stringtranslate.com

Лиссавирус

Лиссавирус (от греческого λύσσα lyssa «ярость, ярость, бешенство» и латинского вируса ) [1] [2] — род РНК-вирусов семейства Rhabdoviridae , порядка Mononegavirales . Млекопитающие, включая человека, могут служить естественными хозяевами . [3] [4] Род Lyssavirus включает возбудителя ( вирус бешенства ) бешенства . [5]

Таксономия

Вирусология

Состав

Лиссавирионы имеют оболочку и имеют пулевидную форму. Эти вирионы имеют ширину около 75 нм и длину 180 нм. [3] Лиссавирионы обладают спиральной симметрией, поэтому их инфекционные частицы имеют приблизительно цилиндрическую форму. Это типично для вирусов, поражающих растения. Вирионы вирусов, инфицирующих человека, чаще имеют кубическую симметрию и принимают форму, приближающуюся к правильным многогранникам . [ нужна цитата ]

Структура состоит из шипованной внешней оболочки , средней области, состоящей из матриксного белка М, и внутренней области рибонуклеокапсидного комплекса, состоящей из генома, связанного с другими белками. [ нужна цитата ]

Геном

Геномы лиссавирусов состоят из одноцепочечной молекулы РНК с отрицательным смыслом, которая кодирует пять вирусных белков: полимеразу L, матричный белок M, фосфопротеин P, нуклеопротеин N и гликопротеин G. Геномы линейные, длиной около 11 КБ. [3]

На основании недавних филогенетических данных лиссавирусы были разделены на семь основных видов . Кроме того, недавно были обнаружены еще пять видов: вирус западно-кавказских летучих мышей, вирус Араван, вирус Худжанд, вирус Иркут и вирус летучих мышей Шимони. [8] [9] Род лиссавирусов можно разделить на четыре филогруппы на основе гомологии последовательностей ДНК. Филогруппа I включает вирусы, такие как вирус бешенства, вирус Дювенхаге, лиссавирус европейских летучих мышей типов 1 и 2, лиссавирус австралийских летучих мышей, вирус Худжанд, лиссавирус летучих мышей Бокело, вирус Иркут и вирус Араван. Филогруппа II содержит вирус летучих мышей Лагос, вирус Мокола и вирус летучих мышей Шимони. Лиссавирус западнокавказских летучих мышей — единственный вирус, входящий в филогруппу III. Лиссавирус Ikoma и лиссавирус летучей мыши Lleida являются примерами филогруппы IV. Лиссавирус летучих мышей Западного Кавказа был отнесен к отдельной филогруппе, поскольку это наиболее дивергентный лиссавирус из всех обнаруженных. [10]

Эволюция

Филогенетические исследования показывают, что первоначальными хозяевами этих вирусов были летучие мыши. [11] Однако недавнее открытие последовательностей лиссавирусов у амфибий и рептилий ставит под сомнение происхождение лиссавирусов у млекопитающих. [12] [13] Большее антигенное разнообразие лиссавирусов из Африки привело к предположению, что Африка была источником этих вирусов. Вместо этого исследование 153 вирусов, собранных в период с 1956 по 2015 год из различных географических мест, предположило палеарктическое происхождение этих вирусов (вероятность 85%). [14] Оценки дат (вероятность 95%) для самого недавнего общего предка были очень широкими – между 3995 и 166 820 годами ранее – что предполагает, что в этой области предстоит провести дальнейшую работу. Хотя летучие мыши эволюционировали в Палеарктике, [15] их происхождение предшествует происхождению лиссавирусов на миллионы лет, что свидетельствует против их совместного видообразования. Скорость эволюции гена N в линии Africa 2 оценивается в 3,75×10 -3 замен на сайт в год. [16] Эта скорость аналогична скорости других РНК-вирусов.

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем прикрепления вирусных G-гликопротеинов к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин-опосредованный эндоцитоз . Репликация соответствует модели репликации вируса с отрицательной цепью РНК. Транскрипция вируса с отрицательной цепью РНК с использованием заикания полимеразы - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем почкования и движения вируса по канальцам. Дикие млекопитающие, особенно летучие мыши и некоторые хищники, служат естественными хозяевами. Пути передачи обычно происходят через укушенные раны. [3]

Тестирование

По состоянию на 2018 год тест на прямые флуоресцентные антитела (DFA) по-прежнему остается золотым стандартом для выявления лиссавирусной инфекции. С начала нового тысячелетия были разработаны тесты ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) на бешенство, но они использовались только в качестве подтверждающего теста. Тесты на основе ПЦР в реальном времени , которые имеют более высокую чувствительность и объективные диагностические пороги и позволяют хранить образцы при комнатной температуре, являются многообещающими с 2005 года, но требуют аппарата для ПЦР в реальном времени и квалифицированных работников с опытом молекулярной диагностики. По данным международной оценки, один анализ TaqMan LN34 позволил обнаружить лиссавирус с высокой чувствительностью (99,90%) по всему роду и высокой специфичностью (99,68%) по сравнению с тестом DFA. Там, где это возможно, он станет основным посмертным диагностическим тестом на бешенство. [17]

Эпидемиология

Классический вирус бешенства распространен на большей части мира и может переноситься любым теплокровным млекопитающим. Остальные лиссавирусы имеют гораздо меньшее разнообразие носителей. Только избранные хозяева могут переносить каждый из этих видов вирусов . Кроме того, эти другие виды характерны только для определенной географической области. Известно, что летучие мыши являются животными- переносчиками всех идентифицированных лиссавирусов, за исключением вируса Мокола . [18]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ λύσσα. Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей» .
  2. ^ вирус. Чарльтон Т. Льюис и Чарльз Шорт. Латинский словарь по проекту «Персей» .
  3. ^ abcd «Вирусная зона». ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
  4. ^ ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Проверено 15 июня 2015 г.
  5. ^ «Вирус - Аннотированная классификация» . Британника . 18 июня 2024 г.
  6. ^ Афонсо CL, Амарасингхе Г.К., Баньяй К., Бао Й., Баслер CF, Бавари С. и др. (август 2016 г.). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2016 г.». Архив вирусологии . 161 (8): 2351–2360. дои : 10.1007/s00705-016-2880-1. ПМЦ 4947412 . ПМИД  27216929. 
  7. ^ «Род: Лиссавирус». Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 18 декабря 2018 г.[ мертвая ссылка ]
  8. ^ Таксономия вирусов: выпуск 2013 г. ictvonline.org
  9. ^ Кузьмин И.В., Хьюз Г.Дж., Ботвинкин А.Д., Орчиари Л.А., Рупрехт CE (июль 2005 г.). «Филогенетические взаимоотношения вирусов Иркута и западнокавказских летучих мышей внутри рода Lyssavirus и предложенные количественные критерии, основанные на последовательности гена N, для определения генотипа лиссавируса». Вирусные исследования . 111 (1): 28–43. doi : 10.1016/j.virusres.2005.03.008. ПМИД  15896400.
  10. ^ Гулд А.Р., Каттенбелт Дж.А., Гамли С.Г., Лант Р.А. (октябрь 2002 г.). «Характеристика варианта лиссавируса австралийской летучей мыши, выделенного от насекомоядной летучей мыши». Вирусные исследования . 89 (1): 1–28. дои : 10.1016/s0168-1702(02)00056-4. ПМИД  12367747.
  11. ^ Banyard AC, Хейман Д., Джонсон Н., МакЭлхинни Л., Фукс А.Р. (2011). «Летучие мыши и лиссавирусы». Достижения в области исследования вирусов . 79 : 239–289. дои : 10.1016/B978-0-12-387040-7.00012-3. ISBN 978-0-12-387040-7. ПМИД  21601050.
  12. ^ Оберхубер М., Шопф А., Хенрих А.А., Сантос-Мандуджано Р., Хун А.Г., Зейтц С., Ридель С., Конзельманн К.К. (сентябрь 2021 г.). «Гликопротеины предсказанных лиссавирусов амфибий и рептилий могут опосредовать инфекцию клеток млекопитающих и рептилий». Вирусы . 13 (9): 1726. doi : 10.3390/v13091726 . ПМЦ 8473393 . ПМИД  34578307. 
  13. ↑ Хорие М., Акаши Х., Кавата М., Томонага К. (1 февраля 2021 г.). «Идентификация лиссавируса рептилий у Anolis allogus дала новое представление об эволюции лиссавируса». Гены вирусов . 57 (1): 40–49. doi : 10.1007/s11262-020-01803-y. PMID  33159637. S2CID  226276694.
  14. ^ Хейман Д.Т., Фукс А.Р., Марстон Д.А., Гарсия-Р. Дж.К. (декабрь 2016 г.). «Глобальная филогеография лиссавирусов - оспаривание гипотезы «из Африки»». PLOS Забытые тропические болезни . 10 (12): e0005266. дои : 10.1371/journal.pntd.0005266 . ПМК 5231386 . ПМИД  28036390. 
  15. ^ Тилинг ЕС, Спрингер М.С., Мэдсен О., Бейтс П., О'Брайен С.Дж., Мерфи В.Дж. (январь 2005 г.). «Молекулярная филогения летучих мышей проливает свет на биогеографию и летопись окаменелостей». Наука . 307 (5709): 580–584. Бибкод : 2005Sci...307..580T. дои : 10.1126/science.1105113. PMID  15681385. S2CID  25912333.
  16. ^ Хэ В., Чжан Х., Чжан Ю., Ван Р., Лу С., Цзи Ю. и др. (октябрь 2017 г.). «Смещение использования кодонов в гене N вируса бешенства». Инфекция, генетика и эволюция . 54 : 458–465. дои : 10.1016/j.meegid.2017.08.012. ПМИД  28818621.
  17. ^ Гиганте CM, Деттингер Л., Пауэлл Дж.В., Сейдерс М., Кондори Р.Э., Гриссер Р. и др. (16 мая 2018 г.). «Многоцентровая оценка пан-лиссавирусного анализа RT-PCR в реальном времени для посмертной диагностики бешенства». ПЛОС ОДИН . 13 (5): e0197074. Бибкод : 2018PLoSO..1397074G. дои : 10.1371/journal.pone.0197074 . ПМЦ 5955534 . ПМИД  29768505. 
  18. ^ Производство карт Rabnet/CDC ВОЗ (2008 г.). «Бешенство, страны или районы риска». Всемирная организация здравоохранения. Архивировано из оригинала 9 октября 2010 года.

дальнейшее чтение

Внешние ссылки

Викискладе есть медиафайлы по теме лиссавируса .