Lassa mammarenavirus ( LASV ) — аренавирус , вызывающий геморрагическую лихорадку Ласса , [1] тип вирусной геморрагической лихорадки (VHF) у людей и других приматов . Lassa mammarenavirus — это новый вирус и селективный агент , требующий сдерживания, эквивалентного 4-му уровню биологической безопасности . Он эндемичен в странах Западной Африки, особенно в Сьерра-Леоне , Гвинейской Республике , Нигерии и Либерии , где ежегодная заболеваемость составляет от 300 000 до 500 000 случаев, что приводит к 5000 смертей в год. [2]
По состоянию на 2012 год открытия в районе реки Мано в Западной Африке расширили эндемичную зону между двумя известными эндемичными регионами Ласса, указывая на то, что LASV более широко распространен в экозоне тропических лесистых саванн в Западной Африке. [3] Не существует одобренных вакцин против лихорадки Ласса для использования у людей. [4]
В 1969 году миссионерская медсестра Лора Уайн заболела загадочной болезнью, которой она заразилась от акушерской пациентки в Лассе, деревне в штате Борно , Нигерия. [5] [6] [1] Затем ее перевезли в Джос , где она умерла. Впоследствии заразились еще двое, одной из которых была пятидесятидвухлетняя медсестра Лили Пиннео, которая ухаживала за Лорой Уайн. [7] Образцы от Пиннео были отправлены в Йельский университет в Нью-Хейвене , где новый вирус, который позже станет известен как Lassa mammarenavirus , был впервые выделен Хорди Касальсом-Ариетом , Соней Бакли и другими. [8] [9] [10] Касальс заразился лихорадкой и едва не погиб; от нее умер один лаборант. [8] К 1972 году было обнаружено, что основным резервуаром вируса в Западной Африке является многососковая крыса Mastomys natalensis , способная выделять вирус с мочой и фекалиями, не проявляя видимых симптомов. [11] [12]
Вирусы Ласса [14] [15] представляют собой оболочечные, одноцепочечные, двухсегментные, амбисенсные РНК-вирусы . Их геном [16] содержится в двух сегментах РНК, каждый из которых кодирует два белка, по одному в каждом смысле, всего четыре вирусных белка. [17] Большой сегмент кодирует небольшой белок цинкового пальца (Z), который регулирует транскрипцию и репликацию, [18] [19] и РНК-полимеразу (L). Маленький сегмент кодирует нуклеопротеин (NP) и предшественник поверхностного гликопротеина (GP, также известный как вирусный шип ), который протеолитически расщепляется на оболочечные гликопротеины GP1 и GP2, которые связываются с рецептором альфа-дистрогликана и опосредуют проникновение в клетку-хозяина. [20]
Лихорадка Ласса вызывает геморрагическую лихорадку, часто проявляющуюся иммуносупрессией. Вирус маммарена Ласса реплицируется очень быстро и демонстрирует временной контроль репликации. [21] Первый этап репликации — транскрипция копий мРНК генома с отрицательным или минус-смыслом. Это обеспечивает достаточный запас вирусных белков для последующих этапов репликации, поскольку белки NP и L транслируются с мРНК. Геном с положительным или плюс-смыслом затем создает копии вирусной комплементарной РНК (vcRNA) самого себя. Копии РНК являются шаблоном для получения потомства с отрицательным смыслом, но из него также синтезируется мРНК. МРНК, синтезированная из vcRNA, транслируется для получения белков GP и Z. Этот временной контроль позволяет шиповидным белкам вырабатываться в последнюю очередь и, следовательно, задерживать распознавание иммунной системой хозяина. [ необходима цитата ]
Нуклеотидные исследования генома показали, что у Lassa есть четыре линии: три из них обнаружены в Нигерии, а четвертая — в Гвинее, Либерии и Сьерра-Леоне. Нигерийские штаммы, по всей видимости, являются предковыми для других, но для подтверждения этого требуются дополнительные исследования. [22]
Вирус маммарены Ласса проникает в клетку-хозяина с помощью рецептора клеточной поверхности альфа-дистрогликана (альфа-ДГ), [20] универсального рецептора для белков внеклеточного матрикса . Он разделяет этот рецептор с прототипическим вирусом лимфоцитарного хориоменингита Старого Света аренавируса . Распознавание рецептора зависит от специфической модификации сахара альфа-дистрогликана группой гликозилтрансфераз, известных как белки LARGE. Определенные варианты генов, кодирующих эти белки, по-видимому, находятся под положительным отбором в Западной Африке , где Ласса является эндемичным заболеванием. [23] Альфа-дистрогликан также используется в качестве рецептора вирусами клады C Нового Света аренавирусы (вирусы Оливерос и Латино). Напротив, аренавирусы Нового Света кладов A и B, которые включают важные вирусы Machupo , Guanarito , Junin и Sabia в дополнение к непатогенному вирусу Amapari, используют рецептор трансферрина 1. Небольшая алифатическая аминокислота в положении аминокислоты гликопротеина GP1 260 необходима для высокоаффинного связывания с альфа-DG. Кроме того, положение аминокислоты GP1 259 также, по-видимому, важно, поскольку все аренавирусы, демонстрирующие высокоаффинное связывание с альфа-DG, обладают объемной ароматической аминокислотой (тирозином или фенилаланином) в этом положении. [ необходима цитата ]
В отличие от большинства оболочечных вирусов, которые используют покрытые клатрином ямки для проникновения в клетку и связываются со своими рецепторами в зависимости от pH, вирус Ласса и лимфоцитарного хориоменингита вместо этого используют эндоцитозный путь, независимый от клатрина, кавеолина , динамина и актина . Попав внутрь клетки, вирусы быстро доставляются в эндосомы посредством везикулярного транспорта, хотя и в значительной степени независимого от малых ГТФаз Rab5 и Rab7. При контакте с эндосомой происходит слияние мембран, зависящее от pH, опосредованное гликопротеином оболочки, который при более низком pH эндосомы связывает лизосомный белок LAMP1, что приводит к слиянию мембран и выходу из эндосомы. [ необходима цитата ]
Жизненный цикл Lassa mammarenavirus похож на цикл аренавирусов Старого Света. Lassa mammarenavirus проникает в клетку посредством рецептор-опосредованного эндоцитоза . Какой эндоцитозный путь используется, пока неизвестно, но, по крайней мере, проникновение в клетку чувствительно к истощению холестерина. Сообщалось, что интернализация вируса ограничивается истощением холестерина. Рецептором, используемым для проникновения в клетку, является альфа - дистрогликан , высококонсервативный и повсеместно экспрессируемый рецептор клеточной поверхности для белков внеклеточного матрикса. Дистрогликан, который позже расщепляется на альфа-дистрогликан и бета-дистрогликан, изначально экспрессируется в большинстве клеток для зрелых тканей и обеспечивает молекулярную связь между ECM и цитоскелетом на основе актина. [24] После того, как вирус проникает в клетку посредством эндоцитоза, опосредованного альфа-дистрогликаном, среда с низким pH запускает pH-зависимое слияние мембран и высвобождает комплекс RNP (вирусный рибонуклеопротеин) в цитоплазму. Вирусная РНК распаковывается, и репликация и транскрипция инициируются в цитоплазме. [24] Когда начинается репликация, геномы как S, так и L РНК синтезируют антигеномные S и L РНК, а из антигеномных РНК синтезируются геномные S и L РНК. Как геномные, так и антигеномные РНК необходимы для транскрипции и трансляции . S РНК кодирует белки GP и NP (вирусный нуклеокапсидный белок), в то время как L РНК кодирует белки Z и L. Белок L, скорее всего, представляет собой вирусную РНК-зависимую РНК-полимеразу. [25] Когда клетка инфицирована вирусом, L-полимераза связывается с вирусным РНП и инициирует транскрипцию геномной РНК. 5'- и 3'-концевые 19-нуклеотидные вирусные промотерные области обоих сегментов РНК необходимы для распознавания и связывания вирусной полимеразы . Первичная транскрипция сначала транскрибирует мРНК из геномных S- и L-РНК, которые кодируют белки NP и L соответственно. Транскрипция заканчивается на структуре стебель-петля (SL) в межгеномной области. Аренавирусы используют стратегию захвата кэпа , чтобы получить кэп-структуры из клеточных мРНК, и это опосредовано эндонуклеазной активностью L-полимеразы и активностью связывания кэпа NP. Антигеномная РНК транскрибирует вирусные гены GPC и Z, закодированные в геномной ориентации, из сегментов S и L соответственно. Антигеномная РНК также служит шаблоном для репликации. [4] После трансляции GPC он посттрансляционно модифицируется в эндоплазматическом ретикулуме.. GPC расщепляется на GP1 и GP2 на более поздней стадии секреторного пути. Сообщалось, что клеточная протеаза SKI-1/S1P отвечает за это расщепление. Расщепленные гликопротеины включаются в оболочку вириона , когда вирус отпочковывается и высвобождается из клеточной мембраны. [25]
Лихорадка Ласса вызывается вирусом Lassa mammarenavirus . Симптомы включают гриппоподобное заболевание, характеризующееся лихорадкой, общей слабостью, кашлем, болью в горле, головной болью и желудочно-кишечными проявлениями. Геморрагические проявления включают сосудистую проницаемость. [4]
При попадании в организм вирус Lassa mammarenavirus заражает практически все ткани человеческого тела. Он начинает со слизистой оболочки , кишечника, легких и мочевыделительной системы, а затем переходит в сосудистую систему. [5]
Основными целями вируса являются антигенпрезентирующие клетки , в основном дендритные клетки и эндотелиальные клетки. [26] [27] [28] В 2012 году было сообщено, как нуклеопротеин (NP) вируса маммарены Ласса саботирует врожденный ответ иммунной системы хозяина . Как правило, когда патоген попадает в хозяина, врожденная система защиты распознает ассоциированные с патогеном молекулярные паттерны (PAMP) и активирует иммунный ответ. Один из механизмов обнаруживает двухцепочечную РНК (dsRNA), которая синтезируется только вирусами с отрицательным смыслом . В цитоплазме рецепторы dsRNA, такие как RIG-I (ген I, индуцируемый ретиноевой кислотой) и MDA-5 (ген 5, ассоциированный с дифференциацией меланомы), обнаруживают dsRNA и инициируют сигнальные пути , которые транслоцируют IRF-3 ( фактор регуляции интерферона 3) и другие факторы транскрипции в ядро. Транслоцированные факторы транскрипции активируют экспрессию интерферонов 𝛂 и 𝛃, и они инициируют адаптивный иммунитет . NP, закодированный в вирусе маммарена Ласса, необходим для репликации и транскрипции вируса, но он также подавляет врожденный ответ IFN хозяина, ингибируя транслокацию IRF-3. Сообщается, что NP вируса маммарена Ласса обладает экзонуклеазной активностью только по отношению к dsRNA. [29] экзонуклеазная активность dsRNA NP противодействует ответам IFN, переваривая PAMP, что позволяет вирусу избегать иммунных ответов хозяина. [30]