stringtranslate.com

РНК Галстук-клуб

Клуб РНК был неформальным научным клубом, отчасти предназначенным для юмористической деятельности [1] избранных ученых, которые интересовались тем, как белки синтезируются из генов, в частности, из генетического кода . [2] Он был создан Джорджем Гамовым по предложению Джеймса Уотсона в 1954 году [2], когда связь между нуклеиновыми кислотами и аминокислотами в генетической информации была неизвестна. Клуб состоял из 20 полноправных членов, каждый из которых представлял аминокислоту, и четырех почетных членов, представляющих четыре нуклеотида . Задача членов клуба заключалась в том, чтобы придумать возможные решения и поделиться ими с другими членами.

Первым важным документом Клуба связей РНК была гипотеза адаптера Фрэнсиса Крика в 1955 году. Экспериментальная работа над этой гипотезой привела к открытию транспортной РНК — молекулы, несущей ключ к генетическому коду. Большая часть теоретических наработок и предварительных экспериментов по генетическому коду была проделана членами клуба в течение десятилетия. Однако конкретный код был обнаружен Маршаллом Ниренбергом , не членом организации, получившим за это открытие Нобелевскую премию по физиологии и медицине в 1968 году.

История

Фон

В 1953 году английский биофизик Фрэнсис Крик и американский биолог Джеймс Уотсон , работая вместе в Кавендишской лаборатории Кембриджского университета, вывели структуру ДНК , основного генетического материала организмов, [3] считали, что генетическая информация в ДНК связана с белками. . [4] К 1954 году стало понятно, что путь генетической информации включает ДНК , РНК и белки. Однако структура и природа РНК все еще оставались загадкой (конкретные молекулы РНК не были известны до 1960 г. [5] ), особенно то, как РНК участвует в синтезе белка. [6] В своем письме Крику Уотсон назвал эту проблему «загадкой жизни». [5]

Советско-американский физик Джордж Гамов из Университета Джорджа Вашингтона предложил первую схему синтеза белка из ДНК. [7] [8] В начале 1954 года он провел несколько дней в Вудс-Хоул на Кейп-Коде с Криком, Уотсоном и Сидни Бреннером , обсуждая генетику. [2] Основываясь на модели Уотсона-Крика , он предложил «гипотезу прямой матрицы ДНК», утверждающую, что белки синтезируются непосредственно из двухцепочечных бороздок ДНК. [9] Предполагалось, что четыре основания ДНК синтезируют 20 различных аминокислот в виде триплетов с перекрывающимися нуклеотидными последовательностями. [10] Он опубликовал свою гипотезу в выпуске журнала Nature от 13 февраля 1954 года , объяснив:

Мне кажется, что такую ​​процедуру трансляции можно легко установить, рассмотрев отношения « ключ-замок » между различными аминокислотами и ромбовидные «дырки», образованные различными нуклеотидами в цепи дезоксирибонуклеиновой кислоты... Один Можно предположить, что свободные аминокислоты из окружающей среды захватываются «дырками» молекул дезоксирибонуклеиновой кислоты и таким образом объединяются в соответствующие пептидные цепи. [11]

Фундамент

В мае 1954 года Уотсон посетил Гамова, который находился в творческом отпуске в Калифорнийском университете в Беркли . Обсуждая гипотезу Гамова, он предложил создать клуб из 20 человек для разработки генетического кода. [2] Гамов сразу же придумал Клуб связи РНК, чтобы «разгадать загадку структуры РНК и понять, как она строит белки», добавив девиз «сделай или умри; или не пытайся». [12]

Таким образом, клуб состоял из 20 выдающихся ученых, каждый из которых соответствовал определенной аминокислоте, плюс четыре почетных члена (С. Бреннер, ВАЛ. Ф. Липман, А. Сент-Дьёрдьи и еще один человек), по одному на каждый нуклеотид . [12]

Каждый участник получил шерстяной галстук с вышитой спиралью, отсюда и название «Клуб галстуков РНК». [12]

Члены

Галстук и булавка для галстука

Члены Клуба галстуков РНК получили черный шерстяной галстук с изображенной на нем зелено-желтой спиралью РНК. Оригинальный дизайн галстука был разработан Оргелем, а окончательный узор переработан Гамовым. [12] Уотсон доставил выкройку галстука Гамова в галантерейный магазин в Лос-Анджелесе на Колорадо-авеню, причем портной пообещал изготовить галстуки по 4 доллара за штуку. [13] Вместе с каждой ничьей члены клуба должны были получить золотую булавку для галстука с трехбуквенной аббревиатурой их клубного обозначения аминокислот. Возможно, не все участники получили свой значок. Гамов, однако, несколько раз носил значок, что часто вызывало замешательство и вопросы, почему он носил «неправильные инициалы». [13]

Успехи

Клуб RNA Tie никогда не проводил официальных собраний всех своих членов. [2] Участники посещали друг друга, чтобы обсудить научные разработки, обычно связанные с сигарами и алкоголем. Это позволило развить связи и близкую дружбу среди этой научной элиты и оказалось питательной средой для творческих идей. Члены отправляли друг другу письма и препринты статей, предлагая новые концепции и идеи. [14]

Количество нуклеотидов в кодоне

Используя математику, Гамов постулировал, что нуклеотидного кода, состоящего из трех букв (троек), будет достаточно для определения всех 20 аминокислот. [11] Эта концепция лежит в основе « кодонов » и устанавливает верхний и нижний предел их размера. Гамов просто подсчитал, что количество оснований и их комплементарных пар в цепи ДНК может создать 20 полостей для аминокислот, а это означает, что 20 различных аминокислот могут участвовать в синтезе белка. [15] Он назвал это взаимодействие ДНК и белка «алмазным кодом». [16] Хотя предположение Гамова о том, что ДНК напрямую синтезирует белки, оказалось ошибочным, [10] триплетный код стал основой генетического кода. [16]

Кодоны

Сидни Бреннер предложил концепцию кодона — идею о том, что три неперекрывающихся нуклеотида могут кодировать одну аминокислоту. [17] Его доказательство включало статистические данные и экспериментальные данные, полученные на основе аминокислотных последовательностей белков.

Гипотеза адаптера

Фрэнсис Крик предложил « гипотезу адаптера » (название, данное Бреннером [18] ), предполагающую, что некая молекула переправляет аминокислоты и размещает их в правильном порядке, соответствующем последовательности нуклеиновой кислоты. [19] Эта гипотеза противоречила гипотезе Гамова о прямой матрице ДНК, утверждавшей, что ДНК не может синтезировать белки напрямую, а вместо этого требует других молекул, адаптеров для преобразования последовательностей ДНК в аминокислотные последовательности. Он также предположил, что таких отдельных молекул-адаптеров существует 20. [20] [21] Позже это было подтверждено Робертом Холли, и молекулы-адаптеры были названы транспортными РНК (тРНК). [22]

Напечатанный документ, распространенный среди членов Клуба связей РНК в январе 1955 года под названием «О вырожденных шаблонах и гипотезе адаптера: заметка для Клуба связей РНК», описывается как «одна из самых важных неопубликованных статей в истории науки». , [23] [24] и «самая известная неопубликованная статья в анналах молекулярной биологии». [24] Уотсон вспоминал: «Самая известная из этих [неопубликованных] заметок Фрэнсиса со временем полностью изменит наше представление о синтезе белка. [2]

Личные успехи

Шесть членов RNA Tie Club стали лауреатами Нобелевской премии: Ричард Фейнман, Мелвин Кэлвин, Джеймс Уотсон, Макс Дельбрук, Фрэнсис Крик и Сидни Бреннер. Однако конечная цель понимания и расшифровки кода, связывающего нуклеиновые кислоты и аминокислоты, была достигнута Маршаллом Ниренбергом , который не был членом РНК-клуба [25] и получил Нобелевскую премию по физиологии и медицине в 1968 году вместе с Холли. и Хар Гобинд Хорана . [26]

Рекомендации

  1. ^ Штраус, Бернард С (01 марта 2019 г.). «Мартинас Йчас: «Архивариус» Галстук-клуба RNA». Генетика . 211 (3): 789–795. doi : 10.1534/genetics.118.301754. ISSN  1943-2631. ПМК  6404253 . ПМИД  30846543.
  2. ^ abcdef Уотсон, Джеймс Д. (2007). Избегайте скучных людей: уроки из жизни в науке. Издательство Оксфордского университета. п. 112. ИСБН 978-0-19-280273-6. ОСЛК  47716375.
  3. ^ Уотсон Дж.Д., Крик Ф.Х. (1953). «Молекулярная структура нуклеиновых кислот: структура нуклеиновой кислоты дезоксирибозы» . Природа . 171 (4356): 737–8. Бибкод : 1953Natur.171..737W. дои : 10.1038/171737a0. PMID  13054692. S2CID  4253007.
  4. ^ Уотсон, Джей Ди; Крик, FH (30 мая 1953 г.). «Генетическое значение структуры дезоксирибонуклеиновой кислоты». Природа . 171 (4361): 964–967. Бибкод : 1953Natur.171..964W. дои : 10.1038/171964b0. ISSN  0028-0836. PMID  13063483. S2CID  4256010.
  5. ^ Аб Кобб, Мэтью (2017). «60 лет назад Фрэнсис Крик изменил логику биологии». ПЛОС Биология . 15 (9): e2003243. дои : 10.1371/journal.pbio.2003243 . ПМК 5602739 . ПМИД  28922352. 
  6. ^ Парди, AB (1954). «Предшественники нуклеиновых кислот и синтез белка». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 40 (5): 263–270. Бибкод : 1954PNAS...40..263P. дои : 10.1073/pnas.40.5.263 . ПМК 534118 . ПМИД  16589470. 
  7. ^ Стегманн, Ульрих Э. (01 сентября 2016 г.). «Переосмысление« генетического кодирования »: анализ фактического использования». Британский журнал философии науки . 67 (3): 707–730. doi : 10.1093/bjps/axv007. ISSN  0007-0882. ПМЦ 4990703 . ПМИД  27924115. 
  8. ^ Рич, Александр (2009). «Эра пробуждения РНК: Структурная биология РНК в ранние годы». Ежеквартальные обзоры биофизики . 42 (2): 117–137. дои : 10.1017/S0033583509004776. ISSN  0033-5835. PMID  19638248. S2CID  2285884.
  9. ^ Хейс, Брайан (1998). «Информатика: изобретение генетического кода». Американский учёный . 86 (1): 8–14. дои : 10.1511/1998.17.3338. ISSN  0003-0996. JSTOR  27856930. S2CID  121907709.
  10. ^ аб Сегре, Джино (2000). «Большой взрыв и генетический код». Природа . 404 (6777): 437. дои : 10.1038/35006517 . PMID  10761891. S2CID  205005362.
  11. ^ Аб Гамов, Г. (1954). «Возможная связь между дезоксирибонуклеиновой кислотой и белковыми структурами». Природа . 173 (4398): 318. Бибкод : 1954Natur.173..318G. дои : 10.1038/173318a0 . S2CID  4279494.
  12. ^ abcd Лили Э. Кей (2000). Кто написал книгу жизни?: История генетического кода, Stanford University Press. ISBN 9780804734172
  13. ^ Аб Уотсон, JD (2002). Гены, девочки и Гамов: после двойной спирали . Нью-Йорк: Рэндом Хаус. ISBN 0-375-41283-2. ОСЛК  47716375.
  14. ^ Фридберг, Эррол С.: Писательная жизнь Джеймса Д. Уотсона , Cold Spring Harbor Laboratory Press, сентябрь 2004 г.
  15. ^ Ватанабэ, Кимицуна (30 мая 2001 г.). «Генетический код: Введение». ЭЛС (1-е изд.). John Wiley & Sons, Ltd., стр. 1–10. дои : 10.1002/9780470015902.a0000809.pub2. ISBN 978-0-470-01617-6.
  16. ^ аб Хейс, Брайан (1998). «Информатика: изобретение генетического кода». Американский учёный . 86 (1): 8–14. дои : 10.1511/1998.17.3338. ISSN  0003-0996. JSTOR  27856930. S2CID  121907709.
  17. ^ Бреннер, Сидней: О невозможности всех перекрывающихся триплетных кодов , 1956,
    позже опубликовано в PNAS: PNAS USA. 1957 г., 15 августа; 43 (8): 687–694.
  18. ^ Крик, Фрэнсис (1955). «О вырожденных шаблонах и гипотезе адаптера: заметка для Клуба связей РНК». Национальная медицинская библиотека . Проверено 21 июля 2022 г.
  19. ^ Крик, Фрэнсис и Бреннер, Сидней: Некоторые сноски по синтезу белка: заметка для Клуба связей РНК. Декабрь 1959 года.
  20. ^ Крик, Фрэнсис: От ДНК к белку О вырожденных матрицах и гипотезе адаптера: заметка для Клуба связей РНК , 1955.
  21. ^ Крик, Фрэнсис: Что за безумное преследование 1988, стр. 95-96.
  22. ^ Барчишевская, Мирослава З.; Перриг, Патрик М.; Барчишевский, Ян (2016). «тРНК - золотой стандарт в молекулярной биологии». Молекулярные биосистемы . 12 (1): 12–17. дои : 10.1039/c5mb00557d. ПМИД  26549858.
  23. ^ «Фрэнсис Крик - Профили в результатах научного поиска» . Profiles.nlm.nih.gov . Проверено 21 июля 2022 г.
  24. ^ аб Фрай, Майкл (2022). «Гипотеза адаптера Крика и открытие транспортной РНК: эксперимент, превосходящий теоретические предсказания». Философия, теория и практика биологии . 14 . дои : 10.3998/ptpbio.2628 . ISSN  2475-3025. S2CID  249112573.
  25. ^ Эверсон, Тед: Ген: историческая перспектива , стр. 90-91.
  26. ^ Назарали, Адиль Дж. (01.06.2011). «Маршалл Ниренберг 1927–2010». Клеточная и молекулярная нейробиология . 31 (6): 805–807. doi : 10.1007/s10571-011-9709-y. ISSN  1573-6830. PMID  21630009. S2CID  35080749.