stringtranslate.com

FlAsH-EDT2

FlAsH-EDT 2 — это мышьякорганическое соединение с молекулярной формулой C 24 H 18 As 2 O 5 S 4 . Его структура основана на ядре флуоресцеина с двумя 1,3,2-дитиарсолановыми заместителями . Он используется в биоаналитических исследованиях в качестве флуоресцентной метки для визуализации белков в живых клетках. [1] FlAsH-EDT 2 — это аббревиатура от флуоресцинового мышьяковистого связующего вещества для волос — этандитиола , и представляет собой бледно - желтое или розоватое флуорогенное твердое вещество. Он имеет полуструктурную формулу (C 2 H 4 AsS 2 ) 2 - (C 13 H 5 O 3 )-C 6 H 4 COOH , представляющую дитиарсолановые заместители, связанные с ядром гидроксиксантона , присоединенным к о -замещенной молекуле бензойной кислоты .

FlAsH-EDT 2 используется для сайт-специфической маркировки, селективно связываясь с белками, содержащими мотив тетрацистеина ( TC) Cys-Cys-Xxx-Xxx-Cys-Cys, и становясь флуоресцентным при связывании. Он демонстрирует неспецифическое связывание с эндогенными белками, богатыми цистеином, то есть он связывается с сайтами, отличными от интересующего (CCXXCC). Дальнейшая оптимизация мотива TC выявила улучшенную аффинность связывания FlAsH с мотивом CCPGCC [2] и более высокий квантовый выход , когда мотив тетрацистеина фланкирован специфическими остатками (HRWCCPGCCKTF или FLNCCPGCCMEP). [3]

Подготовка

Шаг 1 : HgO в TFA ; Шаг 2 : AsCl 3 , затем Pd(OAc) 2 и DIEA ; Шаг 3 : H 2 EDT в водном ацетоне.

FlAsH-EDT 2 можно приготовить из флуоресцеина в три этапа (см. рисунок). [1]

Образование аддукта FlAsH-TC

Многие исследования показывают, что трехвалентные соединения мышьяка связываются с парами остатков цистеина. Это связывание отвечает за токсичность многих соединений мышьяка. [4] Связывание обращается 1,2-этандитиолом, который прочно связывается с соединениями мышьяка, как показано стабильностью FlAsH-EDT 2 . [5] Такая сильная связь сера-мышьяк может, опять же, регулироваться путем разработки пептидного домена, который проявляет более высокое сродство к мышьяку, например, мотива тетрацистеина. Модулируя расстояние между двумя парами остатков цистеина и пространство между центрами мышьяка FlAsH-EDT 2 , можно достичь кооперативной и энтропийно благоприятной связи дитиол-мышьяк. [6]

Образование аддукта FlAsH-TC

Таким образом, связывание FlAsH-EDT 2 подлежит равновесию. Образование аддукта FlAsH-пептида может быть благоприятным при низкой концентрации EDT (ниже 10  мкМ ) и обратимым при высокой концентрации EDT (выше 1 мМ). [6]

Характеристики

FlAsH становится флуоресцентным при связывании мотива тетрацистеина. Он возбуждается при 508 нм и испускает 528 нм, зелено-желтый, свободного флуоресцеина. Квантовый выход составляет 0,49 для 250 нМ FlAsH, связанного с модельным тетрацистеинсодержащим пептидом в фосфатно-солевом буфере при pH 7,4. [6]

В целом, FlAsH-EDT 2 имеет 0,1-0,6 флуоресцентной квантовой эффективности с несколькими пределами обнаружения мкМ для диффузной цитозольной метки и 30-80 коэффициентов экстинкции L ммоль −1  см −1 . Комплекс FlAsH-пептид также продемонстрировал перенос энергии резонанса флуоресценции (FRET) от флуоресцентных белков, таких как усиленный циановый флуоресцентный белок (ECFP) зеленого флуоресцентного белка (GFP). [7]

Приложение

FlAsH-EDT 2 обеспечивает менее токсичную и более специфичную флуоресцентную маркировку, которая проницаема для мембраны. [8] Модификация флуоресцеиновой части также позволяет проводить многоцветный анализ. [9] Было доказано, что это хорошая альтернатива зеленым флуоресцентным белкам (GFP) с тем преимуществом, что FlAsH-EDT 2 намного меньше ( молярная масса  < 1  кДа ) по сравнению с GFP (~30 кДа), поэтому сводит к минимуму возмущение активности исследуемого белка. [1] [10]

Использовать

В прошлом FlAsH-EDT 2 широко использовался для изучения ряда клеточных событий in vivo и субклеточных структур в клетках животных, белка матрицы вируса Эбола и неправильного сворачивания белков. С помощью электронной микроскопии FlAsH-EDT 2 также используется для изучения процессов перемещения белков in situ . [11] Совсем недавно он использовался в расширенном исследовании растительных клеток, таких как Arabidopsis и табак. [12]

Ссылки

  1. ^ abc Адамс, Стивен Р.; Циен, Роджер Й. (2008). «Подготовка проникающих через мембрану биарсенических соединений FlAsH-EDT2 и ReAsH-EDT2 для флуоресцентной маркировки белков с тетрацистеиновой меткой». Nat. Protoc. 3 (9): 1527–1534. doi :10.1038/nprot.2008.144. PMC  2843588 . PMID  18772880.
  2. ^ Адамс, Стивен Р.; Кэмпбелл, Роберт Э.; Гросс, Ларри А.; Мартин, Брент Р.; Уолкап, Грант К.; Яо, Йонг; Ллопис, Хуан; Циен, Роджер Ю. (2002). «Новые биарсенические лиганды и мотивы тетрацистеина для маркировки белков in vitro и in vivo: синтез и биологические приложения». Журнал Американского химического общества . 124 (21): 6063–6076. doi :10.1021/ja017687n. PMID  12022841.
  3. ^ Мартин, Брент Р.; Джипманс, Бен НГ; Адамс, Стивен Р.; Циен, Роджер Й. (2005). «Оптимизация мотива тетрацистеина, связывающего биарсеник, на основе клеток млекопитающих для улучшения флуоресценции и сродства». Nature Biotechnology . 23 (10): 1308–1314. doi :10.1038/nbt1136. PMID  16155565. S2CID  16456334.
  4. ^ Калеф, Эдна; Гитлер, Карлос (1994). «Очистка вицинальных дитиолсодержащих белков с помощью аффинной хроматографии на основе мышьяка». В Sies, Helmut (ред.). Кислородные радикалы в биологических системах, часть C. Методы в энзимологии . Том 233. Academic Press . стр. 395–403. doi :10.1016/S0076-6879(94)33046-8. ISBN 9780080883465. PMID  8015475.
  5. ^ Уиттекер, Виктор П. (1947). «Экспериментальное исследование «кольцевой гипотезы» токсичности мышьяка». Biochem. J. 41 (1): 56–62. doi :10.1042/bj0410056. PMC 1258423 . PMID  16748119.  
  6. ^ abc Гриффин, Б. Альберт; Адамс, Стивен Р.; Циен, Роджер Й. (1998). «Специфическая ковалентная маркировка рекомбинантных белковых молекул внутри живых клеток». Science . 281 (5374): 269–272. Bibcode :1998Sci...281..269G. doi :10.1126/science.281.5374.269. PMID  9657724.
  7. ^ Адамс, Стивен Р.; Кэмпбелл, Роберт Э.; Гросс, Ларри А.; Мартин, Брент Р.; Уолкап, Грант К.; Яо, Йонг; Ллопис, Хуан; Циен, Роджер Ю. (2002). «Новые биарсенические лиганды и мотивы тетрацистеина для маркировки белков in vitro и in vivo: синтез и биологические приложения». J. Am. Chem. Soc. 124 (21): 6063–6076. doi :10.1021/ja017687n. PMID  12022841.
  8. ^ Хоффманн, Карстен; Гайетта, Гвидо; Цюрн, Александр; Адамс, Стивен Р.; Террильон, Соня; Эллисман, Марк Х.; Циен, Роджер Ю.; Лозе, Мартин Дж. (2010). «Флуоресцентная маркировка белков, помеченных тетрацистеином, в неповрежденных клетках». Nature Protocols . 5 (10): 1666–1677. doi :10.1038/nprot.2010.129. PMC 3086663 . PMID  20885379. 
  9. ^ Набор для обнаружения внутриклеточных тетрацистеиновых меток TC-FlAsH™ II (зеленая флуоресценция) для визуализации живых клеток
  10. ^ Гриффин, Б. Альберт; Адамс, Стивен Р.; Джонс, Джей; Циен, Роджер И. (2000). «Флуоресцентная маркировка рекомбинантных белков в живых клетках с помощью FlAsH». В Торнер, Джереми; Эмр, Скотт Д .; Абельсон, Джон Н. (ред.). Применение химерных генов и гибридных белков, часть B: клеточная биология и физиология . Методы в энзимологии . Том 327. Academic Press . стр. 565–578. doi :10.1016/S0076-6879(00)27302-3. ISBN 9780080496825. PMID  11045009.
  11. ^ Gaietta, Guido; Deerinck, Thomas J.; Adams, Stephen R.; Bouwer, James; Tour, Oded; Laird, Dale W.; Sosinsky, Gina E.; Tsien, Roger Y .; Ellisman, Mark H. (2002). «Многоцветная и электронно-микроскопическая визуализация коннексинового трафика». Science . 296 (5567): 503–507. Bibcode :2002Sci...296..503G. doi :10.1126/science.1068793. PMID  11964472. S2CID  16397816.
  12. ^ Эстевес, Хосе М.; Сомервилл, Крис (2006). «Флуоресцентная визуализация синтетических пептидов, экспрессируемых в Arabidopsis и табаке, на основе FlAsH». BioTechniques . 41 (5): 569–574. doi : 10.2144/000112264 . PMID  17140113.