stringtranslate.com

Элемент Sxy 5′ UTR

Элемент Sxy 5′ UTR представляет собой элемент РНК , который контролирует экспрессию гена sxy в H. influenzae . Ген sxy представляет собой фактор транскрипции (также известный как TfoX), который регулирует компетентность , то есть способность бактерий поглощать ДНК из окружающей среды. [1] Когда ген sxy удаляется, бактерия теряет способность экспрессировать гены в регулоне компетентности. Кэмерон и др. недавно показали, что мутации в 5′ конце гена sxy приводят к гиперкомпетентности. [2] Они показали, что этот регион образует вторичную структуру РНК, которая закрывает последовательность Шайна-Дальгарно . Мутации, которые нарушают стабильность этой вторичной структуры, приводят к повышенной трансляции sxy с последующей регуляцией регулона компетентности. [2]

РНК tfoR

У другого гамма-протеобактерия Vibrio cholerae используется другая система регуляции РНК. [3] Здесь sRNA под названием «tfoR» положительно регулирует экспрессию белка sxy (tfoX). [4]

Элемент РНК реагирует на хитин , который является важным регулятором компетентности в V. cholera . [5] Удаление tfoR удалило всю компетентность для экзогенной ДНК в V. cholera in vivo . [3]

Ссылки

  1. ^ Redfield RJ (сентябрь 1991 г.). "sxy-1, мутация Haemophilus influenzae, вызывающая значительное повышение спонтанной компетентности". J. Bacteriol . 173 (18): 5612–5618. PMC  208288. PMID  1653215 .
  2. ^ ab Cameron AD, Volar M, Bannister LA, Redfield RJ (январь 2008 г.). «Вторичная структура РНК регулирует трансляцию sxy и развитие компетентности у Haemophilus influenzae». Nucleic Acids Res . 36 (1): 10–20. doi :10.1093/nar/gkm915. PMC 2248739. PMID  17981840 . 
  3. ^ ab Ямамото, С; Морита, М; Изумия, Х; Ватанабе, Х (1 июня 2010 г.). «Дисахарид хитина (GlcNAc)2 индуцирует естественную компетентность в Vibrio cholerae посредством транскрипционной и трансляционной активации положительного регуляторного гена tfoXVC». Gene . 457 (1–2): 42–49. doi :10.1016/j.gene.2010.03.003. PMID  20302923.
  4. ^ Ямамото, С.; Изумия, Х.; Митобе, Дж.; Морита, М.; Аракава, Э.; Охниши, М.; Ватанабе, Х. (апрель 2011 г.). «Идентификация индуцированной хитином малой РНК, которая регулирует трансляцию гена tfoX, кодирующего положительный регулятор естественной компетентности в Vibrio cholerae». Журнал бактериологии . 193 (8): 1953–1965. doi : 10.1128/JB.01340-10. PMC 3133033. PMID  21317321. 
  5. ^ Meibom, KL; Blokesch, M; Dolganov, NA; Wu, CY; Schoolnik, GK (16 декабря 2005 г.). «Хитин вызывает естественную компетентность у Vibrio cholerae». Science . 310 (5755): 1824–1827. doi :10.1126/science.1120096. PMID  16357262.

Внешние ссылки