Биорепозитарий

Место, где хранятся и консервируются биологические материалы

Биорепозитарий — это учреждение , которое собирает, каталогизирует и хранит образцы биологического материала для лабораторных исследований. Биорепозитарии собирают и управляют образцами животных, растений и других живых организмов. Биорепозитарии хранят множество различных типов образцов, включая образцы крови , мочи , тканей , клеток , ДНК , РНК и белков . Если образцы получены от людей, они могут храниться вместе с медицинской информацией вместе с письменным согласием на использование образцов в лабораторных исследованиях. ^[1]

Цель

Целью биорепозитория является сохранение биологических образцов и связанной с ними информации для будущего использования в исследованиях. Биорепозиторий поддерживает качество образцов в своей коллекции и обеспечивает их доступность для научных исследований.

Операции

Четыре основные операции биорепозитория: (i) сбор, (ii) обработка, (iii) хранение или инвентаризация и (iv) распределение биологических образцов.

(i) Сбор или пополнение происходит, когда образец поступает в биорепозиторий. Информация об образце вводится в систему управления лабораторной информацией («LIMS»), которая отслеживает информацию обо всех образцах в биорепозитории. Типичная информация, связанная с образцом, — это происхождение образца и время его поступления в биорепозиторий.

(ii) Обработка образцов стандартизирована для минимизации вариаций из-за обработки. Обработка может подготовить образец к долгосрочному хранению. Например, образцы ДНК обрабатываются в солевом буфере (водный раствор) с соответствующим pH для стабилизации ДНК для хранения.

(iii) Хранение и инвентаризация — это место, где все образцы хранятся до того, как их запросят через запрос на распространение. Система инвентаризации состоит из коробок для хранения образцов, которые хранятся в морозильниках различных типов в зависимости от требований к хранению образцов.

(iv) Распределение — это процесс извлечения одного или нескольких образцов из системы инвентаризации биорепозитория.

Стандартные операционные процедуры

Стандартные операционные процедуры (СОП) играют решающую роль в биорепозитарном секторе. Существует ряд причин, по которым они важны:

• Стандартные операционные процедуры (СОП) снижают изменчивость образцов и процессов хранения, предоставляя стандартизированные рекомендации по надлежащему хранению и уходу. ^[2]
• Образцы биообразцов должны максимально напоминать биообразцы в их естественном состоянии. Стандартные операционные процедуры помогают это обеспечить.
• Стандартные операционные процедуры (SOP) обеспечивают стандартизированную структуру того, как проводить операции в биохранилище. Они обеспечивают бесперебойную и надежную реализацию процессов на протяжении всех операций. ^[3]

Центры биологических ресурсов

ОЭСР выпустила руководящие принципы передовой практики для биохранилищ, которые называются центрами биологических ресурсов . ^[4] [ ^5] Они определяются ОЭСР следующим образом:

«Центры биологических ресурсов являются неотъемлемой частью инфраструктуры, лежащей в основе биотехнологии. Они состоят из поставщиков услуг и хранилищ живых клеток, геномов организмов и информации, касающейся наследственности и функций биологических систем. BRC содержат коллекции культивируемых организмов (например, микроорганизмов , растительных , животных и человеческих клеток ), их реплицируемых частей (например, геномов , плазмид , вирусов , кДНК ), жизнеспособных, но еще не культивируемых организмов , клеток и тканей , а также базы данных, содержащие молекулярную , физиологическую и структурную информацию, относящуюся к этим коллекциям и связанной с ними биоинформатике ». ^[6]

Примеры биохранилищ в США

Репозитории клеточных линий

• Хранилище человеческих клеток и данных Национального института неврологических расстройств и инсульта (NINDS) содержит коллекцию клеточных линий для дальнейшего изучения неврологических расстройств. ^{[7] [8]}
• Репозиторий клеток старения Национального института старения (NIA) содействует исследованию механизмов старения, предоставляя клеточные линии, собранные у людей разного возраста. ^{[9] [8]}
• Репозиторий генетических клеток человека Национального института общих медицинских наук (NIGMS) представляет собой коллекцию хорошо охарактеризованных человеческих клеток для использования в биомедицинских исследованиях. ^{[10] [8]}

Образцы репозиториев

• Биорепозитарий Intermountain Healthcare представляет собой коллекцию из более чем 4,5 миллионов биологических образцов, сохраненных в формалине и залитых в парафин. ^[11]
• Институт генома человека имени Дж. Крейга Вентера предоставляет образцы ДНК Дж. Крейга Вентера , геном которого был секвенирован и собран. ^[12]
• Программа эталонных материалов для генетического тестирования (GeT-RM) Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC) хранит образцы ДНК для использования в молекулярно-генетическом тестировании. ^[13] Эти образцы получены при таких заболеваниях, как болезнь Хантингтона, муковисцидоз, синдром ломкой Х-хромосомы, альфа-талассемия и синдром Мюнке.

Смотрите также

• Биобанк
• Биологическая база данных
• Генный банк
• Генетическая дактилоскопия
• Геномика
• Генотип

Ссылки

1. "NCI Dictionaries - biorepository". Национальный институт рака . 2011-02-02 . Получено 2021-09-23 .
2. "Геномная медицина: стандартные операционные процедуры (СОП) биобанкинга". Внутри биобанкинга . 2015-12-08 . Получено 2017-10-16 .
3. "Важность стандартных операционных процедур (SOPS) в биобанкинге". Биорепозитарий . Получено 16 октября 2017 г.
4. Смит, Д.; Райан, М.Дж. (январь 2008 г.). «Влияние передовой практики ОЭСР на валидацию методов криоконсервации микроорганизмов». Cryo letters . 29 (1): 63–72. PMID  18392291.
5. Руководящие принципы ОЭСР по передовой практике для центров биологических ресурсов
6. Руководящие принципы ОЭСР BRC
7. «Ресурс по стволовым клеткам, включая iPSC и фибробласты | Репозиторий человеческих клеток и данных NINDS». nindsgenetics.org . Получено 20.10.2021 .
8. Сивек, Мартина (октябрь 2015 г.). «Обзор биохранилищ — прошлое, настоящее и будущее». Военная медицина . 180 (10S): 57–66. doi :10.7205/MILMED-D-15-00119.
9. "NIA". www.coriell.org . Получено 20.10.2021 .
10. "NIGMS Human Genetic Cell Repository". www.nigms.nih.gov . Получено 20.10.2021 .
11. "О биорепозитории Intermountain". intermountainhealthcare.org . Получено 20.10.2021 .
12. "HuRef". www.coriell.org . Получено 20.10.2021 .
13. "GeT-RM | CDC". www.cdc.gov . 2019-11-05 . Получено 2021-10-20 .

Внешние ссылки

• Список биорепозиториев Specimen Central, всемирный список активных биобанков и биорепозиториев
• База данных клинических образцов и репозиторий коллекций образцов
• Биорепозиторий LIMS, программное решение LIMS для биобанкинга и биорепозиториев
• Глобальный каталог биобанков, банков тканей и биохранилищ
• Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний, хранилище образцов ВИЧ/СПИДа
• Международное общество биологических и экологических хранилищ («ISBER»)
• ProMedDx BioServices cGMP Биохранение и Биорепозиторий - Консультации по проектированию биорепозиториев
• Биорепозитарий Cell&Co — первый французский эко-биобанк