stringtranslate.com

Коагулин

Мечехвосты Limulus polyphemus используют коагулин для образования гелевых сгустков

Коагулин — это гелеобразующий белок гемолимфы , который препятствует распространению бактериальных и грибковых захватчиков, обездвиживая их. Он вырабатывается в форме коагулогена, а затем расщепляется в активную форму через каскад сериновых протеиназ. [1] [2] [3] Он был наиболее подробно изучен у мечехвостов . Он также вырабатывался другими организмами, такими как Bacillus coagulans I 4, в плазмидной локализации. [4] В медицине коагуляция коагулина является основой обнаружения бактериального эндотоксина с помощью теста на лизат амебоцитов Limulus для парентеральных препаратов.

Структура

Коагулоген содержит одну полипептидную цепь из 175 остатков, которая расщепляется после Arg-18 и Arg-46 ферментом свертывания Limulus, содержащимся в гранулярных гемоцитарных клетках гемолимфы. Инициируется путь, в котором в конечном итоге фермент свертывания Limulus расщепляет коагулоген до коагулина. Расщепление высвобождает две цепи коагулина, цепи A и B, ковалентно связанные двумя дисульфидными связями , вместе с пептидом C. [1] [2] [5] Складка AB оборачивается вокруг спирального пептида C, образуя компактную структуру. [6] Приблизительная масса коагулина составляет 3-4 кДа по данным SDS-PAGE. [4] Образование геля происходит в результате связывания молекул коагулина. [1] Перед связыванием мономеров коагулина пептид C отщепляется от коагулогена. Удаление пептида C обнажает расширенную гидрофобную полосу вновь расщепленной молекулы, что позволяет взаимодействовать с гидрофобным краем второй молекулы. [6] [7] Известна полная структура коагулогена ( PDB : 1AOC ​); он разделяет то же суперсемейство цитокинов с цистиновым узлом (складку), что и нейротрофины , с несколькими сохраненными цистеинами.

Коагуляция

Коагуляция гемолимфы является частью иммунного ответа беспозвоночных. Факторы внутри гемолимфы активируются и инициируют путь, по которому образуются нерастворимые сгустки, чтобы предотвратить утечку телесных жидкостей и инфицирование организма иммобилизованными микробами. [8] Это имеет решающее значение, поскольку беспозвоночные организмы не имеют адаптивной иммунной системы, сопоставимой с иммунной системой млекопитающих. [7] У ракообразных коагуляция гемолимфы зависит от опосредованного трансглутаминазой перекрестного связывания специфических белков свертывания плазмы, но без протеолитического каскада. [9]

У мечехвостов каскад протеолитической коагуляции запускается липополисахаридами и бета-1,3-глюканами . В гемолимфе мечехвостов есть два типа гемоцитов: гранулярные и негранулярные. Гранулярные гемоциты активируются бактериальными эндотоксинами липополисахаридами (ЛПС), которые находятся на поверхности грамотрицательных бактерий. «... ЛПС составляют приблизительно 70% внешних мембран грамотрицательных бактерий». [10] Они также активируются бета-1,3-глюканами, которые находятся на клеточных стенках дрожжей и некоторых грибов. [5] [7]

В пути, активируемом ЛПС, ЛПС активирует зимогенный фактор C. Он автокаталитически превращается в активированную форму фактора C. Активный фактор C преобразует неактивный фактор B в активный фактор B. Активный фактор B преобразует прокоагулирующий фермент в коагулирующий фермент . [5] Коагулирующий фермент расщепляет коагулоген на коагулины , в результате чего образуются нековалентные гомополимеры коагулинов посредством взаимодействия голова к хвосту.

В пути, активированном бета-1,3-глюканом, есть небольшие различия. Бета-1,3-глюкан активирует зимогенный фактор G. Он автокаталитически превращается в активированный формфактор G. Отсюда путь сходится в путь, активированный ЛПС. Активный фактор G преобразует прокоагуляционный фермент в коагуляционный фермент для расщепления коагулогена в коагулин . [5] В обоих путях образование геля происходит, когда конечный фермент трансглутаминаза сшивает коагулин. [7]

Однако трансглютаминаза мечехвоста не сшивает коагулины межмолекулярно. Недавно было обнаружено, что коагулины сшиваются на поверхностных белках гемоцитов, называемых проксинами. Это указывает на то, что реакция сшивания на заключительном этапе коагуляции гемолимфы является важной врожденной иммунной системой мечехвостов. [9]

Для сравнения, свертывание крови млекопитающих отличается от свертывания гемолимфы. Свертывание крови млекопитающих в значительной степени зависит от тромбоцитов и фибрина, тогда как гемолимфа не содержит тромбоцитов или фибрина, а содержит гемоциты. [ требуется ссылка ] Свертывание крови млекопитающих основано на протеолитически индуцированной полимеризации фибриногенов . Существует два пути (тканевой фактор и контакт), которые приводят к тому, что тромбин превращает фибриноген в фибрин. Мономеры фибрина нековалентно взаимодействуют друг с другом и полимеризуются, образуя сгусток крови. [11] Фибрин и коагулин аналогичны друг другу. Сходства между свертыванием крови млекопитающих и свертыванием гемолимфы включают образование геля, ТГазу и служат частью заживления ран. [7] Однако сгусток, образующийся при свертывании гемолимфы, мягче, чем сгусток фибрина млекопитающих. [5] [7]

Использует

Лимулустест лизата амебоцитов

Лизат амебоцитов Limulus встречается только у мечехвостов, в частности у вида Limulus polyphemus . В присутствии бактериальных эндотоксинов (ЛПС) и бета-1,3-глюканов он инициирует пути коагуляции. Он используется как одобренный FDA метод анализа для проверки стерильности медицинских инструментов и инъекционных препаратов, например, в фармацевтической промышленности. [12]

С 1970-х годов тест на лизат амебоцитов Limulus использовался для проверки образцов крови человека на наличие эндотоксинов. Первоначальный метод ( тест на гелеобразование Limulus ) включал качественный поиск образования коагуляционного геля. После одного часа инкубации, если образец коагулировался, он образовывал твердый сгусток, который был положительным на эндотоксины. Если образец не коагулировался, он был жидким и был отрицательным на эндотоксины. [10] Однако этот метод был ограничен своей чувствительностью. [13]

Сегодня тест Limulus в сто раз более чувствителен и использует хромогенный метод обнаружения. [5] Когда коагулоген расщепляется ферментом свертывания, образуется коагулин . Однако фермент свертывания также производит хромогенный конечный продукт, известный как pNA. pNA (Boc-Leu-Gly-Arg-p-нитроанилид) является хромогенным продуктом, который испускает желтый цвет. [14] [15] Концентрацию эндотоксинов в образце можно рассчитать, измерив поглощение высвобожденного pNA при 405 нм. [5] [15]

Эволюция

Коагулин обнаружен у четырех видов мечехвостов: Limulus polyphemus , Tachypleus tridentatus , Tachypleus gigas и Carcinoscorpius rotundicauda . Они считаются «живыми ископаемыми», поскольку существуют уже 445–500 миллионов лет и практически не изменились по сравнению со своими предками. [7] [12] Предшественник коагулина, коагулоген, имеет частоту мутаций 1,2 x 10−9 на аминокислоту в год по сравнению с его аналогом у млекопитающих, фибриногеном, с частотой мутаций 8,3 x 10−9 . [ 7] Он содержится в гемоцитах, типе фагоцитов . Существуют различные типы фагоцитов, и они встречаются во всех группах беспозвоночных (как гемоциты, амебоциты или целомоциты). Сравнивая позвонки и системы коагуляции Limulus polyphemus , ни один из каскадных белков (включая коагулоген) не имеет общего домена белка, за исключением двух: гемолектина и ТГазы. Хотя эти две системы функционально схожи, белки коагуляции «имеют разную эволюционную историю». [16]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc Шримал С, Мията Т, Кавабата С, Мията Т, Иванага С (август 1985 г.). «Полная аминокислотная последовательность коагулогена, выделенная из мечехвоста Carcinoscorpius rotundicauda из Юго-Восточной Азии». Журнал биохимии . 98 (2): 305–318. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a135283. ПМИД  3905780.
  2. ^ аб Мията Т., Усуи К., Иванага С. (июнь 1984 г.). «Аминокислотная последовательность коагулогена, выделенная из мечехвоста Юго-Восточной Азии Tachypleus gigas». Журнал биохимии . 95 (6): 1793–1801. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a134792. ПМИД  6469947.
  3. ^ Loof TG, Mörgelin M, Johansson L, Oehmcke S, Olin AI, Dickneite G и др. (сентябрь 2011 г.). «Коагуляция, наследственный каскад сериновых протеаз, выполняет новую функцию в ранней иммунной защите». Blood . 118 (9): 2589–2598. doi : 10.1182/blood-2011-02-337568 . PMID  21613262. S2CID  16041445.
  4. ^ ab Hyronimus B, Le Marrec C, Urdaci MC (июль 1998 г.). «Коагулин, бактериоцин-подобное ингибирующее вещество, вырабатываемое Bacillus coagulans I4». Журнал прикладной микробиологии . 85 (1): 42–50. doi : 10.1046/j.1365-2672.1998.00466.x . PMID  9721655. S2CID  27449682.
  5. ^ abcdefg Iwanaga S (май 2007). «Биохимический принцип теста Limulus для обнаружения бактериальных эндотоксинов». Труды Японской академии. Серия B, Физические и биологические науки . 83 (4): 110–119. Bibcode :2007PJAB...83..110I. doi : 10.2183/pjab.83.110. PMC 3756735. PMID  24019589. 
  6. ^ ab Bergner A, Oganessyan V, Muta T, Iwanaga S, Typke D, Huber R, Bode W (декабрь 1996 г.). «Кристаллическая структура коагулогена, белка свертывания крови из мечехвоста: структурный гомолог фактора роста нервов». The EMBO Journal . 15 (24): 6789–6797. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb01070.x. PMC 452504 . PMID  9003754. 
  7. ^ abcdefgh Иванага С., Кавабата С. (сентябрь 1998 г.). «Эволюция и филогения защитных молекул, связанных с врожденным иммунитетом у мечехвоста». Frontiers in Bioscience . 3 (4): D973–D984. doi : 10.2741/A337 . PMID  9727083.
  8. ^ "Свертывание гемолимфы". QuickGO . Европейский институт биоинформатики. GO:0042381.
  9. ^ ab Osaki T, Kawabata S (июнь 2004 г.). «Структура и функция коагулогена, свертываемого белка у мечехвостов». Cellular and Molecular Life Sciences . 61 (11): 1257–1265. doi :10.1007/s00018-004-3396-5. PMC 11138774 . PMID  15170505. S2CID  24537601. 
  10. ^ ab Tinker-Kulberg R, Dellinger K, Brady TE, Robertson L, Levy JH, Abood SK и др. (2020-04-01). «Аквакультура мечехвостов как устойчивый источник тестирования эндотоксинов». Frontiers in Marine Science . 7. doi : 10.3389/fmars.2020.00153 . ISSN  2296-7745.
  11. ^ Смит СА, Трэверс РДж, Моррисси ДжХ (2015-07-04). «Как все начинается: Инициирование каскада свертывания». Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 50 (4): 326–336. doi :10.3109/10409238.2015.1050550. PMC 4826570. PMID  26018600 . 
  12. ^ ab "Факты о мечехвостых крабах и часто задаваемые вопросы". Комиссия по охране рыб и дикой природы Флориды . Получено 27.11.2023 .
  13. ^ Novitsky TJ (декабрь 1994 г.). «Обнаружение эндотоксина в крови человека с помощью лизата амебоцитов Limulus (LAL)». Журнал исследований эндотоксинов . 1 (4): 253–263. doi : 10.1177/096805199400100407 . ISSN  0968-0519. S2CID  85838507.
  14. ^ "Тест на бактериальный эндотоксин". Wako LAL System . Получено 2023-11-27 .
  15. ^ ab Sandle T (2016). «Тестирование эндотоксинов и пирогенов». Фармацевтическая микробиология . Elsevier. стр. 131–145. doi :10.1016/b978-0-08-100022-9.00011-6. ISBN 9780081000229.
  16. ^ Coban A, Bornberg-Bauer E, Kemena C (декабрь 2022 г.). «Эволюция доменов белков каскада свертывания крови позвоночных». Журнал молекулярной эволюции . 90 (6): 418–428. Bibcode : 2022JMolE..90..418C . doi : 10.1007/s00239-022-10071-3. PMC 9643190. PMID  36181519. 
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR000275