« Candidatus Thorarchaeota », или просто Thorarchaeota , является типом супертипа архей Асгарда . Супертип Асгарда представляет собой ближайших прокариотических родственников эукариот . Поскольку существует такая тесная связь между двумя разными доменами, это дает дополнительные доказательства теории двухдоменного древа жизни , которая утверждает, что эукариоты произошли от домена архей . Асгардские археи — это одноклеточные морские микробы, которые содержат ветвистые придатки и имеют гены, сходные с эукариями. [1] Надтип архей Асгарда состоит из Thorarchaeota, Lokiarchaeota , Odinarchaeota и Heimdallarchaeota . [2] Торархеоты были впервые идентифицированы в зоне перехода сульфат-метан в отложениях приливной воды. Торархеоты широко распространены в морских и пресноводных отложениях.
Торархеоты были обнаружены путем анализа отложений устья реки Уайт-Оук в Северной Каролине . Эстуарии — это солоноватые водоемы, где встречаются пресная и морская вода, образуя богатую и уникальную зону питательных веществ. [3] Аспирант Техасского университета обнаружил новые характеристики Thorarchaeota, живущих под отложениями и обладающих бескислородными свойствами. Аспиранты также доказали, что археи способствуют разложению органического вещества, фиксации неорганического углерода и восстановлению серы. [4] Геномы Thorarchaeota, полученные от морских животных, по-видимому, имеют разнообразие метаболических путей с потенциалом разложения и поглощения белков и углеводов. [5]
Thorarchaeota не культивировали в лаборатории. Все, что известно о Thorarchaeota, получено в результате анализа частичных и почти полных геномов. Из частичных геномов было секвенировано 3029 белков. [6] Эти геномы содержат гены, которые предполагают, что Thorarchaeota может обладать способностью разлагать органические вещества, что предполагает их роль в углеродном цикле и промежуточную роль в цикле серы . Были обнаружены гены почти полного пути Вуда-Люнгдала, но в них отсутствовали гены формиатдегидрогеназы . Это может быть связано с неполными геномами. Thorachaeota может использовать путь тетрагидрометаноптерина Вуда-Люнгдала для снижения содержания углекислого газа. [7] У Thorarchaeota есть гены деградации и ассимиляции белков, в том числе гены клострипаин и гингипаин . У них также есть гены внеклеточных пептидаз . Эти гены могут свидетельствовать о том, что основным источником углерода для Thorarchaeota являются белки и пептиды. [5] Частичные секвенированные геномы Thorarchaeota также содержат гены гликолиза . У них отсутствуют гены гексокиназ , однако у них есть гены пируваткиназы и фосфоенолпируватсинтазы . Наличие генов этих ферментов может играть роль в способности адаптироваться к различным условиям окружающей среды. Гены фиксации азота были обнаружены в большинстве образцов, содержащих частичные геномы, однако не было обнаружено генов ферментов, катализирующих восстановление нитрита . [7] Некоторые из секвенированных частичных геномов имеют почти полные пути Кальвина-Бенсона-Бэсшама и, как было обнаружено, используют RuBisCO типа IV . В то время как другие типы супертипа Асгарда используют RuBisCO типа III и типа IV, ни один из них не имеет пути Кальвина-Бенсона-Башама. [7]