stringtranslate.com

Молекулярная самосборка

АСМ- изображение молекул нафталентетракарбонового диимида на серебре, взаимодействующих посредством водородных связей при 77 К. [1] («Водородные связи» на верхнем изображении преувеличены артефактами техники визуализации. [2] [3] )
NC-AFM- визуализация процесса молекулярной самосборки молекул 2-аминотерефталевой кислоты на кальците (104). [4]

В химии и материаловедении молекулярная самосборка — это процесс, при котором молекулы принимают определенную компоновку без руководства или управления извне. Существует два типа самосборки : межмолекулярная и внутримолекулярная . Обычно термин «молекулярная самосборка» относится к первой, тогда как последняя чаще называется фолдингом .

Супрамолекулярные системы

Молекулярная самосборка является ключевым понятием в супрамолекулярной химии . [6] [7] [8] Это связано с тем, что сборка молекул в таких системах осуществляется посредством нековалентных взаимодействий (например, водородных связей , координации металлов, гидрофобных сил , сил Ван-дер-Ваальса , пи-стекинговых взаимодействий и/или электростатических), а также электромагнитных взаимодействий. Обычные примеры включают образование коллоидов , биомолекулярных конденсатов , мицелл , везикул , жидкокристаллических фаз и монослоев Ленгмюра молекулами поверхностно-активного вещества . [9] Дополнительные примеры супрамолекулярных сборок демонстрируют, что с помощью молекулярной самосборки можно получить множество различных форм и размеров. [10]

Молекулярная самосборка позволяет строить сложные молекулярные топологии . Одним из примеров являются кольца Борромео , взаимодействующие кольца, в которых удаление одного кольца разблокирует каждое из других колец. ДНК была использована для приготовления молекулярного аналога колец Борромео . [11] Совсем недавно была получена похожая структура с использованием небиологических строительных блоков. [12]

Биологические системы

Молекулярная самосборка лежит в основе построения биологических макромолекулярных сборок и биомолекулярных конденсатов в живых организмах, и поэтому имеет решающее значение для функционирования клеток . Она проявляется в самосборке липидов для формирования мембраны , образовании двойной спирали ДНК посредством водородных связей отдельных нитей и сборке белков для формирования четвертичных структур . Молекулярная самосборка неправильно свернутых белков в нерастворимые амилоидные волокна ответственна за инфекционные нейродегенеративные заболевания, связанные с прионами . Молекулярная самосборка наномасштабных структур играет роль в росте замечательных структур β-кератиновых пластинок / щетинок / лопаточек, используемых для того, чтобы дать гекконам возможность карабкаться по стенам и прикрепляться к потолкам и выступам скал . [13] [14]

Белковые мультимеры

Когда несколько копий полипептида, кодируемого геном, самоорганизуются, образуя комплекс, эта белковая структура называется «мультимером». [15] Гены, кодирующие полипептиды, образующие мультимеры, по-видимому, распространены. Когда мультимер образуется из полипептидов, продуцируемых двумя различными мутантными аллелями определенного гена, смешанный мультимер может проявлять большую функциональную активность, чем несмешанные мультимеры, образованные каждым из мутантов в отдельности. В таком случае явление называется внутригенной комплементарностью . [16] Йеле указал, что при погружении в жидкость и смешивании с другими молекулами силы флуктуации заряда благоприятствуют ассоциации идентичных молекул в качестве ближайших соседей. [17]

Нанотехнологии

Молекулярная самосборка является важным аспектом подходов «снизу вверх» к нанотехнологии . Используя молекулярную самосборку, конечная (желаемая) структура программируется в форме и функциональных группах молекул. Самосборка упоминается как технология производства «снизу вверх» в отличие от технологии «сверху вниз», такой как литография , где желаемая конечная структура вырезается из более крупного куска материи. В спекулятивном видении молекулярной нанотехнологии микрочипы будущего могут быть изготовлены с помощью молекулярной самосборки. Преимущество построения наноструктуры с использованием молекулярной самосборки для биологических материалов заключается в том, что они будут распадаться обратно на отдельные молекулы, которые могут быть разрушены организмом.

ДНК-нанотехнология

ДНК-нанотехнология — это область современных исследований, которая использует подход самосборки снизу вверх для нанотехнологических целей. ДНК-нанотехнология использует уникальные свойства молекулярного распознавания ДНК и других нуклеиновых кислот для создания самосборочных разветвленных комплексов ДНК с полезными свойствами. [18] Таким образом, ДНК используется как структурный материал, а не как носитель биологической информации, для создания таких структур, как сложные 2D и 3D решетки (как на основе плиток, так и с использованием метода « ДНК-оригами ») и трехмерные структуры в форме многогранников . [19] Эти структуры ДНК также использовались в качестве шаблонов при сборке других молекул, таких как золотые наночастицы [20] и белки стрептавидина . [21]

Двумерные монослои

Спонтанная сборка одного слоя молекул на границах раздела обычно называется двумерной самосборкой. Одним из распространенных примеров таких сборок являются монослои Ленгмюра-Блоджетт и многослойные структуры поверхностно-активных веществ. Неповерхностно-активные молекулы также могут собираться в упорядоченные структуры. Ранние прямые доказательства того, что неповерхностно-активные молекулы могут собираться в архитектуры более высокого порядка на твердых границах раздела, появились с развитием сканирующей туннельной микроскопии и вскоре после этого. [22] В конечном итоге две стратегии стали популярными для самосборки 2D-архитектур, а именно самосборка после осаждения в сверхвысоком вакууме и отжига и самосборка на границе раздела твердое тело-жидкость. [23] Проектирование молекул и условий, приводящих к образованию высококристаллических архитектур, сегодня считается формой инженерии 2D-кристаллов в наноскопическом масштабе .

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Sweetman, AM; Jarvis, SP; Sang, Hongqian; Lekkas, I.; Rahe, P.; Wang, Yu; Wang, Jianbo; Champness, NR; Kantorovich, L.; Moriarty, P. (2014). «Картирование силового поля водородно-связанной сборки». Nature Communications . 5 : 3931. Bibcode :2014NatCo...5.3931S. doi :10.1038/ncomms4931. PMC  4050271 . PMID  24875276.
  2. ^ Хапала, Прокоп; Кичин, Георгий; Вагнер, Кристиан; Тауц, Ф. Стефан; Темиров, Руслан; Елинек, Павел (2014-08-19). "Механизм получения изображений высокого разрешения STM/AFM с помощью функционализированных зондов". Physical Review B. 90 ( 8): 085421. arXiv : 1406.3562 . Bibcode : 2014PhRvB..90h5421H. doi : 10.1103/PhysRevB.90.085421. S2CID  53610973.
  3. ^ Хямяляйнен, Сампса К.; ван дер Хейден, Надин; ван дер Лит, Йост; ден Хартог, Стефан; Лильджерот, Питер; Сварт, Ингмар (31 октября 2014 г.). «Межмолекулярный контраст на изображениях атомно-силовой микроскопии без межмолекулярных связей». Письма о физических отзывах . 113 (18): 186102. arXiv : 1410.1933 . Бибкод : 2014PhRvL.113r6102H. doi : 10.1103/PhysRevLett.113.186102. PMID  25396382. S2CID  8309018.
  4. ^ Клинг, Феликс (2016). Диффузия и структурообразование молекул на кальците(104) (доктор философии). Йоханнес Гутенберг-Университет Майнца. doi : 10.25358/openscience-2179.
  5. ^ Фам, Туан Ань; Сонг, Фей; Нгуен, Мань-Тхуонг; Штор, Майке (2014). «Самосборка производных пирена на Au(111): влияние заместителей на межмолекулярные взаимодействия». Chem. Commun . 50 (91): 14089–14092. doi : 10.1039/C4CC02753A . PMID  24905327.
  6. ^ Lehn, J.-M. (1988). «Перспективы супрамолекулярной химии — от молекулярного распознавания к молекулярной обработке информации и самоорганизации». Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 27 (11): 89–121. doi :10.1002/anie.198800891.
  7. ^ Lehn, J.-M. (1990). «Супрамолекулярная химия — область применения и перспективы: молекулы, супермолекулы и молекулярные устройства (Нобелевская лекция)». Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 29 (11): 1304–1319. doi :10.1002/anie.199013041.
  8. ^ Лен, Дж.-М. Супрамолекулярная химия: концепции и перспективы . Wiley-VCH. ISBN 978-3-527-29311-7.
  9. ^ Rosen, Milton J. (2004). Поверхностно-активные вещества и межфазные явления . Hoboken, NJ: Wiley-Interscience. ISBN 978-0-471-47818-8.
  10. ^ Арига, Кацухико; Хилл, Джонатан П.; Ли, Майкл В.; Вину, Аджаян; Чарвет, Ричард; Ачарья, Сомобрата (2008). «Проблемы и прорывы в недавних исследованиях самосборки». Наука и технология передовых материалов . 9 (1): 014109. Bibcode : 2008STAdM...9a4109A. doi : 10.1088/1468-6996/9/1/014109. PMC 5099804. PMID  27877935. 
  11. ^ Mao, C; Sun, W; Seeman, NC (1997). «Сборка колец Борромео из ДНК». Nature . 386 (6621): 137–138. Bibcode :1997Natur.386..137M. doi :10.1038/386137b0. PMID  9062186. S2CID  4321733.
  12. ^ Чичак, КС; Кантрилл, С.Дж.; Пиз, Арканзас; Чиу, SH; Кейв, Джорджия; Этвуд, Дж.Л.; Стоддарт, Дж. Ф. (2004). «Молекулярные кольца Борромео» (PDF) . Наука . 304 (5675): 1308–1312. Бибкод : 2004Sci...304.1308C. дои : 10.1126/science.1096914. PMID  15166376. S2CID  45191675.
  13. ^ Мин, Юнджин и др. (2008). «Роль межчастичных и внешних сил в сборке наночастиц». Nature Materials . 7 (7): 527–38. Bibcode :2008NatMa...7..527M. doi :10.1038/nmat2206. PMID  18574482.
  14. ^ Сантос, Дэниел; Спенко, Мэтью; Парнесс, Аарон; Ким, Сангбэ; Каткоски, Марк (2007). «Направленная адгезия для скалолазания: теоретические и практические соображения». Журнал «Наука и технологии адгезии » . 21 (12–13): 1317–1341. doi :10.1163/156856107782328399. S2CID  53470787. Стопы и пальцы геккона представляют собой иерархическую систему сложных структур, состоящих из пластинок, щетинок и лопаточек. Отличительные характеристики адгезионной системы геккона были описаны [как] (1) анизотропное прикрепление, (2) высокое отношение силы отрыва к предварительной нагрузке, (3) низкая сила отрыва, (4) независимость от материала, (5) самоочищение, (6) противодействие самоприлипанию и (7) нелипкое состояние по умолчанию. ... Адгезивные структуры геккона состоят из ß-кератина (модуль упругости [приблизительно] 2 ГПа). Такой жесткий материал по своей природе не является липким; однако из-за иерархической природы адгезива геккона и чрезвычайно малых дистальных особенностей (размер лопаточек [приблизительно] 200 нм) стопа геккона способна плотно прилегать к поверхности и создавать значительное притяжение с помощью сил Ван-дер-Ваальса .
  15. ^ Крик ФХ, Орджел ЛЭ. Теория межаллельной комплементарности. J Mol Biol. 1964 Январь;8:161-5. doi: 10.1016/s0022-2836(64)80156-x. PMID 14149958
  16. ^ Бернстайн Х., Эдгар Р. С., Денхардт Г. Х. Внутригенная комплементарность среди температурно-чувствительных мутантов бактериофага T4D. Генетика. 1965;51(6):987-1002.
  17. ^ H. Jehle (1963), «Межмолекулярные силы и биологическая специфичность», Proc Natl Acad Sci USA , 50 (3): 516–524, doi : 10.1073/pnas.50.3.516 , PMC 221211 , PMID  16578546 
  18. ^ Seeman, NC (2003). «ДНК в материальном мире». Nature . 421 (6921): 427–431. Bibcode :2003Natur.421..427S. doi : 10.1038/nature01406 . PMID  12540916.
  19. ^ Чен, Дж. и Симан, NC (1991). «Синтез из ДНК молекулы со связностью куба». Nature . 350 (6319): 631–633. Bibcode :1991Natur.350..631C. doi :10.1038/350631a0. PMID  2017259. S2CID  4347988.
  20. ^ Миркин, CA; Летсингер, RL; Муцик, RC; Сторхофф, JJ (1996). «Метод рациональной сборки наночастиц в макроскопические материалы на основе ДНК». Nature . 382 (6592): 607–609. Bibcode :1996Natur.382..607M. doi :10.1038/382607a0. PMID  8757129. S2CID  4284601.
  21. ^ Ян, Х.; Парк, Ш.Х.; Финкельштейн, Г.; Рейф, Дж.Х.; Лабеан, Т.Х. (2003). «ДНК-шаблонная самосборка белковых массивов и высокопроводящих нанопроводов». Science . 301 (5641): 1882–1884. Bibcode :2003Sci...301.1882Y. doi :10.1126/science.1089389. PMID  14512621. S2CID  137635908.
  22. ^ Foster, JS & Frommer, JE (1988). «Визуализация жидких кристаллов с помощью туннельного микроскопа». Nature . 333 (6173): 542–545. Bibcode :1988Natur.333..542F. doi :10.1038/333542a0. S2CID  4368440.
  23. ^ Rabe, JP & Buchholz, S. (1991). "Соизмеримость и подвижность в двумерных молекулярных узорах на графите". Science . 253 (5018): 424–427. Bibcode :1991Sci...253..424R. doi :10.1126/science.253.5018.424. JSTOR  2878886. PMID  17746397. S2CID  42385720.