Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
85 кДа кальций-независимая фосфолипаза А2 , также известная как 85/88 кДа кальций-независимая фосфолипаза А2 , фосфолипаза группы VI A2 , внутриклеточная мембранно-ассоциированная кальций-независимая фосфолипаза А2 бета или белок 9, содержащий домен пататин-подобной фосфолипазы, представляет собой фермент , который у людей кодируется геном PLA2G6 . [ 5] [6] [7] [8] [9] [10]
Структура
Ген PLA2G6 расположен на плече p хромосомы 22 в позиции 13.1 и охватывает 80 605 пар оснований. [8] Ген PLA2G6 производит белок массой 18,6 кДа, состоящий из 166 аминокислот . [11] [12] Было показано, что структура полученного белка содержит мотив липазы и 8 анкириновых повторов . [5] В отличие от PLA2G6 грызунов, который, как известно, на 90% совпадает с последовательностью аминокислот человека, человеческий белок PLA2G6 содержит вставку из 54 остатков, которая кодирует богатую пролином область. Было показано, что эта вставка нарушает последний предполагаемый анкириновый повтор , а также функционирует как линкерная область, которая отделяет N-концевой домен связывания белка от C-концевого каталитического домена. [5] [13]
Функция
Ген PLA2G6 кодирует фермент фосфолипазу A2 , который является подклассом ферментов, катализирующих высвобождение жирных кислот из фосфолипидов . [8] Этот тип ферментов отвечает за расщепление (метаболизм) фосфолипидов . Метаболизм фосфолипидов необходим для многих процессов в организме, включая помощь в поддержании целостности клеточной мембраны .
В частности, фосфолипаза A2 , продуцируемая геном PLA2G6 , иногда называемая группой VI PLA2, помогает регулировать уровни соединения, называемого фосфатидилхолином , который в изобилии присутствует в клеточной мембране. [14] Кодируемый белок также может играть роль в ремоделировании фосфолипидов , высвобождении арахидоновой кислоты , высвобождении арахидоновой кислоты , вызванном оксидом азота или вазопрессином, а также в синтезе лейкотриенов и простагландинов , апоптозе , опосредованном рецептором Fas , и трансмембранном ионном потоке в стимулированных глюкозой В-клетках . [8] [9]
Кроме того, он играет роль в деацилировании кардиолипина (CL) и необходим как для скорости, так и для направленности хемотаксиса , индуцированного моноцитами MCP1/CCL2, посредством регуляции полимеризации F-актина в псевдоподиях . Изоформа анкирин-iPLA2-1 и изоформа анкирин-iPLA2-2, в которых отсутствует каталитический домен, вероятно, участвуют в отрицательной регуляции активности PLA2G6. [9] Было описано несколько вариантов транскриптов, кодирующих несколько изоформ , но на сегодняшний день определена полноразмерная природа только двух из них. [8]
Каталитическая активность
Фосфатидилхолин + H2O = 1-ацилглицерофосфохолин + карбоксилат. [10] [9]
Клиническое значение
Было показано, что мутации в PLA2G6 приводят к митохондриальным дефицитам и связанным с ними расстройствам, включая нейродегенерацию, связанную с PLA2G6 (PLAN), которая имеет несколько подтипов и также известна как нейродегенерация с накоплением железа в мозге типа 2 (NBIA2), другие формы заболевания также называются болезнью Паркинсона 14 (PARK14) и наследственной спастической параплегией . [15] [9] [10]
PLA2G6-ассоциированная нейродегенерация (PLAN)
PLA2G6-ассоциированная нейродегенерация (PLAN) — нейродегенеративное расстройство, связанное с накоплением железа в мозге, в первую очередь в базальных ганглиях . Характеризуется прогрессирующей экстрапирамидной дисфункцией, приводящей к ригидности, дистонии , дизартрии и сенсомоторным нарушениям. [9] [10] [16]
Детская нейроаксональная дистрофия (ИНАД)
Самая тяжелая форма называется инфантильная нейроаксональная дистрофия (INAD), также нейродегенерация с накоплением железа в мозге типа 2A (NBIA2A), и характеризуется патологическим аксональным отеком и сфероидными тельцами в центральной нервной системе . Начало в течение первых 2 лет жизни со смертью часто в возрасте 10 лет. [9] [10] [16]
Атипичная нейроаксональная дистрофия (атипичная НАД)
Более поздняя детская и более медленно прогрессирующая форма называется атипичной нейроаксональной дистрофией (атипичная НАД), а также нейродегенерацией с накоплением железа в мозге типа 2B (НБИА2Б). [16]
Заболевание, возникающее у взрослых, называемое дистонией-паркинсонизмом, связанным с PLA2G6, приводит к развитию дистонии и паркинсонизма после более раннего нормального развития и также вызывается биаллельными мутациями в PLA2G6 . [16]
Болезнь Паркинсона 14 (PARK14)
Болезнь Паркинсона 14 типа (PARK14) — прогрессирующее нейродегенеративное заболевание, возникающее у взрослых и характеризующееся паркинсонизмом, дистонией , тяжелым снижением когнитивных функций, церебральной и мозжечковой атрофией и отсутствием железа в базальных ганглиях при магнитно-резонансной томографии . [9] [10]
Наследственная спастическая параплегия
Наследственные спастические параплегии — это разнообразный класс наследственных дегенеративных заболеваний спинного мозга , характеризующихся медленной, постепенной, прогрессирующей слабостью и спастичностью (скованностью) ног. Первоначальные симптомы могут включать трудности с равновесием, слабость и скованность в ногах, мышечные спазмы и волочение пальцев ног при ходьбе. При некоторых формах расстройства могут появляться симптомы со стороны мочевого пузыря (например, недержание), или слабость и скованность могут распространяться на другие части тела. Скорость прогрессирования и тяжесть симптомов весьма различны. [17]
Другим заболеванием, связанным с мутациями в этом гене, является детская нейроаксональная дистрофия .
Взаимодействия
Было показано, что PLA2G6 взаимодействует с белками следующими соединениями. [18] [9]
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000184381 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000042632 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ abc
- ^ Wilson PA, Gardner SD, Lambie NM, Commans SA, Crowther DJ (сентябрь 2006 г.). «Характеристика семейства человеческих пататин-подобных фосфолипаз». Journal of Lipid Research . 47 (9): 1940–1949. doi : 10.1194/jlr.M600185-JLR200 . PMID 16799181.
- ^ Kienesberger PC, Oberer M, Lass A, Zechner R (апрель 2009 г.). «Пататиновый домен млекопитающих, содержащий белки: семейство с разнообразной липолитической активностью, участвующей в нескольких биологических функциях». Journal of Lipid Research . 50 Suppl (Suppl): S63–S68. doi : 10.1194/jlr.R800082-JLR200 . PMC 2674697 . PMID 19029121.
- ^ abcde "Ген Entrez: PLA2G6 фосфолипаза A2, группа VI (цитозольная, кальций-независимая)".В данной статье использован текст из этого источника, находящегося в общественном достоянии .
- ^ abcdefghi "PLA2G6 - 85/88 кДа кальций-независимая фосфолипаза A2 - Homo sapiens (человек) - ген и белок PLA2G6" . Получено 22.08.2018 . В данной статье используется текст, доступный по лицензии CC BY 4.0.
- ^ abcdef "UniProt: универсальная база знаний о белках". Nucleic Acids Research . 45 (D1): D158–D169. Январь 2017. doi :10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622 .
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS и др. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний». Circulation Research . 113 (9): 1043–1053. doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338 .
- ^ "85/88 кДа кальций-независимая фосфолипаза A2". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB) . Архивировано из оригинала 2018-08-23 . Получено 2018-08-23 .
- ^ Ma Z, Wang X, Nowatzke W, Ramanadham S, Turk J (апрель 1999 г.). «Человеческие панкреатические островки экспрессируют виды мРНК, кодирующие две различные каталитически активные изоформы фосфолипазы A2 группы VI (iPLA2), которые возникают из-за механизма пропуска экзонов альтернативного сплайсинга транскрипта гена iPLA2 на хромосоме 22q13.1». Журнал биологической химии . 274 (14): 9607–9616. doi : 10.1074/jbc.274.14.9607 . PMC 3715997. PMID 10092647 .
- ^ "PLA2G6". Генетика Главная Справочник . NCBI.В данной статье использован текст из этого источника, находящегося в общественном достоянии .
- ^ Ozes B, Karagoz N, Schüle R, Rebelo A, Sobrido MJ, Harmuth F, et al. (Ноябрь 2017 г.). «Мутации PLA2G6, связанные с непрерывным клиническим спектром от нейроаксональной дистрофии до наследственной спастической параплегии». Clinical Genetics . 92 (5): 534–539. doi :10.1111/cge.13008. PMC 5597457 . PMID 28295203.
- ^ abcd Gregory A, Kurian MA, Maher ER, Hogarth P, Hayflick SJ (1993). "PLA2G6-ассоциированная нейродегенерация". GeneReviews . Университет Вашингтона, Сиэтл. PMID 20301718. Получено 21 апреля 2022 г.
- ^ "Наследственная спастическая параплегия". www.uniprot.org .
- ^ Mick DU, Dennerlein S, Wiese H, Reinhold R, Pacheu-Grau D, Lorenzi I и др. (декабрь 2012 г.). «MITRAC связывает транслокацию митохондриальных белков со сборкой дыхательной цепи и трансляционной регуляцией». Cell . 151 (7): 1528–1541. doi : 10.1016/j.cell.2012.11.053 . hdl : 11858/00-001M-0000-000E-DDDF-4 . PMID 23260140.
Дальнейшее чтение
- Schröder HC, Perovic S, Kavsan V, Ushijima H, Müller WE (1998). «Механизмы гибели нейрональных клеток, вызванной prionSc и HIV-1 gp120». Neurotoxicology . 19 (4–5): 683–688. PMID 9745929.
- Leslie CC (февраль 2004 г.). «Регулирование доступности арахидоновой кислоты для производства эйкозаноидов». Биохимия и клеточная биология . 82 (1): 1–17. doi :10.1139/o03-080. PMID 15052324.
- Turk J, Ramanadham S (октябрь 2004 г.). «Экспрессия и функция группы VIA кальций-независимой фосфолипазы A2 (iPLA2beta) в бета-клетках». Canadian Journal of Physiology and Pharmacology . 82 (10): 824–832. doi :10.1139/y04-064. PMID 15573142.
- Law MH, Cotton RG, Berger GE (июнь 2006 г.). «Роль фосфолипаз A2 при шизофрении». Молекулярная психиатрия . 11 (6): 547–556. doi : 10.1038/sj.mp.4001819 . PMID 16585943.
- Tang J, Kriz RW, Wolfman N, Shaffer M, Seehra J, Jones SS (март 1997). «Новая цитозольная кальций-независимая фосфолипаза A2 содержит восемь анкириновых мотивов». Журнал биологической химии . 272 (13): 8567–8575. doi : 10.1074/jbc.272.13.8567 . PMID 9079687.
- Mavoungou E, Georges-Courbot MC, Poaty-Mavoungou V, Nguyen HT, Yaba P, Delicat A и др. (сентябрь 1997 г.). «Гликопротеины оболочки ВИЧ и SIV вызывают активацию фосфолипазы A2 в лимфоцитах человека и макаки». Журнал синдромов приобретенного иммунодефицита и ретровирусологии человека . 16 (1): 1–9. doi : 10.1097/00042560-199709010-00001 . PMID 9377118.
- Данэм И., Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э. и др. (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека». Природа . 402 (6761): 489–495. Бибкод : 1999Natur.402..489D. дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208.
- Kim SJ, Gershov D, Ma X, Brot N, Elkon KB (сентябрь 2002 г.). «Активация I-PLA(2) во время апоптоза способствует воздействию мембранного лизофосфатидилхолина, что приводит к связыванию с естественными антителами иммуноглобулина М и активации комплемента». Журнал экспериментальной медицины . 196 (5): 655–665. doi :10.1084/jem.20020542. PMC 2194002. PMID 12208880 .
- Hichami A, Joshi B, Simonin AM, Khan NA (ноябрь 2002 г.). «Роль трех изоформ фосфолипазы A2 в емкостном притоке кальция в Т-клетки человека». European Journal of Biochemistry . 269 (22): 5557–5563. doi : 10.1046/j.1432-1033.2002.03261.x . PMID 12423354.
- Cummings BS, McHowat J, Schnellmann RG (март 2004 г.). «Роль Ca2+-независимой фосфолипазы A2 эндоплазматического ретикулума в апоптозе почечных клеток, вызванном цисплатином». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии . 308 (3): 921–928. doi :10.1124/jpet.103.060541. PMID 14634037. S2CID 1036850.
- Bao S, Jin C, Zhang S, Turk J, Ma Z, Ramanadham S (февраль 2004 г.). «Фосфолипаза A(2) бета-клеточной кальций-независимой группы VIA (iPLA(2)beta): отслеживание движений iPLA(2)beta в ответ на стимуляцию стимуляторами секреции инсулина в клетках INS-1». Диабет . 53 (90001, Suppl 1): S186–S189. doi :10.2337/diabetes.53.2007.S186. PMC 3761941 . PMID 14749286.
- Танака Х., Минаками Р., Канайя Х., Сумимото Х. (август 2004 г.). «Каталитические остатки кальций-независимой фосфолипазы А2 группы VIB (iPLA2gamma)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 320 (4): 1284–1290. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.05.225. ПМИД 15249229.