stringtranslate.com

Гликопротеин ядерной поры p62

Ядерный поровый гликопротеин p62 представляет собой белковый комплекс, связанный с ядерной оболочкой . Белок p62 остается связанным с фракцией ядерного порового комплекса -ламины. p62 синтезируется как растворимый цитоплазматический предшественник 61 кДа [5] с последующей модификацией, включающей добавление остатков N-ацетилглюкозамина [6] с последующей ассоциацией с другими сложными белками. У людей он кодируется геном NUP62 .

Комплекс ядерной поры представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя шлюз, который регулирует поток макромолекул между ядром и цитоплазмой. Нуклеопорины являются основными компонентами комплекса ядерной поры в эукариотических клетках. Белок, кодируемый этим геном, является членом FG-повтора, содержащего нуклеопорины, и локализуется в центральной пробке ядерной поры. Этот белок ассоциируется с комплексом импортина альфа/бета, который участвует в импорте белков, содержащих сигналы ядерной локализации . Несколько вариантов транскриптов этого гена кодируют одну изоформу белка. [7]

Структура

P62 — это богатый серином / треонином белок из ~520 аминокислот с тетрапептидными повторами на аминоконце и серией альфа-спиральных областей с гидрофобными гептадными повторами [8], образующими домен бета-пропеллера . P62 собирается в комплекс, содержащий 3 дополнительных белка, p60, p54 и p45 [9] [10], образуя комплекс p62 массой ~235 кДа. O -GlcNAcylation , по-видимому, участвует в сборке и разборке p62 в комплексы более высокого порядка, а богатая серином/треонином линкерная область между Ser270 и Thr294, по-видимому, является регуляторной. [11] Комплекс p62 локализован как на нуклеоплазматической , так и на цитоплазматической сторонах порового комплекса, а относительный диаметр комплекса p62 относительно ядерного порового комплекса предполагает, что он взаимодействует с поровым шлюзом. [12]

Функция

P62, по-видимому, взаимодействует с мРНК во время транспортировки из ядра. [13] P62 также взаимодействует с белком ядерного транспортного фактора ( NTF2 ), который участвует в транспортировке белков между цитоплазмой и ядром. [14] Другой белок, импортин (бета), связывается с секцией спирального стержня p62, который также связывается с NTF2, что предполагает образование комплекса ворот более высокого порядка. [15] Кариоферин бета2 (транспортин), транспортер рибопротеина, также взаимодействует с p62. [16] P62 также взаимодействует с Nup93 , [17] и когда Nup98 истощается, p62 не может собираться с комплексами ядерных пор. [18] Мутантные поры не могут стыковать/транспортировать белки с сигналами ядерной локализации или сигналами импорта M9.

Патология

Антитела к комплексу p62 участвуют в одном или нескольких аутоиммунных заболеваниях. Гликозилирование p62 увеличивается при диабете [19] и может влиять на его связь с другими заболеваниями. p62 также чаще встречается при первичном билиарном циррозе IV стадии и является прогностическим признаком тяжелого заболевания. [20]

Взаимодействия

Было показано, что нуклеопорин 62 взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000213024 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000109511 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Дэвис ЛИ, Блобель Г (1986). «Идентификация и характеристика белка ядерного порового комплекса». Cell . 45 (5): 699–709. doi :10.1016/0092-8674(86)90784-1. PMID  3518946. S2CID  22170880.
  6. ^ Davis LI, Blobel G (1987). «Комплекс ядерных пор содержит семейство гликопротеинов, которое включает p62: гликозилирование через ранее неопознанный клеточный путь». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 84 (21): 7552–6. Bibcode :1987PNAS...84.7552D. doi : 10.1073/pnas.84.21.7552 . PMC 299337 . PMID  3313397. 
  7. ^ "Ген Энтреза: нуклеопорин NUP62 62kDa".
  8. ^ Starr CM, D'Onofrio M, Park MK, Hanover JA (1990). «Первичная последовательность и гетерологичная экспрессия гликопротеина ядерной поры p62». J. Cell Biol . 110 (6): 1861–71. doi :10.1083/jcb.110.6.1861. PMC 2116139. PMID  2190987 . 
  9. ^ Kita K, Omata S, Horigome T (1993). «Очистка и характеристика комплекса гликопротеина ядерной поры, содержащего p62». J. Biochem . 113 (3): 377–82. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124054. PMID  8486610.
  10. ^ Buss F, Stewart M (1995). "Макромолекулярные взаимодействия в комплексе нуклеопорина p62 ядерных пор крысы: связывание нуклеопорина p54 со стержневым доменом p62". J. Cell Biol . 128 (3): 251–61. doi :10.1083/jcb.128.3.251. PMC 2120351. PMID  7531196 . 
  11. ^ Lubas WA, Smith M, Starr CM, Hanover JA (1995). «Анализ гликозилирования белка ядерной поры p62». Биохимия . 34 (5): 1686–94. doi :10.1021/bi00005a025. PMID  7849028.
  12. ^ Guan T, Müller S, Klier G, Panté N, Blevitt JM, Haner M, Paschal B, Aebi U, Gerace L (1995). «Структурный анализ комплекса p62, сборки O-связанных гликопротеинов, которая локализуется вблизи центрального закрытого канала комплекса ядерной поры». Mol. Biol. Cell . 6 (11): 1591–603. doi : 10.1091/mbc.6.11.1591. PMC 301313. PMID  8589458. 
  13. ^ Dargemont C, Schmidt-Zachmann MS, Kühn LC (1995). «Прямое взаимодействие нуклеопорина p62 с мРНК во время его экспорта из ядра». J. Cell Sci . 108 (1): 257–63. doi : 10.1242/jcs.108.1.257 . PMID  7738103.
  14. ^ Bullock TL, Clarkson WD, Kent HM, Stewart M (1996). «Кристаллическая структура ядерного транспортного фактора 2 (NTF2) с разрешением 1,6 ангстрем». J. Mol. Biol . 260 (3): 422–31. doi :10.1006/jmbi.1996.0411. PMID  8757804.
  15. ^ ab Percipalle P, Clarkson WD, Kent HM, Rhodes D, Stewart M (1997). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа/бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Biol . 266 (4): 722–32. doi :10.1006/jmbi.1996.0801. PMID  9102465.
  16. ^ Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина β3». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (9): 4451–6. Bibcode : 1997PNAS...94.4451Y. doi : 10.1073 /pnas.94.9.4451 . PMC 20743. PMID  9114010. 
  17. ^ ab Grandi P, Dang T, Pané N, Shevchenko A, Mann M, Forbes D, Hurt E (1997). "Nup93, позвоночный гомолог дрожжевого Nic96p, образует комплекс с новым белком 205 кДа и необходим для правильной сборки ядерной поры". Mol. Biol. Cell . 8 (10): 2017–38. doi :10.1091/mbc.8.10.2017. PMC 25664 . PMID  9348540. 
  18. ^ Wu X, Kasper LH, Mantcheva RT, Mantchev GT, Springett MJ, van Deursen JM (2001). «Нарушение FG нуклеопорина NUP98 вызывает селективные изменения в стехиометрии и функции комплекса ядерной поры». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (6): 3191–6. Bibcode :2001PNAS...98.3191W. doi : 10.1073/pnas.051631598 . PMC 30629 . PMID  11248054. 
  19. ^ Хан И, О ЭС, Кудлоу ДЖЕ (2000). «Реакция состояния O-связанной модификации N-ацетилглюкозамина ядерного порового белка p62 на внеклеточную концентрацию глюкозы». Biochem. J . 350 Pt 1 (Pt 1): 109–14. doi :10.1042/0264-6021:3500109. PMC 1221231 . PMID  10926833. 
  20. ^ Miyachi K, Hankins RW, Matsushima H, Kikuchi F, Inomata T, Horigome T, Shibata M, Onozuka Y, Ueno Y, Hashimoto E, Hayashi N, Shibuya A, Amaki S, Miyakawa H (2003). «Профиль и клиническое значение антител к ядерной оболочке, обнаруженных у пациентов с первичным билиарным циррозом: многоцентровое исследование». J. Autoimmun . 20 (3): 247–54. doi :10.1016/S0896-8411(03)00033-7. PMID  12753810.
  21. ^ Yoshima T, Yura T, Yanagi H (ноябрь 1997). «Тримеризационный домен человеческого фактора теплового шока 2 способен взаимодействовать с нуклеопорином p62». Biochem. Biophys. Res. Commun . 240 (1): 228–33. doi :10.1006/bbrc.1997.7662. PMID  9367915.
  22. ^ Ben-Efraim I, Gerace L (январь 2001 г.). «Градиент возрастающей аффинности импортина бета к нуклеопоринам вдоль пути ядерного импорта». J. Cell Biol . 152 (2): 411–7. doi :10.1083/jcb.152.2.411. PMC 2199621. PMID  11266456 . 
  23. ^ Hu T, Guan T, Gerace L (август 1996 г.). «Молекулярная и функциональная характеристика комплекса p62, сборки гликопротеинов комплекса ядерной поры». J. Cell Biol . 134 (3): 589–601. doi : 10.1083/jcb.134.3.589. PMC 2120945. PMID  8707840. 
  24. ^ Paschal BM, Gerace L (май 1995). «Идентификация NTF2, цитозольного фактора ядерного импорта, который взаимодействует с белком комплекса ядерной поры p62». J. Cell Biol . 129 (4): 925–37. doi : 10.1083/jcb.129.4.925. PMC 2120498. PMID  7744965. 
  25. ^ Gamper C, van Eyndhoven WG, Schweiger E, Mossbacher M, Koo B, Lederman S (2000). "TRAF-3 взаимодействует с нуклеопорином p62, компонентом центральной пробки ядерной поры, которая связывает классические комплексы импорта, содержащие NLS". Mol. Immunol . 37 (1–2): 73–84. doi :10.1016/S0161-5890(00)00015-8. PMID  10781837.
  26. ^ Kehlenbach RH, Dickmanns A, Kehlenbach A, Guan T, Gerace L (май 1999). «Роль RanBP1 в высвобождении CRM1 из комплекса ядерной поры на конечном этапе ядерного экспорта». J. Cell Biol . 145 (4): 645–57. doi :10.1083/jcb.145.4.645. PMC 2133185. PMID  10330396 . 
  27. ^ Lindsay ME, Holaska JM, Welch K, Paschal BM, Macara IG (июнь 2001 г.). «Ran-связывающий белок 3 является кофактором для экспорта ядерного белка, опосредованного Crm1». J. Cell Biol . 153 (7): 1391–402. doi :10.1083/jcb.153.7.1391. PMC 2150735. PMID  11425870 . 

Дальнейшее чтение