Микробная популяционная биология — это применение принципов популяционной биологии к микроорганизмам .
Биология микробных популяций на практике представляет собой применение популяционной экологии и популяционной генетики для понимания экологии и эволюции бактерий , архебактерий , микроскопических грибов (таких как дрожжи ), дополнительных микроскопических эукариотов (например, « простейших » и водорослей ) и вирусов . .
Биология микробных популяций также охватывает эволюцию и экологию общественных взаимодействий ( экология сообщества ) между микроорганизмами, включая коэволюцию микробов и взаимодействия хищник-жертва . Кроме того, микробная популяционная биология рассматривает микробные взаимодействия с более макроскопическими организмами (например, взаимодействия хозяин - паразит ), хотя, строго говоря, это должно быть больше с точки зрения микроскопического, а не макроскопического организма. Значительную часть микробной популяционной биологии можно также описать как микробную эволюционную экологию . С другой стороны, обычно биологи микробных популяций (в отличие от микробных экологов ) меньше озабочены вопросами роли микроорганизмов в экологии экосистемы , которая представляет собой изучение круговорота питательных веществ и движения энергии между биотическими, а также абиотическими компонентами экосистем.
Биология микробной популяции может включать аспекты молекулярной эволюции или филогенетики . Однако, строго говоря, эти акценты следует использовать для понимания проблем микробной эволюции и экологии, а не как средство понимания более универсальных истин, применимых как к микроскопическим, так и к макроскопическим организмам. Следовательно, микроорганизмы в таких начинаниях следует рассматривать как организмы, а не просто как молекулярные или эволюционно- редукционистские модельные системы. Таким образом, изучение эволюции РНК in vitro не является биологией микробных популяций, равно как и не является созданием in silico филогений немикробных последовательностей, даже если аспекты того и другого могут каким-то (особенно непреднамеренным) образом быть аналогичны эволюции реальных микробов. населения.
Биология микробных популяций может включать (и часто включает) проверку более общих экологических и эволюционных гипотез. Опять же, важно сохранить некоторый акцент на микробах, поскольку в какой-то момент эта «ориентированная на вопросы» микробная популяционная биология становится популяционной биологией с использованием микроорганизмов. Поскольку отправная точка этих потенциально несопоставимых акцентов может быть несколько произвольной, существуют расплывчатые и не общепринятые границы вокруг того, что представляет собой дисциплина микробной популяционной биологии, а что нет.
Гордоновская исследовательская конференция по микробной популяционной биологии проводится каждый нечетный год, вплоть до настоящего времени в Новой Англии (и обычно в Нью-Гэмпшире). На веб-странице конференции 2007 года встречи представлены как:
Биология микробных популяций охватывает широкий спектр передовых проблем в области микробных наук и за ее пределами. Предыдущие встречи, прочно основанные на эволюционной биологии и строго интегративном подходе, охватывали самые разные темы: от динамики и генетики адаптации до эволюции скорости мутаций, экологии сообщества, эволюционной геномики, альтруизма и эпидемиологии.
Эта встреча никогда не бывает скучной: здесь обсуждались некоторые из наиболее важных и спорных вопросов биологии.
Историю встречи можно найти здесь.
Следующая конференция Гордона по микробной популяционной биологии запланирована на 2025 год. Информация о прошлых (и будущих) встречах резюмируется следующим образом: