Американская научная организация
Ассоциация учреждений биомолекулярных ресурсов (ABRF) занимается развитием основных и исследовательских биотехнологических лабораторий посредством исследований, коммуникации и образования. [1] Членами ABRF являются более 2000 ученых, представляющих 340 различных основных лабораторий в 41 стране, включая промышленные, правительственные, академические и исследовательские учреждения.
История
В 1986 году была проведена встреча-сателлит Research Resource Facility в рамках Шестой международной конференции по методам анализа последовательности белков. [ требуется ссылка ] В следующем году образцы секвенирования белков и аминокислот были отправлены для обследования 103 основных объектов. К 1989 году ABRF был официально организован и зарегистрирован. Ежегодное собрание проводилось как сателлитное собрание Protein Society до 1996 года, когда начались отдельные собрания. [2]
Исследовательские группы ABRF
Исследовательские группы созданы для выполнения двух целей Ассоциации биомолекулярных ресурсных объектов. Во-первых, для предоставления механизмов самооценки и улучшения процедурной и операционной точности, прецизионности и эффективности в ресурсных объектах и исследовательских лабораториях. Во-вторых, для содействия образованию персонала ресурсных объектов и исследовательских лабораторий, пользователей, администраторов и заинтересованных членов научного сообщества. [3] Результаты исследований исследовательской группы ABRF были опубликованы в научных статьях. [4] [5] [6] Результаты исследований исследовательской группы ABRF были повторно использованы в других исследованиях. [7] [8] [9]
Технологии Ресурсов
Члены ABRF участвуют в широком спектре биомолекулярных технологий, которые внедряются в основных учреждениях:
- Автоматизация: высокопроизводительный скрининг, LIMS , робототехника .
- Химия белков/пептидов : анализ аминокислот, секвенирование N- и C-концевых участков, синтез пептидов, пептидные/белковые массивы.
- Биофизика : калориметрия , КД, флуоресценция , рассеяние света , ППР , ультрацентрифугирование .
- Проточная цитометрия, активирующая флуоресценцию, сортировка клеток
- Экспрессия, идентификация и профилирование белков : дифференциальная флуоресценция, традиционный двумерный гель-электрофорез , обнаружение биомаркеров заболеваний.
- Экспрессия генов и профилирование: генные матрицы, ПЦР в реальном времени .
- Масс-спектрометрия : качественный, количественный и структурный анализ белков, углеводов , олигонуклеотидов и липидов .
- Микроскопия световая микроскопия и визуализация, Конфокальная микроскопия
- Химия нуклеиновых кислот : секвенирование ДНК , синтез ДНК , синтез РНК , генотипирование .
- Разделение: 1- и 2-мерный ПААГ, капиллярный электрофорез , хроматография .
- Контроль качества : GLP, GMP, качество и соответствие.
- Универсальный стандарт протеомики (UPS), смесь белков, используемых в качестве эталонного стандарта в протеомике, представленная вышеупомянутой sPRG. [10] Она включает в себя два набора: исходный (UPS1, где все 48 белков находятся на уровне 48 пмоль) и динамический диапазон концентраций (называемый UPS2), варьирующийся от 500 амоль до 50 пмоль. [11]
- Другое: биоинформатика , анализ углеводов , дифференциальный дисплей, производство рекомбинантных белков .
Ежегодная конференция
Ежегодная конференция Ассоциации биомолекулярных ресурсов проводится весной в разных городах Северной Америки. Эта международная конференция используется для ознакомления участников с новыми и развивающимися биотехнологиями посредством лекций, круглых столов, презентаций исследовательских групп, стендовых сессий, семинаров и технических выставок.
- ABRF 2023, 7–10 мая 2023 г., Бостон, Массачусетс
- ABRF 2022, 27–30 марта 2022 г., Палм-Спрингс, Калифорния
- ABRF 2021, 7–11 марта 2021 г., виртуальная встреча из-за COVID-19
- ABRF 2020, 29 февраля - 3 марта 2020 г., Палм-Спрингс, Калифорния
- ABRF 2019, 23–26 марта, Сан-Антонио , Техас; 30 лет преодоления границ науки и технологий, открывая двери в будущее
- ABRF 2018, 22–25 апреля, Миртл-Бич, Южная Каролина ; Главная конференция по основным услугам
- ABRF 2017, 25–28 марта, Сан-Диего , Калифорния; Форум для продвижения современных базовых технологий для обеспечения инноваций завтрашнего дня.
- ABRF 2016, 20–23 февраля, Форт-Лодердейл , Флорида; Инновационные технологии, ускоряющие открытия
- ABRF 2015, 28–31 марта, Сент-Луис , Миссури; Интегративные технологии для продвижения научных ядер
- ABRF 2014, 23–25 марта, Альбукерке , Нью-Мексико; Командная наука и большие данные: ядра на переднем крае
- ABRF 2013, 2–5 марта, Палм-Спрингс, Калифорния; Инструменты для развития конвергентной науки
- ABRF 2012, 17–20 марта, Орландо, Флорида; Изучение биомолекул
- ABRF 2011, 19–22 февраля, Сан-Антонио, Техас; Технологии для персонализированной медицины
- ABRF 2010, 20–23 марта, Сакраменто, Калифорния; Трансляция фундаментальных исследований с достижениями в области биомолекулярной технологии
- ABRF 2009, 7–10 февраля, Мемфис, Теннесси; Применение и оптимизация существующих и новых биотехнологий
- ABRF 2008, 9–12 февраля, Солт-Лейк-Сити, Юта; Внедрение технологий в области наук о жизни
- ABRF 2007, 31 марта - 3 апреля, Тампа, Флорида; Создание биологической дорожной карты
- ABRF 2006, 11–14 февраля, Лонг-Бич, Калифорния; Интеграция науки, инструментов и технологий с системной биологией
- ABRF 2005, 5–8 февраля, Саванна, Джорджия; Биомолекулярные технологии: от открытия к гипотезе
- ABRF 2004, 28 февраля - 2 марта, Портленд, Орегон; Интеграция технологий в протеомике и геномике
- ABRF 2003, 10–13 февраля, Денвер, Колорадо; Трансляция биологии с использованием протеомики и функциональной геномики
- ABRF 2002, 9–12 марта, Остин, Техас; Биомолекулярные технологии: инструменты для открытий в протеомике и геномике
- ABRF 2001, 24–27 февраля, Сан-Диего, Калифорния; Новая биология: технология разрешения макромолекулярных коммуникаций
- ABRF 2000, 19–22 февраля, Белвью, Вашингтон; От единичного к глобальному анализу биологических систем
- ABRF 1999, 19–22 марта, Дарем, Северная Каролина; Биоинформатика и биомолекулярные технологии: связывание геномов, протеомов и биохимии
- ABRF 1998, 21–24 марта, Сан-Диего, Калифорния; От геномов к функциям — технические проблемы постгеномной эры
- ABRF 1997, 9–12 февраля, Балтимор, Мэриленд; Методы на интерфейсе генома и протеома
- ABRF 1996, 30 марта - 2 апреля, Сан-Франциско, Калифорния; Биомолекулярные технологии
Премия ABRF
Премия ABRF вручается на ежегодном собрании ABRF за выдающийся вклад в биомолекулярные технологии. Прошлые победители премии (годы относятся к ежегодной конференции, на которой была вручена награда): [12]
Журнал биомолекулярных технологий
ABRF является издателем журнала Journal of Biomolecular Techniques. Журнал рецензируется и издается ежеквартально. [13] Основной упор в журнале делается на публикацию научных обзоров и статей, связанных с биомолекулярными ресурсными объектами. Исследовательская группа публикует отчеты, включающие ежегодные обзоры. Также включены новости и события, а также обзор статей, посвященных методам, используемым в типичных основных условиях объектов. Текущий главный редактор — Рон Орландо, Университет Джорджии .
Исполнительный совет ABRF
- Кевин Кнудтсон, президент ABRF, Отдел геномики, Университет Айовы
- Жюстин Кигени, казначей, Медицинский центр КУ
- Мари Адамс, Институт Ван Анделя
- Роксанн Эшворт, Университет Джонса Хопкинса
- Ким Делвенталь, Институт медицинских исследований Стоуэрса
- Шридар Читтур, SUNY Albany
- Ник Амбулос, Медицинская школа Мэрилендского университета
- Сью Вайнтрауб, Центр медицинских наук Техасского университета в Сан-Антонио
- Магнус Палмблад, Медицинский центр Лейденского университета
- Кен Шоппманн, исполнительный директор ABRF
Ссылки
- ^ "Mission Statement". Association of Biomolecular Resource Facilities. Архивировано из оригинала 1 апреля 2019 года . Получено 4 марта 2020 года .
- ^ Крабб, Дж. У.: «ABRF; Краткая история» ABRF News, июнь 1995 г.
- ^ "Research Group Guidelines" (PDF) . Ассоциация биомолекулярных ресурсных учреждений. Архивировано из оригинала (PDF) 31 января 2012 года . Получено 15 апреля 2009 года .
- ^ Чой, Мина; Эрен-Догу, Зейнеп Ф.; Коланджело, Кристофер; Коттрелл, Джон; Хупманн, Майкл Р.; Капп, Юджин А.; Ким, Сангтае; Лам, Генри; Нойберт, Томас А.; Палмблад, Магнус; Финни, Бретт С.; Вайнтрауб, Сьюзан Т.; Маклин, Брендан; Витек, Ольга (2017). «Исследование исследовательской группы по информатике протеома ABRF (iPRG) 2015 г.: обнаружение дифференциально распространенных белков в количественных экспериментах без меток с использованием ЖХ–МС/МС». Журнал исследований протеома . 16 (2): 945–957. doi :10.1021/acs.jproteome.6b00881. PMID 27990823. S2CID 4578078.
- ^ Chalkley, Robert J.; Bandeira, Nuno; Chambers, Matthew C.; Clauser, Karl R.; Cottrell, John S.; Deutsch, Eric W.; Kapp, Eugene A.; Lam, Henry HN; McDonald, W. Hayes; Neubert, Thomas A.; Sun, Rui-Xiang (2014). "Proteome informatics research group (iPRG)_2012: исследование по обнаружению модифицированных пептидов в сложной смеси". Molecular & Cellular Proteomics . 13 (1): 360–371. doi : 10.1074/mcp.M113.032813 . PMC 3879627 . PMID 24187338 . Получено 5 ноября 2018 г. .
- ^ Беннетт, Кейрин Л.; Ван, Ся; Бистром, Кори Э.; Чемберс, Мэтью К.; Андахт, Трейси М.; Данготт, Ларри Дж.; Элортца, Феликс; Лешик, Джон; Молина, Хенрик; Мориц, Роберт Л.; Финни, Бретт С.; Томпсон, Дж. Уилл; Бангер, Морин К.; Табб, Дэвид Л. (2015). «Исследование протеомной исследовательской группы ABRF 2012/2013 гг.: оценка продольной внутрилабораторной изменчивости в рутинных анализах пептидной жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии». Молекулярная и клеточная протеомика . 14 (12): 3299–3309. doi : 10.1074/mcp.O115.051888 . PMC 4762617 . PMID 26435129 . Получено 5 ноября 2018 г. .
- ^ Нгуен, Трунг Хай; Растенбург, Ариен С.; Криммер, Стефан Г.; Чжан, Хэси; Кларк, Джон Д.; Новик, Пол А.; Брэнсон, Ким; Панде, Виджай С.; Чодера, Джон Д.; Минь, Дэвид Д.Л. (2018). «Байесовский анализ изотермической титрационной калориметрии для термодинамики связывания». PLOS ONE . 13 (9): e0203224. Bibcode : 2018PLoSO..1303224N. doi : 10.1371/journal.pone.0203224 . PMC 6136728. PMID 30212471 .
- ^ The, Matthew; Edfors, Fredrik; Perez-Riverol, Yasset; Payne, Samuel H.; Hoopmann, Michael R.; Palmblad, Magnus; Forsström, Björn; Käll, Lukas (2018). «Стандарт белка, который эмулирует гомологию для характеристики алгоритмов вывода белка». Journal of Proteome Research . 17 (5): 1879–1886. doi :10.1021/acs.jproteome.7b00899. PMC 6474350. PMID 29631402 .
- ^ У, Гуаньин; Вань, Сян; Сюй, Баохуа (2018). «Новая оценка частоты ложных открытий на уровне белков». BMC Genomics . 19 (Suppl 6): 567. doi : 10.1186/s12864-018-4923-3 . PMC 6101079. PMID 30367581 .
- ^ "Универсальные стандарты протеомики – проверка будущего протеомики" . Получено 22 августа 2016 г. .
- ^ "Протеомные стандарты UPS1 и UP2" . Получено 22 августа 2016 г.
- ^ "ABRF Award". Ассоциация биомолекулярных ресурсных учреждений. Архивировано из оригинала 30 января 2012 года . Получено 22 августа 2016 года .
- ^ "JBT: Journal of Biomolecular Techniques". Ассоциация биомолекулярных ресурсных учреждений. Архивировано из оригинала 10 сентября 2022 г. Получено 16 октября 2022 г.
Внешние ссылки
- Ассоциация биомолекулярных ресурсов ABRF
- Федерация американских обществ экспериментальной биологии (FASEB)
- Форум обсуждения ABRF
- Журнал биомолекулярных технологий
- ABRF в LinkedIn
- Лидерство