stringtranslate.com

Семейство генов, переносимых через яички

Семейство транскриптов генов, усиленных тестикулами (TEGT), включает белки транскриптов генов, усиленных тестикулами млекопитающих, которые экспрессируются на высоком уровне в тестикулах, предполагаемые связывающие глутамат/аспартат белки растений и животных, белок YccA Escherichia coli и белок YetJ Bacillus subtilis . Эти белки имеют длину около 200-250 остатков и демонстрируют 7 TMS. [1]

Гомология

Гомологи обнаружены у различных грамотрицательных и грамположительных бактерий , дрожжей, грибов, растений, животных и вирусов. Геном E. coli кодирует три паралога: YbhL, YbhM и YccA. Отдаленные гомологи, обнаруженные у Drosophila melanogaster и крысы, — это белок, ассоциированный с рецептором N-метил-D-аспартата (NMDARAI), и цепь связывания глутамата с рецептором N-метил-D-аспартата соответственно. Два других — это белок мембраны нейронов крысы 35 и белок ингибитора Bax-1 Arabidopsis thaliana (BI-1), способный подавлять гибель клеток, вызванную Bax, у дрожжей .

БИ-1

Один из этих белков, TEGT или Bax Inhibitor-1 (TC# 1.A.14.1.1), имеет C-концевой домен, который образует Ca 2+ -проницаемый канал. [2] BI-1 - это ER -локализованный белок, который защищает от апоптоза и ER-стрессов. Было предложено, что BI-1 модулирует ER Ca 2+ гомеостаз , действуя как Ca 2+ -канал утечки. Эти белки отдаленно связаны с ионотропным глутамат-связывающим белком N-метил D-аспартатного (NMDA) рецептора человека. Гомологи включают предполагаемый белок, индуцируемый холодовым шоком, и SecY-стабилизирующий белок. [1]

Функция

Основываясь на экспериментальном определении топологии BI-1, Бултынк и др. предполагают, что его C-концевой α-спиральный пептид из 20 аминокислот катализирует поток Ca 2+ как in vivo , так и in vitro . [2] Свойства утечки Ca 2+ сохранились среди животных, но не у ортологов растений и дрожжей. Путем мутации одного из критических остатков аспартата (D 213 ) в предполагаемой поре Ca 2+ -канала в полноразмерном BI-1, D 213 оказался необходимым для BI-1-зависимой утечки Ca 2+ ER .

Структура

Чанг и др. опубликовали кристаллические структуры бактериального гомолога YetJ (TC# 1.A.14.2.3) с разрешением 1,9 Å и охарактеризовали его активность утечки кальция. Его складка из семи трансмембранных спиралей включает два сэндвича из трех спиралей, обернутых вокруг центральной С-концевой спирали. [3] Структуры, полученные в закрытой и открытой конформациях, обратимо взаимопревращаемы при изменении pH. Водородно-связанная возмущенная пара консервативных остатков аспартила объясняет зависимость этого перехода от pH, а pH регулирует приток кальция в протеолипосомы. Гомологические модели для человеческого BI-1 дали представление о его цитопротекторной активности. [3]

Реакция транспорта

Обобщенная реакция, катализируемая каналами TEGT, выглядит следующим образом:

катионы (выход) ⇌ катионы (вход)

Ссылки

  1. ^ ab van Stelten J, Silva F, Belin D, Silhavy TJ (август 2009). «Влияние антибиотиков и гомолога протоонкогена на разрушение транслокатора белка SecY». Science . 325 (5941): 753–6. Bibcode :2009Sci...325..753V. doi :10.1126/science.1172221. PMC  2832214 . PMID  19661432.
  2. ^ ab Бултинк Г., Кивилуото С., Хенке Н., Иванова Х., Шнайдер Л., Рыбальченко В., Люйтен Т., Нуйтс К., Де Боргреве В., Безпрозванный И., Парис Дж.Б., Де Смедт Х., Миссиен Л., Метнер А. (январь 2012 г.). «С-конец ингибитора Bax-1 образует пору канала, проницаемую для Ca2+». Журнал биологической химии . 287 (4): 2544–57. дои : 10.1074/jbc.M111.275354 . ПМК 3268414 . ПМИД  22128171. 
  3. ^ ab Chang Y, Bruni R, Kloss B, Assur Z, Kloppmann E, Rost B, Hendrickson WA, Liu Q (июнь 2014 г.). «Структурная основа для pH-чувствительной утечки кальция через мембраны». Science . 344 (6188): 1131–5. Bibcode :2014Sci...344.1131C. doi :10.1126/science.1252043. PMC 4119810 . PMID  24904158. 

На момент редактирования эта статья использует контент из "1.A.14 The Testis-Enhanced Gene Transfer (TEGT) Family" , который лицензирован таким образом, что позволяет повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , но не в соответствии с GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.