fraenz, Christoph; Schlüter, Caroline; Epplen, Jörg T.; Güntürkün, Onur; Beste, Christian; Genç, Erhan; Ocklenburg, Sebastian (2019-05-21). «Структурная асимметрия лобных и височных долей связана с полиморфизмом PCSK6 VNTR». Молекулярная нейробиология . 56 (11): 7765–7773. doi :10.1007/s12035-019-01646-1. ISSN 0893-7648. PMID 31115778. S2CID 160009569.
- ^ ab Robinson, Kelsey J.; Hurd, Peter L.; Read, Silven; Crespi, Bernard J. (апрель 2016 г.). «Ген PCSK6 связан с доминированием одной из рук, расстройствами аутистического спектра и магическими идеями в неклинической популяции». Neuropsychologia . 84 : 205–212. doi : 10.1016/j.neuropsychologia.2016.02.020. ISSN 0028-3932. PMID 26921480. S2CID 6142024.
- ^ ab Arning, Larissa; Ocklenburg, Sebastian; Schulz, Stefanie; Ness, Vanessa; Gerding, Wanda M.; Hengstler, Jan G.; Falkenstein, Michael; Epplen, Jörg T.; Güntürkün, Onur; Beste, Christian (2013-06-27). "PCSK6 VNTR Polymorphism Is Associated with Degree of Handedness but Not Direction of Handedness". PLOS ONE . 8 (6): e67251. Bibcode :2013PLoSO...867251A. doi : 10.1371/journal.pone.0067251 . ISSN 1932-6203. PMC 3695088 . PMID 23826248.
- ^ Шерри, Томас С.; Брандлер, Уильям М.; Параккини, Сильвия; Моррис, Эндрю П.; Ринг, Сьюзан М.; Ричардсон, Алекс Дж.; Талкотт, Джоэл Б.; Стайн, Джон; Монако, Энтони П. (2010-11-04). "PCSK6 связан с доминированием одной руки у людей с дислексией". Human Molecular Genetics . 20 (3): 608–614. doi : 10.1093/hmg/ddq475 . ISSN 1460-2083. PMC 3016905. PMID 21051773 .
- ^ ab Bassi, Daniel E.; Mahloogi, Haleh; Klein-Szanto, Andrés JP (2000). «Пропротеиновые конвертазы Furin и PACE4 играют значительную роль в прогрессировании опухолей». Molecular Carcinogenesis . 28 (2): 63–69. doi :10.1002/1098-2744(200006)28:2<63::aid-mc1>3.0.co;2-c. ISSN 0899-1987. PMID 10900462. S2CID 22849623.
- ^ abc Рыкачевска, Уршула; Суур, Бьянка Э.; Рёль, Самуэль; Разуваев Антон; Ленгквист, Мариетт; Сабатер-Ллеаль, Мария; ван дер Лаан, Сандер В.; Миллер, Клинт Л.; Вирка, Роберт С.; Кронквист, Малин; Гонсалес Диес, Мария (28 февраля 2020 г.). «PCSK6 является ключевой протеазой в контроле функции гладкомышечных клеток при ремоделировании сосудов». Исследование кровообращения . 126 (5): 571–585. дои : 10.1161/circresaha.119.316063 . hdl : 1887/3185300 . ISSN 0009-7330. PMID 31893970. S2CID 209539709.
- ^ Констам, Дэниел Б.; Робертсон, Элизабет Дж. (11.01.1999). «Регуляция активности морфогенетического белка костной ткани с помощью продоменов и пропротеиновых конвертаз». Журнал клеточной биологии . 144 (1): 139–149. doi : 10.1083/jcb.144.1.139 . ISSN 0021-9525. PMC 2148113. PMID 9885250 .
- ^ Констам, ДБ; Кальфон, М; Робертсон, Э.Дж. (1996-07-01). «SPC4, SPC6 и новая протеаза SPC7 коэкспрессируются с костными морфогенетическими белками в различных местах во время эмбриогенеза». Журнал клеточной биологии . 134 (1): 181–191. doi : 10.1083/jcb.134.1.181 . ISSN 0021-9525. PMC 2120924. PMID 8698813 .
- ^ Mesnard, D. (2006-05-25). «Nodal определяет эмбриональную висцеральную энтодерму и поддерживает плюрипотентные клетки в эпибласте до явного осевого паттернирования». Development . 133 (13): 2497–505. doi : 10.1242/dev.02413 . ISSN 0950-1991. PMID 16728477.
- ^ Арнольд, Себастьян Дж.; Робертсон, Элизабет Дж. (2009-01-08). «Принятие обязательства: распределение клеточных линий и паттернирование осей в раннем эмбрионе мыши». Nature Reviews Molecular Cell Biology . 10 (2): 91–103. doi :10.1038/nrm2618. ISSN 1471-0072. PMID 19129791. S2CID 94174.
- ^ Бреннан, Дж. (2002-09-15). «Узловая активность в узле управляет лево-правой асимметрией». Гены и развитие . 16 (18): 2339–2344. doi : 10.1101/gad.1016202 . ISSN 0890-9369. PMC 187443. PMID 12231623 .
Дальнейшее чтение
- Shore R, Covill L, Pettigrew KA, Diaz R, Xu Y, Tello J, Talcott J, Newbury D, Stein J, Monaco A (2016). «Связанный с леворукостью локус PCSK6 охватывает интронный промотор, регулирующий новые транскрипты». Hum Mol Genet . 25 (9): 1771–1779. doi :10.1093/hmg/ddw047. PMC 4986331 . PMID 26908617.
- Bassi DE, Mahloogi H, Klein-Szanto AJ (2000). «Пропротеиновые конвертазы фурин и PACE4 играют важную роль в прогрессировании опухолей». Mol. Carcinog . 28 (2): 63–9. doi :10.1002/1098-2744(200006)28:2<63::AID-MC1>3.0.CO;2-C. PMID 10900462. S2CID 22849623.
- Moulard M, Decroly E (2001). «Созревание предшественников гликопротеинов оболочки ВИЧ клеточными эндопротеазами». Biochim. Biophys. Acta . 1469 (3): 121–32. doi :10.1016/S0304-4157(00)00014-9. PMID 11063880.
- Seidah NG, Prat A (2003). «Предшественники конвертаз в секреторном пути, цитозоле и внеклеточной среде». Essays Biochem . 38 : 79–94. doi :10.1042/bse0380079. PMID 12463163. S2CID 528206.
- Tsuji A, Higashine K, Hine C, Mori K, Tamai Y, Nagamune H, Matsuda Y (1994). «Идентификация новых кДНК, кодирующих человеческую кексин-подобную протеазу, изоформы PACE4». Biochem. Biophys. Res. Commun . 204 (3): 1381–2. doi : 10.1006/bbrc.1994.2616 . PMID 7980617.
- Tsuji A, Higashine K, Hine C, Mori K, Tamai Y, Nagamune H, Matsuda Y (1994). «Идентификация новых кДНК, кодирующих человеческую кексин-подобную протеазу, изоформы PACE4». Biochem. Biophys. Res. Commun . 200 (2): 943–50. doi :10.1006/bbrc.1994.1541. PMID 8179631.
- Vollenweider F, Benjannet S, Decroly E, Savaria D, Lazure C, Thomas G, Chrétien M, Seidah NG (1996). "Сравнительная клеточная обработка гликопротеина оболочки вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1) gp160 субтилизин/кексин-подобными конвертазами млекопитающих". Biochem. J . 314 (Pt 2): 521–32. doi :10.1042/bj3140521. PMC 1217081 . PMID 8670066.
- Чжун М., Бенжаннет С., Лазур С., Мюнцер С., Сейда Н.Г. (1997). «Функциональный анализ изоформ PACE4-A и PACE4-C человека: идентификация новой изоформы PACE4-CS». ФЭБС Летт . 396 (1): 31–6. дои : 10.1016/0014-5793(96)01059-9 . PMID 8906861. S2CID 19890431.
- Decroly E, Wouters S, Di Bello C, Lazure C, Ruysschaert JM, Seidah NG (1997). «Идентификация парных основных конвертаз, вовлеченных в процессинг ВИЧ gp160, на основе анализов in vitro и экспрессии в линиях клеток CD4(+)». J. Biol. Chem . 271 (48): 30442–50. doi : 10.1074/jbc.271.48.30442 . PMID 8940009.
- Inocencio NM, Sucic JF, Moehring JM, Spence MJ, Moehring TJ (1997). "Эндопротеазная активность, отличная от фурина и PACE4, с ролью в обработке гликопротеинов ВИЧ-I gp160 в клетках CHO-K1". J. Biol. Chem . 272 (2): 1344–8. doi : 10.1074/jbc.272.2.1344 . PMID 8995442.
- Мори К., Кии С., Цудзи А., Нагахама М., Имамаки А., Хаяши К., Акамацу Т., Нагамуне Х., Мацуда Ю. (1997). «Новая изоформа PACE4 человека, PACE4E, представляет собой активную процессирующую протеазу, содержащую гидрофобный кластер на карбокси-конце». Дж. Биохим . 121 (5): 941–8. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021677. ПМИД 9192737.
- Tsuji A, Hine C, Tamai Y, Yonemoto K, Mori K, Yoshida S, Bando M, Sakai E, Mori K, Akamatsu T, Matsuda Y (1997). «Геномная организация и альтернативный сплайсинг человеческого PACE4 (SPC4), кексин-подобной процессирующей эндопротеазы». J. Biochem . 122 (2): 438–52. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021772. PMID 9378725.
- Moulard M, Chaloin L, Canarelli S, Mabrouk K, Darbon H, Challoin L (1998). «Процессинг гликопротеина ретровирусной оболочки: структурное исследование сайта расщепления». Биохимия . 37 (13): 4510–7. doi :10.1021/bi972662f. PMID 9521771.
- Nagahama M, Taniguchi T, Hashimoto E, Imamaki A, Mori K, Tsuji A, Matsuda Y (1998). "Биосинтетическая обработка и четвертичные взаимодействия пропротеиновой конвертазы SPC4 (PACE4)". FEBS Lett . 434 (1–2): 155–9. doi : 10.1016/S0014-5793(98)00970-3 . PMID 9738469. S2CID 25126519.
- Виале А., Ортола С., Эрвье Г., Фурута М., Барберо П., Штайнер Д.Ф., Сейда Н.Г., Нахон Дж.Л. (1999). «Клеточная локализация и роль прогормонконвертаз в переработке промеланин-концентрирующего гормона у млекопитающих». Ж. Биол. Хим . 274 (10): 6536–45. дои : 10.1074/jbc.274.10.6536 . ПМИД 10037747.
- Mori K, Imamaki A, Nagata K, Yonetomi Y, Kiyokage-Yoshimoto R, Martin TJ, Gillespie MT, Nagahama M, Tsuji A, Matsuda Y (1999). «Субтилизин-подобные пропротеиновые конвертазы, PACE4 и PC8, а также фурин, являются эндогенными проальбуминовыми конвертазами в клетках HepG2». J. Biochem . 125 (3): 627–33. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022329. PMID 10050053.
- Sucic JF, Moehring JM, Inocencio NM, Luchini JW, Moehring TJ (1999). «Эндопротеаза PACE4 зависит от Ca2+ и чувствительна к температуре, а также может частично спасти фенотип штамма клеток с дефицитом фурина». Biochem. J . 339 (3): 639–47. doi :10.1042/0264-6021:3390639. PMC 1220200 . PMID 10215603.
- Tsuji A, Yoshida S, Hasegawa S, Bando M, Yoshida I, Koide S, Mori K, Matsuda Y (2000). «Экспрессия гена человеческой субтилизин-подобной пропротеиновой конвертазы PACE4 (SPC4) в высокой степени регулируется элементами E-box в клетках HepG2 и GH4C1». J. Biochem . 126 (3): 494–502. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022478. PMID 10467164.