stringtranslate.com

Phikmvvirus

Phikmvvirus — это род вирусов , которые заражают бактерии . В настоящее время в этом роде насчитывается 16 видов, включая типовой вид Pseudomonas virus phiKMV . [1] [2] Бактериофаг phiKMV [3] и его родственники известны как высоковирулентные фаги , образующие крупные (диаметром 3–15 мм (0,12–0,59 дюйма)) прозрачные бляшки на восприимчивом хозяине. [4] [5] Единственным зарегистрированным исключением является фаг LKA1, который образует небольшие бляшки (1 мм (0,039 дюйма)), окруженные ореолом. В то время как все другие специфичные для P. aeruginosa phikmvvirus используют пили типа IV в качестве первичного рецептора, частицы LKA1 прикрепляются к бактериальному липополисахаридному слою.

Таксономия

Признаны следующие виды: [2]

Вирусология

Электронно-микроскопическое исследование очищенных фаговых частиц показало, что эти фаги являются типичными представителями Podoviridae , с диаметром головки приблизительно 60 нм (2,4 × 10−6  дюймов) и коротким хвостом длиной 8–10 нм. Хотя фаг phiKMV напоминает хорошо изученный подовирус T7 по общей архитектуре генома , это был первый известный фаг, подобный T7 , который кодировал ген односубъединичной РНК-полимеразы ниже по течению своих генов метаболизма ДНК , а не в ранней геномной области. На основании этих свойств род Phikmvvirus классифицируется в составе Autographiviridae . [6]

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем абсорбции в клетку-хозяина. Методом транскрипции является транскрипция с использованием шаблона ДНК. Вирус покидает клетку-хозяина путем лизиса и белков холин/эндолизин/спанин. Бактерии служат естественным хозяином. Пути передачи — пассивная диффузия. [1]

Ссылки

  1. ^ ab "Viral Zone". ExPASy . Получено 15 июня 2015 г.
  2. ^ ab "Virus Taxonomy: 2019 Release". talk.ictvonline.org . Международный комитет по таксономии вирусов . Получено 4 мая 2020 г. .
  3. ^ Лавин, Роб; Буркальцева, Мария В.; Роббен, Йохан; Сикилинда, Нина Н.; Курочкина, Лидия П.; Гримонпрез, Барбара; Йонккс, Барт; Крылов, Виктор Н.; и др. (2003). «Геном бактериофага φKMV, вируса типа T7, инфицирующего Pseudomonas aeruginosa». Вирусология . 312 (1): 49–59. doi : 10.1016/S0042-6822(03)00123-5 . PMID  12890620.
  4. ^ Ceyssens, P.-J.; Lavigne, R.; Mattheus, W.; Chibeu, A.; Hertveldt, K.; Mast, J.; Robben, J.; Volckaert, G. (2006). «Геномный анализ фагов Pseudomonas aeruginosa LKD16 и LKA1: установление подгруппы KMV в супергруппе T7». Журнал бактериологии . 188 (19): 6924–31. doi :10.1128/JB.00831-06. PMC 1595506. PMID  16980495 . 
  5. ^ Ламменс, Э.; Цейсенс, П.-Ж.; Воэт, М.; Хертвельдт, К.; Лавин, Р.; Волкарт, Г. (2009). «Анализ репрезентативных различий (RDA) геномов бактериофагов». Журнал микробиологических методов . 77 (2): 207–13. doi :10.1016/j.mimet.2009.02.006. ПМИД  19232531.
  6. ^ Лавин, Роб; Сето, Дональд; Махадеван, Падманабхан; Акерманн, Ханс-В.; Кропински, Эндрю М. (2008). «Унификация классической и молекулярной таксономической классификации: анализ Podoviridae с использованием инструментов на основе BLASTP». Исследования в области микробиологии . 159 (5): 406–14. doi : 10.1016/j.resmic.2008.03.005 . PMID  18555669.

Внешние ссылки