stringtranslate.com

Цитозин

Цитозин ( / ˈ s t ə ˌ s n , - ˌ z n , - ˌ s ɪ n / [2] [3] ) ( символ C или Cyt ) — одно из четырёх нуклеотидных оснований , встречающихся в ДНК и РНК , наряду с аденином , гуанином и тимином ( урацил в РНК). Это производное пиримидина с гетероциклическим ароматическим кольцом и двумя присоединёнными заместителями (аминогруппа в положении 4 и кетогруппа в положении 2). Нуклеозидом цитозина является цитидин . В спаривании оснований Уотсона-Крика он образует три водородные связи с гуанином .

История

Цитозин был открыт и назван Альбрехтом Косселем и Альбертом Нойманном в 1894 году, когда он был гидролизован из тканей тимуса теленка. [4] [5] Структура была предложена в 1903 году и синтезирована (и, таким образом, подтверждена) в лаборатории в том же году.

В 1998 году цитозин был использован в ранней демонстрации квантовой обработки информации , когда исследователи Оксфордского университета реализовали алгоритм Дойча-Йожи на двухкубитном ядерно -магнитно-резонансном квантовом компьютере (ЯМРК) . [6]

В марте 2015 года ученые НАСА сообщили об образовании цитозина, а также урацила и тимина из пиримидина в лабораторных условиях, подобных космическим, что представляет интерес, поскольку пиримидин был обнаружен в метеоритах, хотя его происхождение неизвестно. [7]

Химические реакции

Цитозин и гуанин с указанным направлением водородной связи (стрелка указывает от положительного к отрицательному заряду).
Метилирование цитозина происходит по углероду номер 5.

Цитозин может быть найден как часть ДНК, как часть РНК или как часть нуклеотида . Как цитидинтрифосфат (ЦТФ), он может действовать как кофактор ферментов и может переносить фосфат для преобразования аденозиндифосфата (АДФ) в аденозинтрифосфат (АТФ).

В ДНК и РНК цитозин находится в паре с гуанином . Однако он по своей природе нестабилен и может превращаться в урацил ( спонтанное дезаминирование ). Это может привести к точечной мутации , если не будет исправлено ферментами репарации ДНК , такими как урацилгликозилаза, которая расщепляет урацил в ДНК.

Цитозин также может быть метилирован в 5-метилцитозин ферментом, называемым ДНК-метилтрансферазой, или метилирован и гидроксилирован , чтобы получить 5-гидроксиметилцитозин . Разница в скоростях дезаминирования цитозина и 5-метилцитозина (в урацил и тимин ) составляет основу бисульфитного секвенирования . [8]

Биологическая функция

При нахождении в кодоне РНК на третьем месте цитозин является синонимом урацила , поскольку они взаимозаменяемы в качестве третьего основания. При нахождении в кодоне на втором месте третье основание всегда взаимозаменяемо. Например, UCU, UCC, UCA и UCG — все это серин , независимо от третьего основания.

Активное ферментативное дезаминирование цитозина или 5-метилцитозина семейством цитозиндезаминаз APOBEC может иметь как полезные, так и вредные последствия для различных клеточных процессов, а также для эволюции организмов. [9] С другой стороны, последствия дезаминирования для 5-гидроксиметилцитозина остаются менее понятными.

Теоретические аспекты

До октября 2021 года цитозин не был обнаружен в метеоритах, что предполагает, что первые нити РНК и ДНК должны были искать в другом месте, чтобы получить этот строительный блок. Цитозин, вероятно, образовался в некоторых родительских телах метеоритов, однако не сохранился в этих телах из-за эффективной реакции дезаминирования в урацил . [10]

В октябре 2021 года было объявлено, что цитозин был обнаружен в метеоритах исследователями в рамках совместного проекта Японии и НАСА, в котором использовались новые методы обнаружения, позволяющие избежать повреждения нуклеотидов при их извлечении из метеоритов. [11]

Ссылки

  1. ^ Доусон, RMC; и др. (1959). Данные для биохимических исследований . Оксфорд: Clarendon Press.
  2. ^ "Цитозин". Dictionary.com Unabridged (Online). nd
  3. ^ "Цитозин". Словарь Merriam-Webster.com . Merriam-Webster.
  4. ^ А. Коссель и Альберт Нойман (1894) «Darstellung und Spaltungsprodukte der Nucleïnsäure (Adenylsäure)» (Получение и продукты расщепления нуклеиновых кислот (аденовая кислота)), Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft zu Berlin , 27  : 2215–2222. Название «цитозин» придумано на странице 2219: «… ein Produkt von Basischen Eigenschaften, für welches wir den Namen «Cytosin» vorschlagen». (…продукт с основными свойствами, для которого мы предлагаем название «цитозин».)
  5. ^ Коссель, А.; Штойдель, ГЦ (1903). «Weitere Untersuchungen über das Cytosin». Физиол. Хим . 38 (1–2): 49–59. дои : 10.1515/bchm2.1903.38.1-2.49.
  6. ^ Джонс, JA; М. Моска (1998-08-01). «Реализация квантового алгоритма на ядерно-магнитно-резонансном квантовом компьютере». J. Chem. Phys . 109 (5): 1648–1653. arXiv : quant-ph/9801027 . Bibcode : 1998JChPh.109.1648J. doi : 10.1063/1.476739. S2CID  19348964. Архивировано из оригинала 2008-06-12 . Получено 2007-10-18 .
  7. ^ Марлер, Рут (3 марта 2015 г.). «NASA Ames воспроизводит строительные блоки жизни в лаборатории». NASA . Архивировано из оригинала 5 марта 2015 г. Получено 5 марта 2015 г.
  8. ^ Hayatsu, Hikoya (2008). «Открытие бисульфит-опосредованного превращения цитозина в урацил, ключевой реакции для анализа метилирования ДНК — личный отчет». Труды Японской академии. Серия B, Физические и биологические науки . 84 (8): 321–330. Bibcode : 2008PJAB...84..321H. doi : 10.2183/pjab.84.321. ISSN  0386-2208. PMC 3722019. PMID 18941305  . 
  9. ^ Чахван Р.; Вонтакал СН; Роа С. (2010). «Перекрестные помехи между генетической и эпигенетической информацией через дезаминирование цитозина». Тенденции в генетике . 26 (10): 443–448. doi :10.1016/j.tig.2010.07.005. PMID  20800313.
  10. ^ Таскер, Элизабет. «Пришли ли семена жизни из космоса?». Scientific American Blog Network . Получено 24.11.2016 .
  11. ^ Ясухиро Оба; Ёсинори Такано; Ёсихиро Фурукава; Тошики Кога; Дэниел П. Главин; Джейсон П. Дворкин; Хироши Нараока. «Идентификация широкого разнообразия внеземных пуриновых и пиримидиновых азотистых оснований в углеродистых метеоритах». The Journal of Nature Communications . Nature.com . Получено 7 июля 2022 г. .

Внешние ссылки и цитаты