Гаплогруппа митохондриальной ДНК человека
Гаплогруппа R — широко распространённая гаплогруппа митохондриальной ДНК (мтДНК) человека. Гаплогруппа R связана с заселением Евразии примерно 70 000 лет назад и распространена в современных популяциях по всему миру за пределами Африки к югу от Сахары . [4]
Гаплогруппа R является потомком макрогаплогруппы N. Среди гаплогрупп-потомков клады R есть B , U (и, следовательно, K ), F , R0 (и, следовательно , HV , H и V ) и JT (предковая гаплогруппа J и T ).
Источник
Соарес и др. (2009) оценивают возраст гаплогруппы R примерно в 50 000–70 000 лет назад. [1]
Это согласуется с появлением в ходе прибрежной миграции из Восточной Африки в Западную, Южную и Юго-Восточную Азию. [5]
Было высказано предположение, что ранняя линия гаплогрупп M, N и R вдоль прибрежного маршрута в период примерно 70 000 - 60 000 лет назад. [6] Северный маршрут из Африки - это еще одна возможность, где экспансия гаплогруппы R может происходить из Юго-Восточной Азии . [7]
Гаплогруппа R имеет широкое разнообразие и древность среди коренного населения Южной Азии. Племена и касты Западной и Южной Индии демонстрируют более высокое разнообразие, чем другие регионы, что, возможно, указывает на их автохтонный статус. [8] Ларруга и др. (2017) обнаружили, что мтДНК R распространилась в Евразию и Австралию из центральной области вдоль побережья Юго-Восточной Азии . [4]
Археогенетика
Ископаемые останки усть-ишимского человека из Сибири, датируемые примерно 45 000 лет назад, принадлежат к гаплогруппе R* (ранее классифицировавшейся как U*). [9] [10]
Гаплогруппа R также была обнаружена среди египетских мумий, раскопанных на археологическом объекте Абусир-эль-Малек в Северном Египте, которые датируются доптолемеевским/поздним периодом Нового царства , птолемеевским и римским периодами. [11]
Субклад R2 был обнаружен в останках неолитического человека из западного Ирана в Тепе Абдул Хосейн. [12]
Распределение
Гаплогруппа R и ее потомки распространены по всей Австралазии , Америке , Юго-Восточной Азии , Южной Азии , Центральной Азии , Западной Азии , Восточной Азии , Европе , Северной Африке и Африканском Роге .
Базальная клада R* обнаружена среди сокотрийцев (1,2%), а также в Северо-Восточной Африке (1,5%), на Ближнем Востоке (0,8%), на Ближнем Востоке (0,8%) и на Аравийском полуострове (0,3%). [13]
Субклады
- Гаплогруппа R
- R0 или пре-HV
- Р1
- пре-JT или R2'JT
- R3 : Найден в Армении. [22] Также обнаружен у древнего человека из Венгрии , возраст которого составляет 7000 лет [23]
- R5 : Широко распространен на индийском субконтиненте . Особенно в Мадхья-Прадеш ( Индия ) — 17%. [24]
- R6'7 (16362) Наиболее значительное присутствие наблюдается среди носителей австроазиатских языков из Индии (10%). [25]
- R8 : Самая высокая частота встречается в Восточной Индии , особенно в Ориссе (12%), и встречается среди австроазиатских племен ( говорящих на языках мунда и кхаси ). Он также присутствует с низкой частотой среди говорящих на дравидийских, индоевропейских и тибето-бирманских языках ( например , ньиши , чангпа , шерпа ). [27]
- Р9 (16304)
- Р11'Б (16189)
- Р12'21
- R14 : Встречается в Папуа-Новой Гвинее [40] и у носителей австронезийского языка в Восточном Тиморе и Лембате . [41]
- R22 или R12: Очень часто встречается в Шомпене ( 10/29 = 34,5%). [42] В других местах встречается в основном в юго-центральной Индонезии (11,4% Матарам , 8,0% Вайнгапу , 7,3% Бали , 1,9% Борнео ) и в Чаме Биньтхуана , Вьетнам (7/168 = 4,2%), [43] с единичными или спорадическими появлениями в Таиланде , Суматре , Яве , Сулавеси и Алоре . [32]
- R23 : Небольшая группа, обнаруженная на Бали и Сумбе (Индонезия). [32]
- Р30
- Р31
- Р32
- П: Характерно для Сахула . Встречается на Филиппинах и в Восточной Индонезии .
- У
Дерево
Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы R основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера « Обновленное всеобъемлющее филогенетическое дерево глобальной вариации митохондриальной ДНК человека» [3] и последующих опубликованных исследованиях.
- Р
- R0 (ранее до HV)
- Р1
- R2'JT
- Р5
- Р6'7
- R8 - Индия
- R8a - Шри-Ланка
- Р8а1
- Р8а1а
- Р8а1а1
- Р8а1а2
- R8a1a3 — Южная Африка, Норвегия
- Р8а1б
- Р8а2
- Р8б
- (16304)
- Р9
- R9b - Камбоджа, Таиланд ( Лао Исан в провинциях Убонратчатхани и Ройэт ), [54] Гвинея
- R9b1 — Китай, Уйгурский, Таиланд ( Пн в Центральном Таиланде , Тайский в Западном Таиланде ), Лаос ( Лаос во Вьентьяне [54] ), Вьетнам ( Ла Хо ), Дания
- R9b1a
- R9b1a1 - Филиппины ( Маманва )
- R9b1a1a — Китай, Таиланд ( Карен и Тай Лю в Северном Таиланде , Лао Исан в провинции Рой Эт , [54] Тай в Центральном Таиланде и Восточном Таиланде ), Камбоджа ( Бантей Минчей ), Малайзия ( Семелаи , коренные малайцы ), Сингапур, Индонезия ( Тенггер , Палембанг , Паданг , Манадо ), Вьетнам ( Гиарай )
- R9b1a2 - Тайвань ( Цоу ), Таиланд ( Лао Исан в провинции Лоэй , Тай в Западном Таиланде )
- R9b1a3 — Таиланд, Китай ( Хань , Дай ), Вьетнам ( Дао , Нунг и др. ), Казахстан
- R9b1b - Китай, Вьетнам, Камбоджа ( Сиемреап ), Таиланд ( Кхонмыанг из провинции Чиангмай , Тайюань из Центрального Таиланда , Мон из Северного Таиланда )
- R9b2 — Таиланд, Камбоджа, Вьетнам
- R9c — Китай (Баргут из Хулун Буир ), Тайвань
- Р9с1
- R9c1a — Филиппины, Индонезия, Тайвань ( Макатао ), Таиланд ( Кхон Муанг из провинции Чианграй )
- Р9с1б
- R9c1b1 - Китай ( хань ), Вьетнам ( кинь , дао ), Таиланд ( Тайдам в провинции Канчанабури , Кхонмыанг в провинции Мэхонгсон , Тайюань в Северном Таиланде , Тайлуэ в Северном Таиланде ), Мьянма
- R9c1b2 — Таиланд ( Кхон Муанг в провинции Чианграй ), Тайвань ( Макатао и др. ), Филиппины ( Ифугао , Бугкалот ), Восточный Тимор
- Ф
- Р22
- Р11'Б (16189)
- Р12'21
- Р22
- Р14
- Р23
- Р30
- Р31
- Р32
- П
- У
Ссылки
- ^ ab Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Maru; Rito, Teresa; Röhl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Stephen; MacAulay, Vincent (2009). «Коррекция очищающего отбора: улучшенные молекулярные часы митохондрий человека». Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–59. doi :10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773 .
- ^ Ларруга, Хосе М. (23 мая 2017 г.). «Носители митохондриальной ДНК макрогаплогруппы R колонизировали Евразию и Австралазию из центральной области юго-восточной Азии». BMC Evolutionary Biology . 17 (1): 115. Bibcode :2017BMCEE..17..115L. doi : 10.1186/s12862-017-0964-5 . PMC 5442693 . PMID 28535779.
- ^ ab Ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2009). «Обновленное всеобъемлющее филогенетическое дерево глобальной вариации митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация . 30 (2): E386–94. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457. S2CID 27566749.
- ^ ab Larruga, Jose M (23 мая 2017 г.). «Носители митохондриальной ДНК макрогаплогруппы R колонизировали Евразию и Австралазию из центральной области юго-восточной Азии». BMC Evolutionary Biology . 17 (1): 115. Bibcode :2017BMCEE..17..115L. doi : 10.1186/s12862-017-0964-5 . PMC 5442693 . PMID 28535779.
- ^ abcd Кармин, Моника (2005). Человеческая митохондриальная ДНК гаплогруппы R в Индии: анализ филогенетического дерева южноазиатских специфичных линий (диссертация на степень магистра наук). Университет Тарту. hdl :10062/567. OCLC 692161090.[ нужна страница ]
- ^ abcd Palanichamy, Malliya Gounder; Sun, Chang; Agrawal, Suraksha; Bandelt, Hans-Jürgen; Kong, Qing-Peng; Khan, Faisal; Wang, Cheng-Ye; Chaudhuri, Tapas Kumar; Palla, Venkatramana (2004). "Филогения митохондриальной ДНК макрогаплогруппы N в Индии на основе полного секвенирования: последствия для заселения Южной Азии". The American Journal of Human Genetics . 75 (6): 966–78. doi :10.1086/425871. PMC 1182158 . PMID 15467980.
- ^ Larruga JM, Marrero P, Abu-Amero KK, Golubenko MV, Cabrera VM (2017). «Носители митохондриальной ДНК макрогаплогруппы R колонизировали Евразию и Австралазию из центральной области юго-восточной Азии». BMC Evolutionary Biology . 17 (1): 115. Bibcode :2017BMCEE..17..115L. doi : 10.1186/s12862-017-0964-5 . PMC 5442693 . PMID 28535779.
- ^ Маджи, Сувенду; Критика, С.; Васул, ТС (2008). «Распространение макрогаплогруппы N митохондриальной ДНК в Индии с особым упором на гаплогруппу R и ее субгаплогруппу U» (PDF) . Международный журнал генетики человека . 8 (1–2): 85–96. дои : 10.1080/09723757.2008.11886022. S2CID 14231815.
- ^ Марреро, Патрисия; Абу-Амеро, Халед К; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М (2016). «Носители макрогаплогруппы M митохондриальной ДНК человека колонизировали Индию из юго-восточной Азии». BMC Evolutionary Biology . 16 (1): 246. Bibcode :2016BMCEE..16..246M. doi : 10.1186/s12862-016-0816-8 . PMC 5105315 . PMID 27832758.
- ^ Ларруга, Хосе М; Марреро, Патрисия; Абу-Амеро, Халед К; Голубенко, Мария В; Кабрера, Висенте М (2017). «Носители митохондриальной ДНК макрогаплогруппы R колонизировали Евразию и Австралазию из центральной области юго-восточной Азии». BMC Evolutionary Biology . 17 (1): 115. Bibcode :2017BMCEE..17..115L. doi : 10.1186/s12862-017-0964-5 . PMC 5442693 . PMID 28535779.
- ^ Schuenemann, Verena J.; et al. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримский период». Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode :2017NatCo...815694S. doi :10.1038/ncomms15694. PMC 5459999 . PMID 28556824.
- ^ Брушаки, Фарназ; Томас, Марк Г.; Линк, Вивиан; Лопес, Сайоа; ван Дорп, Люси; Кирсанов, Карола; Хофманова, Зузана; Дикманн, Йоан; Кэссиди, Лара М.; Диес-дель-Молино, Давид; Кусафанас, Афанасий; Продай, Кристиан; Робсон, Гарри К.; Мартиниано, Руи; Блёхер, Йенс; Шой, Амели; Крейцер, Сюзанна; Боллонгино, Рут; Бобо, Дин; Давуди, Хосейн; Муньос, Оливия; Куррат, Матиас; Абди, Камьяр; Биглари, Ферейдун; Крейг, Оливер Э.; Брэдли, Дэниел Г.; Шеннан, Стивен; Вирама, Кришна Р.; Машкур, Марьян; Вегманн, Дэниел; Хелленталь, Гарретт; Бургер, Иоахим (29 июля 2016 г.). «Ранние неолитические геномы с востока Плодородного полумесяца». Science . 353 (6298): 499–503. Bibcode :2016Sci...353..499B. doi :10.1126/ science.aaf7943. PMC 5113750. PMID 27417496 .
- ^ Черны, Виктор; и др. (2009). «Из Аравии — поселение острова Сокотра, выявленное по митохондриальному и Y-хромосомному генетическому разнообразию» (PDF) . American Journal of Physical Anthropology . 138 (4): 439–447. doi :10.1002/ajpa.20960. PMID 19012329. Архивировано из оригинала (PDF) 6 октября 2016 г. . Получено 13 июня 2016 г. .
- ^ Нон, Эми. «АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДАННЫХ В ИНТЕРДИСЦИПЛИНАРНЫХ РАМКАХ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ НЕДАВНЕЙ ИСТОРИИ ЭВОЛЮЦИИ ЧЕЛОВЕКА И СЛОЖНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ» (PDF) . Университет Флориды. Архивировано из оригинала (PDF) 13 октября 2020 г. . Получено 22 апреля 2016 г. .
- ^ abcd Кинтана-Мурси, Луис; Шейкс, Рафаэль; Уэллс, Р. Спенсер; Бехар, Дорон М.; Сайар, Хамид; Скоццари, Розария; Ренго, Кьяра; Аль-Захери, Надя; Семино, Орнелла (2004). «Там, где Запад встречается с Востоком: сложный ландшафт мтДНК юго-западного и центральноазиатского коридора». Американский журнал генетики человека . 74 (5): 827–45. doi :10.1086/383236. PMC 1181978. PMID 15077202 .
- ^ ab Хельгасон, Агнар; Хики, Эйлин; Гудакр, Сара; Боснес, Видар; Стефанссон, Кари; Уорд, Райк; Сайкс, Брайан (2001). «МтДНК и острова Северной Атлантики: оценка пропорций норвежского и гэльского происхождения». Американский журнал генетики человека . 68 (3): 723–37. doi :10.1086/318785. PMC 1274484. PMID 11179019 .
- ^ аб Абу-Амеро, Халед К; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М; Гонсалес, Ана М (2008). «Структура митохондриальной ДНК на Аравийском полуострове». Эволюционная биология BMC . 8 (1): 45. Бибкод : 2008BMCEE...8...45A. дои : 10.1186/1471-2148-8-45 . ПМК 2268671 . ПМИД 18269758.
- ^ ab Malyarchuk, B.; Grzybowski, T.; Derenko, M.; Perkova, M.; Vanecek, T.; Lazur, J.; Gomolcak, P.; Tsybovsky, I. (2008). "Филогения митохондриальной ДНК у восточных и западных славян". Молекулярная биология и эволюция . 25 (8): 1651–8. doi : 10.1093/molbev/msn114 . PMID 18477584.
- ^ Миттник, Алисса; Ван, Чуан-Чао; Пфренгле, Саския; Даубарас, Мантас; Зариня, Гунита; Халлгрен, Фредрик; Аллмяэ, Райли; Хартанович, Валерий; Моисеев, Вячеслав; Тырв, Мари; Фуртвенглер, Аня (2018-01-30). "Генетическая предыстория региона Балтийского моря". Nature Communications . 9 (1): 442. Bibcode :2018NatCo...9..442M. doi :10.1038/s41467-018-02825-9. ISSN 2041-1723. PMC 5789860 . PMID 29382937.
- ^ Серк, Пийа (2004). Человеческая митохондриальная ДНК гаплогруппа J в Европе и на Ближнем Востоке (диссертация на степень магистра наук). Эстония: Тартуский университет. hdl :10062/777. OCLC 692161303.[ нужна страница ]
- ^ oxfordancestors.com Материнская родословная Архивировано 2017-07-15 в Wayback Machine
- ^ PhyloTree.org Манниса ван Овена – поддерево мтДНК R Архивировано 13 июня 2009 г. на Wayback Machine
- ^ Фу, Цяомэй; Пост, Козимо; Хайдиняк, Матея; Петр, Мартин; Маллик, Свапан; Фернандес, Даниэль; Фуртвенглер, Аня; Хаак, Вольфганг; Мейер, Матиас; Миттник, Алисса; Никель, Биргит (июнь 2016 г.). «Генетическая история Европы ледникового периода». Природа . 534 (7606): 200–205. Бибкод : 2016Natur.534..200F. дои : 10.1038/nature17993. hdl : 10211.3/198594. ISSN 1476-4687. ПМЦ 4943878 . ПМИД 27135931.
- ^ abc Метспалу, Майт; Кивисильд, Тоомас; Метспалу, Эне; Парик, Юри; Худжашов, Георги; Калдма, Катрин; Серк, Пия; Кармин, Моника; Бехар, Дорон М; Гилберт, М Томас П; Эндикотт, Филлип; Мастана, Сарабджит; Папиха, Суриндер С; Скорецкий, Карл; Торрони, Антонио; Виллемс, Ричард (2004). «Большинство сохранившихся границ мтДНК в южной и юго-западной Азии, вероятно, были сформированы во время первоначального заселения Евразии анатомически современными людьми». BMC Genetics . 5 : 26. doi : 10.1186/1471-2156-5-26 . PMC 516768 . PMID 15339343.
- ^ abcdefg Чаубей, Гьянешвер; Кармин, Моника; Мецпалу, Эне; Мецпалу, Мейт; Сельви-Рани, Дипа; Сингх, Виджай; Парик, Юри; Сольник, Ану; Найду, Б. Пратхап; Кумар, Аджай; Адарш, Нихарика; Маллик, Чандана; Триведи, Бхаргав; Пракаш, Свами; Редди, Рамеш; Шукла, Парул; Бхагат, Санджана; Верма, Свати; Васник, Самикша; Хан, Имран; Барва, Аншу; Саху, Дипти; Шарма, Арчана; Рашид, Мамун; Чандра, Вишал; Редди, Алла Г; Торрони, Антонио; Фоли, Роберт А; Тангарадж, Кумарасами; Сингх, Лалджи (2008). "Филогеография мтДНК гаплогруппы R7 на Индийском полуострове". BMC Evolutionary Biology . 8 (1): 227. Bibcode : 2008BMCEE...8..227C. doi : 10.1186/1471-2148-8-227 . PMC 2529308. PMID 18680585.
- ^ abc Chaubey, Gyaneshwer; et al. (4 августа 2008 г.). "Рисунок 4. Распределение частот кладов R7a и R7b на индийском субконтиненте". BMC Evolutionary Biology . 8 (1): 227. Bibcode :2008BMCEE...8..227C. doi : 10.1186/1471-2148-8-227 . PMC 2529308 . PMID 18680585. в Чаубее, Гьянешвер; Кармин, Моника; Мецпалу, Эне; Мецпалу, Мейт; Сельви-Рани, Дипа; Сингх, Виджай; Парик, Юри; Сольник, Ану; Найду, Б. Пратхап; Кумар, Аджай; Адарш, Нихарика; Маллик, Чандана; Триведи, Бхаргав; Пракаш, Свами; Редди, Рамеш; Шукла, Парул; Бхагат, Санджана; Верма, Свати; Васник, Самикша; Хан, Имран; Барва, Аншу; Саху, Дипти; Шарма, Арчана; Рашид, Мамун; Чандра, Вишал; Редди, Алла Г; Торрони, Антонио; Фоли, Роберт А; Тангарадж, Кумарасами; Сингх, Лалджи (2008). "Филогеография мтДНК гаплогруппы R7 на Индийском полуострове". BMC Evolutionary Biology . 8 (1): 227. Bibcode : 2008BMCEE...8..227C. doi : 10.1186/1471-2148-8-227 . PMC 2529308. PMID 18680585.
- ^ Рисунок 4 в Тангарадже, Кумарасами; Нандан, Амрита; Шарма, Вишвас; Шарма, Варун Кумар; Иасвархант, Мутхукришнан; Патра, Прадип Кумар; Сингх, Сандхья; Рекха, Саши; Дуа, Моника; и др. (2009). Ахмед, Нияз (ред.). «Глубокое укоренение in-situ расширения гаплогруппы R8 мтДНК в Южной Азии». ПЛОС ОДИН . 4 (8): е6545. Бибкод : 2009PLoSO...4.6545T. дои : 10.1371/journal.pone.0006545 . ПМК 2718812 . ПМИД 19662095.
- ^ Ян Логан 2009, Haplogrupo R9b, сайт митохондриальной ДНК
- ^ ab Hill, C.; Soares, P.; Mormina, M.; MacAulay, V.; Meehan, W.; Blackburn, J.; Clarke, D.; Raja, JM; Ismail, P. (2006). «Филогеография и этногенез аборигенов Юго-Восточной Азии». Молекулярная биология и эволюция . 23 (12): 2480–91. doi : 10.1093/molbev/msl124 . hdl : 1885/23220 . PMID 16982817.
- ^ Скоулз, Кларисса; Сиддл, Кэтрин; Дюкурно, Аксель; Кривелларо, Федерика; Ярве, Мари; Роотси, Сиири; Беллатти, Мэгги; Таббада, Кристина; Мормина, Мару (2011). «Генетическое разнообразие и доказательства примеси популяции Батак Негритос из Палавана». Американский журнал физической антропологии . 146 (1): 62–72. дои : 10.1002/ajpa.21544. ПМИД 21796613.
- ^ Альберт Мин-Шань Ко, Чунг-Ю Чен, Цяомэй Фу и др. (2014), «Ранние австронезийцы: на Тайване и за его пределами». Американский журнал генетики человека 94, 426–436, 6 марта 2014 г.
- ^ abc Хилл, Кэтрин; Соарес, Педро; Мормина, Мару; Маколей, Винсент; Кларк, Дуги; Блюмбах, Петя Б.; Визуэте-Форстер, Матье; Форстер, Питер; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2007). «Митохондриальная стратиграфия островов Юго-Восточной Азии». Американский журнал генетики человека . 80 (1): 29–43. дои : 10.1086/510412. ПМЦ 1876738 . ПМИД 17160892.
- ^ Деренко, Мирослава; Малярчук Борис; Гжибовский, Томаш; Денисова Галина; Дамбуева Ирина; Перкова, Мария; Доржу, Чодураа; Лузина, Фаина; Ли, Хон Кю (2007). «Филогеографический анализ митохондриальной ДНК в популяциях Северной Азии». Американский журнал генетики человека . 81 (5): 1025–41. дои : 10.1086/522933. ПМК 2265662 . ПМИД 17924343.
- ^ Танака, М.; Кабрера, В.М.; Гонсалес, AM; Ларруга, Дж. М.; Такэясу, Т; Фуку, Н; Го, Эл-Джей; Хиросе, Р; Фудзита, Ю. (2004). «Вариации митохондриального генома в Восточной Азии и заселении Японии». Геномные исследования . 14 (10а): 1832–50. дои : 10.1101/гр.2286304. ПМК 524407 . ПМИД 15466285.
- ^ Хван Ён Ли, Джи-Ын Ю, Мён Джин Пак, Укхи Чунг, Чон-Юл Ким и Кён-Джин Шин, «Определение гаплогруппы мтДНК Восточной Азии у корейцев: анализ SNP кодирующей области на уровне гаплогруппы и анализ последовательности контрольной области на уровне подгаплогруппы». Электрофорез (2006). DOI 10.1002/elps.200600151.
- ^ He, JD; Peng, MS; Quang, HH; Dang, KP; Trieu, AV; et al. (2012). «Патрилинейный взгляд на австронезийскую диффузию в материковой части Юго-Восточной Азии». PLOS ONE . 7 (5): e36437. Bibcode : 2012PLoSO...736437H. doi : 10.1371/journal.pone.0036437 . PMC 3346718. PMID 22586471 .
- ^ Аб Таббада, штат Калифорния; Трежо, Дж.; Лоо, Ж.-Х.; Чен, Ю.-М.; Лин, М.; Миразон-Лар, М.; Кивисилд, Т.; Де Унгрия, MCA (2009). «Разнообразие митохондриальной ДНК Филиппин: населенный виадук между Тайванем и Индонезией?». Молекулярная биология и эволюция . 27 (1): 21–31. дои : 10.1093/molbev/msp215 . ПМИД 19755666.
- ^ Пирсон, М. Дж.; Мартинес-Ариас, Р.; Холланд, Б. Р.; Джеммелл, Н. Дж.; Херлс, М. Э.; Пенни, Д. (2006). «Расшифровка прошлых перемещений населения в Океании: доказуемо оптимальные деревья 127 геномов мтДНК». Молекулярная биология и эволюция . 23 (10): 1966–75. doi :10.1093/molbev/msl063. PMC 2674580. PMID 16855009 .
- ^ Кутанан, Вибху; Кампуансай, Джатупол; Чангмай, Пия; и др. (2018). «Контрастирование материнской и отцовской генетической изменчивости групп охотников-собирателей в Таиланде». Scientific Reports . 8 (1): 1536. Bibcode :2018NatSR...8.1536K. doi :10.1038/s41598-018-20020-0. PMC 5784115 . PMID 29367746.
- ^ Гаплогруппа R14, сайт митохондриальной ДНК Яна Логана
- ^ Мона, С.; Грюнц, К.Е.; Брауэр, С.; Пакендорф, Б.; Кастри, Л.; Судойо, Х.; Марзуки, С.; Барнс, Р.Х.; Шмидтке, Дж. (2009). «История генетического смешения Восточной Индонезии, выявленная с помощью анализа Y-хромосомы и митохондриальной ДНК». Молекулярная биология и эволюция . 26 (8): 1865–77. doi : 10.1093/molbev/msp097 . PMID 19414523.
- ^ Триведи, Раджни; Ситалакшими, Т.; Банерджи, Джилам; и др. (2006). «Молекулярное понимание происхождения шомпенов, сокращающегося населения Никобарского архипелага». Джей Хум Жене . 51 (3): 217–226. дои : 10.1007/s10038-005-0349-2 . ПМИД 16453062.
- ^ Пэн, Мин-Шэн; Хо Куанг, Хуй; Фам Данг, Хоа; и др. (2010). «Отслеживание австронезийского следа на материковой части Юго-Восточной Азии: взгляд с точки зрения митохондриальной ДНК». Mol. Biol. Evol . 27 (10): 2417–2430. doi : 10.1093/molbev/msq131 . PMID 20513740.
- ^ аб Форнарино, Симона; Пала, Мария; Батталья, Винченца; Маранта, Рамона; Ахилли, Алессандро; Модиано, Гвидо; Торрони, Антонио; Семино, Орнелла; Сантакьяра-Бенерекетти, Сильвана А (2009). «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие Таруса (Непал): резервуар генетических вариаций». Эволюционная биология BMC . 9 (1): 154. Бибкод : 2009BMCEE...9..154F. дои : 10.1186/1471-2148-9-154 . ПМК 2720951 . ПМИД 19573232.
- ^ abc Фридлендер, Дж.; Шурр, Т.; Генц, Ф.; Коки, Г.; Фридлендер, Ф.; Хорват, Г.; Бабб, П.; Церкио, С.; Кестле, Ф. (2005). «Расширение митохондриальных гаплогрупп P и Q юго-западной части Тихого океана». Молекулярная биология и эволюция . 22 (6): 1506–17. doi : 10.1093/molbev/msi142 . PMID 15814828.
- ^ Кайзер, М.; Брауэр, С; Кордо, Р; Касто, А; Лао, О; Животовский, Л.А.; Мойс-Фори, К; Ратледж, РБ; Шифенхувел, W (2006). «Меланезийское и азиатское происхождение полинезийцев: градиенты мтДНК и Y-хромосомы через Тихий океан». Молекулярная биология и эволюция . 23 (11): 2234–44. дои : 10.1093/molbev/msl093 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-0145-0 . ПМИД 16923821.
- ^ Хардинг, Розалинд 2006, Анализ генетического дерева австралийских аборигенов. Архивировано 20 сентября 2009 г. в Wayback Machine Оксфордского университета
- ^ Худжашов, Г.; Кивисилд, Т.; Андерхилл, ПА; Эндикотт, П.; Санчес, Дж. Дж.; Лин, AA; Шен, П.; Офнер, П.; Ренфрю, К.; и др. (2007). «Выявление доисторического поселения Австралии с помощью анализа Y-хромосомы и мтДНК». Труды Национальной академии наук . 104 (21): 8726–30. Bibcode : 2007PNAS..104.8726H. doi : 10.1073 /pnas.0702928104 . JSTOR 25427741. PMC 1885570. PMID 17496137.
- ^ Страница мтДНК гаплогруппы U1a на cagetti.com
- ^ Карима Фадхлауи-Зид; Лаура Родригес-Ботиге; Неджиб Науи; Амель Бенаммар-Эльгаайед; Франческ Калафель; Дэвид Комас (май 2011 г.). «Структура митохондриальной ДНК в Северной Африке обнаруживает генетическую неоднородность в долине Нила» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 145 (1): 107–117. дои : 10.1002/ajpa.21472. hdl : 10261/42802 . ПМИД 21312180 . Проверено 22 апреля 2016 г.
- ^ Мака-Мейер, Николь; Гонсалес, Ана М; Пестано, Хосе; Флорес, Карлос; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М (2003). «Транзит митохондриальной ДНК между Западной Азией и Северной Африкой, сделанный на основе филогеографии U6». БМК Генетика . 4:15 . дои : 10.1186/1471-2156-4-15 . ПМК 270091 . ПМИД 14563219.
- ^ Мохамед, Хишам Юсиф Хассан. «Генетические закономерности вариаций Y-хромосомы и митохондриальной ДНК с учетом их влияния на население Судана». Университет Хартума. Архивировано из оригинала (PDF) 10 ноября 2020 г. Получено 22 апреля 2016 г.
- ^ Бернард Сехер; Роза Фрегель; Хосе М. Ларруга; Висенте М. Кабрера; Филипп Эндикотт; Хосе Дж. Пестано; Ана М. Гонсалес (2014). «История потока генов североафриканской митохондриальной ДНК гаплогруппы U6 на африканский, евразийский и американский континенты». BMC Evolutionary Biology . 14 (1): 109. Bibcode :2014BMCEE..14..109S. doi : 10.1186/1471-2148-14-109 . PMC 4062890 . PMID 24885141.
- ^ abc Kutanan, Wibhu; Kampuansai, Jatupol; Srikummool, Metawee; Kangwanpong, Daoroong; Ghirotto, Silvia; Brunelli, Andrea; Stoneking, Mark (2016). «Полные митохондриальные геномы тайских и лаосских популяций указывают на древнее происхождение австроазиатских групп и демическую диффузию в распространении языков тай-кадай». Hum Genet . 136 (1): 85–98. doi : 10.1007/s00439-016-1742-y . PMC 5214972. PMID 27837350 .
Внешние ссылки
На Викискладе есть медиафайлы по теме Гаплогруппа R (мтДНК) .
- PhyloTree.org Манниса ван Овена - поддерево R мтДНК
- Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана