ЗБП1

Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens

Z-ДНК-связывающий белок 1 , также известный как ДНК-зависимый активатор IFN-регуляторных факторов ( DAI ) и DLM-1 , представляет собой белок , который у человека кодируется геном ZBP1 . ^{[5] [6]}

ZBP1 также является аббревиатурой куриного или крысиного белка 1, связывающего зипкод β-актина , гомолога человеческого инсулиноподобного фактора роста 2, связывающего мРНК белка 1 ( IMP-1 ), и мышиного CRD-BP , белков, участвующих в мРНК. транспорт ( РНК-связывающие белки, RBP ).

Функция

DLM1 кодирует белок, связывающий Z-ДНК . Формирование Z-ДНК — это динамический процесс, в значительной степени контролируемый степенью сверхспирализации . ^[6] ZBP1 распознает ДНК в цитоплазме как противовирусный механизм. Жизненный цикл вируса часто включает этапы, на которых ДНК оказывается в цитоплазме. ДНК обычно содержится в ядре клетки, поэтому клетки используют белки, подобные ZBP1, в качестве индикатора вирусной инфекции. Как только ZBP1 активируется, он увеличивает выработку противовирусных цитокинов, таких как бета-интерферон . ^[7] Затем DLM1 связывается с цитозольной вирусной ДНК, используя два Z-ДНК-связывающих домена (Zα и Zβ) на своем N-конце, а также ДНК-связывающий домен (D3). ^[8]

Роль ZBP1 в распознавании ДНК подвергается сомнению. Было обнаружено, что он обнаруживает заражение вирусом гриппа А (IAV) и вызывает гибель клеток. Поскольку ДНК не синтезируется ни на одной стадии жизненного цикла IAV, определение ДНК, играющее роль в этом контексте, маловероятно. ^{[9] [10]} Однако недавнее исследование показало, что ZBP1 способен воспринимать РНК Z-формы, образующиеся во время IAV-инфекции, кумулирующиеся в форме независимой от каспаз воспалительной гибели клеток, называемой некроптозом. ^[11]

Последующее исследование показало, что ZBP1 воспринимает рибонуклеопротеиновый комплекс IAV, вызывая гибель клеток. ^[10] Более недавнее исследование идентифицировало фактор транскрипции IRF1 как вышестоящий регулятор экспрессии ZBP1. ^[12]

Рекомендации

1. GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124256 — Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027514 — Ensembl , май 2017 г.
3. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Ротенбург С., Шварц Т., Кох-Нолте Ф., Хааг Ф. (февраль 2002 г.). «Комплексная регуляция человеческого гена Z-ДНК-связывающего белка DLM-1». Исследования нуклеиновых кислот . 30 (4): 993–1000. дои : 10.1093/нар/30.4.993. ПМЦ 100341 . ПМИД  11842111. 
6. «Ген Энтреза: белок 1, связывающий Z-ДНК ZBP1» .
7. Ратинам В.А., Фицджеральд К.А. (март 2011 г.). «Врожденное иммунное восприятие ДНК-вирусов». Вирусология . 411 (2): 153–62. doi :10.1016/j.virol.2011.02.003. ПМК 3070751 . ПМИД  21334037. 
8. Ха С.К., Ким Д., Хван ХИ, Рич А., Ким ЮГ, Ким К.К. (декабрь 2008 г.). «Кристаллическая структура второго связывающего домена Z-ДНК человеческого DAI (ZBP1) в комплексе с Z-ДНК обнаруживает необычный способ связывания с Z-ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (52): 20671–6. Бибкод : 2008PNAS..10520671H. дои : 10.1073/pnas.0810463106 . ПМЦ 2634953 . ПМИД  19095800. 
9. Куриакосе Т., Ман С.М., Суббарао Малиредди Р.К., Карки Р., Кесавардхана С., Плейс Д.Э., Нил Г., Фогель П., Каннеганти Т.Д. (август 2016 г.). «ZBP1/DAI представляет собой врожденный сенсор вируса гриппа, запускающий воспалительные процессы NLRP3 и пути запрограммированной гибели клеток». Наука Иммунология . 1 (2): ааг2045. doi : 10.1126/sciimmunol.aag2045. ПМК 5131924 . ПМИД  27917412. 
10. Кесавардхана С., Куриакосе Т., Гай К.С., Самир П., Малиредди Р.К., Мишра А., Каннеганти Т.Д. (август 2017 г.). «Убиквитинирование ZBP1/DAI и обнаружение вРНП гриппа активируют запрограммированную гибель клеток». Журнал экспериментальной медицины . 214 (8): 2217–2229. дои : 10.1084/jem.20170550. ПМЦ 5551577 . ПМИД  28634194. 
11. Чжан Т., Инь С., Бойд Д.Ф., Куарато Дж., Ингрэм Дж.П., Шубина М. и др. (март 2020 г.). «Z-РНК вируса гриппа индуцируют ZBP1-опосредованный некроптоз». Клетка . 180 (6): 1115–1129.e13. doi : 10.1016/j.cell.2020.02.050. ПМЦ 7153753 . ПМИД  32200799. 
12. Куриакосе Т., Чжэн М., Нил Г., Каннеганти Т.Д. (февраль 2018 г.). «IRF1 является регулятором транскрипции ZBP1, способствующим активации воспаления NLRP3 и гибели клеток во время инфекции вируса гриппа». Журнал иммунологии . 200 (4): 1489–1495. doi : 10.4049/jimmunol.1701538. ПМК 6483084 . ПМИД  29321274. 

дальнейшее чтение

• Ха С.К., Ван Куен Д., Хван ХИ, О Д.Б., Браун Б.А., Ли С.М., Пак Х.Дж., Ан Дж.Х., Ким К.К., Ким Ю.Г. (февраль 2006 г.). «Биохимическая характеристика и предварительное рентгенокристаллографическое исследование доменов ZBP1 человека, связанных с левосторонней Z-ДНК». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1764 (2): 320–3. дои : 10.1016/j.bbapap.2005.12.012. ПМИД  16448869.
• Шварц Т., Бельке Дж., Ловенхаупт К., Хайнеманн У., Рич А. (сентябрь 2001 г.). «Структура комплекса DLM-1-Z-ДНК демонстрирует консервативное семейство Z-ДНК-связывающих белков». Структурная биология природы . 8 (9): 761–5. дои : 10.1038/nsb0901-761 . PMID  11524677. S2CID  22313681.
• Шварц Т., Рулд М.А., Ловенхаупт К., Герберт А., Рич А. (июнь 1999 г.). «Кристаллическая структура Zalpha-домена человеческого фермента редактирования ADAR1, связанного с левосторонней Z-ДНК». Наука . 284 (5421): 1841–5. дои : 10.1126/science.284.5421.1841. ПМИД  10364558.