stringtranslate.com

Доставка генов

Доставка генов — это процесс введения чужеродного генетического материала, такого как ДНК или РНК , в клетки- хозяева . [1] Доставка генов должна достичь генома клетки-хозяина, чтобы вызвать экспрессию генов . [2] Успешная доставка генов требует, чтобы доставка чужеродного гена оставалась стабильной внутри клетки-хозяина и могла либо интегрироваться в геном , либо реплицироваться независимо от него. [3] Для этого требуется, чтобы чужеродная ДНК была синтезирована как часть вектора , который предназначен для проникновения в нужную клетку-хозяина и доставки трансгена в геном этой клетки. [4] Векторы, используемые в качестве метода доставки генов, можно разделить на две категории: рекомбинантные вирусы и синтетические векторы (вирусные и невирусные). [2] [5]

В сложных многоклеточных эукариотах (точнее, вейсманистах ), если трансген включен в зародышевые клетки хозяина , полученная клетка хозяина может передать трансген своему потомству . Если трансген включен в соматические клетки, трансген останется с соматической клеточной линией, и, таким образом, с организмом хозяина. [6]

Доставка генов является необходимым шагом в генной терапии для введения или подавления гена для содействия терапевтическому результату у пациентов, а также имеет применение в генетической модификации сельскохозяйственных культур. Существует много различных методов доставки генов для различных типов клеток и тканей. [6]

История

Векторы на основе вирусов появились в 1980-х годах как инструмент для экспрессии трансгенов. В 1983 году Альберт Сигел описал использование вирусных векторов для экспрессии трансгенов растений, хотя вирусная манипуляция посредством клонирования кДНК еще не была доступна. [7] Первым вирусом, который был использован в качестве вектора вакцины, был вирус коровьей оспы в 1984 году как способ защиты шимпанзе от гепатита B. [ 8] О невирусной доставке генов впервые сообщили в 1943 году Эвери и др., которые показали изменение клеточного фенотипа посредством воздействия экзогенной ДНК . [9]

Методы

Бактериальная трансформация подразумевает перемещение гена из одной бактерии в другую. Он интегрируется в плазмиду реципиента и затем может быть выражен новым хозяином.

Существует множество методов доставки генов в клетки-хозяева. Когда гены доставляются в бактерии или растения, этот процесс называется трансформацией , а когда он используется для доставки генов животным, он называется трансфекцией . Это связано с тем, что трансформация имеет другое значение по отношению к животным, указывая на прогрессирование в раковое состояние. [10] Для некоторых бактерий не нужны внешние методы для введения генов, поскольку они естественным образом способны поглощать чужеродную ДНК . [11] Большинству клеток требуется какое-то вмешательство, чтобы сделать клеточную мембрану проницаемой для ДНК и позволить ДНК стабильно встраиваться в геном хозяина .

Химический

Химические методы доставки генов могут использовать природные или синтетические соединения для формирования частиц, которые облегчают перенос генов в клетки. [2] Эти синтетические векторы обладают способностью электростатически связывать ДНК или РНК и уплотнять генетическую информацию для размещения более крупных генетических переносов. [5] Химические векторы обычно проникают в клетки путем эндоцитоза и могут защищать генетический материал от деградации. [6]

Тепловой шок

Один из самых простых методов заключается в изменении среды клетки, а затем в ее стрессе путем теплового шока . Обычно клетки инкубируют в растворе, содержащем двухвалентные катионы (часто хлорид кальция ) в условиях холода, перед тем как подвергать их тепловому импульсу. Хлорид кальция частично разрушает клеточную мембрану, что позволяет рекомбинантной ДНК проникнуть в клетку-хозяина. Предполагается, что воздействие двухвалентных катионов на клетки в условиях холода может изменить или ослабить структуру поверхности клетки, сделав ее более проницаемой для ДНК. Считается, что тепловой импульс создает тепловой дисбаланс через клеточную мембрану, что заставляет ДНК проникать в клетки либо через поры клетки, либо через поврежденную клеточную стенку.

фосфат кальция

Другой простой метод включает использование фосфата кальция для связывания ДНК и последующее воздействие на культивируемые клетки. Раствор вместе с ДНК инкапсулируется клетками , и небольшое количество ДНК может быть интегрировано в геном. [12]

Липосомы и полимеры

Липосомы и полимеры могут использоваться в качестве векторов для доставки ДНК в клетки. Положительно заряженные липосомы связываются с отрицательно заряженной ДНК, в то время как полимеры могут быть разработаны для взаимодействия с ДНК. [2] Они образуют липоплексы и полиплексы соответственно, которые затем поглощаются клетками. [13] Эти две системы также могут быть объединены. [6] Невирусные векторы на основе полимеров используют полимеры для взаимодействия с ДНК и образования полиплексов. [6]

Наночастицы

Использование искусственных неорганических и органических наночастиц является еще одним невирусным подходом к доставке генов. [14] [15]

Физический

Искусственная доставка генов может быть осуществлена ​​с помощью физических методов, которые используют силу для введения генетического материала через клеточную мембрану. [2]

Электропорация

Электропораторы можно использовать для того, чтобы сделать клеточную мембрану проницаемой для ДНК.

Электропорация — это метод повышения компетентности . Клетки подвергаются кратковременному шоку электрическим полем напряженностью 10-20 кВ /см, что, как полагают, создает отверстия в клеточной мембране, через которые может проникнуть плазмидная ДНК. После электрошока отверстия быстро закрываются механизмами восстановления мембраны клетки.

Биолистика

Генная пушка использует биолистику для внедрения ДНК в клетки

Другой метод, используемый для трансформации растительных клеток, — это биолистика , где частицы золота или вольфрама покрываются ДНК, а затем выстреливаются в молодые растительные клетки или растительные эмбрионы. [16] Некоторый генетический материал проникает в клетки и трансформирует их. Этот метод можно использовать на растениях, которые не восприимчивы к инфекции Agrobacterium , а также позволяет трансформировать растительные пластиды . Растительные клетки также можно трансформировать с помощью электропорации, которая использует электрический шок, чтобы сделать клеточную мембрану проницаемой для плазмидной ДНК. Из-за повреждения, наносимого клеткам и ДНК, эффективность трансформации биолистики и электропорации ниже, чем агробактериальной трансформации. [17]

Микроинъекция

Микроинъекция – это процесс, при котором ДНК вводится через ядерную оболочку клетки непосредственно в ядро . [11]

Сонопорация

Сонопорация — это кратковременное проникновение через клеточные мембраны с помощью ультразвука , как правило, в присутствии газовых микропузырьков . [18] Сонопорация позволяет проникать генетическому материалу в клетки. [19] [20]

Фотопорация

Фотопорация — это процесс, при котором лазерные импульсы используются для создания пор в клеточной мембране, через которые проникает генетический материал.

Магнитофекция

Магнитофекция использует магнитные частицы, соединенные с ДНК, а внешнее магнитное поле концентрирует частицы нуклеиновой кислоты в клетках-мишенях.

Гидропорация

Гидродинамический капиллярный эффект можно использовать для управления проницаемостью клеток.

Агробактерии

A. tumefaciens прикрепляется к клетке моркови

В растениях ДНК часто вставляется с помощью рекомбинации, опосредованной Agrobacterium , [21] используя последовательность T-ДНК Agrobacterium , которая позволяет естественным образом вставлять генетический материал в растительные клетки. [22] Растительная ткань разрезается на небольшие кусочки и замачивается в жидкости, содержащей суспендированную Agrobacterium . Бактерии прикрепляются ко многим растительным клеткам, обнажаемым надрезами. Бактерии используют конъюгацию для переноса сегмента ДНК, называемого T-ДНК, из своей плазмиды в растение. Перенесенная ДНК направляется в ядро ​​растительной клетки и интегрируется в геномную ДНК растения-хозяина. Плазмидная T-ДНК интегрируется полуслучайным образом в геном клетки-хозяина. [23]

Модифицируя плазмиду для экспрессии интересующего гена, исследователи могут стабильно вставлять выбранный ими ген в геном растения. Единственными существенными частями Т-ДНК являются ее два небольших (25 пар оснований) пограничных повтора, по крайней мере один из которых необходим для трансформации растения. [24] [25] Гены, которые должны быть введены в растение, клонируются в вектор трансформации растения , который содержит область Т-ДНК плазмиды . Альтернативным методом является агроинфильтрация . [26] [27]

Вирусная доставка

Чужеродная ДНК трансдуцируется в клетку-хозяина через аденовирусный вектор.

Вирусопосредованная доставка генов использует способность вируса вводить свою ДНК внутрь клетки-хозяина и использует собственную способность вируса реплицироваться и внедрять свой собственный генетический материал. Вирусные методы доставки генов с большей вероятностью вызывают иммунный ответ, но они обладают высокой эффективностью. [6] Трансдукция — это процесс, который описывает вирусопосредованную вставку ДНК в клетку-хозяина. Вирусы являются особенно эффективной формой доставки генов, поскольку структура вируса предотвращает деградацию через лизосомы ДНК, которую он доставляет в ядро ​​клетки-хозяина. [28] В генной терапии ген, предназначенный для доставки, упаковывается в вирусную частицу с дефектом репликации для формирования вирусного вектора . [29] Вирусы, используемые для генной терапии на сегодняшний день, включают ретровирус, аденовирус, аденоассоциированный вирус и вирус простого герпеса. Однако существуют недостатки использования вирусов для доставки генов в клетки. Вирусы могут доставлять в клетки только очень маленькие фрагменты ДНК, это трудоемкий процесс, и существуют риски случайных мест вставки, цитопатических эффектов и мутагенеза. [30]

Доставка генов на основе вирусного вектора использует вирусный вектор для доставки генетического материала в клетку-хозяина. Это делается с помощью вируса, содержащего нужный ген, и удаления части генома вируса, которая является инфекционной. [2] Вирусы эффективны в доставке генетического материала в ядро ​​клетки-хозяина, что жизненно важно для репликации. [2]

Вирусные векторы на основе РНК

Вирусы на основе РНК были разработаны из-за возможности транскрибировать напрямую с инфекционных РНК-транскриптов. Векторы РНК быстро экспрессируются и экспрессируются в целевой форме, поскольку не требуется никакой обработки [необходим источник]. Ретровирусные векторы включают онкоретровирусный, лентивирусный и пенистый вирус человека , являются вирусными векторами на основе РНК, которые осуществляют обратную транскрипцию и интегрируются в геном хозяина, что обеспечивает долгосрочную экспрессию трансгена. [2]

Вирусные векторы на основе ДНК

Вирусные векторы на основе ДНК включают Adenoviridae , аденоассоциированный вирус и вирус простого герпеса . [2]

Приложения

генная терапия

Некоторые из методов, используемых для облегчения доставки генов, имеют применение в терапевтических целях. Генная терапия использует доставку генов для доставки генетического материала с целью лечения заболевания или состояния в клетке. Доставка генов в терапевтических условиях использует неиммуногенные векторы , способные к клеточной специфичности, которые могут доставлять достаточное количество экспрессии трансгена, чтобы вызвать желаемый эффект. [3]

Достижения в области геномики позволили идентифицировать множество новых методов и генных мишеней для возможных приложений. ДНК-микрочипы, используемые в различных методах секвенирования следующего поколения, могут одновременно идентифицировать тысячи генов, с аналитическим программным обеспечением, изучающим паттерны экспрессии генов, и ортологичными генами в модельных видах для идентификации функции. [31] Это позволило идентифицировать множество возможных векторов для использования в генной терапии. В качестве метода создания нового класса вакцин доставка генов использовалась для создания гибридного биосинтетического вектора для доставки возможной вакцины. Этот вектор преодолевает традиционные барьеры для доставки генов, объединяя E. coli с синтетическим полимером для создания вектора, который поддерживает плазмидную ДНК, имея при этом повышенную способность избегать деградации лизосомами целевых клеток. [32]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Jones CH, Chen CK, Ravikrishnan A, Rane S, Pfeifer BA (ноябрь 2013 г.). «Преодоление барьеров невирусной доставки генов: перспективы и будущее». Molecular Pharmaceutics . 10 (11): 4082–98. doi :10.1021/mp400467x. PMC  5232591 . PMID  24093932.
  2. ^ abcdefghi Камимура К, Суда Т, Чжан Г, Лю Д (октябрь 2011 г.). «Достижения в системах доставки генов». Фармацевтическая медицина . 25 (5): 293–306. doi :10.1007/bf03256872. PMC 3245684. PMID  22200988 . 
  3. ^ ab Mali S (январь 2013 г.). «Системы доставки для генной терапии». Indian Journal of Human Genetics . 19 (1): 3–8. doi : 10.4103/0971-6866.112870 . PMC 3722627. PMID  23901186 . 
  4. ^ Гибсон Г., Мьюз С.В. (2009). Учебник по геномной науке (третье изд.). 23 Plumtree Rd, Sunderland, MA 01375: Sinauer Associates. стр. 304–305. ISBN 978-0-87893-236-8.{{cite book}}: CS1 maint: location (link)
  5. ^ ab Pack DW, Hoffman AS, Pun S, Stayton PS (июль 2005 г.). «Проектирование и разработка полимеров для доставки генов». Nature Reviews. Drug Discovery . 4 (7): 581–93. doi :10.1038/nrd1775. PMID  16052241. S2CID  20972049.
  6. ^ abcdef Nayerossadat N, Maedeh T, Ali PA (6 июля 2012 г.). "Вирусные и невирусные системы доставки для доставки генов". Advanced Biomedical Research . 1 : 27. doi : 10.4103/2277-9175.98152 . PMC 3507026. PMID  23210086 . 
  7. ^ Юсибов В, Шивпрасад С, Терпен ТХ, Доусон В, Копровски Х (1999). «Растительные вирусные векторы на основе тобамовирусов». Биотехнология растений . Актуальные темы микробиологии и иммунологии. Т. 240. С. 81–94. doi :10.1007/978-3-642-60234-4_4. ISBN 978-3-540-66265-5. PMID  10394716.
  8. ^ Moss B, Smith GL, Gerin JL, Purcell RH (сентябрь 1984 г.). «Живой рекомбинантный вирус вакцины защищает шимпанзе от гепатита B». Nature . 311 (5981): 67–9. Bibcode :1984Natur.311...67M. doi : 10.1038/311067a0 . PMID  6472464. S2CID  4358204.
  9. ^ Эйвери ОТ, Маклауд СМ, Маккарти М (2017). Die Entdeckung der Doppelhelix . Klassische Texte der Wissenschaft (на немецком языке). Шпрингер Спектрум, Берлин, Гейдельберг. стр. 97–120. дои : 10.1007/978-3-662-47150-0_2. ISBN 9783662471494. S2CID  52805314.
  10. ^ Альбертс Б. , Джонсон А., Льюис Дж., Рафф М., Робертс К., Уолтер П. (2002). Молекулярная биология клетки. Нью-Йорк: Garland Science. стр. G:35. ISBN 978-0-8153-4072-0.
  11. ^ ab Chen I, Dubnau D (март 2004). «Поглощение ДНК во время бактериальной трансформации». Nature Reviews. Microbiology . 2 (3): 241–9. doi :10.1038/nrmicro844. PMID  15083159. S2CID  205499369.
  12. ^ "Лекция 8 генная инженерия животных клеток". www.slideshare.net . 2012-01-25 . Получено 2018-07-18 .
  13. ^ Biocyclopedia.com. "Методы переноса генов (трансфекции) у животных | Генная инженерия и биотехнология Методы переноса генов и трансгенные организмы | Генетика, биотехнология, молекулярная биология, ботаника | Biocyclopedia.com". biocyclopedia.com . Получено 18 июля 2018 г.
  14. ^ Инь, Фэн; Гу, Бобо; Линь, Инин; Панвар, Ништа; Тджин, Суи Чуан; Ку, Джунле; Лау, Шу Пин; Йонг, Кен-Тай (15 сентября 2017 г.). «Функционализированные 2D-наноматериалы для приложений доставки генов». Coordination Chemistry Reviews . 347 : 77. doi : 10.1016/j.ccr.2017.06.024. hdl : 10397/95016 .
  15. ^ Сингх Б. Н., Пратикша, Гупта В. К., Чен Дж., Атанасов А. Г. Комбинированные подходы на основе органических наночастиц для генной терапии. Trends Biotechnol. 2017 Декабрь; 35(12): 1121–1124. doi: 10.1016/j.tibtech.2017.07.010.
  16. ^ Head G, Hull RH, Tzotzos GT (2009). Генетически модифицированные растения: оценка безопасности и управление рисками . Лондон: Academic Pr. стр. 244. ISBN 978-0-12-374106-6.
  17. ^ Hwang, HH; Yu, M; Lai, EM (2017 ) . «Трансформация растений, опосредованная Agrobacterium: биология и применение». The Arabidopsis Book . 15 : e0186. doi :10.1199/tab.0186. PMC 6501860. PMID  31068763. 
  18. ^ Постема М., Котопоулис С., Делаланд А., Гилья О.Г. (2012). «Сонопорация: почему микропузырьки создают поры». Ультрашкола в медицине . 33 (1): 97–98. дои : 10.1055/s-0031-1274749. S2CID  260344222.
  19. ^ Delalande A, Postema M, Mignet N, Midoux P, Pichon C (2012). «Доставка генов с помощью ультразвука и микропузырьков: последние достижения и текущие проблемы». Therapeutic Delivery . 3 (10): 1199–1215. doi :10.4155/TDE.12.100. PMID  23116012. S2CID  20924113.
  20. ^ Delalande A, Kotopoulis S, Postema M, Midoux P, Pichon C (2013). «Сонопорация: механистические идеи и текущие проблемы переноса генов». Gene . 525 (2): 191–199. doi :10.1016/j.gene.2013.03.095. PMID  23566843.
  21. ^ Национальный исследовательский совет (США) Комитет по выявлению и оценке непреднамеренных эффектов генетически модифицированных продуктов питания на здоровье человека (2004-01-01). Методы и механизмы генетической манипуляции растениями, животными и микроорганизмами. National Academies Press (США).
  22. ^ Gelvin SB (март 2003 г.). «Трансформация растений, опосредованная агробактериями: биология, стоящая за инструментом «генного жокея». Microbiology and Molecular Biology Reviews . 67 (1): 16–37, оглавление. doi :10.1128/MMBR.67.1.16-37.2003. PMC 150518. PMID 12626681  . 
  23. ^ Francis KE, Spiker S (февраль 2005 г.). «Идентификация трансформантов Arabidopsis thaliana без отбора выявляет высокую частоту молчащих интеграций T-ДНК». The Plant Journal . 41 (3): 464–77. doi : 10.1111/j.1365-313x.2004.02312.x . PMID  15659104.
  24. ^ Schell J, Van Montagu M (1977). «Ti-плазмида Agrobacterium Tumefaciens, естественный вектор для внедрения генов NIF в растения?». В Hollaender A, Burris RH, Day PR, Hardy RW, Helinski DR, Lamborg MR, Owens L, Valentine RC (ред.). Генная инженерия для фиксации азота . Basic Life Sciences. Том 9. стр. 159–79. doi :10.1007/978-1-4684-0880-5_12. ISBN 978-1-4684-0882-9. PMID  336023.
  25. ^ Joos H, Timmerman B, Montagu MV, Schell J (1983). «Генетический анализ переноса и стабилизации ДНК Agrobacterium в растительных клетках». The EMBO Journal . 2 (12): 2151–60. doi : 10.1002 /j.1460-2075.1983.tb01716.x. PMC 555427. PMID  16453483. 
  26. ^ Thomson JA. "Генетическая инженерия растений" (PDF) . Биотехнология . 3. Получено 17 июля 2016 г.
  27. ^ Leuzinger K, Dent M, Hurtado J, Stahnke J, Lai H, Zhou X, Chen Q (июль 2013 г.). «Эффективная агроинфильтрация растений для высокоуровневой транзиентной экспрессии рекомбинантных белков». Journal of Visualized Experiments . 77 (77). doi :10.3791/50521. PMC 3846102 . PMID  23913006. 
  28. ^ Wivel NA, Wilson JM (июнь 1998). «Методы доставки генов». Hematology/Oncology Clinics of North America . 12 (3): 483–501. doi : 10.1016/s0889-8588(05)70004-6 . PMID  9684094.
  29. ^ Lodish H, Berk A, Zipursky SL, et al. (2000). Молекулярная клеточная биология (четвертое издание). Нью-Йорк: WH Freeman and Company. стр. Раздел 6.3, Вирусы: структура, функция и использование. ISBN 9780716737063.
  30. ^ Keles E, Song Y, Du D, Dong WJ, Lin Y (август 2016 г.). «Последний прогресс в области наноматериалов для доставки генов». Biomaterials Science . 4 (9): 1291–309. doi :10.1039/C6BM00441E. PMID  27480033.
  31. ^ Guyon I, Weston J, Barnhill S, Vapnik V (2002). «Выбор генов для классификации рака с использованием машин опорных векторов». Машинное обучение . 46 : 389–422. doi : 10.1023/A:1012487302797 .
  32. ^ Jones CH, Ravikrishnan A, Chen M, Reddinger R, Kamal Ahmadi M, Rane S, Hakansson AP, Pfeifer BA (август 2014 г.). «Разработка гибридного биосинтетического вектора генной терапии и возможности двойной инженерии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (34): 12360–5. Bibcode : 2014PNAS..11112360J. doi : 10.1073/pnas.1411355111 . PMC 4151754. PMID  25114239 . 

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки