Эволюционная линия — это временной ряд популяций, организмов, клеток или генов, связанных непрерывной линией происхождения от предка к потомку. [1] [2] Линии — это подмножества эволюционного древа жизни . Линии часто определяются методами молекулярной систематики .
Родословные обычно визуализируются как подмножества филогенетического дерева . Родословная — это одна линия происхождения или линейная цепь внутри дерева, в то время как клада — это (обычно разветвленная) монофилетическая группа, содержащая одного предка и всех его потомков. [3] Филогенетические деревья обычно создаются на основе данных о последовательностях ДНК , РНК или белков . Помимо этого, морфологические различия и сходства использовались и до сих пор используются для создания филогенетических деревьев. Собираются последовательности от разных особей, и их сходство количественно оценивается. Математические процедуры используются для кластеризации особей по сходству. [4]
Члены вида считаются эволюционирующими как единое целое (или родословная), когда они неоднократно разделяют одни и те же гены. Узлы будут представлять собой разделение родословной из-за разрыва генетических связей: когда одна родословная делится на два подмножества, а особи не обмениваются генами, они будут накапливать различия в генах. Если они не сольются снова, это создаст новую отдельную потомковую кладу. [4]
Так же, как карта является масштабированным приближением истинной географии , филогенетическое дерево является приближением истинных полных эволюционных отношений. Например, в полном дереве жизни весь клад животных может быть сжат до одной ветви дерева. Однако это всего лишь ограничение пространства визуализации. Теоретически, истинное и полное дерево для всех живых организмов или для любой последовательности ДНК может быть создано. [4]
Тем не менее, филогении иногда могут появляться в недревовидной форме. Ветви на дереве жизни могут расти вместе, явление, называемое ретикуляцией , которое происходит из-за различных биологических процессов. Другой процесс, интрогрессия , происходит, когда гибриды между различными линиями передают новый генетический материал посредством последующего скрещивания. В других случаях гибридное видообразование происходит, когда линии гибридизируются, образуя новую, отличную линию. Горизонтальный перенос генов, включающий интрогрессию очень немногих генов, обычно выглядит как древовидная история популяции с некоторыми генами, имеющими несогласованную историю. Таким образом, древовидное представление было бы правильным, пока интрогрессия и гибридное видообразование редки или ограничены близкородственными кончиками (линий). В некоторых случаях эволюционные связи должны быть лучше изображены в виде сети. [4]