stringtranslate.com

Цистовирус

Цистовирус — род вирусов с двухцепочечной РНК , поражающих бактерии . Это единственный род в семействе Cystoviridae . Название группы c ysto происходит от греческого kystis, что означает пузырь или мешок. В этом роде семь видов. [1] [2] [3]

Открытие

Вирус Pseudomonas phi6 был первым вирусом в этом семействе, который был обнаружен и первоначально был охарактеризован в 1973 году Энн Видавер в Университете Небраски . Она обнаружила, что при культивировании бактериального штамма Pseudomonas phaseolicola HB1OY с соломой бобов, инфицированной гало-филлофитией , в культивируемых газонах были обнаружены цитопатические эффекты, что указывало на присутствие литического микроба или бактериофага . [4]

В 1999 году phi7–14 были идентифицированы лабораторией Леонарда Миндича в Научно-исследовательском институте общественного здравоохранения, связанном с Нью-Йоркским университетом . Они сделали это, культивируя различные листья в бульоне лизогении , а затем высеивая бульон на газоны Pseudomonas syringae pv phaseolicola . Они смогли идентифицировать вирусные бляшки из этого, а затем последовательно секвенировать их геномы. [5]

Микробиология

Структура

Сборка вирионов и предгеномная упаковка семейства Cystoviridae

Частицы цистовируса имеют оболочку , икосаэдрическую и сферическую геометрию, симметрию T=13, T=2. Диаметр вириона составляет около 85 нм. Цистовирусы отличаются внешним слоем белка и липидной оболочкой. Ни один другой бактериофаг не имеет липидов во внешней оболочке, хотя у Tectiviridae и Corticoviridae липиды есть внутри капсидов . [1] [2]

Геном

Цистовирусы имеют трехкомпонентный двухцепочечный РНК-геном, общая длина которого составляет приблизительно 14 кб . Геном линейный и сегментированный, и обозначен как большой (L) 6,4 кб, средний (M) 4 кб и малый (S) 2,9 кб в длину. Геном кодирует двенадцать белков. [1] [2]

Жизненный цикл

Жизненный цикл цистовирусов

Цитовирусы проникают в бактерию путем адсорбции на ее пилях и последующего слияния с мембраной. Репликация вируса происходит цитоплазматически. Репликация следует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК. Транскрипция вируса с двухцепочечной РНК является методом транскрипции. Потомство вирусов высвобождается из клетки путем лизиса . [1] [2]

Большинство идентифицированных цистовирусов заражают виды Pseudomonas , но это, вероятно, предвзято из-за метода скрининга и обогащения. [6] Существует много предполагаемых членов этого семейства. Вирусы Pseudomonas φ7, φ8, φ9, φ10, φ11, φ12 и φ13 были идентифицированы и названы, [5] но другие цистовирусоподобные вирусы также были изолированы. [6] Эти семь предполагаемых родственников классифицируются как близкие (φ7, φ9, φ10, φ11) или дальние (φ8, φ12, φ13) родственники φ6, [5] при этом дальние родственники, как полагают, заражают через ЛПС, а не пили. [7]

Однако цистовирусы заражают не только Pseudomonas , но и бактерии родов Streptomyces , [8] Microvirgula , [9] Acinetobacter , [10] Lactococcus , Pectobacterium , [11] и, возможно, другие роды бактерий.

Таксономия

Филогенетическое дерево цистовирусов

Члены Cystoviridae , по-видимому, наиболее тесно связаны с Reoviridae , [12], но также имеют гомологию с Totiviridae . В частности, структурные гены цистовирусов очень похожи на те, которые используются рядом вирусов dsRNA, инфицирующих эукариот. [13] Род Cystovirus включает семь видов: [1]

Другие нераспределенные фаги:

Ссылки

  1. ^ abcde «Отчет ICTV о цистовирусах».
  2. ^ abcd "Viral Zone". ExPASy . Получено 15 июня 2015 г. .
  3. ^ "NCBI Taxonomy Browser: Cystoviridae". NCBI . Получено 19 июня 2016 г. .
  4. ^ Видавер АК, Коски РК, Ван Эттен ДЖЛ (май 1973). «Бактериофаг Φ6 — липидсодержащий вирус Pseudomonas phaseolicola». Журнал вирусологии . 11 (15): 799–805. doi :10.1128/jvi.11.5.799-805.1973. PMC 355178. PMID  16789137 . 
  5. ^ abc Mindich L, Qiao X, Qiao J, Onodera S, Romantschuk M, Hoogstraten D (август 1999). "Выделение дополнительных бактериофагов с геномами сегментированной двухцепочечной РНК". J. Bacteriol . 181 (15): 4505–8. doi :10.1128/JB.181.15.4505-4508.1999. PMC 103579. PMID  10419946 . 
  6. ^ ab Silander OK, Weinreich DM, Wright KM и др. (декабрь 2005 г.). «Широко распространенный генетический обмен среди наземных бактериофагов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 102 (52): 19009–14. Bibcode : 2005PNAS..10219009S. doi : 10.1073/pnas.0503074102 . PMC 1323146. PMID  16365305 . 
  7. ^ Gottlieb P, Potgieter C, Wei H и Toporovsky I (2002). «Характеристика φ12, бактериофага, родственного φ6: нуклеотидная последовательность большой двухцепочечной РНК». Вирусология . 295 (2): 266–271. doi : 10.1006/viro.2002.1436 . PMID  12033785.
  8. ^ ab Krishnamurthy, Siddharth R.; Janowski, Andrew B.; Zhao, Guoyan; Barouch, Dan; Wang, David (2016). «Гиперэкспансия разнообразия РНК-бактериофагов». PLOS Biology . 14 (3): e1002409. doi : 10.1371/journal.pbio.1002409 .
  9. ^ ab Cai, Xiaoyao; Tian, ​​Fengjuan; Teng, Li; Liu, Hongmei; Tong, Yigang; Le, Shuai; Zhang, Tingting (2021). «Выращивание литического двухцепочечного РНК-бактериофага, инфицирующего Microvirgula aerodenitrificans, выявляет мутуалистический паразитический образ жизни». Journal of Virology . 95 (17): e0039921. doi :10.1128/JVI.00399-21. PMC 8354237 . PMID  34133887. 
  10. ^ abcdef Криппен, CS; Чжоу, B.; Андресен, S.; Патри, RT; Мушинский, A.; Паркер, CT; Купер, KK; Шиманский, CM (2021). "РНК и сахара, уникальные свойства бактериофагов, инфицирующих штамм Acinetobacter radioresistens с множественной лекарственной устойчивостью LH6". Вирусы . 13 (8): 1652. doi : 10.3390/v13081652 . PMC 8402811 . PMID  34452516. 
  11. ^ abc Cystoviridae. Таксономия NCBI.
  12. ^ Butcher SJ, Dokland T, Ojala PM, Bamford DH, Fuller SD (июль 1997 г.). «Промежуточные звенья в пути сборки двухцепочечной РНК-вируса phi6». EMBO J . 16 (14): 4477–87. doi :10.1093/emboj/16.14.4477. PMC 1170074 . PMID  9250692. 
  13. ^ Кунин, Евгений В.; Доля, Валериан В.; Крупович, Март (2015). «Происхождение и эволюция вирусов эукариот: конечная модульность». Вирусология . 479–480: 2–25. doi :10.1016/j.virol.2015.02.039. PMC 5898234. PMID  25771806 . 

Внешние ссылки