stringtranslate.com

РАД23Б

Белок эксцизионной репарации УФ-излучения RAD23 гомолог B — это белок , который у людей кодируется геном RAD23B . [5] [6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является одним из двух человеческих гомологов Saccharomyces cerevisiae Rad23, белка, участвующего в репарации нуклеотидов методом эксцизии (NER). Было обнаружено, что этот белок является компонентом белкового комплекса, который специфически дополняет дефект NER клеточных экстрактов пигментной ксеродермы группы C (XP-c) in vitro. Было также показано, что этот белок взаимодействует с 3-метиладенин-ДНК-гликозилазой (MPG) и повышает ее активность по эксцизии, что предполагает его роль в распознавании повреждений ДНК при репарации оснований методом эксцизии. Этот белок содержит N-концевой убиквитин-подобный домен, который, как сообщалось, взаимодействует с протеасомой 26S, и, таким образом, этот белок может быть вовлечен в опосредованный убиквитином протеолитический путь в клетках. [7]

Роль в восстановлении ДНК

Комплекс XPC-RAD23B является начальным фактором распознавания повреждений в глобальной геномной эксцизионной репарации нуклеотидов (GG-NER). XPC-RAD23B распознает широкий спектр повреждений, которые термодинамически дестабилизируют дуплексы ДНК, включая фотопродукты, индуцированные УФ-излучением (димеры циклопиримидина и фотопродукты 6-4), аддукты, образованные мутагенами окружающей среды, такими как бензо[a]пирен или различные ароматические амины, некоторые окислительные эндогенные повреждения, такие как циклопурины, и аддукты, образованные противораковыми химиотерапевтическими препаратами, такими как цисплатин. Присутствие XPC-RAD23B необходимо для сборки других основных факторов NER и прогрессирования по пути NER как in vitro, так и in vivo. [8] Хотя большинство исследований было проведено с XPC-RAD23B, он является частью тримерного комплекса с центрином-2, кальций-связывающим белком семейства кальмодулинов. [8]

Эпигенетическая репрессия

Уровень экспрессии белка RAD23B может быть подавлен эпигенетически либо путем метилирования промотора гена RAD23B [9] [10] , либо с помощью одной из двух микроРНК (miR-744-3p [11] или miR-373 [12] ).

Дефицит RAD23B при раке

Дефицит экспрессии гена репарации ДНК увеличивает риск развития рака (см. Дефицит репарации ДНК при канцерогенезе ). Экспрессия RAD23B снижена в опухолевой ткани женщин с раком молочной железы. [13] Также наблюдался низкий процент RAD23B-положительных ядер при раке молочной железы высокой степени злокачественности. [14]

Уровень RAD23B был существенно снижен за счет метилирования промотора в клеточной линии, полученной из множественной миеломы. [9] и снижен за счет метилирования промотора в небольшой доле опухолей немелкоклеточного рака легких (НМРЛ). [10]

RAD23B, по-видимому, является одним из 26 генов репарации ДНК, которые эпигенетически репрессируются при различных видах рака (см. Эпигенетика рака ).

Взаимодействия

Было показано, что RAD23B взаимодействует с PSMD4 [15] и атаксином 3. [ 16]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000119318 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028426 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ван дер Спек П.Дж., Смит Э.М., Беверлоо Х.Б., Сугасава К., Масутани С., Ханаока Ф., Хоймейкерс Дж.Х., Хагемейер А. (октябрь 1994 г.). «Хромосомная локализация трех генов репарации: гена пигментной ксеродерма группы C и двух человеческих гомологов дрожжей RAD23». Геномика . 23 (3): 651–8. дои : 10.1006/geno.1994.1554. hdl : 1765/3069 . ПМИД  7851894.
  6. ^ Масутани С, Сугасава К, Янагисава Дж, Сонояма Т, Уи М, Эномото Т, Такио К, Танака К, ван дер Спек П.Дж., Бутсма Д (апрель 1994 г.). «Очистка и клонирование эксцизионно-восстановительного комплекса нуклеотидов, включающего белок C пигментной ксеродерма и человеческий гомолог дрожжей RAD23». Журнал ЭМБО . 13 (8): 1831–43. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06452.x. ПМЦ 395023 . ПМИД  8168482. 
  7. ^ "Ген Энтреза: RAD23B RAD23 гомолог B (S. cerevisiae)".
  8. ^ ab Schärer OD (октябрь 2013 г.). "Репарация эксцизионных нуклеотидов у эукариот". Cold Spring Harbor Perspectives in Biology . 5 (10): a012609. doi :10.1101/cshperspect.a012609. PMC 3783044. PMID 24086042  . 
  9. ^ ab Peng B, Hodge DR, Thomas SB, Cherry JM, Munroe DJ, Pompeia C, Xiao W, Farrar WL (февраль 2005 г.). «Эпигенетическое подавление гена эксцизионной репарации нуклеотидов человека, hHR23B, в клетках множественной миеломы KAS-6/1, чувствительных к интерлейкину-6». Журнал биологической химии . 280 (6): 4182–7. doi : 10.1074/jbc.M412566200 . PMID  15550378.
  10. ^ ab Do H, Wong NC, Murone C, John T, Solomon B, Mitchell PL, Dobrovic A (2014). "Критическая переоценка метилирования промотора гена репарации ДНК при немелкоклеточной карциноме легких". Scientific Reports . 4 : 4186. Bibcode :2014NatSR...4E4186D. doi :10.1038/srep04186. PMC 3935198 . PMID  24569633. 
  11. ^ Hatano K, Kumar B, Zhang Y, Coulter JB, Hedayati M, Mears B, Ni X, Kudrolli TA, Chowdhury WH, Rodriguez R, DeWeese TL, Lupold SE (апрель 2015 г.). «Функциональный скрининг выявляет микроРНК, которые ингибируют восстановление ДНК и повышают чувствительность клеток рака простаты к ионизирующему излучению». Nucleic Acids Research . 43 (8): 4075–86. doi :10.1093/nar/gkv273. PMC 4417178. PMID  25845598 . 
  12. ^ Crosby ME, Kulshreshtha R, Ivan M, Glazer PM (февраль 2009 г.). «Регулирование экспрессии генов репарации ДНК с помощью микроРНК при гипоксическом стрессе». Cancer Research . 69 (3): 1221–9. doi :10.1158/0008-5472.CAN-08-2516. PMC 2997438 . PMID  19141645. 
  13. ^ Matta J, Morales L, Dutil J, Bayona M, Alvarez C, Suarez E (февраль 2013 г.). "Дифференциальная экспрессия генов репарации ДНК у испаноговорящих женщин с раком груди". Molecular Cancer Biology . 1 (1): 54. doi :10.9777/mcb.2013.10006 (неактивен 1 ноября 2024 г.). PMC 4189824 . PMID  25309843. {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2024 г. ( ссылка )
  14. ^ Linge A, Maurya P, Friedrich K, Baretton GB, Kelly S, Henry M, Clynes M, Larkin A, Meleady P (июль 2014 г.). «Идентификация и функциональная проверка RAD23B как потенциального белка в прогрессировании рака молочной железы у человека». Journal of Proteome Research . 13 (7): 3212–22. doi :10.1021/pr4012156. PMID  24897598.
  15. ^ Hiyama H, Yokoi M, Masutani C, Sugasawa K, Maekawa T, Tanaka K, Hoeijmakers JH, Hanaoka F (сентябрь 1999 г.). «Взаимодействие hHR23 с S5a. Убиквитин-подобный домен hHR23 опосредует взаимодействие с субъединицей S5a протеасомы 26 S» (PDF) . Журнал биологической химии . 274 (39): 28019–25. doi : 10.1074/jbc.274.39.28019 . PMID  10488153. S2CID  1757366.
  16. ^ Wang G, Sawai N, Kotliarova S, Kanazawa I, Nukina N (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации ДНК дрожжей RAD23, HHR23A и ​​HHR23B». Human Molecular Genetics . 9 (12): 1795–803. doi :10.1093/hmg/9.12.1795. PMID  10915768.

Дальнейшее чтение