stringtranslate.com

Тобамовирус

Tobamovirus — род вирусов с положительной цепью РНК [2] в семействе Virgaviridae . [3] Многие растения, [2] включая табак , картофель , томат и кабачки , служат естественными хозяевами. Заболевания, связанные с этим родом, включают: некротические поражения на листьях. [3] [4] Название Tobamovirus происходит от хозяина и симптомов первого обнаруженного вируса ( вирус табачной мозаики ). [5]

В этом роде есть четыре неформальные подгруппы: это тобамовирусы, которые заражают капустные , тыквенные , мальвовые и пасленовые растения. Основные различия между этими группами — последовательности генома и соответствующий диапазон растений-хозяев. [ необходима цитата ] В этом роде есть 37 видов. [6]

Структура

Тобамовирусы не имеют оболочки, имеют спиральную стержневую [2] геометрию и спиральную симметрию. Диаметр составляет около 18 нм, длина — 300–310 нм. Геномы линейные и несегментированные, длиной около 6,3–6,5 кб. [3] [4]

Геном

Геном РНК кодирует по крайней мере четыре полипептида : [3] это неструктурный белок и продукт считывания, которые участвуют в репликации вируса (РНК-зависимая РНК-полимераза, RdRp); белок движения (MP), который необходим для перемещения вируса между клетками, и белок оболочки (CP). Часть считывания RdRp может быть выражена как отдельный белок в TMV. [7] Вирус способен реплицироваться без белков движения или оболочки, но два других необходимы. Неструктурный белок имеет домены, предполагающие, что он участвует в кэпировании РНК, а продукт считывания имеет мотив для РНК-полимеразы. Белки движения производятся очень рано в цикле инфекции и локализуются в плазмодесмах , они, вероятно, участвуют в специфичности хозяина, поскольку, как полагают, они взаимодействуют с некоторыми факторами клетки хозяина. [ необходима цитата ]

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК является методом транскрипции. Трансляция происходит путем подавления терминации. Вирус покидает клетку-хозяина путем однокомпонентного нетрубчатого вирусного движения. Растения служат естественным хозяином. [2] Пути передачи механические. [3] [4]

Ферменты

РНК-зависимые РНК-полимеразы тобамовируса гомологичны РНК-полимеразам бромовирусов , иларвирусов , тобравирусов и вируса крапчатости гвоздики . [2]

Пути заражения

Инфекция изначально локализована, но если вирус не будет остановлен, он распространится через сосудистую систему в системную инфекцию. Точный механизм, который вирус использует для перемещения по растению, неизвестен, но взаимодействие пектинметилэстеразы , клеточного фермента, важного для метаболизма клеточной стенки и развития растения, с белком перемещения было вовлечено. [8]

Эволюция

Существует по крайней мере 3 различных клада тобамовирусов, которые в некоторой степени следуют своим ареалам хозяев: то есть один заражает виды пасленовых , второй заражает тыквенные и бобовые , а третий заражает крестоцветные. [9]

Классификация

Разновидность

Филогенетическое дерево тобамовируса

Род содержит следующие виды: [6]

Предложенные члены

Предложенные, но в настоящее время непризнанные члены рода включают: [11]

Ссылки

  1. ^ "Virus Taxonomy: 2018b Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2019. Архивировано из оригинала 20 марта 2020 года . Получено 18 марта 2019 года .
  2. ^ abcde Strauss, JH; Strauss, EG (1988). «Эволюция РНК-вирусов». Annual Review of Microbiology . 42 (1). Annual Reviews : 657–683. doi : 10.1146/annurev.mi.42.100188.003301. ISSN  0066-4227. PMID  3060004.
  3. ^ abcde "ICTV Online Report Virgaviridae". Архивировано из оригинала 9 июля 2023 г. Получено 21 сентября 2017 г.
  4. ^ abc "Viral Zone". ExPASy. Архивировано из оригинала 27 июня 2015 г. Получено 15 июня 2015 г.
  5. ^ "ПРОТОКОЛ ТРЕТЬЕГО ЗАСЕДАНИЯ ICTV, состоявшегося в МАДРИДЕ 12 и 16 сентября 1975 года" (PDF) . Архивировано (PDF) из оригинала 9 апреля 2023 года . Получено 9 июля 2023 года .
  6. ^ ab "Virus Taxonomy: 2020 Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Архивировано из оригинала 20 марта 2020 г. Получено 14 мая 2021 г.
  7. ^ Creager, Angela NH; Scholthof, Karen-Beth G.; Citovsky, Vitaly; Scholthof, Herman B. (март 1999 г.). «Вирус табачной мозаики: пионерские исследования на протяжении столетия». The Plant Cell . 11 (3): 301–8. doi :10.1105/tpc.11.3.301. PMC 1464663. PMID  10072391 . 
  8. ^ Чен, МХ; Цитовский, В. (август 2003 г.). «Системное перемещение тобамовируса требует пектинметилэстеразы клетки-хозяина». The Plant Journal . 35 (3): 386–92. doi : 10.1046/j.1365-313X.2003.01818.x . PMID  12887589.
  9. ^ Lartey, RT; Voss, TC; Melcher, U. (1996). «Эволюция тобамовируса: перекрытия генов, рекомбинация и таксономические последствия» (PDF) . Молекулярная биология и эволюция . 13 (10): 1327–1338. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025579 . PMID  8952077.
  10. ^ Min, BE; Chung, BN; Kim, MJ; Ha, JH; Lee, BY; Ryu, KH (январь 2006 г.). «Вирус мягкой пятнистости кактуса — новый тобамовирус, заражающий кактусы». Архивы вирусологии . 151 (1): 13–21. doi :10.1007/s00705-005-0617-7. PMID  16132178. S2CID  40760030.
  11. ^ ab "Описания вирусов растений: группа тобамовирусов". Ассоциация прикладных биологов (AAB). Архивировано из оригинала 17 ноября 2007 г. Получено 7 апреля 2008 г.

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы по теме Тобамовирус .
Wikispecies содержит информацию, связанную с тобамовирусом .