stringtranslate.com

Лиор Пахтер

Лиор Сэмюэл Пахтер — вычислительный биолог . Он работает в Калифорнийском технологическом институте , где является профессором вычислительной биологии имени Брена. У него широкий спектр исследовательских интересов, включая геномику , комбинаторику , вычислительную геометрию , машинное обучение , научные вычисления и статистику . [1] [4] [5]

Ранняя жизнь и образование

Пахтер родился в Израиле и вырос в Южной Африке . [6] Он получил степень бакалавра по математике в Калифорнийском технологическом институте в 1994 году . [4] Он получил докторскую степень по математике в Массачусетском технологическом институте в 1999 году под руководством Бонни Бергер , [2] с Эриком Ландером и Дэниелом Клейтманом в качестве соруководителей. [4]

Карьера и исследования

Пахтер работал на факультете Калифорнийского университета в Беркли с 1999 по 2018 год [7] и получил должность заведующего кафедрой имени Саклера в 2012 году. [4]

Помимо своего технического вклада, Пахтер известен использованием новых медиа для продвижения открытой науки [8] и мысленным экспериментом, который он разместил в своем блоге, согласно которому «ближайший сосед «идеального человека» находится в Пуэрто-Рико» . [9] Это привлекло значительное внимание СМИ, [10] а ответ был опубликован в Scientific American . [11] Он также известен критикой использования UMAP проектом All-of-us для визуализации и интерпретации данных популяционной генетики. [12]

Награды и почести

В 2017 году Пахтер был избран членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB). [13]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Публикации Лиора Пахтера, проиндексированные Google Scholar
  2. ^ abc Лиор Пахтер в проекте «Генеалогия математики»
  3. ^ Trapnell, Cole; Pachter, Lior; Salzberg, Steven L. (2009). «TopHat: обнаружение сплайс-соединений с помощью RNA-Seq». Bioinformatics . 25 (9): 1105–1111. doi :10.1093/bioinformatics/btp120. ISSN  1460-2059. PMC  2672628 . PMID  19289445.
  4. ^ abcd Curriculum vitae: Лиор Пахтер (PDF) , 2017 г. , получено 16 мая 2017 г..
  5. ^ Trapnell, Cole; Williams, Brian A; Pertea, Geo; Mortazavi, Ali; Kwan, Gordon; van Baren, Marijke J; Salzberg, Steven L; Wold, Barbara J; Pachter, Lior (2010). «Сборка и количественная оценка транскриптов с помощью RNA-Seq выявляет неаннотированные транскрипты и переключение изоформ во время дифференциации клеток». Nature Biotechnology . 28 (5): 511–515. doi :10.1038/nbt.1621. ISSN  1087-0156. PMC 3146043 . PMID  20436464. 
  6. ↑ Эскенази, Джо (14 июня 2002 г.), «Петиция о лишении прав Калифорнийского университета беспокоит произраильских активистов», Jweekly.
  7. ^ "UC Berkeley, Mathematics Department Faculty, Lior Pachter" . Получено 2019-06-08 .
  8. ^ Лесен, Эми Э. (2015), «Новая парадигма научной коммуникации? Социальные сети, Twitter, наука и участие общественности: обзор литературы», в Лесен, Эми Э. (ред.), Ученые, эксперты и участие общественности: балансируя на грани , Ashgate Studies in Environmental Policy and Practice, Ashgate Publishing, Ltd., стр. 111–136, ISBN 9781472415240. См. в частности стр. 119–120.
  9. ^ Пахтер, Лиор (2 декабря 2014 г.). «Идеальный человек — пуэрториканец». Bits of DNA — Обзоры и комментарии по вычислительной биологии Лиора Пахтера . Получено 11 декабря 2016 г.
  10. ^ Вальдес, Мария Г. (4 декабря 2014 г.), «Новое исследование показывает, что идеальный с точки зрения генетики человек родом с этого Карибского острова!», Latin Times
  11. ^ Олексик, Тарас К.; Мартинес-Крузадо, Хуан Карлос (5 ​​февраля 2015 г.). «Почему нет идеального человека в Пуэрто-Рико или где-либо еще». Scientific American ..
  12. ^ pachter, lior (26 февраля 2024 г.). "все мы потерпели неудачу". wordpress . Получено 2024-03-08 . все мы потерпели неудачу
  13. ^ "13 февраля 2017 г.: Международное общество вычислительной биологии называет семь членов в качестве стипендиатов ISCB 2017 года". www.iscb.org . Получено 13 февраля 2017 г.

Внешние ссылки