Семейство белков с железо-серным центром, переносящим электроны
Белки Риске являются компонентами железо-серного белка (ISP) комплексов цитохрома bc 1 и комплексов цитохрома b 6 f и отвечают за перенос электронов в некоторых биологических системах. Джон С. Риске и его коллеги впервые открыли этот белок и в 1964 году выделили ацетилированную форму митохондриального белка быка . [1] В 1979 году команда Трампауэра выделила «фактор окисления» из митохондрий быка и показала, что это реконститутивно-активная форма железо-серного белка Риске. [2] Это уникальный кластер [2Fe-2S], в котором один из двух атомов Fe координируется двумя остатками гистидина, а не двумя остатками цистеина . С тех пор они были обнаружены в растениях, животных и бактериях с широко варьирующимися потенциалами восстановления электронов от -150 до +400 мВ. [3]
Комплекс состоит из трех субъединиц в большинстве бактерий и девяти в митохондриях: как бактериальные, так и митохондриальные комплексы содержат субъединицы цитохрома b и цитохрома c1 , а также железо-серную субъединицу «Риске», которая содержит высокопотенциальный кластер 2Fe-2S. [6] Митохондриальная форма также включает шесть других субъединиц, которые не обладают окислительно-восстановительными центрами. Пластохинон-пластоцианинредуктаза ( комплекс b6f ), присутствующий в цианобактериях и хлоропластах растений, катализирует оксидоредукцию пластохинола и цитохрома f . Этот комплекс, функционально аналогичный убихинол-цитохромредуктазе c , включает цитохром b6, цитохром f и субъединицы Риске. [7]
Субъединица Риске действует путем связывания аниона убихинола или пластохинола , перенося электрон на кластер 2Fe-2S, а затем высвобождая электрон на гемовое железо цитохрома c или цитохрома f . [4] [7] Восстановление центра Риске увеличивает сродство субъединицы на несколько порядков, стабилизируя радикал семихинона на сайте Q(P). [8] Домен Риске имеет центр [2Fe-2S]. Два консервативных цистеина координируют один ион Fe, в то время как другой ион Fe координируется двумя консервативными гистидинами. Кластер 2Fe-2S связан в высококонсервативной С-концевой области субъединицы Риске.
Кристаллические структуры ряда белков Риске известны. Общая складка, включающая два субдомена, доминирует над антипараллельной β-структурой и содержит переменное количество α-спиралей . Меньшие «кластер-связывающие» субдомены в митохондриальных и хлоропластных белках практически идентичны, тогда как большие субдомены существенно отличаются, несмотря на общую топологию сворачивания. Субдомены, связывающие кластер [Fe 2 S 2 ], имеют топологию неполной антипараллельной β-бочки. Один атом железа кластера Риске [Fe 2 S 2 ] в домене координируется двумя остатками цистеина , а другой координируется двумя остатками гистидина через атомы N δ . Лиганды, координирующие кластер, происходят из двух петель; каждая петля вносит один Cys и один His.
^ Rieske JS, Maclennan DH, Coleman R (1964). «Выделение и свойства железосодержащего белка из комплекса (восстановленный кофермент Q)-цитохром C-редуктазы дыхательной цепи». Biochem. Biophys. Res. Commun . 15 (4): 338–344. doi :10.1016/0006-291X(64)90171-8.
^ Trumpower BL, Edwards CA (1979). "Очистка реконститутивно активного белка железа и серы (фактора окисления) из комплекса сукцинат:цитохром с редуктазы митохондрий бычьего сердца". J Biol Chem . 254 (17): 8697–706. doi : 10.1016/S0021-9258(19)86947-8 . PMID 224062.
^ Браун, EN и Фриманн, Р. и Карлссон, А. и Паралес, Дж. В. и Кутюр, М. М. и Элтис, Л. Д. и Рамасвами, С. (2008). «Определение потенциалов восстановления кластера Риске». J. Biol. Inorg. Chem . 13 (8): 1301–1313. doi :10.1007/s00775-008-0413-4. PMID 18719951. S2CID 3303144.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ ab Harnisch U, Weiss H, Sebald W (май 1985). «Первичная структура железо-серной субъединицы убихинол-цитохром-c-редуктазы из Neurospora, определенная с помощью кДНК и секвенирования генов». Eur. J. Biochem . 149 (1): 95–9. doi : 10.1111/j.1432-1033.1985.tb08898.x . PMID 2986972.
^ Gabellini N, Sebald W (февраль 1986). "Нуклеотидная последовательность и транскрипция оперона fbc из Rhodopseudomonas sphaeroides. Оценка выведенных аминокислотных последовательностей белка FeS, цитохрома b и цитохрома c1". Eur. J. Biochem . 154 (3): 569–79. doi :10.1111/j.1432-1033.1986.tb09437.x. PMID 3004982.
^ Куровски Б., Людвиг Б. (октябрь 1987 г.). «Гены комплекса Paracoccus denitrificans bc1. Нуклеотидная последовательность и гомология между бактериальными и митохондриальными субъединицами». J. Biol. Chem . 262 (28): 13805–11. doi : 10.1016/S0021-9258(19)76497-7 . PMID 2820981.
^ ab Madueño F, Napier JA, Cejudo FJ, Gray JC (октябрь 1992 г.). «Импорт и обработка предшественника белка Rieske FeS хлоропластов табака». Plant Mol. Biol . 20 (2): 289–99. doi :10.1007/BF00014496. PMID 1391772. S2CID 2306978.
^ Link TA (июль 1997 г.). «Роль белка железа и серы „Риске“ в участке окисления гидрохинона (Q(P)) комплекса цитохрома bc1. Механизм „изменения сродства, управляемого протоном“». FEBS Lett . 412 (2): 257–64. doi :10.1016/S0014-5793(97)00772-2. PMID 9256231. S2CID 35375512.
Дальнейшее чтение
Iwata S, Saynovits M, Link TA, Michel H (май 1996). "Структура водорастворимого фрагмента железо-серного белка 'Rieske' комплекса митохондриального цитохрома bc1 сердца быка, определенная с помощью фазирования MAD при разрешении 1,5 A". Структура . 4 ( 5): 567–79. doi : 10.1016/S0969-2126(96)00062-7 . PMID 8736555.
Huang JT, Struck F, Matzinger DF, Levings CS (декабрь 1991 г.). "Функциональный анализ кДНК, кодирующей митохондриальный железо-серный белок Риске высших растений, в дрожжах". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 88 (23): 10716–20. Bibcode :1991PNAS...8810716H. doi : 10.1073/pnas.88.23.10716 . PMC 53001 . PMID 1961737.
Brandt U, Yu L, Yu CA, Trumpower BL (апрель 1993 г.). «Митохондриальная целевая препоследовательность железо-серного белка Риске обрабатывается за один шаг после вставки в комплекс цитохрома bc1 у млекопитающих и сохраняется в качестве субъединицы в комплексе». J. Biol. Chem . 268 (12): 8387–90. doi : 10.1016/S0021-9258(18)52883-0 . PMID 8386158.
Ferraro, DJ, Gakhar, L. и Ramaswamy, S. (2005). "Бизнес Rieske: структура-функция негемовых оксигеназ Rieske". Biochem. Biophys. Res. Commun . 338 (1): 175–190. doi :10.1016/j.bbrc.2005.08.222. PMID 16168954.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
Мейсон, Дж. Р. и Кэммак, Р. (1992). «Электрон-транспортные белки гидроксилирующих бактериальных диоксигеназ». Annu. Rev. Microbiol . 46 : 277–305. doi :10.1146/annurev.mi.46.100192.001425. PMID 1444257.
Шмидт, CL (2004). «Железо-серные белки Риске из экстремофильных организмов». J. Bioenerg. Biomembr . 36 (1): 107–113. doi :10.1023/B:JOBB.0000019602.96578.78. PMID 15168614. S2CID 23790442.
Шнайдер, Д. и Шмидт, КЛ (2005). «Множественные белки Риске в прокариотах: где и почему?». Biochim. Biophys. Acta . 1710 (1): 1–12. doi : 10.1016/j.bbabio.2005.09.003 . PMID 16271700.
Браун, EN и Фриманн, Р. и Карлссон, А. и Паралес, Дж. В. и Кутюр, М. М. и Элтис, Л. Д. и Рамасвами, С. (2008). «Определение потенциалов восстановления кластера Риске». J. Biol. Inorg. Chem . 13 (8): 1301–1313. doi :10.1007/s00775-008-0413-4. PMID 18719951. S2CID 3303144.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
Внешние ссылки
PDB : 1RIE - Рентгеновская структура белка Риске (водорастворимый фрагмент)комплекса цитохрома bc 1 митохондрий быка
PDB : 1RFS - Рентгеновская структура белка Риске (водорастворимый фрагмент)комплекса цитохрома b 6 f хлоропласта шпината
PDB : 1FQT - Рентгеновская структура ферредоксина типа Риске, связанного с бифенилдиоксигеназой из Burkholderia cepacia
PDB : 1G8J - Рентгеновская структура субъединицы Риске арсенитоксидазы из Alcaligenes faecalis