12 развивающихся популяций E. coli , 25 июня 2008 г.
Эксперимент по долгосрочной эволюции E. coli — это продолжающееся исследование экспериментальной эволюции под руководством Ричарда Ленски, которое отслеживает генетические изменения в 12 изначально идентичных популяциях бесполых бактерий Escherichia coli с 24 февраля 1988 года . 75 000 поколений в 2022 году. [15]
С момента начала эксперимента Ленски и его коллеги сообщили о широком спектре генетических изменений; некоторые эволюционные адаптации произошли во всех 12 популяциях, тогда как другие появились только в одной или нескольких популяциях. Одной из особенно поразительных адаптаций стала эволюция штамма кишечной палочки , который был способен использовать цитрат в качестве источника углерода в аэробной среде. [16] Определяющей характеристикой кишечной палочки является ее неспособность использовать цитрат в качестве источника энергии в кислородных условиях. [17]
Авида моделирование
Ричард Ленски, Чарльз Офриа и др. в Университете штата Мичиган разработали компьютерную программу искусственной жизни , способную детализировать эволюцию сложных систем. Система использует набор значений для определения случайных мутаций и учитывает эффект естественного отбора для сохранения полезных признаков. Программа получила название Avida и начинается с искусственной чашки Петри, в которой организмы размножаются и выполняют математические расчеты, чтобы получить в награду больше компьютерного времени для репликации. Программа случайным образом добавляет мутации к копиям искусственных организмов, чтобы обеспечить естественный отбор. По мере воспроизводства искусственной жизни различные линии адаптировались и развивались в зависимости от окружающей среды. Преимущество программы в том, что она аналогична реальной жизни на высоких скоростях. [18] [19] [20] [21]
СМИ
В августе 2013 года, вдохновленный презентацией Титуса Брауна о роли социальных сетей в науке, Ленски начал вести блог на сайте Telliamed Revisited и писать в Твиттере под ником @RELenski. [22]
Исследования Ленски привлекли значительное внимание, включая продолжительное обсуждение в книге Карла Циммера об кишечной палочке « Микрокосм » и в книге Ричарда Докинза о доказательствах эволюции « Величайшее шоу на Земле ». В дискуссию Докинза было включено описание диалога, который Ленски вел в 2008 году с Эндрю Шлафли, создателем Conservapedia , который Шлафли инициировал как реакцию на сообщения об описании Ленски эволюции использования аэробного цитрата в одном из долгосрочных эволюционных экспериментов. населения. Эти же данные позже были приведены креационистом Кеном Хэмом в дискуссии об эволюции с Биллом Наем . Ленски резко раскритиковал цитирование Хэмом его работы и выводы, которые Хэм сделал из нее. [23]
Рекомендации
^ ab «Ричард Ленски из МГУ выигрывает премию «Друг Дарвина 2017»» .
^ "Фонд Джона Саймона Гуггенхайма | Ричард Э. Ленски" .
^ Тенайон, Оливье; Баррик, Джеффри Э.; Рибек, Ной; Детередж, Дэниел Э.; Бланшар, Джеффри Л.; Дасгупта, Аурко; Ву, Габриэль С.; Вильгосс, Себастьен; Крювейе, Стефан (11 августа 2016 г.). «Темп и характер эволюции генома в эксперименте на 50 000 поколений». Природа . 536 (7615): 165–170. Бибкод : 2016Natur.536..165T. дои : 10.1038/nature18959. ISSN 0028-0836. ПМЦ 4988878 . ПМИД 27479321.
^ Маддамсетти, Рохан; Ленски, Ричард Э.; Баррик, Джеффри Э. (01 июня 2015 г.). «Адаптация, клональная интерференция и частотно-зависимые взаимодействия в долгосрочном эксперименте по эволюции Escherichia coli». Генетика . 200 (2): 619–631. doi : 10.1534/genetics.115.176677. ISSN 0016-6731. ПМЦ 4492384 . ПМИД 25911659.
^ Ленски, RE (1 декабря 1998 г.). «Эволюция бактерий и цена устойчивости к антибиотикам». Международная микробиология . 1 (4): 265–270. ISSN 1139-6709. ПМИД 10943373.
^ Блаунт, Закари Д.; Борланд, Кристина З.; Ленски, Ричард Э. (10 июня 2008 г.). «Историческая случайность и эволюция ключевой инновации в экспериментальной популяции Escherichia coli». Труды Национальной академии наук . 105 (23): 7899–7906. Бибкод : 2008PNAS..105.7899B. дои : 10.1073/pnas.0803151105 . ISSN 0027-8424. ПМЦ 2430337 . ПМИД 18524956.
^ Мейер, Джастин Р.; Добиас, Девин Т.; Медина, Сара Дж.; Сервилио, Лиза; Гупта, Анимеш; Ленски, Ричард Э. (24 ноября 2016 г.). «Экологическое видообразование бактериофага лямбда в аллопатрии и симпатрии». Наука . 354 (6317): 1301–1304. Бибкод : 2016Sci...354.1301M. дои : 10.1126/science.aai8446 . ISSN 0036-8075. ПМИД 27884940.
↑ Ричард Ленски [@relenski] (17 августа 2014 г.). «Фото Рихарда Ленски и Герхарда Ленски к 90-летию отца» (Твит) . Проверено 18 августа 2014 г. — через Twitter .
^ Кэмпбелл, Нил А.; Рис, Джейн Б. (2005). Биология (7-е изд.). Пирсон, Бенджамин Каммингс. стр. 538–539. ISBN978-0-8053-7146-8.
^ Список членов Национальной академии наук США, «Справочник участников», Ричард Э. Ленски , 2006 г.
^ «Выборы новых членов на весеннем собрании 2018 года».
^ «Общество изучения эволюции». www.evolutionsociety.org . Проверено 4 июля 2021 г.
^ Ленски, Ричард Э. (2000). «Источник основополагающего штамма». Домашняя страница Ричарда Э. Ленски . Мичиганский государственный университет. Архивировано из оригинала 31 мая 2018 г. Проверено 18 июня 2008 г.
↑ Ленски, Ричард (15 февраля 2023 г.). «Возвращаясь к плану эксперимента по долгосрочной эволюции Escherichia coli». Журнал молекулярной эволюции . 91 (1): 241–253. Бибкод : 2023JMolE..91..241L. дои : 10.1007/s00239-023-10095-3. PMID 36790511. S2CID 256869639.
^ Блаунт, Закари Д.; Борланд, Кристина З.; Ленски, Ричард Э. (2008). «Историческая случайность и эволюция ключевой инновации в экспериментальной популяции Escherichia coli». Труды Национальной академии наук . 105 (23): 7899–906. Бибкод : 2008PNAS..105.7899B. дои : 10.1073/pnas.0803151105 . JSTOR 25462703. PMC 2430337 . ПМИД 18524956.
^ Блаунт, Закари; Борланд, Кристина; Ленски, Ричард (10 июня 2008 г.). «Историческая случайность и эволюция ключевой инновации в экспериментальной популяции Escherichia coli». ПНАС . 105 (23): 7899–7906. Бибкод : 2008PNAS..105.7899B. дои : 10.1073/pnas.0803151105 . ПМЦ 2430337 . ПМИД 18524956.
^ Ленски, RE; Офрия, К. ; Пеннок, RT ; Адами, К. (2003). «Эволюционное происхождение сложных особенностей» (PDF) . Природа . 423 (6936): 139–144. Бибкод : 2003Natur.423..139L. дои : 10.1038/nature01568. PMID 12736677. S2CID 4401833. Архивировано из оригинала (PDF) 21 января 2021 г. Проверено 20 августа 2013 г.
^ «Цифровые организмы, используемые для подтверждения эволюционного процесса» . Американская ассоциация содействия развитию науки . Проверено 21 марта 2011 г.
^ «Эксперименты с искусственной жизнью показывают, как могут развиваться сложные функции» . Американская ассоциация содействия развитию науки . Проверено 21 марта 2011 г.
^ Ричард Э. Ленски; Чарльз Офриа; Клаус О. Уилке; Цзя Лань Ван и Кристоф Адами (19 июля 2001 г.). «Эволюция цифровых организмов с высокой скоростью мутаций приводит к выживанию самых плоских» (PDF) . Природа . 412 (6844): 331–3. Бибкод : 2001Natur.412..331W. дои : 10.1038/35085569. PMID 11460163. S2CID 1482925.
↑ Ричард Ленски (19 августа 2013 г.). «Добро пожаловать в новый Теллиамед».