Антуан Даншен (родился 7 мая 1944 года) — французский генетик . Он наиболее известен своими исследованиями в нескольких областях биологии, от структуры и функции аденилатциклазы до моделирования обучения в нервной системе и раннего развития геномики и биоинформатики . Он является председателем стартапа AMAbiotics, который специализируется на метаболической биоремедиации и синтетической биологии. Он был директором департамента геномов и генетики в Институте Пастера в Париже, где возглавлял подразделение генетики бактериальных геномов.
Он получил образование математика в Институте Анри Пуанкаре и физика в Высшей нормальной школе . Работая сначала с Милдред Кон , Марианной Грюнберг-Манаго и Ионелом Соломоном в области ядерного магнитного резонанса , Данчин стал экспериментальным микробиологом в начале семидесятых. Он создал вместе с Филиппом Куррежем и Жаном-Пьером Шанже в Институте физико-химической биологии в Париже, Франция, рабочий семинар, где они вместе работали над созданием математических моделей обучения и памяти. [2]
Заинтересованный в университетском образовании, он создал вместе с Морисом Героном первый семестр биологии в Политехнической школе и развивал свое преподавание в течение четырех лет. Среди его первых студентов можно найти Даниэля Кана, Патрика Шарнея и многих других. Главной целью его исследований было попытаться понять, как гены могут функционировать коллективно в клетке. Это привело его к работе над системами регуляции, которые контролируют глобальную экспрессию генов у бактерий. Часть его работы была посвящена изучению ферментов, которые синтезируют циклический АМФ. Он создал эталонную классификацию аденилатциклаз [3] после того, как его лаборатория успешно клонировала и секвенировала гены токсинов аденилатциклазы из возбудителя коклюша [4] , а также из возбудителя сибирской язвы . [5] Эта работа привела его к этическим размышлениям о практиках молекулярной генетики и геномики в то время, когда это не считалось важным. [6]
В 1985 году Данчин начал сотрудничество с компьютерными учеными для оценки методов искусственного интеллекта для изучения комплексных проблем в молекулярной генетике . [7] Это убедило его, что пришло время исследовать геномы как целые, при условии, что параллельно будет начато важное усилие в компьютерных науках ( биология in silico ). В начале 1987 года он предложил провести программу секвенирования для Bacillus subtilis . Это предложение было реализовано совместными европейскими усилиями по этому геному, начавшимися в 1988 году. Полная последовательность была опубликована в 1997 году. [8] Первым значительным и неожиданным открытием этой работы стало то, что в 1991 году многие гены (в то время половина генов) имели совершенно неизвестную функцию. Это привело его к попытке организовать биоинформатику во Франции с помощью нескольких коллег из университетов, CNRS и INRIA , путем создания общенациональной группы GDR 1029 (1991–1995) и впоследствии посредством координации программы биоинформатики Groupement de Recherche et d'Etudes des Genomes (1992–1996), затем в Comité de Coordination des Sciences du Vivant (1998–2000). Повторное секвенирование и повторная аннотация генома B. subtilis были завершены в 2009 году для обновления последовательности и аннотации этого эталонного генома . [9]
В 2000 году Данчин создал в Гонконге Исследовательский центр HKU-Pasteur, призванный развивать микробную геномику в регионе, при поддержке Комиссии по инновациям и технологиям правительства Специального административного района Гонконг для развития биоинформатики (программа Biosupport). [10]
В настоящее время Данчин разрабатывает теоретические размышления и эксперименты в области синтетической биологии , [11] пытаясь сделать явной идею о том, что клетки ведут себя как компьютеры ( машины Тьюринга ), создающие компьютеры. [12] Вместе с Виктором де Лоренцо он создал бесплатный и открытый журнал Symplectic Biology , посвященный публикации инновационных идей в области системной и синтетической биологии. [13]
Антуан Даншен — отец Рафаэля Даншена.