Микробная популяционная биология — это применение принципов популяционной биологии к микроорганизмам .
Микробная популяционная биология на практике представляет собой применение популяционной экологии и популяционной генетики для понимания экологии и эволюции бактерий , архебактерий , микроскопических грибов (например, дрожжей ), дополнительных микроскопических эукариот (например, « простейших » и водорослей ) и вирусов .
Микробная популяционная биология также охватывает эволюцию и экологию взаимодействия сообществ ( экология сообществ ) между микроорганизмами, включая микробную коэволюцию и взаимодействия хищник-жертва . Кроме того, микробная популяционная биология рассматривает микробные взаимодействия с более макроскопическими организмами (например, взаимодействия хозяин - паразит ), хотя строго это должно быть больше с точки зрения микроскопического, а не макроскопического организма. Значительную часть микробной популяционной биологии можно также описать как микробную эволюционную экологию . С другой стороны, обычно биологи микробных популяций (в отличие от микробных экологов ) меньше озабочены вопросами роли микроорганизмов в экологии экосистем , которая является изучением круговорота питательных веществ и перемещения энергии между биотическими, а также абиотическими компонентами экосистем.
Микробная популяционная биология может включать аспекты молекулярной эволюции или филогенетики . Строго говоря, однако, эти акценты должны использоваться для понимания вопросов микробной эволюции и экологии, а не как средства понимания более универсальных истин, применимых как к микроскопическим, так и к макроскопическим организмам. Микроорганизмы в таких начинаниях, следовательно, должны быть признаны организмами, а не просто молекулярными или эволюционными редукционистскими модельными системами. Таким образом, изучение эволюции РНК in vitro не является микробной популяционной биологией, как и генерация in silico филогений в противном случае немикробных последовательностей, даже если аспекты любого из них могут в некоторой (особенно непреднамеренной) манере быть аналогичными эволюции в реальных микробных популяциях.
Микробная популяционная биология может (и часто так и делает) включать проверку более общих экологических и эволюционных гипотез. Опять же, важно сохранить некоторый акцент на микробе, поскольку в какой-то момент эта «вопросно-ориентированная» микробная популяционная биология становится вместо этого популяционной биологией, использующей микроорганизмы. Поскольку отправная точка этих потенциально разрозненных акцентов может быть несколько произвольной, существуют неопределенные и не общепринятые границы вокруг того, что дисциплина микробной популяционной биологии составляет, а что нет.
Конференция по исследованию микробной популяции Гордона проводится каждый нечетный год, на сегодняшний день в Новой Англии (и обычно в Нью-Гемпшире). Веб-страница конференции 2007 года представляет встречи как:
Микробная популяционная биология охватывает широкий спектр передовых вопросов в микробиологических науках и за их пределами. Прочно основанные на эволюционной биологии и с ярко выраженным интегративным подходом, прошлые встречи охватывали темы от динамики и генетики адаптации до эволюции скорости мутаций, экологии сообщества, эволюционной геномики, альтруизма и эпидемиологии.
На этой встрече никогда не бывает скучно: здесь обсуждались некоторые из самых важных и спорных вопросов биологии.
Историю встречи можно найти здесь.
Следующая конференция имени Гордона по микробной популяционной биологии запланирована на 2025 год. Информация о прошедших (и будущих) встречах обобщена следующим образом: