stringtranslate.com

Диктиостелид

Диктиостелиды ( Dictyostelia /Dictyostelea , ICZN , Dictyosteliomycetes , ICBN ) или клеточные слизевики представляют собой группу слизевиков или общественных амеб .

Многоклеточное поведение

Чашка Петри с Dictyostelium .

Когда пища (обычно бактерии) легкодоступна, диктиостелиды ведут себя как отдельные амебы, которые питаются и делятся нормально. Однако, когда запасы пищи истощаются, они объединяются, образуя многоклеточную совокупность, называемую псевдоплазмодием, грексом или слизнем (не путать с брюхоногим моллюском , называемым слизнем ). Грекс имеет четко выраженную переднюю и заднюю части, реагирует на свет и температурные градиенты и обладает способностью к миграции. При правильных обстоятельствах грекс созревает, образуя сорокарпий ( плодовое тело) со стеблем, поддерживающим один или несколько сорусов (шариков спор). Эти споры представляют собой неактивные клетки, защищенные устойчивыми клеточными стенками, и становятся новыми амебами, как только появляется пища.

У Acytostelium сорокарпий поддерживается стеблем, состоящим из целлюлозы , но у других диктиостелид стебель состоит из клеток, иногда занимая большую часть исходных амеб. За некоторыми исключениями, эти клетки умирают во время формирования стебля, и существует определенное соответствие между частями грекса и частями плодового тела. Агрегация амеб обычно происходит в сходящихся потоках. Амебы передвигаются с помощью нитевидных ложноножек и привлекаются химическими веществами, вырабатываемыми другими амебами. У Dictyostelium discoideum агрегация сигнализируется цАМФ , но другие используют другие химические вещества. У вида Dictyostelium purpureum группировка осуществляется по родству, а не только по близости.

Использование в качестве модельного организма

Dictyostelium использовался как модельный организм в молекулярной биологии и генетике и изучался как пример клеточной коммуникации , дифференциации и запрограммированной клеточной смерти . Это также интересный пример эволюции кооперации и обмана. [1] [2] [3] Большой объем исследовательских данных, касающихся D. discoideum, доступен в сети на DictyBase .

Жизненный цикл диктиостелиума

Механизм агрегации вДиктиостелиум дискоидеум

Диаграмма, показывающая, как амеба Dictyostelium discoideum реагирует на цАМФ

Механизм агрегации амеб основан на циклическом аденозинмонофосфате (цАМФ) как сигнальной молекуле. Одна клетка, основательница колонии, начинает секретировать цАМФ в ответ на стресс. Другие обнаруживают этот сигнал и реагируют двумя способами:

Эффект этого заключается в передаче сигнала всей близлежащей популяции амеб и в движении внутрь к области с самой высокой концентрацией цАМФ.

Внутри отдельной клетки механизм выглядит следующим образом:

  1. Прием цАМФ на клеточной мембране активирует G-белок
  2. G-белок стимулирует аденилатциклазу
  3. цАМФ диффундирует из клетки в среду
  4. Внутренний цАМФ инактивирует внешний рецептор цАМФ.
  5. Другой G-белок стимулирует фосфолипазу C
  6. IP 3 вызывает высвобождение ионов кальция
  7. Ионы кальция воздействуют на цитоскелет , вызывая расширение псевдоподий .

Поскольку внутренняя концентрация цАМФ инактивирует рецептор внешнего цАМФ, отдельная клетка демонстрирует колебательное поведение. Это поведение производит красивые спирали, наблюдаемые в сходящихся колониях, и напоминает реакцию Белоусова-Жаботинского и двумерные циклические клеточные автоматы .

Геном

Полный геном Dictyostelium discoideum был опубликован в журнале Nature в 2005 году генетиком Людвигом Эйхингером и его коллегами. [4] Гаплоидный геном содержит приблизительно 12 500 генов на 6 хромосомах. Для сравнения, диплоидный геном человека содержит 20 000–25 000 генов (представленных дважды) на 23 парах хромосом. Существует высокий уровень нуклеотидов аденозина и тимидина (~77%), что приводит к использованию кодона, которое благоприятствует большему количеству аденозинов и тимидинов в третьей позиции. Тандемные повторы тринуклеотидов широко распространены у Dictyostelium, что у людей вызывает нарушения тринуклеотидных повторов .

Половое размножение

Половое развитие может происходить, когда амебоидные клетки испытывают нехватку бактериальной пищи и присутствуют темные влажные условия. [5] Как гетероталличные, так и гомоталличные штаммы Dictostelium могут подвергаться спариванию. Гетероталлическое половое развитие наиболее подробно изучено у D. discoideum , а гомоталличное половое развитие наиболее хорошо изучено у D. mucoroides . [6] Гетероталлические спаривания инициируются слиянием гаплоидных клеток (гамет) из двух штаммов противоположного типа спаривания. Это контрастирует с гомоталличными штаммами, которые, по-видимому, выражают оба типа спаривания. [7]

Спаривание инициируется гаметогенезом, который производит маленькие подвижные гаметы, которые сливаются, образуя маленькую двуядерную клетку . Затем объем двуядерной клетки увеличивается, образуя гигантскую двуядерную клетку. По мере роста ядра набухают, а затем сливаются, образуя настоящую диплоидную зиготную гигантскую клетку. Пока это происходит, амебы подвергаются цАМФ-индуцированному хемотаксису по направлению к поверхности гигантской клетки. Это образует клеточный агрегат, и в центре агрегата гигантская клетка зиготы поглощает окружающие амебы. За фагоцитозом следует переваривание поглощенных амеб. Затем зигота образует макроцисту, характеризующуюся окружающей внеклеточной целлюлозной оболочкой. После того, как макроциста сформирована, она обычно остается в состоянии покоя в течение некоторого периода, прежде чем может произойти прорастание. [8] Внутри макроцисты диплоидная зигота претерпевает мейоз, за ​​которым следуют последовательные митотические деления. При прорастании макроциста высвобождает множество гаплоидных амебоидных клеток.

Таксономия

История классификации

Филогенетическое дерево Dictyostelium претерпело множество изменений за последние десятилетия. Первым диктиостелидом, описанным в 1869 году, был Dictyostelium mucoroides Оскера Брефельда, а первоначальное открытие Dictyostelium discoideum произошло в 1935 году [9] с дальнейшими открытиями Кеннета Рэпера , за которыми последовали глобальные усилия под руководством Джеймса Кавендера и его коллег. Dictyostelium discoideum изначально относился к «низшим грибам», но с тех пор классификация переместилась в тип Amoebozoa, где он находится и в настоящее время. [4]

Группы в древе филогении диктиостелид часто перестраивались из-за доступности новых доказательств. Большинство принятых в настоящее время филогений диктиостелид используют секвенирование генома и малую субъединицу рибосомной ДНК (ssu-rDNA). Диктиостелиды могут быть далее подразделены на четыре группы. В частности, группа 4 содержит вид Dictyostelium discoideum и отличается от других групп использованием цАМФ в качестве аттрактанта, выделяемого во время агрегации. [10]

Эволюция

Калибровка ископаемых показывает, что класс диктиостелид изначально разделился на две основные ветви примерно 0,52 миллиарда лет назад. Современные теории предполагают, что стебель и спорообразование диктиостелид изначально развились как адаптация к глобальным ледниковым образованиям. Дальнейшее подразделение видов диктиостелид, вероятно, возникло по мере таяния большинства ледниковых образований. Большинство видов в основных группах 1, 2 и 3 демонстрируют способность к инцистированию, которая позволяет особям выживать при низких температурах, но споры показали повышенную способность противостоять более низким температурам. Группа 4 отличается от других основных групп общим отсутствием способности к инцистированию, но ее споры показали лучшую устойчивость к более низким температурам по сравнению со спорами из других групп. [11]

Внутренняя филогения диктиостелид представлена ​​на кладограмме . [12]

Таксономия

Класс Dictyostelia Lister 1909 см. Олива 1970 [13]

Модель организма-хозяина дляЛегионелла

Dictyostelium разделяет многие молекулярные особенности с макрофагами , человеческим хозяином Legionella . Состав цитоскелета D. discoideum похож на состав клеток млекопитающих, как и процессы, управляемые этими компонентами, такие как фагоцитоз, мембранный трафик, эндоцитарный транзит и сортировка везикул. Подобно лейкоцитам, D. discoideum обладает хемотаксической способностью. Следовательно, D. discoideum представляет собой подходящую модельную систему для определения влияния различных факторов клетки-хозяина во время инфекций Legionella . [14]

Ссылки

  1. ^ Strassman JE, Zhu Y и Queller DC. (2000) Альтруизм и социальное мошенничество у социальной амебы Dictyostelium discoideum . Природа
  2. ^ Дао DN, Кессин RH и Эннис HL (2000). Обман развития и эволюционная биология Dictyostelium и Myxococcus . Микробиология
  3. ^ Брэннсром А. и Дикманн У. (2005). Эволюционная динамика альтруизма и обмана среди социальных амеб. Труды Лондонского королевского общества Б.
  4. ^ ab Eichinger, L.; Pachebat, JA; Glöckner, G.; Rajandream, MA; Sucgang, R.; Berriman, M.; Song, J.; Olsen, R.; Szafranski, K.; Xu, Q.; et al. (2005). «Геном социальной амебы Dictyostelium discoideum». Nature . 435 (7038): 43–57. Bibcode :2005Natur.435...43E. doi :10.1038/nature03481. PMC  1352341 . PMID  15875012.
  5. ^ Флауэрс Дж. М., Ли СИ, Статос А., Саксер Г., Островски EA, Куэллер Д. Квеллер, Штрассман Дж. Э., Пуругганан М. Д. (июль 2010 г.). «Изменчивость, пол и социальное сотрудничество: молекулярная популяционная генетика социальной амебы Dictyostelium discoideum». PLOS Genet . 6 (7): e1001013. doi : 10.1371/journal.pgen.1001013 . PMC 2895654. PMID  20617172 . 
  6. ^ O'Day DH, Keszei A (май 2012). «Сигнализация и секс у социальных амебозоев». Biol Rev Camb Philos Soc . 87 (2): 313–29. doi :10.1111/j.1469-185X.2011.00200.x. PMID  21929567. S2CID  205599638.
  7. ^ Robson GE, Williams KL (апрель 1980 г.). «Система спаривания клеточной слизистой плесени Dictyostelium discoideum». Curr. Genet . 1 (3): 229–32. doi :10.1007/BF00390948. PMID  24189663. S2CID  23172357.
  8. ^ Никерсон AW, Рапер KB. Макроцисты в жизненном цикле Dictyostelliaceae II. Прорастание макроцист. Am. J. Bot. 1973 60(3): 247-254.
  9. ^ Брефельд, О (1869). «Ein neuer Organismus und der Verwandschaft der Myxomyceten». Абх Зекенберг Натурфорш Гес . 7 : 85–107.
  10. ^ Шильде, Кристина; Лаваль, Хаджара М.; Кин, Корю; Сибано-Хаякава, Икуми; Иноуе, Кей; Шаап, Полина (2019). «Хорошо подтвержденная мультигенная филогения 52 диктиостелий». Молекулярная филогенетика и эволюция . 134 : 66–73. doi :10.1016/j.ympev.2019.01.017. ISSN  1055-7903. ПМК 6430600 . ПМИД  30711536. 
  11. ^ Лавал, Хаджара М.; Шильде, Кристина; Кин, Корю; Браун, Мэтью У.; Джеймс, Джон; Прескотт, Алан Р.; Шаап, Полин (29.05.2020). «Адаптация к холодному климату — вероятная причина эволюции многоклеточного спорообразования у Dictyostelia». Scientific Reports . 10 (1): 8797. doi :10.1038/s41598-020-65709-3. ISSN  2045-2322. PMC 7260361 . PMID  32472019. 
  12. ^ Шейх, Санеа; Тулин, Матс; Кавендер, Джеймс С; Эскаланте, Рикардо; Каваками, Синъити; Ладо, Карлос; Ландольт, Джон; Нанджундия, Видьянанд; Квеллер, Дэвид; Штрассманн, Джоан; Шпигель, Фредерик В.; Стивенсон, Стив; Ваделл, Эдуардо М; Балдауф, Сандра (24 ноября 2017 г.). «Новая классификация диктиостелид». Протисты . 169 (1): 1–28. doi :10.1016/j.protis.2017.11.001. ПМИД  29367151.
  13. ^ Виджаявардене, Налин; Хайд, Кевин; Аль-Ани, ЛКТ; Долатабади, С; Штадлер, Марк; Хейлевотерс, Дэнни; ​​и др. (2020). «Очерк грибов и грибоподобных таксонов». Mycosphere . 11 : 1060–1456. doi : 10.5943/mycosphere/11/1/8 . hdl : 10481/61998 .
  14. ^ Брун и др. (2008). «Dictyostelium, податливый модельный организм-хозяин для легионеллы».Легионелла : Молекулярная микробиология . Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-26-4.

Внешние ссылки