Филогенез (от греч. φῦλον phylon «племя» + γένεσις генезис «происхождение») — биологический процесс, посредством которого появляется таксон (любого ранга ). Наука, изучающая эти процессы, называется филогенетикой . [1] [2] [3] [4] [5]
Эти термины можно спутать с термином филогенетика , применение молекулярно - аналитических методов (т.е. молекулярной биологии и геномики ) при объяснении филогении и ее исследовании.
Филогенетические отношения обнаруживаются с помощью методов филогенетического вывода , которые оценивают наблюдаемые наследственные признаки, такие как последовательности ДНК или общие морфоанатомические , этологические и другие характеристики.
Результатом этих анализов является филогения (также известная как филогенетическое дерево ) – схематическая гипотеза об истории эволюционных взаимоотношений группы организмов. [6] Филогенетический анализ стал центральным элементом понимания биоразнообразия, эволюции, экологической генетики и геномов .
Кладистика ( греч. κλάδος , klados , т.е. «ветвь») [7] — это подход к биологической классификации , при котором организмы классифицируются на основе общих, производных характеристик, которые можно проследить до самого недавнего общего предка группы и которые отсутствуют у более отдаленных предков. предки. Таким образом, предполагается, что члены группы имеют общую историю и считаются тесно связанными. [8] [9] [10] [11]
Кладистический метод интерпретирует каждую трансформацию состояния признака, подразумеваемую распределением общих состояний признака среди таксонов (или других терминалей), как потенциальное свидетельство для группировки. Результатом кладистического анализа является кладограмма – древовидная диаграмма ( дендрограмма ) [12] , которая интерпретируется как наилучшая гипотеза филогенетических связей.
Хотя традиционно такие кладограммы создавались в основном на основе морфологических характеристик, рассчитанных вручную, сейчас широко используются данные генетического секвенирования и компьютерной филогенетики, и многие филогенетики отказались от критерия экономности в пользу более «сложных» (но менее экономных) эволюционных методов. модели трансформации состояний персонажей.
Таксономия ( греческий язык τάξις , Taxis = «порядок», «расположение» + νόμος , nomos = «закон» или «наука») — это классификация, идентификация и наименование организмов. Обычно она богата информацией из филогенетики, но остается методологически и логически отдельной дисциплиной. [13] Степень, в которой таксономии зависят от филогении (или классификация зависит от эволюционного развития), различается в зависимости от школы таксономии: фенетика вообще игнорирует филогению, пытаясь вместо этого представить сходство между организмами; кладистика (филогенетическая систематика) пытается воспроизвести филогению в своей классификации.
Расширение филогенеза на клеточный уровень Жан-Жаком Купиком [14] [15] известно как онтофилогенез.
Филогенетика - это отрасль науки о жизни, занимающаяся анализом данных молекулярного секвенирования для изучения эволюционных взаимоотношений между группами организмов.