stringtranslate.com

Холестан

Холестаннасыщенный тетрациклический тритерпен . Этот 27-углеродный биомаркер производится в результате диагенеза холестерина и является одним из самых распространенных биомаркеров в горных породах. [2] Присутствие холестана, его производных и родственных химических соединений в образцах окружающей среды обычно интерпретируется как индикатор жизни животных и/или следов O 2 , поскольку известно, что животные производят исключительно холестерин, и, таким образом, использовалось для выявления эволюционных связей между древними организмами неизвестного филогенетического происхождения и современными таксонами многоклеточных животных . [3] Холестерин производится в небольших количествах другими организмами (например, родофитами , наземными растениями ), но поскольку эти другие организмы производят различные стерины, его нельзя использовать в качестве окончательного индикатора какого-либо одного таксона. [4] [5] Он часто обнаруживается при анализе органических соединений в нефти .

Фон

Холестан — это насыщенный биомаркер животных C-27, часто встречающийся в нефтяных месторождениях. Это диагенетический продукт холестерина , который представляет собой органическую молекулу, производимую в основном животными и составляющую ~30% мембран животных клеток [ требуется ссылка ] . Холестерин отвечает за жесткость и текучесть мембран , а также за внутриклеточный транспорт , клеточную сигнализацию и нервную проводимость . [6] У людей он также является предшественником гормонов (то есть эстрогена , тестостерона ). Он синтезируется через сквален и естественным образом принимает определенную стереохимическую ориентацию (3β-ол, 5α (H), 14α (H), 17α (H), 20R). Эта стереохимическая ориентация обычно сохраняется на протяжении диагенетических процессов, но холестан можно найти в ископаемой летописи со многими стереохимическими конфигурациями.

Биомаркер

Холестан в палеонтологической летописи часто интерпретируется как индикатор ( биомаркер ) древней животной жизни и часто используется геохимиками и геобиологами для реконструкции эволюции животных (особенно в докембрийской истории Земли; например, эдиакарской , [3] криогеновой и протерозойской в ​​целом [7] [8] ). Молекулярный кислород необходим для производства холестерина; [9] таким образом, присутствие холестана предполагает наличие некоторых следов кислорода в палеосреде. Холестан не является исключительно производным диагенеза стероидных молекул животного происхождения; холестан также может быть связан с присутствием, например, родофитов и эмбриофитов , [10] [5] хотя распространенность такого неметаозанового холестана неизвестна. Эмбриофиты обычно производят различные стерины, которые в совокупности известны как фитостерины , [11] а холестерин остается второстепенным компонентом. Напротив, бактерии продуцируют другие циклические тритерпеноиды, такие как гопаноиды , а их диагенетические продукты гопаны используются в качестве бактериальных биомаркеров.

Естественное сохранение в окаменелостях

Холестерин распадается до холестана путем потери функциональной группы ОН и насыщения двойной связи (обозначено розовым цветом). Стереохимия молекулы сохраняется при этой деградации.

Холестерин имеет 256 стереоизомеров , но только один из них образуется естественным образом при производстве холестерина (3β-ол, 5α (H), 14α (H), 17α (H), 20R) и, следовательно, является основным стереоизомером, представляющим интерес для измерений холестана. Отклонения от этой стереохимии часто отражают диагенез , термическое созревание и смещение сохранения .

Диагенез обычно приводит к потере функциональных групп и двойных связей в органических молекулах. Для холестана, в частности, диагенез холестерина в холестан производит молекулу, которая полностью насыщена по сравнению со своим стероидным аналогом. Этот процесс происходит без потери или приобретения атомов углерода и, следовательно, может служить индикатором исходного стероида, произведенного организмом в окружающей среде. [12]

Термическое изменение также может вызвать потерю боковой цепи алкана при C 17 . [13] Эксперимент показал, что в течение 4 недель при 300 °C холестан претерпел 17% разложения своей боковой цепи алкана. Напротив, полициклическая структура (C 1-17 ) очень термически стабильна. Диагенетические процессы также могут вызывать метильные сдвиги и ароматизацию .

Стереохимическое изменение

Дополнительные диагенетические процессы могут дополнительно изменять молекулу холестана. Например, холестан подвержен стереохимическим сдвигам с течением времени от своего природного изомера. Эти изменения могут быть результатом термического или микробного изменения. Термическое изменение может вызвать изменения стереохимии как в хиральном центре C20 , так и в атомах водорода. Соотношение стереоизомеров R/S обычно сообщается как мера «термической зрелости». [14] Напротив, преобразование атома водорода в положении C5 из α в β-конфигурацию отражает анаэробную микробную активность, [3] и может быть понято с помощью экспериментов по мечению изотопов в контролируемых экспериментах с микробами, метаболизирующими интересующий стероид. [15] [16] Одно исследование продемонстрировало, что существуют две реакции, которые могут привести к потере двойной связи холестерина — (1) прямое восстановление двойной связи или (2) образование кетона до восстановления двойной связи — что приводит к отчетливой изомеризации атома водорода в положении C5 . [15] Атомы водорода C14 и C17α более стабильны и претерпевают изменения в β-конфигурации при гораздо меньших содержаниях, чем атом водорода 5.

Методы измерения

ГХ/МС

Изомеры холестана элюируются в разное время в экспериментах ГХ/МС/МС во фрагменте m/z 372→217. Рисунок адаптирован из работы Бобровского и др. [3]

Холестан можно извлечь из образцов и измерить на ГХ/МС для количественной оценки относительного содержания по отношению к другим органическим соединениям. Это измерение выполняется путем экстракции стеранов в неполярный растворитель (например, дихлорметан или хлороформ ) и очистки до фракции « насыщенных » с использованием газовой хроматографии на колонке с силикагелем. Изомеры холестана будут элюироваться из колонки на основе молекулярной массы и различной стереохимии, что делает традиционную масс-спектрометрию сложной из-за тесного совместного элюирования изомеров. В качестве альтернативы можно измерить холестан с помощью экспериментов ГХ/МС/МС, которые нацелены на фрагмент m/z 217 (из молекулярного иона 372). Этот конкретный метод сначала ищет молекулярный ион 372 холестана, а затем фрагментирует этот молекулярный ион далее до его фрагмента m/z 217, чтобы улучшить идентификацию конкретных изомеров.

δ13Соотношения изотопов углерода

Значения δ 13 C холестана отражают изотопный состав углерода животных, которые создали исходные молекулы холестерина. Обычно считается, что изотопный состав углерода животных является функцией их рациона; [17] поэтому изотопный состав углерода холестана также будет отражать это исходное значение рациона. Значения δ 13 C можно измерить с помощью газового хроматографа, соединенного с IRMS.

В более общем плане стераны можно использовать в качестве индикатора изменений в окружающей среде. Исследование представило значения δ 13 C стеранов по сравнению с гопанами и использовало их для предложения изменений в фотической зоне в течение миоцена , поскольку изменения в значении изотопа должны быть результатом либо растворенного неорганического углерода в воде, либо биологического фракционирования изотопов . [14]

Примеры исследований

Биомаркеры раннего периода жизни

С помощью идентификации биомаркера холестана было доказано, что окаменелость дикинсонии принадлежит древнему животному.

Присутствие холестана не обязательно указывает на присутствие животных, но часто используется в сочетании с другими биомаркерами, чтобы отметить рост отдельных таксонов в палеонтологической летописи; в связи с этим исследование измерило относительное содержание холестана по сравнению с другими тритерпеноидными биомаркерами, чтобы продемонстрировать рост водорослей в неопротерозое . [7] [18]

Прослеживание фактического происхождения холестана в палеонтологической летописи является сложной задачей, поскольку большинство пород того периода времени сильно метаморфизованы, и, таким образом, потенциальные биомаркеры термически изменены. [ требуется ссылка ] Исследование связало источник холестана с конкретной эдиакарской окаменелостью ( Dickinsonia), чтобы обеспечить ограничения для таксономической классификации эдиакарской биоты как эволюционной прелюдии к жизни многоклеточных животных . [3] Холестан не является специфическим маркером для животных и обнаруживается в большинстве эукариотических линий.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Номенклатура стероидов. Архивировано 14 мая 2011 г. на Wayback Machine , IUPAC.
  2. ^ Питерс, Кеннет Э. (Кеннет Эрик), 1950- (2007). Руководство по биомаркерам . Cambridge University Press. ISBN 9780521039987. OCLC  1015511618.{{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  3. ^ abcde Бобровский, Илья; Хоуп, Джанет М.; Иванцов, Андрей; Неттерсхайм, Бенджамин Дж.; Холлманн, Кристиан; Брокс, Йохен Дж. (2018-09-20). «Древние стероиды устанавливают ископаемое эдиакарское дикинсонию как одно из самых ранних животных». Science . 361 (6408): 1246–1249. Bibcode :2018Sci...361.1246B. doi : 10.1126/science.aat7228 . hdl : 1885/230014 . ISSN  0036-8075. PMID  30237355.
  4. ^ Combaut, Georges; Saenger, Peter (апрель 1984). "Sterols of the amansieae (rhodomelaceae: Rhodophyta)". Фитохимия . 23 (4): 781–782. Bibcode : 1984PChem..23..781C. doi : 10.1016/s0031-9422(00)85025-6. ISSN  0031-9422.
  5. ^ аб Сонаване, Прашант Д.; Поллиер, Джейкоб; Панда, Саянтан; Шиманский, Енджей; Массалья, Хасан; Йона, Мейталь; Унгер, Тамар; Малицкий, Сергей; Арендт, Филипп; Пауэлс, Лоренс; Алмекиас-Зигль, Эфрат (22 декабря 2016 г.). «Путь биосинтеза растительного холестерина перекрывается с метаболизмом фитостеринов». Природные растения . 3 (1): 16205. doi :10.1038/nplants.2016.205. ISSN  2055-0278. PMID  28005066. S2CID  5518449.
  6. ^ Жизнь: наука биологии . Садава, Дэвид Э. (9-е изд.). Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Associates. 2011. ISBN 978-1429219624. OCLC  368046231.{{cite book}}: CS1 maint: другие ( ссылка )
  7. ^ Аб Брокс, Йохен Дж.; Джарретт, Эмбер Дж. М.; Сирантуан, Ева; Халлманн, Кристиан; Хосино, Ёске; Лиянаге, Тарика (август 2017 г.). «Рост водорослей в криогенных океанах и появление животных». Природа . 548 (7669): 578–581. Бибкод : 2017Natur.548..578B. дои : 10.1038/nature23457. ISSN  0028-0836. PMID  28813409. S2CID  205258987.
  8. ^ Summons, Roger E; Brassell, Simon C; Eglinton, Geoffrey; Evans, Evan; Horodyski, Robert J; Robinson, Neil; Ward, David M (ноябрь 1988 г.). «Отличительные углеводородные биомаркеры из ископаемых осадков позднепротерозойского пласта Уолкотт, группа Чуар, Гранд-Каньон, Аризона». Geochimica et Cosmochimica Acta . 52 (11): 2625–2637. Bibcode : 1988GeCoA..52.2625S. doi : 10.1016/0016-7037(88)90031-2. ISSN  0016-7037.
  9. ^ Mehta, Sweety (2013-09-17). "Биосинтез и регуляция холестерина (с анимацией) | Анимации". PharmaXChange.info . Получено 2019-06-04 .
  10. ^ Summons, Roger E.; Erwin, Douglas H. (2018-09-20). «Химические ключи к самым ранним окаменелостям животных». Science . 361 (6408): 1198–1199. Bibcode :2018Sci...361.1198S. doi :10.1126/science.aau9710. hdl : 1721.1/134716.2 . ISSN  0036-8075. PMID  30237342. S2CID  52306517.
  11. ^ Дарнет, Сильвен; Блэри, Орельен; Шевалье, Квентин; Шаллер, Хьюберт (2021). «Профили фитостеролов, геномы и ферменты — обзор». Frontiers in Plant Science . 12 : 878. doi : 10.3389/fpls.2021.665206 . ISSN  1664-462X. PMC 8172173. PMID 34093623  . 
  12. ^ Grantham, PJ; Wakefield, LL (январь 1988). «Изменения в распределении числа углерода стерана в сырой нефти, полученной из морских материнских пород, в течение геологического времени». Organic Geochemistry . 12 (1): 61–73. Bibcode : 1988OrGeo..12...61G. doi : 10.1016/0146-6380(88)90115-5. ISSN  0146-6380.
  13. ^ Манго, Фрэнк Д. (январь 1990 г.). «Происхождение легких циклоалканов в нефти». Geochimica et Cosmochimica Acta . 54 (1): 23–27. Бибкод : 1990GeCoA..54...23M. дои : 10.1016/0016-7037(90)90191-м. ISSN  0016-7037.
  14. ^ ab Schoell, M.; Schouten, S.; Damste, JSS; de Leeuw, JW; Summons, RE (1994-02-25). "Молекулярно-органические изотопные данные об изменениях климата в миоцене". Science . 263 (5150): 1122–1125. Bibcode :1994Sci...263.1122S. doi :10.1126/science.263.5150.1122. hdl : 1874/4185 . ISSN  0036-8075. PMID  17831625. S2CID  40960698.
  15. ^ ab Mermoud, F.; Wünsche, L.; Clerc, O.; Gülaçar, FO; Buchs, A. (январь 1984 г.). «Стероидные кетоны в ранних диагенетических преобразованиях Δ5-стеринов в различных типах осадков». Органическая геохимия . 6 : 25–29. doi :10.1016/0146-6380(84)90023-8. ISSN  0146-6380.
  16. ^ Тейлор, Крейг Д.; Смит, Стивен О.; Гагосян, Роберт Б. (ноябрь 1981 г.). «Использование микробного обогащения для изучения анаэробной деградации холестерина». Geochimica et Cosmochimica Acta . 45 (11): 2161–2168. Bibcode : 1981GeCoA..45.2161T. doi : 10.1016/0016-7037(81)90068-5. ISSN  0016-7037.
  17. ^ Хейс, Джон М. (2001-12-31), "3. Фракционирование изотопов углерода и водорода в биосинтетических процессах", Stable Isotope Geochemistry , De Gruyter, стр. 225–278, doi :10.1515/9781501508745-006, ISBN 9781501508745
  18. ^ Хосино, Йосуке; Пошибаева, Александра; Мередит, Уильям; Снейп, Колин; Пошибаев, Владимир; Верстиг, Джерард Дж. М.; Кузнецов, Николай; Лейдер, Арне; ван Мальдегем, Леннарт; Нойманн, Марейке; Наэр, Себастьян (2017). "Криогеновая эволюция биосинтеза стигмастероидов". Science Advances . 3 (9): e1700887. Bibcode :2017SciA....3E0887H. doi :10.1126/sciadv.1700887. PMC 5606710 . PMID  28948220. 

Внешние ссылки