Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens
ДНК-полимераза эта ( Pol η ) представляет собой белок , который у человека кодируется геном POLH . [5] [6] [7]
ДНК-полимераза эта представляет собой эукариотическую ДНК-полимеразу, участвующую в репарации ДНК путем синтеза транслейкоза . Ген, кодирующий ДНК-полимеразу эта, представляет собой POLH , также известный как XPV, поскольку потеря этого гена приводит к заболеванию пигментной ксеродермии . Полимераза эта особенно важна для обеспечения точного синтеза повреждений ДНК, возникающих в результате ультрафиолетового или УФ-излучения.
Функция
Этот ген кодирует члена семейства Y специализированных ДНК-полимераз . Он копирует неповрежденную ДНК с меньшей точностью, чем другие ДНК-направленные полимеразы. Однако он точно копирует ДНК, поврежденную УФ-излучением; когда присутствуют димеры тимина , эта полимераза вставляет комплементарные нуклеотиды во вновь синтезированную ДНК, тем самым минуя повреждение и подавляя мутагенный эффект повреждения ДНК, вызванного УФ-излучением. Считается, что эта полимераза участвует в гипермутации во время рекомбинации переключения класса иммуноглобулина. [5]
Обход 8-оксогуанина
Во время репликации ДНК хромосомы Saccharomyces cerevisiae окислительное повреждение ДНК 8-оксогуанином запускает переключение на синтез транслейкоза с помощью ДНК-полимеразы эта . [8] Эта полимераза реплицирует 8-оксогуанин с точностью (вставка цитозина напротив 8-оксогуанина) примерно 94%. Репликация 8-оксогуанина в отсутствие ДНК-полимеразы эта составляет менее 40%.
Клиническое значение
Мутации в этом гене приводят к XPV, вариантному типу пигментной ксеродермы , характеризующемуся чувствительностью к солнцу, повышенной заболеваемостью раком кожи, а на клеточном уровне - задержкой репликации и гипермутабельностью после УФ-облучения [9] [10]
Взаимодействия
Было показано, что POLH взаимодействует с PCNA . [11]
Рекомендации
- ^ abc GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000170734 — Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023953 — Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ ab «Ген Энтрез: полимераза POLH (направленная на ДНК), эта» .
- ^ Масутани С, Кусумото Р, Ямада А, Домаэ Н, Ёкои М, Юаса М, Араки М, Иваи С, Такио К, Ханаока Ф (июнь 1999 г.). «Ген XPV (вариант пигментной ксеродерма) кодирует эта-полимеразу ДНК человека». Природа . 399 (6737): 700–4. Бибкод : 1999Natur.399..700M. дои : 10.1038/21447. PMID 10385124. S2CID 4429698.
- ^ Джонсон Р.Э., Кондратик С.М., Пракаш С., Пракаш Л. (июль 1999 г.). «Мутации hRAD30 при вариантной форме пигментной ксеродермии». Наука . 285 (5425): 263–5. дои : 10.1126/science.285.5425.263. ПМИД 10398605.
- ^ Родригес GP, Сонг JB, Crouse GF (2013). «Обход 8-oxodG in vivo». ПЛОС Генет . 9 (8): e1003682. дои : 10.1371/journal.pgen.1003682 . ПМЦ 3731214 . ПМИД 23935538.
- ^ Старый А, Сарасин А (сентябрь 2002 г.). «Молекулярные механизмы мутаций, индуцированных УФ-излучением, выявленные при исследовании ДНК-полимеразы эта в клетках человека». Рез. Микробиол . 153 (7): 441–5. дои : 10.1016/S0923-2508(02)01343-8. ПМИД 12405351.
- ^ Круэ-Хеннекварт С., Галлахер К., Сокол А.М., Виллалан С., Прендергаст А.М., Карти MP (2010). «ДНК-полимераза η, ключевой белок в синтезе транслейкоза в клетках человека». Стабильность генома и болезни человека . Субклеточная биохимия. Том. 50. стр. 189–209. дои : 10.1007/978-90-481-3471-7_10. ISBN 978-90-481-3470-0. ПМИД 20012583.
- ^ Харачка Л., Джонсон Р.Э., Унк И., Филлипс Б., Гурвиц Дж., Пракаш Л., Пракаш С. (ноябрь 2001 г.). «Физические и функциональные взаимодействия ДНК-полимеразы эта человека с PCNA». Мол. Клетка. Биол . 21 (21): 7199–206. дои : 10.1128/MCB.21.21.7199-7206.2001. ПМК 99895 . ПМИД 11585903.
дальнейшее чтение
- Плахта М., Халас, Макинтайр Дж., Следзиевска-Гойска Э. (2015). «Установочный уровень и стабильность TLS-полимеразы эта зависят от клеточного цикла у дрожжей S. cerevisiae». Восстановление ДНК . 29 : 147–153. doi :10.1016/j.dnarep.2015.02.015. ПМИД 25766643.
- Сконечна А, Макин Атайр Дж, Сконечны М, Поличинска З, Следзиевска-Гойска Е (2007). «Полимераза эта представляет собой короткоживущий, протеасомно разлагаемый белок, который временно стабилизируется после УФ-облучения в Saccharomyces cerevisiae». Дж. Мол. Биол . 366 (4): 1074–86. дои : 10.1016/j.jmb.2006.11.093. ПМИД 17198712.
- Масутани С, Кусумото Р, Ямада А, Домаэ Н, Ёкои М, Юаса М, Араки М, Иваи С, Такио К, Ханаока Ф (1999). «Ген XPV (вариант пигментной ксеродерма) кодирует эта-полимеразу ДНК человека». Природа . 399 (6737): 700–4. Бибкод : 1999Natur.399..700M. дои : 10.1038/21447. PMID 10385124. S2CID 4429698.
- Джонсон Р.Э., Кондратик С.М., Пракаш С., Пракаш Л. (1999). «Мутации hRAD30 при вариантной форме пигментной ксеродермии». Наука . 285 (5425): 263–5. дои : 10.1126/science.285.5425.263. ПМИД 10398605.
- Масутани С., Кусумото Р., Иваи С., Ханаока Ф. (2000). «Механизмы точного синтеза транслейкоза с помощью ДНК-полимеразы эта человека». ЭМБО Дж . 19 (12): 3100–9. дои : 10.1093/emboj/19.12.3100. ПМК 203367 . ПМИД 10856253.
- Ямада А., Масутани С., Иваи С., Ханаока Ф. (2000). «Комплементация дефектного синтеза транслейкоза и чувствительности к ультрафиолетовому свету в клетках варианта пигментной ксеродермы с помощью ДНК-полимеразы эта человека и мыши». Нуклеиновые кислоты Рез . 28 (13): 2473–80. дои : 10.1093/нар/28.13.2473. ПМК 102698 . ПМИД 10871396.
- Юаса М, Масутани С, Эки Т, Ханаока Ф (2000). «Геномная структура, хромосомная локализация и идентификация мутаций в гене варианта пигментной ксеродермы (XPV)». Онкоген . 19 (41): 4721–8. дои : 10.1038/sj.onc.1203842 . ПМИД 11032022.
- Ито Т., Линн С., Камидэ Р., Токусигэ Х., Катори Н., Хосака Ю., Ямаидзуми М. (2000). «Гетерозиготы пигментного варианта Xeroderma демонстрируют снижение уровня восстановления репликативного синтеза ДНК в присутствии кофеина после ультрафиолетового облучения». Дж. Инвест. Дерматол . 115 (6): 981–5. дои : 10.1046/j.1523-1747.2000.00154.x . ПМИД 11121129.
- Цзэн X, Винтер Д.Б., Касмер С., Кремер К.Х., Леманн А.Р., Геархарт П.Дж. (2001). «ДНК-полимераза эта является мутатором АТ при соматической гипермутации вариабельных генов иммуноглобулина». Нат. Иммунол . 2 (6): 537–41. дои : 10.1038/88740. PMID 11376341. S2CID 6213513.
- Мацуда Т., Бебенек К., Масутани С., Рогозин И.Б., Ханаока Ф., Кункель Т.А. (2001). «Частота ошибок и специфичность эта-полимеразы ДНК человека и мыши». Дж. Мол. Биол . 312 (2): 335–46. дои : 10.1006/jmbi.2001.4937. ПМИД 11554790.
- Харачка Л., Джонсон Р.Э., Унк И., Филлипс Б., Гурвиц Дж., Пракаш Л., Пракаш С. (2001). «Физические и функциональные взаимодействия ДНК-полимеразы эта человека с PCNA». Мол. Клетка. Биол . 21 (21): 7199–206. дои : 10.1128/MCB.21.21.7199-7206.2001. ПМК 99895 . ПМИД 11585903.
- Глик Э., Винья К.Л., Леб Л.А. (2001). «Мутации в мотиве II ДНК-полимеразы человека изменяют обход повреждений ДНК». ЭМБО Дж . 20 (24): 7303–12. дои : 10.1093/emboj/20.24.7303. ПМЦ 125802 . ПМИД 11743006.
- Лимоли CL, Гидзински Э, Боннер ВМ, Кливер Дж. Э. (2002). «УФ-индуцированная остановка репликации в варианте пигментной ксеродермы приводит к двухцепочечным разрывам ДНК, образованию гамма-H2AX и релокализации Mre11». Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (1): 233–8. Бибкод : 2002PNAS...99..233L. дои : 10.1073/pnas.231611798 . ПМК 117544 . ПМИД 11756691.
- Бротон Б.К., Кордонье А., Клейер В.Дж., Джасперс Н.Г., Фосетт Х., Раамс А., Гарритсен В.Х., Старый А., Аврил М.Ф., Будсок Ф., Масутани С., Ханаока Ф., Фукс Р.П., Сарасин А., Леманн А.Р. (2002). «Молекулярный анализ мутаций ДНК-полимеразы эта у пациентов с пигментной ксеродерма». Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (2): 815–20. Бибкод : 2002PNAS...99..815B. дои : 10.1073/pnas.022473899 . ПМК 117388 . ПМИД 11773631.
- Кьяпперино Д., Крот Х., Крамарчук И.Х., Сайер Дж.М., Масутани С., Ханаока Ф., Джерина Д.М., Че А.М. (2002). «Преимущественное неправильное включение пуриновых нуклеотидов ДНК-полимеразой человека эта напротив аддуктов бензо[а]пирен-7,8-диол-9,10-эпоксид-дезоксигуанозин». Ж. Биол. Хим . 277 (14): 11765–71. дои : 10.1074/jbc.M112139200 . ПМИД 11821420.
- Кусумото Р., Масутани С., Иваи С., Ханаока Ф. (2002). «Синтез транслезий с помощью ДНК-полимеразы эта человека через повреждения тимингликоля». Биохимия . 41 (19): 6090–9. дои : 10.1021/bi025549k. ПМИД 11994004.
- Явуз С., Явуз А.С., Кремер К.Х., Липский П.Е. (2002). «Роль полимеразы эта в соматической гипермутации, определенная путем анализа мутаций у пациента с вариантом пигментной ксеродермии». Дж. Иммунол . 169 (7): 3825–30. дои : 10.4049/jimmunol.169.7.3825 . ПМИД 12244178.
- Каннуш П., Фернандес де Хенестроса А.Р., Кулл Б., Видал А.Е., Грей С., Зича Д., Вудгейт Р., Леманн А.Р. (2002). «Локализация ДНК-полимераз эта и йота в аппарате репликации тесно скоординирована в клетках человека». ЭМБО Дж . 21 (22): 6246–56. doi : 10.1093/emboj/cdf618. ПМК 137208 . ПМИД 12426396.
- Чжэн Х, Ван Х, Уоррен А.Дж., Легерски Р.Дж., Нэрн Р.С., Гамильтон Дж.В., Ли Л. (2003). «Эта-опосредованное репарацией нуклеотидов и полимеразой, подверженное ошибкам удаление межцепочечных поперечных связей митомицина С». Мол. Клетка. Биол . 23 (2): 754–61. дои : 10.1128/MCB.23.2.754-761.2003. ПМК 151552 . ПМИД 12509472.
- Ян И.Ю., Миллер Х., Ван З., Фрэнк Э.Г., Омори Х., Ханаока Ф., Мория М. (2003). «Синтез трансфункциональной ДНК млекопитающих с помощью аддукта дезоксигуанозина, полученного из акролеина. Участие ДНК-полимеразы эта в подверженном ошибкам синтезе в клетках человека». Ж. Биол. Хим . 278 (16): 13989–94. дои : 10.1074/jbc.M212535200 . ПМИД 12584190.
- Каннуш П., Фернандес де Хенестроса А.Р., Кулл Б., Видал А.Е., Грей С., Зича Д., Вудгейт Р., Леманн А.Р. (2003). «Локализация ДНК-полимераз эта и йота в аппарате репликации тесно скоординирована в клетках человека». ЭМБО Дж . 22 (5): 1223–33. doi : 10.1093/emboj/cdf618. ПМЦ 150329 . ПМИД 12606586.
Внешние ссылки
- Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW о пигментной ксеродерма
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .