stringtranslate.com

Питер Мюррей-Раст

Питер Мюррей-Раст — химик, в настоящее время работающий в Кембриджском университете . Помимо своей работы в области химии, Мюррей-Раст также известен своей поддержкой открытого доступа и открытых данных .

Образование

Он получил образование в Bootham School , [ требуется ссылка ] частной школе в Йорке , и в Balliol College, Оксфорд . Получив степень доктора философии за диссертацию под названием « Структурное исследование некоторых соединений, демонстрирующих свойства переноса заряда» , он стал преподавателем химии в (новом) Университете Стерлинга и был первым смотрителем общежития Andrew Stewart Hall of Residence. В 1982 году он перешел в Glaxo Group Research в Гринфорде, чтобы возглавить молекулярную графику, [1] вычислительную химию и позднее определение структуры белка. Он был профессором фармации в Университете Ноттингема с 1996 по 2000 год, основав Виртуальную школу молекулярных наук. Сейчас он почетный преподаватель молекулярной информатики в Кембриджском университете и почетный старший научный сотрудник в Churchill College, Кембридж .

Исследовать

Его исследовательские интересы включают автоматизированный анализ данных в научных публикациях, создание виртуальных сообществ, например, Виртуальной школы естественных наук в Академии глобальной сети и Семантической паутины . Совместно с Генри Рзепой он распространил это на химию посредством разработки языков разметки , особенно языка химической разметки . [2] Он выступает за открытые данные , особенно в науке, и является членом консультативного совета Open Knowledge International и соавтором Принципов Пантона для открытых научных данных. [3] Вместе с несколькими другими химиками он был одним из основателей движения Blue Obelisk в 2005 году. [4] [5] [6]

В 2002 году Питер Мюррей-Раст и его коллеги предложили создать электронное хранилище неопубликованных химических данных под названием World Wide Molecular Matrix (WWMM). В январе 2011 года был организован симпозиум, посвященный его карьере и видению, под названием Visions of a Semantic Molecular Future . [7] [8] [9] [10] В 2011 году он и Генри Ржепа стали соавторами премии Германа Скольника Американского химического общества . [11] В 2014 году он был удостоен стипендии от Фонда Шаттлворта для разработки автоматизированного извлечения научных данных из литературы.

В 2009 году Мюррей-Раст ввел термин «модель Доктора Кто» для феномена, продемонстрированного проектом Blue Obelisk и другими проектами Open Science, где, когда у руководителя проекта нет ресурсов, чтобы продолжать руководить проектом (например, потому что он или она перешли в другой университет с другими задачами), кто-то другой встает, чтобы стать новым лидером и продолжить проект. [12] [13] Это отсылка к продолжительному британскому научно-фантастическому телесериалу «Доктор Кто» , в котором главный герой периодически перерождается в другую форму, которую играет другой актер.

В 2014 году Мюррей-Раст получил стипендию от Фонда Шаттлворта в связи с проектом ContentMine, который использует машины для извлечения 100 000 000 фактов из научной литературы. [14]

Активизм

Мюррей-Раст также известен своей работой по предоставлению свободного доступа к научным знаниям из литературы и, таким образом, позицией против издателей, которые не полностью соблюдают Берлинскую декларацию об открытом доступе . В 2014 году он активно повышал осведомленность о сбоях в издательской системе Elsevier , где Elsevier налагала ограничения на повторное использование статей после того, как авторы заплатили Elsevier за предоставление свободного доступа к статье. [15]

Ссылки

  1. ^ Мюррей-Раст, П.; Глускер, Дж. П. (1984). «Направленная водородная связь с sp2- и sp3-гибридизованными атомами кислорода и ее значение для лиганд-макромолекулярных взаимодействий». Журнал Американского химического общества . 106 (4): 1018–1025. doi :10.1021/ja00316a034.
  2. ^ Мюррей-Раст, П.; Ржепа, Х. С. (1999). «Химическая разметка, XML и Всемирная паутина. 1. Основные принципы». Журнал химической информации и моделирования . 39 (6): 928–942. CiteSeerX 10.1.1.40.8275 . doi :10.1021/ci990052b. 
  3. ^ http://pantonprinciples.org/ Архивировано 22 июня 2017 г. в Wayback Machine Принципы Panton для открытых данных в науке
  4. ^ Гуха, Р.; Говард, М. Т.; Хатчисон, ГР.; Мюррей-Раст, П.; Рзепа, Х .; Стейнбек, К .; Вегнер, Дж.; Виллигхаген, Э. Л. (2006). «Голубой обелиск — совместимость в химической информатике». Журнал химической информации и моделирования . 46 (3): 991–998. doi :10.1021/ci050400b. PMC 4878861. PMID 16711717  . 
  5. ^ O'Boyle, NM; Guha, R.; Willighagen, EL; Adams, SE; Alvarsson, J.; Bradley, JC; Filippov, IV; Hanson, RM; Hanwell, MD; Hutchison, GR; James, CA; Jeliazkova, N.; Lang, ASD; Langner, KM; Lonie, DC; Lowe, DM; Pansanel, JRM; Pavlov, D.; Spjuth, O.; Steinbeck, C.; Tenderholt, AL; Theisen, KJ; Murray-Rust, P. (2011). "Открытые данные, открытый исходный код и открытые стандарты в химии: Голубой обелиск пять лет спустя". Journal of Cheminformatics . 3 (1): 37. doi : 10.1186/1758-2946-3-37 . PMC 3205042. PMID  21999342 . 
  6. Голубой обелиск, CDK News , 2005, 2, 43–46
  7. ^ Джонс, Р.; Макгилливрей, М.; Мюррей-Раст, П.; Питман, Дж.; Сефтон, П.; О'Стин, Б.; Уэйтс, У. (2011). «Открытая библиография по науке, технологиям и медицине». Журнал химинформатики . 3 : 47. doi : 10.1186/1758-2946-3-47 . PMC 3206455. PMID  21999661 . 
  8. ^ Архив CCL, 2010, http://ccl.net/chemistry/resources/messages/2010/11/12.005-dir/
  9. ^ Архивы встреч и публикации, 2011, http://www.dspace.cam.ac.uk/handle/1810/238409
  10. ^ Мюррей-Раст, П. (2011). «Семантическая наука и ее коммуникация — личный взгляд». Журнал химинформатики . 3 : 48. doi : 10.1186/1758-2946-3-48 . PMC 3206456. PMID  21999715 . 
  11. ^ Архив CCL, 2011, http://www.ccl.net/cgi-bin/ccl/message-new?2011+09+26+014
  12. ^ Глин Муди, Модель открытого исходного кода «Доктора Кто», 2009, http://opendotdotdot.blogspot.nl/2009/06/doctor-who-model-of-open-source.html
  13. ^ П. Мюррей-Раст, Модель открытого исходного кода «Доктора Кто», 2009, http://blogs.ch.cam.ac.uk/pmr/2009/06/06/the-doctor-who-model-of-open-source/
  14. ^ http://contentmine.org/ Архивировано 31 июля 2014 г. на Wayback Machine
  15. ^ Пол Джамп, Elsevier: трудности на пути к открытому доступу, Times Higher Education, 2014, http://www.timeshighereducation.co.uk/news/elsevier-bumps-on-road-to-open-access/2012238.article

Внешние ссылки