Трансактивирующая crRNA

В молекулярной биологии транс -активирующая РНК CRISPR ( tracrRNA ) представляет собой небольшую транс -кодируемую РНК. Впервые его обнаружила Эммануэль Шарпантье в ходе исследования человеческого возбудителя Streptococcus pyogenes — типа бактерий , наносящих вред человечеству. ^[1] У бактерий и архей CRISPR-Cas (кластерные, регулярно расположенные короткие палиндромные повторы/CRISPR-ассоциированные белки) представляют собой РНК-опосредованную защитную систему, которая защищает от вирусов и плазмид . Этот защитный путь состоит из трех этапов. Сначала копия вторгшейся нуклеиновой кислоты интегрируется в локус CRISPR . Затем из этого локуса CRISPR транскрибируются CRISPR-РНК (crRNA). Затем crРНК включаются в эффекторные комплексы , где crRNA направляет комплекс к вторгающейся нуклеиновой кислоте, а белки Cas разрушают эту нуклеиновую кислоту. ^[2] Существует несколько подтипов системы CRISPR.

Системам CRISPR-Cas типа II требуется tracrRNA, которая играет роль в созревании crRNA. ^[3] tracrRNA частично комплементарна пре-crRNA и по парам оснований образует дуплекс РНК . Он расщепляется РНКазой III , РНК-специфической рибонуклеазой , с образованием гибрида crРНК/tracrRNA. Этот гибрид действует как проводник для эндонуклеазы Cas9, которая расщепляет вторгшуюся нуклеиновую кислоту. ^{[1] [4] [5]}

Смотрите также

• КРИСПР

Рекомендации

1. Дельчева Е, Чилински К., Шарма С.М., Гонсалес К., Чао Ю., Пирзада З.А. и др. (2011). «Созревание РНК CRISPR с помощью транскодируемой малой РНК и фактора хозяина РНКазы III». Природа . 471 (7340): 602–607. Бибкод : 2011Natur.471..602D. дои : 10.1038/nature09886. ПМК  3070239 . ПМИД  21455174.
2. Тернс МП, Тернс РМ (2011). «Адаптивные иммунные системы на основе CRISPR». Curr Opin Микробиол . 14 (3): 321–327. дои : 10.1016/j.mib.2011.03.005. ПМК 3119747 . ПМИД  21531607. 
3. Шарпантье Э., Рихтер Х., ван дер Ост Дж., Уайт М.Ф. (2015). «Пути биогенеза РНК-направляющих в адаптивном иммунитете CRISPR-Cas архей и бактерий». Обзоры микробиологии FEMS . 39 (3): 428–441. дои : 10.1093/femsre/fuv023. ПМЦ 5965381 . ПМИД  25994611. 
4. Джинек М., Чилински К., Фонфара И., Хауэр М., Дудна Дж.А., Шарпантье Э. (2012). «Программируемая ДНК-эндонуклеаза, управляемая двойной РНК, в адаптивном бактериальном иммунитете». Наука . 337 (6096): 816–821. Бибкод : 2012Sci...337..816J. дои : 10.1126/science.1225829. ПМК 6286148 . ПМИД  22745249. 
5. Браунс С.Дж. (2012). «Швейцарский армейский нож иммунитета». Наука . 337 (6096): 808–809. Бибкод : 2012Sci...337..808B. дои : 10.1126/science.1227253. PMID  22904002. S2CID  206543893.

дальнейшее чтение

• Ле Рун А, Шарпантье Э (2012). «Маленькие РНК стрептококков». РНК Биол . 9 (4): 414–426. дои : 10.4161/rna.20104 . ПМИД  22546939.