.jpg/1280px-Marocaster_coronatus_MHNT.PAL.2010.2.2_(Close_up).jpg)
В биологии тип — это конкретный экземпляр (или в некоторых случаях группа экземпляров) организма, с которым формально связано научное название этого организма. Другими словами, тип — это пример, который служит для закрепления или централизации определяющих особенностей этого конкретного таксона . В более старом использовании (до 1900 года в ботанике) типом считался таксон, а не образец. [1]
Таксон — это научно названная группа организмов с другими подобными организмами, совокупность , включающая одни организмы и исключающая другие, основанная на подробном опубликованном описании (например, описании вида ) и предоставлении типового материала, который обычно доступен ученых для экспертизы в исследовательской коллекции крупного музея или аналогичного учреждения. [1] [2]
Согласно точному набору правил, изложенных в Международном кодексе зоологической номенклатуры (ICZN) и Международном кодексе номенклатуры водорослей, грибов и растений (ICN), научное название каждого таксона почти всегда основано на одном конкретном экземпляре . , или в некоторых случаях образцы. Типы имеют большое значение для биологов, особенно для систематиков . Типы обычно представляют собой физические образцы, которые хранятся в музее или исследовательской коллекции гербария , но в противном случае изображение особи этого таксона иногда обозначалось как тип. [3] Описание видов и назначение типовых экземпляров является частью научной номенклатуры и альфа-таксономии .
При идентификации материала ученый пытается применить название таксона к образцу или группе образцов на основе своего понимания соответствующих таксонов [ необходимы разъяснения ] [ необходима ссылка ] на основе (по крайней мере) прочтения типового описания(ий) [ нужна ссылка ] , предпочтительно также на основе изучения всего типового материала всех соответствующих таксонов. Если существует более одного названного типа, и все они кажутся одним и тем же таксоном, то самое старое название имеет приоритет и считается правильным названием имеющегося материала. С другой стороны, если таксон вообще не имел названия, тогда ученый или другой квалифицированный эксперт выбирает типовой образец и публикует новое название и официальное описание. [ нужна цитата ]
В зависимости от номенклатурного кода , применяемого к рассматриваемому организму, типом может быть образец, культура, иллюстрация или (в соответствии с бактериологическим кодом) описание. Некоторые кодексы считают типом подчиненный таксон, но согласно ботаническому кодексу тип всегда является образцом или иллюстрацией.
Например, в исследовательской коллекции Музея естественной истории в Лондоне есть экземпляр птицы под номером 1886.6.24.20. Это образец птицы, широко известной как пятнистый лунь , которая в настоящее время носит научное название Circus assimilis . Этот конкретный экземпляр является голотипом этого вида; название Circus assimilis по определению относится к виду этого конкретного экземпляра. Этот вид был назван и описан Джардином и Селби в 1828 году, а голотип был помещен в музейную коллекцию, чтобы другие ученые могли ссылаться на него при необходимости.
По крайней мере, для типовых образцов не требуется использовать «типичную» особь. Роды и семейства , особенно установленные ранними систематиками, имеют тенденцию называться по именам более «типичных» для них видов, но и здесь это не всегда так и в связи с изменениями в систематике не может быть. Следовательно, термин номенклатурный тип или ономатофор иногда используется для обозначения того факта, что биологические типы не определяют «типичных» особей или таксонов , а скорее фиксируют научное название для конкретной оперативной таксономической единицы. Типовые экземпляры теоретически даже могут быть аберрантными или деформированными особями или вариациями цвета, хотя это редко случается, поскольку затрудняет определение, к какой популяции принадлежал человек. [1] [2] [4]
Использование термина « тип» несколько осложняется из-за несколько разных его значений в ботанике и зоологии . В PhyloCode определения на основе типов заменены филогенетическими определениями .
В некоторых старых таксономических работах слово «тип» иногда использовалось по-другому. Значение было аналогичным в первых Законах ботанической номенклатуры , [5] [6] , но имеет значение, более близкое к термину « таксон» в некоторых других работах: [7]
Эти особенности позволяют различать тип всех других особенных разделов. … После изучения этих разнообразных форм я пришёл к тому, чтобы подумать о том, что это один и тот же тип мема.
Перевод: Этот единственный признак позволяет [можно] отличить этот тип от всех других видов секции... Изучив разнообразные формы, я пришел к выводу, что они принадлежат к одному и тому же видовому типу.
В ботанической номенклатуре тип ( typus , номенклатурный тип ) «является тем элементом , за которым постоянно закреплено название таксона». (статья 7.2) [8] В ботанике типом является либо образец, либо иллюстрация. Образец — это настоящее растение (или одна или несколько частей растения или множество маленьких растений), мертвое и хранящееся в безопасности, «кураторе» в гербарии ( или его эквиваленте для грибов). Примеры того, где иллюстрация может служить типом:
Тип не определяет границы таксона. Например, одуванчик обыкновенный — спорный таксон: одни ботаники считают, что он состоит из более чем ста видов, а другие считают его одним видом. Тип названия Taraxacum officinale один и тот же, независимо от того, включает ли описание вида все эти мелкие виды ( Taraxacum officinale — «большой» вид) или ограничивается ли описание только одним мелким видом из ста ( Taraxacum officinale — «мелкий» вид). Название Taraxacum officinale то же самое, и тип названия тот же, но степень его фактического применения сильно различается. Определение границ таксона осуществляется систематиком в публикации.
Разные примечания:
В МКП представлен список различных видов типов (статья 9 и Глоссарий), [8] наиболее важным из которых является голотип. Это
Слово «тип» появляется в ботанической литературе как часть некоторых старых терминов, не имеющих статуса в МКП : например, клонотип.
В зоологической номенклатуре типом вида или подвида является экземпляр или серия экземпляров. Тип рода или подрода является видом. Типом надродового таксона (например, семейства и т. д.) является род. Имена выше ранга надсемейства не имеют типов. «Номенклатурный тип» — это образец или изображение, которое «обеспечивает объективный эталон, с помощью которого можно определить применение названия номинального таксона».
Хотя на самом деле биологи могут исследовать множество экземпляров (если таковые имеются) нового таксона, прежде чем написать официальное опубликованное описание вида, тем не менее, согласно формальным правилам наименования видов (Международный кодекс зоологической номенклатуры), должен быть обозначен один тип, как часть опубликованного описания.
Описание типа должно включать диагноз (обычно обсуждение сходств и отличий от близкородственных видов) и указание того, где типовой образец или образцы переданы для исследования. Географическое положение, в котором первоначально был обнаружен типовой экземпляр, называется его местом обитания.тип местность . В случае паразитов этот терминтип хозяина (или симбиотип) используется для обозначения организма-хозяина, из которого был получен типовой образец.[9]
Зоологические коллекции поддерживаются университетами и музеями. Две важные функции таких коллекций — обеспечение того, чтобы типы сохранялись в хорошем состоянии и были доступны для изучения систематикам. И хотя обозначен только один голотип , могут существовать и другие «типовые» экземпляры, из которых формально определены следующие:
Если в исходном описании четко указан один экземпляр, этот экземпляр известен как голотип этого вида. Голотип обычно помещается в крупный музей или аналогичную общеизвестную публичную коллекцию, чтобы он был доступен для последующего изучения другими биологами.
Если в исходном описании указан голотип, могут существовать дополнительные экземпляры, которые автор обозначает как дополнительные представители того же вида, называемые паратипами. Это не именной тип .
Аллотип — особь противоположного голотипу пола, выделенная из числа паратипов. Раньше это слово также использовалось для обозначения образца, имеющего особенности, не наблюдаемые в голотипе окаменелости. [10] Термин не регулируется МКЗН .
Неотип — это образец, позже выбранный в качестве единственного типового образца, когда исходный голотип был утерян или уничтожен или если первоначальный автор никогда не цитировал образец.
Синтип — это любой из двух или более экземпляров, перечисленных в описании вида, где не указан голотип; исторически синтипы часто явно обозначались как таковые, и в соответствии с нынешней МКЗН это является требованием, но современные попытки опубликовать описание видов на основе синтипов обычно не одобряются практикующими систематиками, и большинство из них постепенно заменяются лектотипами. Те, которые существуют до сих пор, по-прежнему считаются именной типами.
Лектотип — это образец, позже выбранный в качестве единственного типового образца для видов, первоначально описанных из набора синтипов . В зоологии лектотип — это разновидность номенклатурного типа . Если вид первоначально был описан на основе номенклатурного типа, состоящего из нескольких экземпляров, один из них может быть обозначен как лектотип. Наличие одного номенклатурного типа снижает вероятность путаницы, особенно если учесть, что серия синтипов нередко содержит экземпляры более чем одного вида.
Ярким примером является предположение, что Карл Линней должен составлять лектотип вида Homo sapiens . [11]
Паралектотипом называется любой дополнительный экземпляр из множества синтипов после выделения из них лектотипа. Это не именной тип. [12]
Особый случай у протистанов , когда тип состоит из двух или более экземпляров «непосредственно связанных особей, представляющих отдельные стадии жизненного цикла»; В совокупности они рассматриваются как единое целое, и среди них нельзя выделить лектотипы.
Иллюстрация, на основе которой был создан новый вид или подвид. Например, бирманский питон Python bivittatus — один из многих видов, созданных на основе иллюстраций Альбертуса Себы (1734 г.). [13] [14]
Эргатотип — это образец, выбранный для обозначения рабочего члена перепончатокрылых , имеющих полиморфные касты. [10]
Гипотип — это экземпляр, сведения о котором ранее были опубликованы и который используется в дополнительных рисунках или описаниях вида. [15]
Термин « клептотип » неофициально относится к типовому экземпляру или его части, которые были украдены или неправильно перемещены. [16] [17] [18] [19]
Типовые иллюстрации также использовались зоологами, как в случае с попугаем Реюньона , который известен только по историческим иллюстрациям и описаниям. [20] : 24
Недавно были описаны некоторые виды, где типовой экземпляр был выпущен живым обратно в дикую природу, например, Bulo Burti boubou ( кустарник ), описанный как Laniarius liberatus , у которого описание вида включало последовательности ДНК из образцов крови и перьев. Если предположить, что в будущем не возникнет вопроса о статусе такого вида, отсутствие типового экземпляра не делает название недействительным, но в будущем может возникнуть необходимость обозначить неотип для такого таксона, если возникнут какие-либо вопросы. Однако в случае с кустарниковым сорокопутом орнитологи, используя только доступные образцы крови и перьев, утверждали, что этот экземпляр представлял собой редкую и до сих пор неизвестную цветовую морфу давно известного вида. Хотя до сих пор ведутся споры о необходимости хранения фактически убитых особей в качестве типовых образцов, можно заметить, что при правильном оформлении и хранении образцы тканей могут быть столь же ценными, если возникнет спор о достоверности вида.
Перечисленные выше различные типы необходимы , поскольку многие виды были описаны одно или два столетия назад, когда часто не обозначался единственный типовой экземпляр, голотип. Кроме того, шрифты не всегда тщательно сохранялись, а промежуточные события, такие как войны и пожары, приводили к уничтожению исходного шрифтового материала. Действительность названия вида часто зависит от наличия оригинальных типовых экземпляров; или, если тип не может быть найден или он никогда не существовал, при ясности описания.
МКЗН существует только с 1961 года, когда было опубликовано первое издание Кодекса. МКЗН не всегда требует типового образца для исторической достоверности вида, и многие «бестиповые» виды действительно существуют. Действующая редакция Кодекса, статья 75.3, запрещает обозначение неотипа, за исключением случаев «исключительной необходимости» для «уточнения таксономического статуса» вида (статья 75.2).
Существует множество других перестановок и вариаций терминов, использующих суффикс «-тип» (например, аллотип , котип, топотип, генитип , изотип , изонеотип, изолектотип и т. д.), но они формально не регламентированы Кодексом, и их очень много. являются устаревшими и/или уникальными. Однако некоторые из этих категорий потенциально могут применяться к подлинным типовым образцам, таким как неотип; например, изотипические/топотипические образцы предпочтительнее других образцов, если они доступны на момент выбора неотипа (поскольку они происходят из того же времени и/или места, что и исходный тип).
Термин «фиксация» используется в Кодексе для объявления номенклатурного типа посредством первоначального или последующего обозначения.
.jpg/1280px-Bufo_bufo_(Marek_Szczepanek).jpg)
Каждый род должен иметь обозначенный типовой вид (когда-то для этого использовался термин «генотип», но от него отказались, поскольку это слово стало гораздо более известным как термин, обозначающий другое понятие в генетике ). Описание рода обычно основывается преимущественно на его типовом виде, модифицированном и расширенном за счет признаков других входящих в него видов. Родовое название постоянно связано с номенклатурным типом своего типового вида.
В идеале типовой вид лучше всего отражает основные характеристики рода, к которому он принадлежит, но это субъективно и, в конечном счете, технически нерелевантно, поскольку это не является требованием Кодекса. Если при более внимательном рассмотрении оказывается, что типовой вид принадлежит к ранее существовавшему роду (обычное явление), то все составляющие виды должны быть либо перемещены в ранее существовавший род, либо отделены от исходного типового вида и присвоены новое родовое название; старое родовое название переходит в синонимию и от него отказываются, если только нет острой необходимости сделать исключение (решается в каждом конкретном случае посредством обращения в Международную комиссию по зоологической номенклатуре). [ нужна цитата ]
Типовой род — род, от которого образовано название семейства или подсемейства. Как и в случае с типовыми видами, типовой род не обязательно является наиболее репрезентативным, но обычно является самым ранним описанным, крупнейшим или наиболее известным родом. Нередко в основе названия семейства лежит название типового рода, перешедшее в синонимию; фамилию в такой ситуации менять не нужно.