Зеленый флуоресцентный белок ( GFP ) представляет собой белок , который проявляет зеленую флуоресценцию при воздействии света в диапазоне от синего до ультрафиолетового . [2] [3] Метка GFP традиционно относится к белку, впервые выделенному из медузы Aequorea victoria , и иногда его называют avGFP . Однако GFP были обнаружены и у других организмов, включая кораллы , морские анемоны , зоанитиды , копеподы и ланцетники . [4]
GFP A. victoria имеет основной пик возбуждения при длине волны 395 нм и второстепенный пик при 475 нм. Пик его излучения находится на длине волны 509 нм, что находится в нижней зеленой части видимого спектра . Квантовый выход флуоресценции (QY) GFP составляет 0,79. GFP морской анютины глазки ( Renilla reniformis ) имеет один основной пик возбуждения при 498 нм. GFP является отличным инструментом во многих формах биологии благодаря своей способности образовывать внутренний хромофор , не требуя каких-либо дополнительных кофакторов , генных продуктов или ферментов / субстратов , кроме молекулярного кислорода. [5]
В клеточной и молекулярной биологии ген GFP часто используется в качестве репортера экспрессии . [6] Его использовали в модифицированных формах для изготовления биосенсоров , и было создано множество животных, экспрессирующих GFP, что демонстрирует доказательство концепции того, что ген может экспрессироваться в данном организме, в выбранных органах или в представляющих интерес клетках. . GFP может быть введен животным или другим видам с помощью трансгенных методов и сохранен в их геноме и геноме их потомства. На сегодняшний день GFP экспрессируется у многих видов, включая бактерии, дрожжи, грибы, рыбы и млекопитающие, в том числе в клетках человека. 10 октября 2008 года учёные Роджер Ю. Циен , Осаму Симомура и Мартин Чалфи были удостоены Нобелевской премии по химии за открытие и разработку зелёного флуоресцентного белка.
Большинство коммерчески доступных генов GFP и подобных флуоресцентных белков имеют длину около 730 пар оснований. Натуральный белок содержит 238 аминокислот. Его молекулярная масса составляет 27 кД. [7] Таким образом, слияние гена GFP с геном интересующего белка может значительно увеличить размер и молекулярную массу белка и может нарушить естественную функцию белка или изменить его местоположение или траекторию транспорта внутри клетки. [8]
В 1960-х и 1970-х годах GFP вместе с отдельным люминесцентным белком экворином ( ферментом , который катализирует расщепление люциферина , выделяя свет), был впервые выделен из медузы Aequorea victoria и его свойства изучены Осаму Шимомура . [9] У A. victoria флуоресценция GFP возникает, когда экворин взаимодействует с ионами Ca 2+ , вызывая голубое свечение. Часть этой люминесцентной энергии передается GFP, сдвигая общий цвет в сторону зеленого. [10] Однако его полезность в качестве инструмента для молекулярных биологов начала осознаваться только в 1992 году, когда Дуглас Прашер сообщил о клонировании и нуклеотидной последовательности wtGFP в Gene . [11] Финансирование этого проекта закончилось, поэтому Прашер отправил образцы кДНК в несколько лабораторий. Лаборатория Мартина Чалфи экспрессировала кодирующую последовательность wtGFP с удаленными первыми несколькими аминокислотами в гетерологичных клетках E. coli и C. elegans , опубликовав результаты в журнале Science в 1994 году. [12] Лаборатория Фредерика Цуджи независимо сообщила об экспрессии рекомбинантного белка через месяц. [13] Примечательно, что молекула GFP сворачивалась и флуоресцировала при комнатной температуре без необходимости использования экзогенных кофакторов, специфичных для медуз. Хотя этот почти wtGFP был флуоресцентным, он имел несколько недостатков, в том числе двухпиковые спектры возбуждения, чувствительность к pH, чувствительность к хлоридам, плохой квантовый выход флуоресценции, плохую фотостабильность и плохую укладку при 37 ° C (99 ° F).
Впервые кристаллическая структура GFP была описана группой Remington в журнале Science в 1996 году у мутанта S65T. Месяц спустя группа Phillips независимо сообщила о структуре GFP дикого типа в журнале Nature Biotechnology . [15] Эти кристаллические структуры обеспечили жизненно важную основу для формирования хромофора и взаимодействия соседних остатков. Исследователи модифицировали эти остатки путем направленного и случайного мутагенеза, чтобы получить широкий спектр производных GFP, используемых сегодня. Дальнейшие исследования GFP показали, что он устойчив к детергентам, протеазам, обработке гуанидинийхлоридом (GdmCl) и резким изменениям температуры. [16]
Из-за возможности широкого использования и растущих потребностей исследователей было создано множество различных мутантов GFP. [17] [18] Первым значительным улучшением стала точечная мутация (S65T), о которой в 1995 году сообщил в журнале Nature Роджер Цянь . [19] Эта мутация значительно улучшила спектральные характеристики GFP, что привело к увеличению флуоресценции, фотостабильности и сдвигу основного пика возбуждения до 488 нм, при этом пик испускания сохранился на уровне 509 нм. Это соответствовало спектральным характеристикам общедоступных наборов фильтров FITC , что повышало практичность использования исследователем общего профиля. Точечный мутант этого каркаса с эффективностью сворачивания при 37 °C (F64L), дающий улучшенный GFP (EGFP), был обнаружен в 1995 году лабораториями Таструпа [20] и Фалькоу. [21] EGFP позволил практическое использование GFP в клетках млекопитающих. EGFP имеет коэффициент экстинкции (обозначенный ε) 55 000 M -1 см -1 . [22] Квантовый выход флуоресценции (QY) EGFP составляет 0,60. Относительная яркость, выраженная как ε•QY, составляет 33 000 М –1 см –1 .
В 2006 году сообщалось о суперфолдере GFP (sfGFP), серии мутаций, которые позволяют GFP быстро сворачиваться и созревать даже при слиянии с плохо сворачивающимися пептидами. [23]
Было сделано множество других мутаций, включая цветные мутанты; в частности, синий флуоресцентный белок (EBFP, EBFP2, Azurite, mKalama1), голубой флуоресцентный белок (ECFP, Cerulean, CyPet, mTurquoise2) и производные желтого флуоресцентного белка (YFP, Citrine, Venus, YPet). Производные BFP (кроме mKalama1) содержат замену Y66H. Они демонстрируют широкую полосу поглощения в ультрафиолете с центром около 380 нанометров и максимум излучения при 448 нанометрах. Был разработан мутант зеленого флуоресцентного белка (BFPms1), который преимущественно связывает Zn(II) и Cu(II). BFPms1 имеет несколько важных мутаций, включая хромофор BFP (Y66H), Y145F для более высокого квантового выхода, H148G для создания отверстия в бета-цилиндре и несколько других мутаций, которые увеличивают растворимость. Связывание Zn(II) увеличивает интенсивность флуоресценции, а связывание Cu(II) тушит флуоресценцию и смещает максимум поглощения с 379 до 444 нм. Следовательно, их можно использовать в качестве биосенсора Zn. [24]
Связывание хромофора. Критической мутацией в производных циана является замена Y66W, которая приводит к образованию хромофора с индольным , а не фенольным компонентом. Чтобы восстановить яркость этого модифицированного хромофора из-за увеличения объема индольной группы, необходимы несколько дополнительных компенсаторных мутаций в окружающем стволе. У ECFP и Cerulean N-концевая половина седьмой цепи имеет две конформации. Обе эти конформации имеют сложный набор ван-дер-ваальсовых взаимодействий с хромофором. Мутации Y145A и H148D в Cerulean стабилизируют эти взаимодействия и позволяют хромофору быть более плоским, лучше упакованным и менее склонным к столкновительному тушению. [25]
Дополнительный сайт-направленный случайный мутагенез в сочетании с скринингом на основе времени жизни флуоресценции дополнительно стабилизировал седьмую β-цепь, в результате чего появился яркий вариант mTurquoise2 с квантовым выходом (QY) 0,93. [26] Красное смещение длины волны производных YFP достигается за счет мутации T203Y и обусловлено взаимодействиями укладки π-электронов между замещенным остатком тирозина и хромофором. [3] Эти два класса спектральных вариантов часто используются в экспериментах по резонансной передаче энергии Фёрстера (FRET). Генетически закодированные репортеры FRET, чувствительные к сигнальным молекулам клетки, таким как кальций или глутамат, состоянию фосфорилирования белков, комплементации белков, димеризации рецепторов и другим процессам, обеспечивают высокоспецифичные оптические данные о клеточной активности в режиме реального времени.
Полурациональный мутагенез ряда остатков привел к появлению чувствительных к pH мутантов, известных как pHluorins, а позже и суперэклиптических pHluorins. Используя быстрое изменение pH при слиянии синаптических пузырьков, pHluorins, помеченные синаптобревином , были использованы для визуализации синаптической активности в нейронах. [27]
Редокс-чувствительный GFP ( roGFP ) был создан путем введения цистеинов в структуру бета-цилиндра. Окислительно -восстановительное состояние цистеинов определяет флуоресцентные свойства roGFP . [28]
Номенклатура модифицированных GFP часто сбивает с толку из-за совпадения нескольких версий GFP с одним именем. Например, mGFP часто относится к GFP с N-концевым пальмитоилированием , которое заставляет GFP связываться с клеточными мембранами . Однако тот же термин также используется для обозначения мономерного GFP, что часто достигается за счет нарушения интерфейса димера мутацией A206K. [29] GFP дикого типа имеет слабую тенденцию к димеризации при концентрациях выше 5 мг/мл. mGFP также означает «модифицированный GFP», который был оптимизирован за счет замены аминокислот для стабильной экспрессии в растительных клетках.
Цель как (первичной) биолюминесценции (в результате действия экворина на люциферин), так и (вторичной) флуоресценции GFP у медуз неизвестна. GFP экспрессируется совместно с экворином в небольших гранулах по краю колокольчика медузы. Пик вторичного возбуждения (480 нм) GFP действительно поглощает часть синего излучения экворина, придавая биолюминесценции более зеленый оттенок. Остаток серина 65 хромофора GFP отвечает за двухпиковые спектры возбуждения GFP дикого типа. Он консервативен во всех трех изоформах GFP, первоначально клонированных Прашером. Почти все мутации этого остатка объединяют спектры возбуждения в один пик при 395 или 480 нм. Точный механизм этой чувствительности сложен, но, по-видимому, он включает в себя передачу водорода от серина 65 глутамату 222, что влияет на ионизацию хромофора. [3] Поскольку одна мутация может значительно усилить пик возбуждения 480 нм, что делает GFP гораздо более эффективным партнером экворина, A. victoria, по-видимому, эволюционно предпочитает менее эффективный, двухпиковый спектр возбуждения. Роджер Цзянь предположил, что изменение гидростатического давления с глубиной может повлиять на способность серина 65 отдавать водород хромофору и изменить соотношение двух пиков возбуждения. Таким образом, медуза может менять цвет своей биолюминесценции с глубиной. Однако сокращение популяции медуз в Фрайдей-Харборе , где первоначально был обнаружен GFP, затруднило дальнейшее изучение роли GFP в естественной среде обитания медуз.
Известно, что большинство видов ланцетника производят GFP в различных частях тела. [30] В отличие от A. victoria , ланцетники не производят собственный синий свет, и происхождение их эндогенного GFP до сих пор неизвестно. Некоторые предполагают, что он привлекает планктон ко рту ланцетника, служа пассивным охотничьим механизмом. Он также может служить фотозащитным агентом для личинок, предотвращая повреждение, вызванное синим светом высокой интенсивности, путем преобразования его в зеленый свет более низкой интенсивности. Однако эти теории не были проверены.
GFP-подобные белки были обнаружены у многих видов морских копепод , особенно из семейств Pontellidae и Aetideidae . [31] GFP, выделенный из Pontella mimocerami, продемонстрировал высокие уровни яркости с квантовым выходом 0,92, что делает их почти в два раза ярче, чем обычно используемые EGFP, выделенные из A. victoria. [32]
Существует множество GFP-подобных белков, которые, несмотря на то, что относятся к тому же семейству белков, что и GFP, не происходят напрямую от Aequorea victoria . К ним относятся dsRed , eqFP611, Dronpa, TagRFPs, KFP, EosFP/IrisFP, Dendra и так далее. Будучи развитыми из белков разных организмов, эти белки иногда могут проявлять неожиданный подход к образованию хромофора. Некоторые из них, такие как KFP, созданы из природных нефлуоресцентных или слабофлуоресцентных белков, которые можно значительно улучшить с помощью мутагенеза. [33] Когда используются GFP-подобные стволы с различными спектральными характеристиками, спектры возбуждения одного хромофора могут использоваться для питания другого хромофора (FRET), что позволяет осуществлять преобразование между длинами волн света. [34]
FMN-связывающие флуоресцентные белки (FbFP) были разработаны в 2007 году и представляют собой класс небольших (11–16 кДа) кислороднезависимых флуоресцентных белков, которые происходят из рецепторов синего света. Они предназначены специально для использования в анаэробных или гипоксических условиях, поскольку для образования и связывания хромофора флавина не требуется молекулярный кислород, как в случае с синтезом хромофора GFP. [35]
Флуоресцентные белки с другими хромофорами, такие как UnaG с билирубином, могут проявлять уникальные свойства, такие как излучение с красным смещением выше 600 нм или фотоконверсия из состояния зеленого излучения в состояние красного излучения. Они могут иметь длины волн возбуждения и излучения, достаточно удаленные друг от друга, чтобы обеспечить преобразование красного и зеленого света.
Новый класс флуоресцентных белков был выделен из цианобактериального ( Trichodesmium erythraeum ) фикобилипротеина , α- аллофикоцианина , и в 2016 году получил название малого ультракрасного флуоресцентного белка ( smURFP ) . smURFP автокаталитически самостоятельно включает хромофор биливердин без необходимости использования внешнего белка . известный как лиаза . [36] [37] GFP-подобные белки, полученные из медуз и кораллов , требуют кислорода и производят стехиометрическое количество перекиси водорода при образовании хромофора . [38] smURFP не требует кислорода и не производит перекись водорода и использует хромофор биливердин . smURFP имеет большой коэффициент экстинкции (180 000 M -1 см -1 ) и скромный квантовый выход (0,20), что делает его биофизическую яркость сравнимой с eGFP и примерно в 2 раза ярче, чем большинство красных или дальнекрасных флуоресцентных белков , полученных из коралл . Спектральные свойства smURFP аналогичны органическому красителю Cy5 . [36] [39]
Обзоры новых классов флуоресцентных белков и их применения можно найти в цитируемых обзорах. [40] [41]
GFP имеет структуру бета-цилиндра , состоящую из одиннадцати β-нитей со складчатыми листами, с альфа-спиралью, содержащей ковалентно связанный хромофор 4-( п -гидроксибензилиден)имидазолидин-5-он (HBI), проходящий через центр. [3] [14] [15] Пять более коротких альфа-спиралей образуют колпачки на концах структуры. Структура бета-цилиндра представляет собой почти идеальный цилиндр длиной 42 Å и диаметром 24 Å (в некоторых исследованиях сообщается о диаметре 30 Å [16] ), [14] образуя так называемое образование «β-банки», которое является уникальным. к GFP-подобному семейству. [15] HBI, спонтанно модифицированная форма трипептида Ser65-Tyr66-Gly67, не флуоресцирует в отсутствие правильно свернутого каркаса GFP и существует в основном в неионизированной фенольной форме в wtGFP. [42] Обращенные внутрь боковые цепи ствола вызывают специфические реакции циклизации в Ser65-Tyr66-Gly67, которые вызывают ионизацию HBI до фенолятной формы и образование хромофора . Этот процесс посттрансляционной модификации называется созреванием . [43] Сеть водородных связей и взаимодействие электронов с этими боковыми цепями влияют на цвет, интенсивность и фотостабильность GFP и его многочисленных производных. [44] Плотно упакованный корпус цилиндра исключает молекулы растворителя, защищая флуоресценцию хромофора от тушения водой. Помимо автоциклизации Ser65-Tyr66-Gly67, по остатку Tyr66 происходит реакция 1,2-дегидрирования. [16] Помимо трех остатков, образующих хромофор, такие остатки, как Gln94, Arg96, His148, Thr203 и Glu222, действуют как стабилизаторы. Остатки Gln94, Arg96 и His148 способны стабилизироваться за счет делокализации заряда хромофора. Arg96 является наиболее важным стабилизирующим остатком, поскольку он вызывает необходимые структурные перестройки, необходимые для кольца HBI. Любая мутация остатка Arg96 приведет к снижению скорости развития хромофора, поскольку правильные электростатические и стерические взаимодействия будут потеряны. Tyr66 является реципиентом водородных связей и не ионизируется, создавая благоприятную электростатику. [45]
Механически процесс включает циклизацию, опосредованную основаниями, за которой следуют дегидратация и окисление. В реакции 7а с 8 происходит образование енамина из имина, а в реакции 7б с 9 происходит отрыв протона. [46] Образовавшийся флуорофор ГБЖ выделен зеленым цветом.
Реакции катализируются остатками Glu222 и Arg96. [46] [47] Аналогичный механизм возможен и с треонином вместо Ser65.
Зеленый флуоресцентный белок может быть использован в качестве репортерного гена . [48] [49]
Например, GFP можно использовать в качестве репортера уровней экологической токсичности. Было показано, что этот белок является эффективным способом измерения уровня токсичности различных химических веществ, включая этанол, параформальдегид , фенол, триклозан и парабен. GFP отлично подходит в качестве репортерного белка, поскольку он не оказывает влияния на хозяина при попадании в его клеточную среду. Благодаря этой способности не требуется никаких внешних красителей для визуализации, АТФ или кофакторов. Что касается уровней загрязняющих веществ, флуоресценцию измеряли, чтобы оценить эффект, который загрязняющие вещества оказывают на клетку-хозяина. Также измеряли клеточную плотность клетки-хозяина. Результаты исследования, проведенного Song, Kim и Seo (2016), показали, что по мере увеличения уровня загрязняющих веществ наблюдается снижение как флуоресценции, так и плотности клеток. Это свидетельствовало о том, что клеточная активность снизилась. Дополнительные исследования этого конкретного применения, чтобы определить механизм, с помощью которого GFP действует как маркер загрязнителя. [50] Аналогичные результаты наблюдались у рыбок данио, поскольку рыбки данио, которым вводили GFP, были примерно в двадцать раз более восприимчивы к распознаванию клеточных стрессов, чем рыбки данио, которым не вводили GFP. [51]
Самым большим преимуществом GFP является то, что он может передаваться по наследству, в зависимости от того, как он был введен, что позволяет продолжать изучение клеток и тканей, в которых он экспрессируется. Визуализация GFP неинвазивна и требует только освещения синим светом. GFP сам по себе не вмешивается в биологические процессы, но при слиянии с представляющими интерес белками для поддержания функции интересующего белка требуется тщательный дизайн линкеров. Более того, при использовании с мономером он способен легко диффундировать по клеткам. [52]
Доступность GFP и его производных полностью изменила определение флуоресцентной микроскопии и способов ее использования в клеточной биологии и других биологических дисциплинах. [53] Хотя большинство небольших флуоресцентных молекул, таких как FITC (изотиоцианат флуоресцеина), сильно фототоксичны при использовании в живых клетках, флуоресцентные белки, такие как GFP, обычно гораздо менее вредны при освещении в живых клетках. Это привело к разработке высокоавтоматизированных систем флуоресцентной микроскопии живых клеток, которые можно использовать для наблюдения за клетками с течением времени, экспрессирующими один или несколько белков, помеченных флуоресцентными белками.
Существует множество методов использования GFP в эксперименте по визуализации живых клеток. Самый прямой способ использования GFP — напрямую присоединить его к интересующему белку. Например, GFP можно включить в плазмиду, экспрессирующую другие гены, чтобы указать на успешную трансфекцию интересующего гена. Другой метод — использовать GFP, который содержит мутацию, при которой флуоресценция со временем меняется с зеленого на желтый, что называется флуоресцентным таймером. С помощью флуоресцентного таймера исследователи могут изучать состояние производства белка, например, недавно активированное, постоянно активированное или недавно деактивированное, на основе цвета, сообщаемого флуоресцентным белком. [54] В еще одном примере ученые модифицировали GFP, чтобы он стал активным только после воздействия облучения, предоставив исследователям инструмент для выборочной активации определенных частей клетки и наблюдения за тем, где белки, помеченные GFP, перемещаются из исходного местоположения. [55] Это только два примера в растущей области флуоресцентной микрокопии, а более полный обзор биосенсоров, использующих GFP и другие флуоресцентные белки, можно найти здесь [56]
Например, GFP широко использовался при маркировке сперматозоидов различных организмов в целях идентификации, например, у Drosophila melanogaster , где экспрессия GFP может использоваться в качестве маркера определенной характеристики. GFP также может быть выражен в различных структурах, позволяющих морфологическое различие. В таких случаях ген продукции GFP встраивается в геном организма в участок ДНК, кодирующий целевые белки и контролируемый той же регуляторной последовательностью ; то есть регуляторная последовательность гена теперь контролирует выработку GFP в дополнение к меченому белку(ам). В клетках, где экспрессируется ген и продуцируются меченые белки, одновременно вырабатывается GFP. Таким образом, только те клетки, в которых экспрессируется меченый ген или продуцируются целевые белки, будут флуоресцировать при наблюдении под флуоресцентной микроскопией. Анализ таких замедленных фильмов переопределил понимание многих биологических процессов, включая сворачивание белков, транспорт белков и динамику РНК, которые в прошлом изучались с использованием фиксированного (то есть мертвого) материала. Полученные данные также используются для калибровки математических моделей внутриклеточных систем и оценки скорости экспрессии генов. [57] Аналогичным образом, GFP можно использовать в качестве индикатора экспрессии белка в гетерологичных системах. В этом сценарии слитые белки, содержащие GFP, вводятся опосредованно, с использованием РНК конструкции, или напрямую, с самим меченым белком. Этот метод полезен для изучения структурных и функциональных характеристик меченого белка в макромолекулярном или одномолекулярном масштабе с помощью флуоресцентной микроскопии.
Микроскоп Vertico SMI , использующий технологию SPDM Phymod, использует так называемый эффект «обратимого фотообесцвечивания» флуоресцентных красителей, таких как GFP и его производные, для локализации их в виде одиночных молекул с оптическим разрешением 10 нм. Это также можно выполнить путем совместной локализации двух производных GFP (2CLM). [58]
Еще одним мощным применением GFP является экспрессия белка в небольших наборах специфических клеток. Это позволяет исследователям оптически обнаруживать определенные типы клеток in vitro (в чашке) или даже in vivo (в живом организме). [59] Генетическое объединение нескольких спектральных вариантов GFP — полезный трюк для анализа схем мозга ( Brainbow ). [60] Другие интересные применения флуоресцентных белков в литературе включают использование FP в качестве датчиков мембранного потенциала нейронов , [61] отслеживание рецепторов AMPA на клеточных мембранах, [62] проникновение вируса и заражение отдельными вирусами гриппа и лентивирусными вирусами, [60] 63] [64] и т. д.
Также было обнаружено, что новые линии трансгенных крыс GFP могут быть полезны для генной терапии, а также регенеративной медицины. [65] При использовании GFP с «высоким уровнем экспрессии» трансгенные крысы демонстрируют высокую экспрессию в большинстве тканей и многих клетках, которые не были охарактеризованы или были лишь плохо охарактеризованы у предыдущих трансгенных крыс с GFP.
Было показано, что GFP полезен в криобиологии в качестве анализа жизнеспособности . Корреляция жизнеспособности, измеренная с помощью анализа трипанового синего , составила 0,97. [66] Другим применением является использование котрансфекции GFP в качестве внутреннего контроля эффективности трансфекции в клетках млекопитающих. [67]
Новое возможное использование GFP включает использование его в качестве чувствительного монитора внутриклеточных процессов с помощью лазерной системы eGFP, изготовленной из линии клеток эмбриональной почки человека. Первый сконструированный живой лазер создан с помощью клетки, экспрессирующей eGFP, внутри отражающей оптической полости и воздействующей на нее импульсами синего света. При определенном пороге импульса оптический выход eGFP становится более ярким и полностью однородным, окрашенным в чистый зеленый цвет с длиной волны 516 нм. Прежде чем излучаться в виде лазерного света, свет отражается взад и вперед внутри полости резонатора и проходит через ячейку множество раз. Изучая изменения оптической активности, исследователи смогут лучше понять клеточные процессы. [68] [69]
GFP широко используется в исследованиях рака для маркировки и отслеживания раковых клеток. Раковые клетки, меченные GFP, использовались для моделирования метастазирования — процесса, посредством которого раковые клетки распространяются в отдаленные органы. [70]
GFP можно использовать для анализа колокализации белков. Это достигается путем «разделения» белка на два фрагмента, которые способны самособираться, а затем слияния каждого из них с двумя интересующими белками. По отдельности эти неполные фрагменты GFP не способны флуоресцировать. Однако если два представляющих интерес белка колокализуются, то два фрагмента GFP собираются вместе, образуя GFP-подобную структуру, которая способна флуоресцировать. Таким образом, измеряя уровень флуоресценции, можно определить, колокализуются ли два представляющих интерес белка. [71]
Макромасштабные биологические процессы, такие как распространение вирусных инфекций, можно отслеживать с помощью маркировки GFP. [72] В прошлом мутагенный ультрафиолетовый свет (УФ) использовался для освещения живых организмов (например, см. [73] ) для обнаружения и фотографирования экспрессии GFP. Недавно для макрофотографии был разработан метод использования неготагенных светодиодов [74] . [75] В этом методе используется приставка для эпифлуоресцентной камеры [76] , основанная на том же принципе, который используется в конструкции эпифлуоресцентных микроскопов .
Альба , зелено-флуоресцентный кролик, был создан французской лабораторией по заказу Эдуардо Каца с использованием GFP в целях искусства и социальных комментариев. [77] Американская компания Yorktown Technologies продает аквариумным магазинам зеленых флуоресцентных рыбок данио ( GloFish ), которые изначально были разработаны для обнаружения загрязнений в водных путях. NeonPets, американская компания, продает зеленые флуоресцентные мыши для индустрии домашних животных под названием NeonMice. [78] Зеленые флуоресцентные свиньи, известные как Ноэлы, были выведены группой исследователей под руководством Ву Шинн-Чи на факультете зоотехники и технологий Национального Тайваньского университета . [79] Японско-американская группа создала зелено-флуоресцентных кошек в качестве доказательства концепции потенциального использования их в качестве модельных организмов для болезней, особенно ВИЧ . [80] В 2009 году южнокорейская команда из Сеульского национального университета вывела первых трансгенных биглей с клетками фибробластов морских анемонов. Собаки излучают красный флуоресцентный свет, и они предназначены для того, чтобы позволить ученым изучать гены, вызывающие у человека такие заболевания, как нарколепсия и слепота. [81]
Джулиан Восс-Андре , художник немецкого происхождения, специализирующийся на «белковых скульптурах», [82] создал скульптуры, основанные на структуре GFP, в том числе «Зеленый флуоресцентный белок» высотой 1,70 м (5 футов 6 дюймов) (2004) [83]. ] и «Стальная медуза» высотой 1,40 м (4 фута 7 дюймов) (2006). Последняя скульптура расположена на месте открытия GFP Шимомурой в 1962 году, в лабораториях Фрайдей-Харбор Вашингтонского университета . [84]