Гомохиральность — это однородность хиральности или хиральности. Объекты хиральны, когда они не могут быть наложены на свои зеркальные отражения. Например, левая и правая руки человека являются приблизительно зеркальными отражениями друг друга, но не являются своими собственными зеркальными отражениями, поэтому они хиральны. В биологии 19 из 20 природных аминокислот являются гомохиральными, будучи L -хиральными (левосторонними), в то время как сахара являются D -хиральными (правосторонними). [1] Гомохиральность может также относиться к энантиомерным веществам, в которых все компоненты являются одним и тем же энантиомером (правосторонней или левосторонней версией атома или молекулы), но некоторые источники не одобряют такое использование термина.
Неясно, имеет ли гомохиральность цель; однако, по-видимому, она является формой хранения информации. [2] Одно из предположений заключается в том, что она снижает энтропийные барьеры при образовании крупных организованных молекул. [3] Экспериментально подтверждено, что аминокислоты образуют большие агрегаты в большем количестве из энантиомерно чистых образцов аминокислоты, чем из рацемических (энантиомерно смешанных) образцов. [3]
Неясно, возникла ли гомохиральность до или после возникновения жизни, и было предложено множество механизмов ее происхождения. [4] Некоторые из этих моделей предлагают три отдельных шага: нарушение зеркальной симметрии создает небольшой энантиомерный дисбаланс, хиральное усиление строится на этом дисбалансе, а хиральная передача представляет собой передачу хиральности от одного набора молекул к другому.
Аминокислоты являются строительными блоками пептидов и ферментов , в то время как цепи сахар-пептид являются основой РНК и ДНК . [5] [6] В биологических организмах аминокислоты появляются почти исключительно в левосторонней форме ( L -аминокислоты), а сахара - в правосторонней форме (R-сахара). [7] [ требуется проверка ] Поскольку ферменты катализируют реакции, они обеспечивают гомохиральность большому количеству других химических веществ, включая гормоны , токсины, ароматизаторы и пищевые ароматизаторы. [8] : 493–494 Глицин ахирален, как и некоторые другие непротеиногенные аминокислоты , которые либо ахиральны (например, диметилглицин ), либо имеют D- энантиомерную форму.
Биологические организмы легко различают молекулы с разной хиральностью. Это может влиять на физиологические реакции, такие как запах и вкус. Карвон , терпеноид , содержащийся в эфирных маслах , пахнет мятой в L-форме и тмином в R-форме. [8] : 494 [ требуется проверка ] Лимонен имеет вкус цитрусовых, если он правша, и сосны, если он левша. [9] : 168
Гомохиральность также влияет на реакцию на лекарства. Талидомид в своей левосторонней форме лечит утреннюю тошноту ; в своей правосторонней форме он вызывает врожденные дефекты. [9] : 168 К сожалению, даже если вводится чистая левосторонняя версия, часть ее может преобразоваться в правостороннюю форму у пациента. [10] Многие лекарства доступны как в виде рацемической смеси (равные количества обеих хиральностей), так и в виде энантиочистого препарата (только одна хиральность). В зависимости от производственного процесса, энантиочистые формы могут быть более дорогими в производстве, чем стереохимические смеси. [9] : 168
Хиральные предпочтения также могут быть обнаружены на макроскопическом уровне. Раковины улиток могут быть спиралями правого или левого вращения, но одна или другая форма является строго предпочтительной у данного вида. У съедобной улитки Helix pomatia только одна из 20 000 является левой спиралью. [11] : 61–62 Скручивание растений может иметь предпочтительную хиральность, и даже жевательное движение коров имеет 10% избыток в одном направлении. [12]
Теории происхождения гомохиральности в молекулах жизни можно классифицировать как детерминированные или основанные на случайности в зависимости от их предлагаемого механизма. Если существует связь между причиной и следствием — то есть, определенное хиральное поле или влияние, вызывающее нарушение зеркальной симметрии — теория классифицируется как детерминированная; в противном случае она классифицируется как теория, основанная на случайных (в смысле случайности) механизмах. [13]
Другая классификация различных теорий происхождения биологической гомохиральности может быть сделана в зависимости от того, возникла ли жизнь до этапа энантиодискриминации (биотические теории) или после него (абиотические теории). Биотические теории утверждают, что гомохиральность является просто результатом естественного процесса автоусиления жизни — что либо формирование жизни, предпочитающей одну или другую хиральность, было случайным редким событием, которое произошло с наблюдаемыми нами хиральностями, либо что все хиральности жизни возникли быстро, но из-за катастрофических событий и сильной конкуренции другие ненаблюдаемые хиральные предпочтения были уничтожены преобладанием и метаболическим, энантиомерным обогащением от «выигрышных» выборов хиральности. [ необходима цитата ] Если бы это было так, то должны были бы быть найдены остатки вымершего знака хиральности. Поскольку это не так, в настоящее время биотические теории больше не поддерживаются.
Возникновение консенсуса хиральности как естественного процесса автоусиления также было связано со вторым законом термодинамики . [14]
Детерминированные теории можно разделить на две подгруппы: если начальное хиральное влияние имело место в определенном пространстве или времени (усредняясь до нуля по достаточно большим областям наблюдения или периодам времени), теория классифицируется как локально детерминированная; если хиральное влияние постоянно в момент, когда произошел хиральный отбор, то она классифицируется как универсально детерминированная. Группы классификации для локальных детерминированных теорий и теорий, основанных на случайных механизмах, могут перекрываться. Даже если внешнее хиральное влияние создало начальный хиральный дисбаланс детерминированным образом, итоговый знак может быть случайным, поскольку внешнее хиральное влияние имеет свой энантиомерный аналог в другом месте.
В детерминированных теориях энантиомерный дисбаланс создается из-за внешнего хирального поля или влияния, и конечный знак, запечатленный в биомолекулах, будет обусловлен им. Детерминированные механизмы для получения нерацемических смесей из рацемических исходных материалов включают: асимметричные физические законы, такие как электрослабое взаимодействие (через космические лучи [15] ) или асимметричные среды, такие как вызванные циркулярно поляризованным светом, кварцевыми кристаллами или вращением Земли, β-радиолизом или магнитохиральным эффектом. [16] [17] Наиболее принятой универсальной детерминированной теорией является электрослабое взаимодействие. После установления хиральность будет выбрана для. [18]
Одно из предположений заключается в том, что открытие энантиомерного дисбаланса в молекулах в метеорите Мерчисон подтверждает внеземное происхождение гомохиральности: есть доказательства существования циркулярно поляризованного света , возникающего в результате рассеяния Ми на выровненных межзвездных частицах пыли, что может вызвать образование энантиомерного избытка в хиральном материале в космосе. [11] : 123–124 Межзвездные и околозвездные магнитные поля могут выстраивать частицы пыли таким образом. [19] Другое предположение (гипотеза Вестера-Ульбрихта) предполагает, что фундаментальная хиральность физических процессов, таких как хиральность бета-распада (см. Нарушение четности ), приводит к несколько иным периодам полураспада биологически значимых молекул.
Теории вероятности основаны на предположении, что « Абсолютный асимметричный синтез, т. е. образование энантиомерно обогащенных продуктов из ахиральных предшественников без вмешательства хиральных химических реагентов или катализаторов, на практике неизбежен только по статистическим причинам ». [20]
Рассмотрим рацемическое состояние как макроскопическое свойство, описываемое биномиальным распределением; эксперимент по подбрасыванию монеты, где два возможных результата — два энантиомера, является хорошей аналогией. Дискретное распределение вероятностей получения n успехов из испытаний Бернулли, где результат каждого испытания Бернулли происходит с вероятностью , а противоположный — с вероятностью, задается как:
.
Дискретное распределение вероятностей наличия молекул одной и другой хиральности определяется по формуле:
.
Как и в эксперименте по подбрасыванию монеты, в этом случае мы предполагаем, что оба события ( или ) равновероятны, . Вероятность наличия одинакового количества обоих энантиомеров обратно пропорциональна квадратному корню из общего числа молекул . Для одного моля рацемического соединения, молекул, эта вероятность становится . Вероятность обнаружения рацемического состояния настолько мала, что мы можем считать ее пренебрежимо малой.
В этом сценарии необходимо усилить начальный стохастический энантиомерный избыток с помощью любого эффективного механизма усиления. [4] Наиболее вероятный путь для этого этапа усиления — асимметричный автокатализ . Автокаталитическая химическая реакция — это та, в которой продукт реакции сам по себе является реактивным, другими словами, химическая реакция является автокаталитической, если продукт реакции сам по себе является катализатором реакции. При асимметричном автокатализе катализатором является хиральная молекула, что означает, что хиральная молекула катализирует свое собственное производство. Начальный энантиомерный избыток, такой как тот, который может быть получен поляризованным светом, затем позволяет более распространенному энантиомеру вытеснить другой.
В 1953 году Чарльз Франк предложил модель, демонстрирующую, что гомохиральность является следствием автокатализа . [21] [22] В его модели L- и D- энантиомеры хиральной молекулы автокаталитически образуются из ахиральной молекулы A.
подавляя друг друга посредством реакции, которую он назвал взаимным антагонизмом
В этой модели рацемическое состояние нестабильно в том смысле, что малейший энантиомерный избыток будет усилен до полностью гомохирального состояния. Это можно показать, вычислив скорости реакции из закона действующих масс :
где — константа скорости автокаталитических реакций, — константа скорости реакции взаимного антагонизма, а концентрация А для простоты сохраняется постоянной.
Аналитические решения для найдены как . Отношение увеличивается более чем экспоненциально, если положительно (и наоборот). Каждое начальное условие, отличное от
приводят к одной из асимптот или . Таким образом, равенство и , а также и представляет собой состояние неустойчивого равновесия, причем этот результат зависит от наличия члена, представляющего взаимный антагонизм.
Определяя энантиомерный избыток как
Скорость изменения энантиомерного избытка можно рассчитать с помощью цепного правила из скорости изменения концентраций энантиомеров L и D.
Линейный анализ устойчивости этого уравнения показывает, что рацемическое состояние нестабильно. Начиная почти отовсюду в концентрационном пространстве, система эволюционирует в гомохиральное состояние.
Обычно считается, что автокатализ сам по себе не приводит к гомохиральности, и наличие взаимно антагонистических отношений между двумя энантиомерами необходимо для нестабильности рацемической смеси. Однако недавние исследования показывают, что гомохиральность может быть достигнута из автокатализа при отсутствии взаимно антагонистических отношений, но базовый механизм нарушения симметрии отличается. [4] [23]
Существует несколько лабораторных экспериментов, которые демонстрируют, как небольшое количество одного энантиомера в начале реакции может привести к большому избытку одного энантиомера в качестве продукта. Например, реакция Соаи является автокаталитической . [24] [25] Если реакция начинается с некоторым из одного из энантиомеров продукта, который уже присутствует, продукт действует как энантиоселективный катализатор для получения большего количества того же энантиомера. [26] Первоначальное присутствие всего лишь 0,2 эквивалента одного энантиомера может привести к 93% энантиомерному избытку продукта.
Другое исследование [27] касается катализируемого пролином аминоксилирования пропионового альдегида нитрозобензолом . В этой системе небольшой энантиомерный избыток катализатора приводит к большому энантиомерному избытку продукта.
Кластеры сериновых октамеров [28] [29] также являются претендентами. Эти кластеры из 8 молекул серина появляются в масс-спектрометрии с необычным гомохиральным предпочтением, однако нет никаких доказательств того, что такие кластеры существуют в неионизирующих условиях, а поведение аминокислотной фазы гораздо более релевантно пребиотическому. [30] Недавнее наблюдение, что частичная сублимация 10% энантиообогащенного образца лейцина приводит к обогащению до 82% в сублимате, показывает, что энантиообогащение аминокислот может происходить в космосе. [31] Процессы частичной сублимации могут происходить на поверхности метеоров, где существуют большие колебания температуры. Это открытие может иметь последствия для разработки Mars Organic Detector, запуск которого запланирован на 2013 год, и который направлен на извлечение следовых количеств аминокислот с поверхности Марса именно методом сублимации.
Высокая асимметричная амплификация энантиомерного избытка сахаров также присутствует в катализируемом аминокислотами асимметричном образовании углеводов [32]
Одно классическое исследование включает эксперимент, который проводится в лаборатории. [33] Когда хлорату натрия дают кристаллизоваться из воды, а собранные кристаллы исследуют в поляриметре , каждый кристалл оказывается хиральным и либо в форме L , либо в форме D. В обычном эксперименте количество собранных кристаллов L равно количеству кристаллов D (с поправкой на статистические эффекты). Однако, когда раствор хлората натрия перемешивают во время процесса кристаллизации, кристаллы являются либо исключительно L , либо исключительно D. В 32 последовательных экспериментах по кристаллизации 14 экспериментов дают D -кристаллы, а 18 других - L -кристаллы. Объяснение этого нарушения симметрии неясно, но связано с автокатализом, происходящим в процессе зародышеобразования .
В родственном эксперименте кристаллическая суспензия рацемического производного аминокислоты при непрерывном перемешивании приводит к 100% кристаллической фазе одного из энантиомеров, поскольку энантиомерная пара способна уравновешиваться в растворе (сравните с динамическим кинетическим разрешением ). [34]
После того, как в системе произошло значительное энантиомерное обогащение, передача хиральности через всю систему является обычной. Этот последний шаг известен как шаг хиральной передачи. Многие стратегии в асимметричном синтезе построены на хиральной передаче. Особенно важен так называемый органокатализ органических реакций пролином, например, в реакциях Манниха .
Некоторые предлагаемые модели передачи хиральной асимметрии — это полимеризация, [35] [36] [37 ] [38] [39] [40] эпимеризация [41] [42] или сополимеризация. [43] [44]
Исследование/эксперимент по гомохиральности, проведенный Ш. Фурканом Озтюрком в статье «Новый взгляд на происхождение биологической гомохиральности», дает нам «новый взгляд на происхождение биологической гомохиральности».
В своей диссертации он говорит : «Мы изучили спин-селективную кристаллизацию рацемического рибоаминооксазолина (RAO), центрального предшественника РНК , на поверхностях магнетита ( Fe3O4 ), достигая гомохиральности за два этапа кристаллизации. Более того, мы показали вызванное хиральностью лавинное намагничивание магнетита молекулами RAO, что подтверждает обратную природу эффекта и допускает кооперативную обратную связь между хиральными молекулами и магнитными поверхностями. Наконец, основываясь на эмпирических данных, мы предлагаем путь, по которому достигнутая гомохиральность в одном хиральном соединении, RAO, может эффективно распространяться по всей пребиотической сети, начиная с D-нуклеиновых кислот, до L-пептидов, а затем до гомохиральных метаболитов».
Наши результаты демонстрируют пребиотически вероятный способ достижения гомохиральности на системном уровне из полностью рацемических исходных материалов посредством процесса, инициируемого физической средой».
Не существует теории, объясняющей корреляции между L -аминокислотами. Если взять, например, аланин , имеющий небольшую метильную группу, и фенилаланин , имеющий большую бензильную группу, то простой вопрос заключается в том, в каком аспекте L -аланин больше похож на L -фенилаланин, чем на D -фенилаланин, и какой механизм вызывает выбор всех L -аминокислот, поскольку вполне возможно, что аланин был L , а фенилаланин был D.
В 2004 году было сообщено [45], что избыток рацемического D , L -аспарагина (Asn), который спонтанно образует кристаллы любого изомера во время перекристаллизации, вызывает асимметричное разделение сосуществующей рацемической аминокислоты, такой как аргинин (Arg), аспарагиновая кислота (Asp), глутамин (Gln), гистидин (His), лейцин (Leu), метионин (Met), фенилаланин (Phe) , серин (Ser), валин (Val), тирозин (Tyr) и триптофан (Trp). Энантиомерный избыток ee = 100 × ( L - D )/( L + D ) этих аминокислот коррелировал почти линейно с избытком индуктора, т. е. Asn. При перекристаллизации из смеси 12 D , L -аминокислот (Ala, Asp, Arg, Glu, Gln, His, Leu, Met, Ser, Val, Phe и Tyr) и избытка D , L -Asn все аминокислоты с одинаковой конфигурацией с Asn предпочтительно сокристаллизовались. [45] Было неважно, происходило ли обогащение в L- или D -Asn, однако, как только выбор был сделан, сосуществующая аминокислота с одинаковой конфигурацией у α-углерода была предпочтительно вовлечена из-за термодинамической стабильности в образование кристалла. Сообщалось, что максимальный ее составляет 100%. На основании этих результатов предполагается, что смесь рацемических аминокислот вызывает спонтанное и эффективное оптическое разрешение, даже если асимметричный синтез одной аминокислоты не происходит без помощи оптически активной молекулы.
Это первое исследование, обоснованно объясняющее образование хиральности из рацемических аминокислот с помощью экспериментальных доказательств.
Этот термин был введен Кельвином в 1904 году, в год публикации им Балтиморской лекции 1884 года. Кельвин использовал термин гомохиральность как отношение между двумя молекулами, т. е. две молекулы являются гомохиральными, если они имеют одинаковую хиральность. [32] [46] Однако в последнее время термин гомохиральный используется в том же смысле, что и энантиомерно чистый. Это разрешено в некоторых журналах (но не поощряется), [47] : 342 [48] его значение меняется на предпочтение процесса или системы для одного оптического изомера в паре изомеров в этих журналах.
{{cite journal}}
: CS1 maint: multiple names: authors list (link){{cite journal}}
: CS1 maint: multiple names: authors list (link){{cite journal}}
: CS1 maint: multiple names: authors list (link){{cite journal}}
: CS1 maint: multiple names: authors list (link)