stringtranslate.com

Генетическая примесь

Генетическая примесь происходит, когда ранее изолированные популяции скрещиваются, в результате чего образуется популяция, которая произошла от нескольких источников. Это может происходить между видами, например, с гибридами , или внутри видов, например, когда географически удаленные особи мигрируют в новые регионы. Это приводит к генофонду , который является смесью исходных популяций. [1] [2] [3]

Примеры

Климатические циклы способствуют генетическому смешению в холодные периоды и генетическому разнообразию в теплые периоды. [4] Естественное наводнение может вызвать генетическое смешение в популяциях мигрирующих видов рыб. [5] Генетическая примесь может играть важную роль в успехе популяций, которые колонизируют новую территорию и скрещиваются с особями местных популяций. [6]

Картографирование

Картирование примесей — это метод картирования генов , который использует популяцию смешанного происхождения (смешанную популяцию) для поиска генетических локусов , которые способствуют различиям в заболеваниях или других фенотипах, обнаруженных между различными предковыми популяциями. Метод лучше всего применять к популяциям с недавним смешением из двух популяций, которые ранее были генетически изолированы. Метод пытается сопоставить степень родства вблизи генетического локуса с интересующим фенотипом или заболеванием. Генетические маркеры, которые различаются по частоте между предковыми популяциями, необходимы по всему геному. [7]

Картирование примесей основано на предположении, что различия в показателях заболеваемости или фенотипах частично обусловлены различиями в частотах генетических вариантов, вызывающих заболевания или фенотипы, между популяциями. В смешанной популяции эти причинные варианты чаще встречаются в хромосомных сегментах, унаследованных от той или иной предковой популяции. Первые сканы примесей были опубликованы в 2005 году, и с тех пор были картированы генетические факторы, способствующие различным заболеваниям и различиям в признаках. [8] К 2010 году были построены высокоплотные панели картирования для афроамериканцев, латиноамериканцев/испаноязычных и уйгуров .

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Корунес, Кэтрин Л.; Голдберг, Эми (2021-03-11). "Генетическая примесь человека". PLOS Genetics . 17 (3). Публичная научная библиотека (PLoS): e1009374. doi : 10.1371/journal.pgen.1009374 . ISSN  1553-7404. PMC  7951803 .
  2. ^ Риус, М.; Дарлинг, Дж. А. (2014). «Насколько важна внутривидовая генетическая примесь для успеха колонизации популяций?». Тенденции в экологии и эволюции . 29 (4): 233−242. doi :10.1016/j.tree.2014.02.003. PMID  24636862.
  3. ^ Ян, Мелинда А.; Фу, Цяомей (март 2018 г.). «Взгляд на предысторию современного человека с использованием древних геномов». Тенденции в генетике . 34 (3): 184–196 6y. doi :10.1016/j.tig.2017.11.008. PMID  29395378.
  4. ^ Lv X, Cheng J, Meng Y, Chang Y, Xia L, Wen Z, Ge D, Liu S, Yang Q (2018). «Разобщенное распространение и отчетливая внутривидовая диверсификация Eothenomys melanogaster в Южном Китае». BMC Evolutionary Biology . 18 (1): 50. doi : 10.1186/s12862-018-1168-3 . PMC 5894153. PMID  29636000 . 
  5. ^ Jaisuk, C.; Senanan, W. (2018). «Влияние особенностей ландшафта на генетическую изменчивость популяции тропической речной рыбы, каменного гольяна, Garra cambodgiensis, в верхнем бассейне реки Нан, северный Таиланд». PeerJ . 6 : e4487. doi : 10.7717/peerj.4487 . PMC 5845392 . PMID  29568710. 
  6. ^ Kolbe JJ, Larson A, Losos JB, de Queiroz K (2008). «Примесь определяет генетическое разнообразие и дифференциацию популяции при биологической инвазии видов ящериц». Biology Letters . 4 (4): 434−437. doi :10.1098/rsbl.2008.0205. PMC 2610154. PMID  18492644 . 
  7. ^ Шрайвер, MD; и др. (апрель 2003 г.). «Пигментация кожи, биогеографическое происхождение и картирование примесей». Генетика человека . 112 (4): 387–99. doi :10.1007/s00439-002-0896-y. PMID  12579416. S2CID  7877572.
  8. ^ Winkler, CA; Nelson, GW; Smith, MW (2010). «Картирование примесей достигает зрелости». Annu Rev Genom Hum Genet . 11 : 65–89. doi :10.1146/annurev-genom-082509-141523. PMC 7454031 . PMID  20594047. 

Дальнейшее чтение