stringtranslate.com

Субъединица белка

Визуализация HLA-A11 , показывающая субъединицы α (продукт гена A*1101) и β (микроглобулин бета-2) . Этот рецептор имеет связанный пептид (в связывающем кармане ) гетерологичного происхождения, который также вносит вклад в функцию.

В структурной биологии белковая субъединица представляет собой полипептидную цепь или отдельную белковую молекулу, которая собирается (или « собирается ») с другими, образуя белковый комплекс . [1] [2] [3] Большие скопления белков, такие как вирусы, часто используют небольшое количество типов белковых субъединиц в качестве строительных блоков. [4]

Субъединица часто именуется греческой или римской буквой, а номера этого типа субъединицы в белке обозначаются нижним индексом. [5] Например, АТФ-синтаза имеет тип субъединицы, называемый α. Три из них присутствуют в молекуле АТФ-синтазы, что приводит к обозначению α 3 . Также могут быть указаны более крупные группы субъединиц, такие как α 3 β 3 -гексамер и c-кольцо. [6]

Белки природного происхождения, которые имеют относительно небольшое количество субъединиц, называются олигомерными . [7] Например, гемоглобин представляет собой симметричное расположение двух идентичных субъединиц α-глобина и двух идентичных субъединиц β-глобина. [3] [8] Более длинные мультимерные белки, такие как микротрубочки и другие белки цитоскелета , могут состоять из очень большого количества субъединиц. Например, динеин представляет собой мультимерный белковый комплекс, включающий две тяжелые цепи (DHC), две промежуточные цепи (IC), две легкие промежуточные цепи (LIC) и несколько легких цепей (LC). [9]

Субъединицы белкового комплекса могут быть идентичными, гомологичными или совершенно разными и выполнять разные задачи. [1] В некоторых белковых сборках одна субъединица может быть «каталитической субъединицей», которая ферментативно катализирует реакцию, тогда как «регуляторная субъединица» будет способствовать или подавлять активность. [10] Хотя теломераза имеет теломеразную обратную транскриптазу в качестве каталитической субъединицы, регуляция осуществляется факторами, находящимися вне белка. [11]

Фермент, состоящий из регуляторных и каталитических субъединиц в собранном виде, часто называют голоферментом . Например, фосфоинозитид-3-киназа класса I состоит из каталитической субъединицы p110 и регуляторной субъединицы p85. [12] Одна субъединица состоит из одной полипептидной цепи. Полипептидная цепь имеет один ген , кодирующий ее, что означает, что белок должен иметь один ген для каждой уникальной субъединицы.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Stoker, H. Stephen (1 января 2015 г.). Общая, органическая и биологическая химия (7-е изд.). Бостон, Массачусетс: Cengage Learning. стр. 709–710. ISBN 978-1-305-68618-2. Получено 15 апреля 2022 г. .
  2. ^ Смит, Майкл Б. (27 апреля 2020 г.). Биохимия: подход органической химии. Boca Raton: CRC Press. стр. 269–270. ISBN 978-1-351-25807-4. Получено 15 апреля 2022 г. .
  3. ^ ab Альбертс, Брюс; Джонсон, Александр; Льюис, Джулиан; Рафф, Мартин; Робертс, Кит; Уолтер, Питер (2002). Форма и структура белков. Нью-Йорк: Garland Science . Получено 15 апреля 2022 г.
  4. ^ Кумар, А.; Эварссон, А.; Хол, WGJ (1999). «Мультипротеиновые сборки с симметрией точечной группы». В Виджаян, М.; Ятиндра, Н.; Коласкар, А.С. (ред.). Перспективы структурной биологии: том в честь Г. Н. Рамачандрана . Хайдарабад, Индия: Universities Press. стр. 449–466. ISBN 978-81-7371-254-8. Получено 15 апреля 2022 г. .
  5. ^ Lesieur, Claire (18 июня 2014 г.). Олигомеризация химических и биологических соединений. Хорватия: Intech. стр. 240–241. ISBN 978-953-51-1617-2. Получено 15 апреля 2022 г. .
  6. ^ Ахмад, Зульфикар; Окафор, Флоренс; Азим, София; Лафлин, Томас Ф. (2013). «АТФ-синтаза: молекулярная терапевтическая лекарственная мишень для антимикробных и противоопухолевых пептидов». Current Medicinal Chemistry . 20 (15): 1956–1973. doi :10.2174/0929867311320150003. ISSN  0929-8673. PMC 4734648. PMID 23432591  . 
  7. ^ Дженкинс, А.Д.; Кратохвил, П.; Степто, Р.Ф.Т.; Сутер, У.В. (1996). «Глоссарий основных терминов в полимерной науке (Рекомендации ИЮПАК 1996 г.)». Чистая и прикладная химия . 68 (12): 2287–2311. doi : 10.1351/pac199668122287 .Цитата: Молекула олигомера: Молекула со средней относительной молекулярной массой, структура которой по существу состоит из небольшого множества единиц, полученных, фактически или концептуально, из молекул с более низкой относительной молекулярной массой.
  8. ^ Лю, Шицзе (7 апреля 2020 г.). Биотехнология: кинетика, устойчивость и проектирование реакторов. Elsevier. стр. 358. ISBN 978-0-12-822383-3. Получено 15 апреля 2022 г. .
  9. ^ Дхаран, Адарш; Кэмпбелл, Эдвард М. (31 июля 2018 г.). «Роль микротрубочек и связанных с микротрубочками белков в инфекции ВИЧ-1». Журнал вирусологии . 92 (16): e00085–18. doi :10.1128/JVI.00085-18. ISSN  0022-538X. PMC 6069196. PMID 29899089  . 
  10. ^ Søberg, Kristoffer; Skålhegg, Bjørn Steen (12 сентября 2018 г.). «Молекулярная основа специфичности на уровне каталитической субъединицы протеинкиназы a». Frontiers in Endocrinology . 9 : 538. doi : 10.3389/fendo.2018.00538 . ISSN  1664-2392. PMC 6143667. PMID 30258407  . 
  11. ^ Daniel M, Peek GW, Tollefsbol TO (2012). «Регулирование человеческой каталитической субъединицы теломеразы (hTERT)». Gene . 498 (2): 135–46. doi :10.1016/j.gene.2012.01.095. PMC 3312932 . PMID  22381618. 
  12. ^ Carpenter CL, Duckworth BC, Auger KR, Cohen B, Schaffhausen BS, Cantley LC (ноябрь 1990 г.). «Очистка и характеристика фосфоинозитид-3-киназы из печени крысы». J. Biol. Chem . 265 (32): 19704–11. doi : 10.1016/S0021-9258(17)45429-9 . PMID  2174051.