stringtranslate.com

Клад

Кладограмма (генеалогическое древо) биологической группы. Последним общим предком является стержень вертикальной линии внизу. Синяя и оранжевая подгруппы представляют собой клады; каждая из них показывает свою общую предковую основу в нижней части ветви подгруппы . Сама по себе зеленая подгруппа не считается кладой; это парафилетическая группа , поскольку она исключает синюю ветвь, произошедшую от одного и того же общего предка. Зеленая и синяя подгруппы вместе образуют кладу.

В биологической филогенетике клада (от древнегреческого κλάδος (klados)  «ветвь»), также известная как монофилетическая группа или естественная группа , [ 1] представляет собой группу организмов , которые являются монофилетическими , то есть состоящими из общего предка и все его прямые потомки – на филогенетическом дереве . [2] В таксономической литературе иногда используется латинская форма cladus (множественное число cladi ), а не английская форма. [ нужна цитация ] Клады являются фундаментальной единицей кладистики , современного подхода к таксономии, принятого в большинстве биологических областей.

Общим предком может быть особь, популяция или вид ( вымерший или существующий ). Клады вложены друг в друга, поскольку каждая ветвь, в свою очередь, распадается на более мелкие ветви. Эти расколы отражают эволюционную историю , когда популяции расходились и развивались независимо. Клады называются монофилетическими (греч. «один клан») группами.

За последние несколько десятилетий кладистический подход произвел революцию в биологической классификации и выявил удивительные эволюционные связи между организмами. [3] Систематики все чаще стараются избегать названий таксонов , которые не являются кладами; то есть таксоны, которые не являются монофилетическими . Некоторые из взаимосвязей между организмами, которые выявил отдел кладистики молекулярной биологии, включают в себя то, что грибы являются более близкими родственниками животных, чем растениями, археи теперь считаются отличными от бактерий , а многоклеточные организмы, возможно, произошли от архей. [4]

Термин «клада» также используется в аналогичном значении и в других областях, помимо биологии, таких как историческая лингвистика ; см. Кладистика § В дисциплинах, отличных от биологии .

Именование и этимология

Термин «клада» был придуман в 1957 году биологом Джулианом Хаксли для обозначения результата кладогенеза , эволюционного разделения родительского вида на два отдельных вида, концепцию, которую Хаксли заимствовал у Бернхарда Ренша . [5] [6]

Многие обычно называемые группы — например, грызуны и насекомые — являются кладами, поскольку в каждом случае группа состоит из общего предка со всеми его потомками. Грызуны, например, представляют собой ветвь млекопитающих , которая отделилась после окончания периода, когда клада Dinosauria перестала быть доминирующим наземным позвоночным 66 миллионов лет назад. Исходное население и все его потомки представляют собой кладу. Клада грызунов соответствует отряду Rodentia, а насекомые — классу Insecta. Эти клады включают более мелкие клады, такие как бурундук или муравей , каждая из которых состоит из еще более мелких клад. Клада «грызуны», в свою очередь, включена в клады млекопитающих, позвоночных и животных.

История номенклатуры и таксономии

Раннее филогенетическое дерево Геккеля , 1866 год. Группы, которые когда-то считались более продвинутыми, такие как птицы («Aves»), помещены вверху.

Идея клады не существовала в додарвиновской линнеевской систематике , которая по необходимости основывалась только на внутреннем или внешнем морфологическом сходстве между организмами. Многие из наиболее известных групп животных в оригинальной Systema Naturae Линнея (в основном группы позвоночных ) действительно представляют собой клады. Феномен конвергентной эволюции ответственен за многие случаи обманчивого сходства в морфологии групп, которые произошли от разных линий.

С растущим осознанием в первой половине XIX века того, что виды менялись и разделялись на протяжении веков, классификация все чаще стала рассматриваться как ветви на эволюционном древе жизни . Публикация теории эволюции Дарвина в 1859 году придала этой точке зрения еще больший вес. Томас Генри Хаксли , один из первых сторонников эволюционной теории, предложил пересмотренную таксономию, основанную на концепции, сильно напоминающей клады, [7] хотя сам термин клада не был придуман до 1957 года его внуком Джулианом Хаксли .

Основоположником кладистики считается немецкий биолог Эмиль Ганс Вилли Хенниг (1913–1976) . [8] Он предложил систему классификации, которая представляла собой повторяющиеся разветвления генеалогического древа, в отличие от предыдущих систем, которые ставили организмы на «лестницу» с предположительно более «продвинутыми» организмами наверху. [3] [9]

Таксономисты все активнее работают над тем, чтобы таксономическая система отражала эволюцию. [9] Когда дело доходит до именования , этот принцип не всегда совместим с традиционной ранговой номенклатурой (в которой могут быть названы только таксоны, связанные с рангом ), поскольку существует недостаточно рангов, чтобы назвать длинную серию вложенных клад. По этим и другим причинам была разработана филогенетическая номенклатура ; это до сих пор спорно.

В качестве примера можно просмотреть полную текущую классификацию Anas platyrhynchos (утка-кряква) с 40 кладами от эукариот , перейдя по этой ссылке Wikispecies и нажав «Развернуть».

Название клады обычно имеет множественное число, где единственное число относится к каждому члену в отдельности. Уникальным исключением является клада рептилий Дракогоры , которая образовалась методом гаплологии от латинского «драко» и «когорс», т.е. « когорта дракона »; его форма с добавленным суффиксом должна быть, например, «дракогорт».

Определение

Gavialidae, Crocodylidae и Alligatoridae — это названия клад, которые здесь применяются к филогенетическому дереву крокодилов.

Клада по определению является монофилетической , что означает, что она содержит одного предка (который может быть организмом, популяцией или видом) и всех его потомков. [примечание 1] [10] [11] Предок может быть известен или неизвестен; любые члены клады могут быть существующими или вымершими.

Клады и филогенетические деревья

Наука, которая пытается реконструировать филогенетические деревья и таким образом обнаружить клады, называется филогенетикой или кладистикой , последний термин, придуманный Эрнстом Майром (1965), происходит от слова «клада». Результаты филогенетического/кладистического анализа представляют собой древовидные диаграммы, называемые кладограммами ; они и все их ответвления представляют собой филогенетические гипотезы. [12]

В филогенетической номенклатуре представлены три метода определения клад : на основе узла, стебля и апоморфии ( подробные определения см. в разделе «Филогенетическая номенклатура § Филогенетические определения названий клад »).

Терминология

Кладограмма современных групп приматов; все долгопяты — долгопяты, но не все долгопяты — долгопяты; все обезьяны — катары, но не все катары — обезьяны; и т. д.

Отношения между кладами можно описать несколькими способами:

Возраст

Возраст клады можно описать на основе двух разных ориентиров: возраста кроны и возраста ствола. Коронный возраст клады относится к возрасту самого последнего общего предка всех видов клады. Основной возраст клады относится к тому времени, когда предковая линия клады отошла от ее сестринской клады. Основной возраст клады либо равен возрасту ее короны, либо старше ее. [15] Обратите внимание, что возраст клад невозможно наблюдать напрямую. Они выводятся либо на основе стратиграфии окаменелостей , либо на основе оценок молекулярных часов . [16]

Вирусы

Филогенетическое древо вирусов SIV и ВИЧ, показывающее клады (подтипы) вируса.

Вирусы , и особенно РНК-вирусы, образуют клады. [17] Они полезны для отслеживания распространения вирусных инфекций . ВИЧ , например, имеет клады, называемые подтипами, которые различаются по географической распространенности. [18] Подтип ВИЧ (клада) B, например, преобладает в Европе, Америке и Японии, тогда как подтип A чаще встречается в Восточной Африке. [19]

Смотрите также

Примечания

  1. ^ Высказывались семантические доводы в пользу того, что название должно быть «голофилетическим», но этот термин не получил широкого распространения. Для получения дополнительной информации см. голофилия .

Рекомендации

  1. ^ Мартин, Элизабет; Хин, Роберт (2008). Биологический словарь . Издательство Оксфордского университета.
  2. ^ Кракрафт, Джоэл; Донохью, Майкл Дж., ред. (2004). "Введение". Сборка Древа Жизни . Издательство Оксфордского университета. п. 1. ISBN 978-0-19-972960-9.
  3. ^ Аб Палмер, Дуглас (2009). Эволюция: История жизни . Беркли: Издательство Калифорнийского университета. п. 13.
  4. Пейс, Норман Р. (18 мая 2006 г.). "Время перемен". Природа . 441 (7091): 289. Бибкод : 2006Natur.441..289P. дои : 10.1038/441289a . ISSN  1476-4687. PMID  16710401. S2CID  4431143.
  5. ^ Дюпюи, Клод (1984). «Влияние Вилли Хеннига на таксономическую мысль». Ежегодный обзор экологии и систематики . 15 : 1–24. doi : 10.1146/annurev.es.15.110184.000245 .
  6. ^ Хаксли, Дж. С. (1957). «Три типа эволюционного процесса». Природа . 180 (4584): 454–455. Бибкод : 1957Natur.180..454H. дои : 10.1038/180454a0. S2CID  4174182.
  7. ^ Хаксли, TH (1876): Лекции по эволюции. Нью-Йорк Трибьюн . Дополнительный. № 36. В сборнике сочинений IV: стр. 46–138, оригинальный текст с рисунками.
  8. ^ Брауэр, Эндрю В.З. (2013). «Вилли Хенниг в 100 лет». Кладистика . 30 (2): 224–225. дои : 10.1111/cla.12057 .
  9. ^ ab «Эволюция 101». Страница 10. Веб-сайт «Понимание эволюции». Калифорнийский университет, Беркли. Проверено 26 февраля 2016 г.
  10. ^ «Международный кодекс филогенетической номенклатуры. Версия 4c. Глава I. Таксоны». 2010. Архивировано из оригинала 15 июня 2010 года . Проверено 22 сентября 2012 г.
  11. ^ Энвалл, Матс (2008). «О различии между моно-, голо- и парафилетическими группами: последовательное различие процесса и образца». Биологический журнал Линнеевского общества . 94 : 217. doi : 10.1111/j.1095-8312.2008.00984.x .
  12. ^ Никсон, Кевин С.; Карпентер, Джеймс М. (1 сентября 2000 г.). «О другой «филогенетической систематике»». Кладистика . 16 (3): 298–318. дои : 10.1111/j.1096-0031.2000.tb00285.x . PMID  34902935. S2CID  73530548.
  13. ^ Аб Крелл, Ф.-Т. и Крэнстон, П. (2004). «Какая сторона дерева более базальная?». Систематическая энтомология . 29 (3): 279–281. Бибкод : 2004SysEn..29..279K. дои : 10.1111/j.0307-6970.2004.00262.x . S2CID  82371239.
  14. Смит, Стейси (19 сентября 2016 г.). «Из любви к деревьям: Предков нет среди нас». Из любви к деревьям . Проверено 23 марта 2019 г.
  15. ^ Хармон 2021.
  16. ^ Брауэр, АВЗ, Шух, RT 2021. Биологическая систематика: принципы и приложения (3-е изд.). Издательство Корнельского университета, Итака, Нью-Йорк.
  17. ^ Ямаджи Р., Саад, доктор медицинских наук, Дэвис Коннектикут, Суэйн Д.Е., Ван Д., Вонг Ф.Ю., Макколи Дж.В., Пейрис Дж.С., Уэбби Р.Дж., Фушье Р.А., Каваока Ю., Чжан В. (май 2020 г.). «Пандемический потенциал высокопатогенных вирусов птичьего гриппа клады 2.3.4.4 A(H5)». Обзоры по медицинской вирусологии . 30 (3): e2099. дои : 10.1002/rmv.2099. ПМЦ 9285678 . ПМИД  32135031. 
  18. ^ Стеббинг Дж., Мойл Дж. (2003). «Клады ВИЧ: их происхождение и клиническое значение». Обзоры по СПИДу . 5 (4): 205–13. ПМИД  15011999.
  19. Сарабия I, Bosque A (ноябрь 2019 г.). «Задержка ВИЧ-1 и изменение задержки: имеет ли значение подтип?». Вирусы . 11 (12): 1104. дои : 10.3390/v11121104 . ПМК 6950696 . ПМИД  31795223. 

Библиография

Внешние ссылки