stringtranslate.com

PubMed

PubMed — это бесплатная база данных , включающая в себя в первую очередь базу данных MEDLINE ссылок и рефератов по биологическим наукам и биомедицинским темам. Национальная медицинская библиотека США (NLM) в Национальном институте здравоохранения поддерживает базу данных как часть системы поиска информации Entrez . [1]

С 1971 по 1997 год онлайн-доступ к базе данных MEDLINE осуществлялся в основном через институциональные учреждения, такие как университетские библиотеки . [2] PubMed, впервые выпущенный в январе 1996 года, открыл эру частного, бесплатного, домашнего и офисного поиска MEDLINE. [3] Система PubMed стала предлагаться бесплатно для публики с июня 1997 года. [2]

Содержание

Помимо MEDLINE, PubMed предоставляет доступ к:

Многие записи PubMed содержат ссылки на полные тексты статей, некоторые из которых находятся в свободном доступе, часто в PubMed Central [5] и локальных зеркалах, таких как Europe PubMed Central . [6]

Информация о журналах, индексированных в MEDLINE и доступных через PubMed, находится в каталоге NLM. [7]

По состоянию на 23 мая 2023 года в PubMed имеется более 35 миллионов ссылок и рефератов, датируемых с 1966 года, выборочно с 1865 года и очень выборочно с 1809 года. По состоянию на ту же дату 24,6 миллиона записей PubMed перечислены с их рефератами, а 26,8 миллиона записей имеют ссылки на полнотекстовые версии (из которых 10,9 миллиона статей доступны в виде полных текстов бесплатно). [8] За последние 10 лет (по состоянию на 31 декабря 2019 года) в среднем каждый год добавлялось около миллиона новых записей.

В 2016 году NLM изменила систему индексации, чтобы издатели могли напрямую исправлять опечатки и ошибки в статьях, проиндексированных PubMed. [9]

Сообщалось, что PubMed включает некоторые статьи, опубликованные в хищных журналах. Политики MEDLINE и PubMed по выбору журналов для включения в базу данных немного различаются. Слабости в критериях и процедурах индексации журналов в PubMed Central могут позволить публикациям из хищных журналов просочиться в PubMed. [10]

Характеристики

Дизайн веб-сайта

Новый интерфейс PubMed был запущен в октябре 2009 года и поощрял использование таких быстрых поисковых формулировок, как у Google; их также называют поиском «телеграмм». [11] По умолчанию результаты сортируются по «Самым последним», но это можно изменить на «Лучшее совпадение», «Дата публикации», «Первый автор», «Последний автор», «Журнал» или «Название». [12]

Дизайн и домен веб-сайта PubMed были обновлены в январе 2020 года и стали использоваться по умолчанию 15 мая 2020 года с обновленными и новыми функциями. [13] Была критическая реакция со стороны многих исследователей, которые часто используют сайт. [14]

PubMed для карманных компьютеров/мобильных телефонов

Доступ к PubMed/MEDLINE можно получить с помощью портативных устройств, например, с помощью опции «PICO» (для специализированных клинических вопросов), созданной NLM. [15] Также доступна опция «PubMed Mobile», обеспечивающая доступ к мобильной, упрощенной версии PubMed. [16]

Поиск

Простой поиск в PubMed можно выполнить, введя ключевые аспекты темы в окно поиска PubMed.

PubMed переводит эту первоначальную формулировку поиска и автоматически добавляет названия полей, соответствующие термины MeSH (Медицинские предметные рубрики), синонимы, логические операторы и «вкладывает» полученные термины соответствующим образом, значительно улучшая формулировку поиска, в частности, путем регулярного объединения (с использованием оператора OR) текстовых слов и терминов MeSH. [ необходима ссылка ]

Примеры, приведенные в руководстве PubMed [17], демонстрируют, как работает этот автоматический процесс:

Причины снохождения переводятся как («этиология»[Подзаголовок] ИЛИ «этиология»[Все поля] ИЛИ «причины»[Все поля] ИЛИ «причинность»[Термины MeSH] ИЛИ «причинность»[Все поля]) И («сомнамбулизм»[Термины MeSH] ИЛИ «сомнамбулизм»[Все поля] ИЛИ («сон»[Все поля] И «ходьба»[Все поля]) ИЛИ «хождение во сне»[Все поля])

Так же,

soft Attack Aspirin Prevention переводится как («инфаркт миокарда»[Термины MeSH] ИЛИ («миокардиальный»[Все поля] И «инфаркт»[Все поля]) ИЛИ «инфаркт миокарда»[Все поля] ИЛИ («сердце»[Все поля] И «атака»[Все поля]) ИЛИ «сердечный приступ»[Все поля]) И («аспирин»[Термины MeSH] ИЛИ «аспирин»[Все поля]) И («профилактика и контроль»[Подзаголовок] ИЛИ («профилактика»[Все поля] И «контроль»[Все поля]) ИЛИ «профилактика и контроль»[Все поля] ИЛИ «профилактика»[Все поля])

Для оптимального поиска в PubMed необходимо понимать его основной компонент, MEDLINE, и особенно контролируемый словарь MeSH (Medical Subject Headings), используемый для индексации статей MEDLINE. Они также могут потребовать сложных стратегий поиска, использования названий полей (тегов), правильного использования ограничений и других функций; библиотекари-справочники и специалисты по поиску предлагают услуги поиска. [18] [19]

Поиск в окне поиска PubMed рекомендуется только для поиска однозначных тем или новых вмешательств, для которых еще не создан заголовок MeSH, а также для поиска коммерческих марок лекарств и имен собственных. Он также полезен, когда нет подходящего заголовка или дескриптор представляет собой частичный аспект. Поиск с использованием тезауруса MeSH более точен и даст меньше нерелевантных результатов. Кроме того, он избавляет от недостатка поиска свободного текста, при котором необходимо учитывать орфографические, единственное/множественное число или сокращения. С другой стороны, статьи, недавно включенные в базу данных, которым еще не были назначены дескрипторы, не будут найдены. Поэтому, чтобы гарантировать исчерпывающий поиск, необходимо использовать комбинацию контролируемых языковых заголовков и свободных текстовых терминов. [20]

Параметры статьи журнала

При индексации журнальной статьи извлекаются многочисленные параметры статьи и сохраняются в виде структурированной информации. К таким параметрам относятся: Тип статьи (термины MeSH, например, «Клиническое исследование»), Вторичные идентификаторы (термины MeSH), Язык, Страна журнала или история публикации (дата электронной публикации, дата публикации печатного журнала).

Тип публикации: Клинические запросы/систематические обзоры

Параметр типа публикации позволяет осуществлять поиск по типу публикации , включая отчеты о различных видах клинических исследований. [21]

Вторичный идентификатор

С июля 2005 года процесс индексации статей MEDLINE извлекает идентификаторы из аннотации статьи и помещает их в поле, называемое Вторичный идентификатор (SI). Поле вторичного идентификатора предназначено для хранения номеров доступа к различным базам данных молекулярных последовательностей, экспрессии генов или химических соединений и идентификаторов клинических испытаний. Для клинических испытаний PubMed извлекает идентификаторы испытаний из двух крупнейших реестров испытаний: ClinicalTrials.gov (идентификатор NCT) и Международный стандартный регистр рандомизированных контролируемых испытаний (идентификатор IRCTN). [22]

Смотрите также

Ссылка, которая считается особенно релевантной, может быть отмечена, и могут быть идентифицированы «связанные статьи». Если релевантно, можно выбрать несколько исследований и сгенерировать связанные статьи для всех них (в PubMed или любой другой базе данных NCBI Entrez) с помощью опции «Найти связанные данные». Затем связанные статьи перечисляются в порядке «связанности». Чтобы создать эти списки связанных статей, PubMed сравнивает слова из заголовка и аннотации каждой цитаты, а также назначенные заголовки MeSH, используя мощный алгоритм взвешивания слов. [23] Функция «связанные статьи» была признана настолько точной, что авторы статьи предложили использовать ее вместо полного поиска. [24]

Сопоставление с MeSH

PubMed автоматически ссылается на термины и подзаголовки MeSH. Примерами могут служить: «плохое дыхание» ссылается на (и включает в поиск) «галитоз», «сердечный приступ» на «инфаркт миокарда», «рак груди» на «новообразования груди». Где это уместно, эти термины MeSH автоматически «расширяются», то есть включают более конкретные термины. Такие термины, как «уход» автоматически связываются с «Уход [MeSH]» или «Уход [Подзаголовок]». Эта функция называется «Автоматическое сопоставление терминов» и по умолчанию применяется при свободном текстовом поиске, но не при точном поиске фраз (т. е. при заключении поискового запроса в двойные кавычки). [25] Эта функция делает поиск PubMed более чувствительным и избегает ложноотрицательных (пропущенных) результатов, компенсируя разнообразие медицинской терминологии. [25]

PubMed не применяет автоматическое сопоставление термина в следующих случаях: при написании фразы в кавычках (например, «почечный аллотрансплантат»), при усечении на звездочке (например, почечный аллотрансплантат*) и при поиске с метками полей (например, Рак [ti]). [20]

Мой NCBI

Дополнительная функция PubMed «Мой NCBI» (с бесплатной регистрацией) предоставляет инструменты для

и широкий спектр других опций. [26] Доступ к разделу "My NCBI" возможен с любого компьютера с доступом в Интернет. Более ранняя версия "My NCBI" называлась "PubMed Cubby". [27]

LinkOut

LinkOut — это средство NLM для связывания и предоставления доступа к полным текстам местных журнальных фондов. [28] Около 3200 сайтов (в основном академические учреждения) участвуют в этом средстве NLM (по состоянию на март 2010 г. ), от Университета Ольборга в Дании до ZymoGenetics в Сиэтле. [29] Пользователи этих учреждений видят логотип своего учреждения в результатах поиска PubMed (если журнал хранится в этом учреждении) и могут получить доступ к полному тексту. Link out объединяется с Outside Tool с момента крупного обновления платформы, которое состоится летом 2019 г. [30]

PubMed Commons

В 2016 году PubMed позволяет авторам статей комментировать статьи, индексируемые PubMed. Эта функция изначально тестировалась в пилотном режиме (с 2013 года) и стала постоянной в 2016 году. [31] В феврале 2018 года PubMed Commons был закрыт из-за того, что «использование оставалось минимальным». [32] [33]

спроситеMEDLINE

askMEDLINE, инструмент для создания запросов на естественном языке в свободном тексте для MEDLINE/PubMed, разработанный NLM, также подходит для портативных устройств. [34]

Идентификатор PubMed

PMID (идентификатор PubMed или уникальный идентификатор PubMed) [35] — это уникальное целочисленное значение , начинающееся с , назначаемое каждой записи PubMed. PMID — это не то же самое, что PMCID ( идентификатор PubMed Central), который является идентификатором для всех работ, опубликованных в свободном доступе PubMed Central . [36]1

Присвоение PMID или PMCID публикации ничего не говорит читателю о типе или качестве контента. PMID присваиваются письмам редактору , редакционным мнениям, колонкам и любым другим материалам, которые редактор решает включить в журнал, а также рецензируемым статьям. Наличие идентификационного номера также не является доказательством того, что статьи не были отозваны из -за мошенничества, некомпетентности или неправомерного поведения. Объявлению о любых исправлениях в исходных статьях может быть присвоен PMID.

Каждое число, введенное в окно поиска PubMed, по умолчанию рассматривается как PMID. Таким образом, любая ссылка в PubMed может быть найдена с помощью PMID.

Альтернативные интерфейсы

MEDLINE — одна из баз данных, доступ к которой осуществляется через PubMed. Несколько компаний предоставляют доступ к MEDLINE через свои платформы.

Национальная медицинская библиотека сдает в аренду информацию MEDLINE ряду частных поставщиков, таких как Embase , Ovid , Dialog , EBSCO , Knowledge Finder и многим другим коммерческим, некоммерческим и академическим поставщикам. [37] По состоянию на октябрь 2008 года было выдано более 500 лицензий, более 200 из них — поставщикам за пределами США. Поскольку лицензии на использование данных MEDLINE предоставляются бесплатно, NLM фактически предоставляет бесплатную испытательную площадку для широкого спектра [38] альтернативных интерфейсов и сторонних дополнений к PubMed, одной из очень немногих крупных, профессионально курируемых баз данных, которая предлагает такую ​​возможность.

Лу определяет выборку из 28 текущих и бесплатных веб-версий PubMed, не требующих установки или регистрации, которые сгруппированы в четыре категории: [38]

  1. Ранжирование результатов поиска, например: eTBLAST ; MedlineRanker; [39] MiSearch; [40]
  2. Кластеризация результатов по темам, авторам, журналам и т. д., например: Anne O'Tate ; [41] ClusterMed; [42]
  3. Улучшение семантики и визуализации, например: EBIMed; [43] MedEvi. [44]
  4. Улучшенный интерфейс поиска и возможности поиска, например, askMEDLINE [45] [46] BabelMeSH; [47] и PubCrawler. [48]

Поскольку большинство из этих и других альтернатив в основном полагаются на данные PubMed/MEDLINE, взятые в аренду по лицензии у NLM/PubMed, был предложен термин «производные PubMed». [38] Без необходимости хранить около 90 ГБ исходных наборов данных PubMed, любой может писать приложения PubMed, используя программный интерфейс eutils-application, как описано в «The E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More» Эрика Сэйерса, доктора философии. [49] Различные генераторы форматов цитирования, принимающие номера PMID в качестве входных данных, являются примерами веб-приложений, использующих программный интерфейс eutils-application. Примеры веб-страниц включают Citation Generator – Mick Schroeder, Pubmed Citation Generator – Ultrasound of the Week, PMID2cite и Cite this for me.

Интеллектуальный анализ данных PubMed

Альтернативные методы добычи данных в PubMed используют среды программирования, такие как Matlab , Python или R. В этих случаях запросы PubMed пишутся как строки кода и передаются в PubMed, а затем ответ обрабатывается непосредственно в среде программирования. Код может быть автоматизирован для систематического запроса с различными ключевыми словами, такими как болезнь, год, органы и т. д.

В дополнение к своей традиционной роли биомедицинской базы данных, PubMed стал общим ресурсом для обучения моделей биомедицинского языка . [50] Недавние достижения в этой области включают разработку таких моделей, как PubMedGPT, модель с 2,7 млрд параметров, обученная на данных PubMed Стэнфордским CRFM, и BiomedCLIP-PubMedBERT от Microsoft, которая использует пары рисунок-подпись из PubMed Central для обработки зрения-языка. Эти модели демонстрируют значительный потенциал данных PubMed в расширении возможностей ИИ в медицинских исследованиях и приложениях здравоохранения. Такие достижения подчеркивают растущее пересечение между крупномасштабным интеллектуальным анализом данных и разработкой ИИ в области биомедицины.

Данные, доступные через PubMed, можно отразить локально с помощью неофициального инструмента, такого как MEDOC. [51]

Миллионы записей PubMed дополняют различные открытые наборы данных об открытом доступе , такие как Unpaywall . Инструменты анализа данных, такие как Unpaywall Journals, используются библиотеками для помощи в отмене крупных сделок : библиотеки могут избежать подписки на материалы, уже обслуживаемые мгновенным открытым доступом через открытые архивы, такие как PubMed Central. [52]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ "PubMed". Архивировано из оригинала 13 декабря 2020 г. Получено 22 февраля 2019 г.
  2. ^ ab Lindberg DA (2000). "Интернет-доступ к Национальной медицинской библиотеке" (PDF) . Эффективная клиническая практика . 3 (5): 256–60. PMID  11185333. Архивировано из оригинала (PDF) 2 ноября 2013 г.
  3. ^ "PubMed празднует свое 10-летие". Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США . 5 октября 2006 г. Архивировано из оригинала 23 апреля 2018 г. Получено 22 марта 2011 г.
  4. ^ "PubMed: MEDLINE Retrieval on the World Wide Web". Информационный листок . Национальная медицинская библиотека США. 7 июня 2002 г. Архивировано из оригинала 1 сентября 2018 г. Получено 22 марта 2011 г.
  5. ^ Roberts RJ (январь 2001 г.). «PubMed Central: GenBank опубликованной литературы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (2): 381–2. Bibcode : 2001PNAS...98..381R. doi : 10.1073/pnas.98.2.381 . PMC 33354. PMID  11209037 . 
  6. ^ McEntyre JR, Ananiadou S, Andrews S, Black WJ, Boulderstone R, Buttery P, et al. (Январь 2011 г.). "UKPMC: ресурс полнотекстовых статей для наук о жизни". Nucleic Acids Research . 39 (выпуск базы данных): D58-65. doi :10.1093/nar/gkq1063. PMC 3013671. PMID  21062818 . 
  7. ^ "Каталог NLM: Журналы, на которые есть ссылки в базах данных NCBI". NCBI. 2011. Архивировано из оригинала 13 октября 2023 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  8. ^ "PubMed". PubMed . Архивировано из оригинала 6 января 2022 года . Получено 5 января 2023 года .Поисковый запрос «1800:2100[dp]» извлекает все результаты, дата публикации которых находится в диапазоне от 1800 до 2100 года включительно.
  9. ^ "MEDLINE/PubMed Production Improvements Underway". Технический бюллетень NLM (411): e1. Июль–август 2016 г. Архивировано из оригинала 29 марта 2023 г. Получено 29 июля 2016 г.
  10. ^ Manca A, Moher D, Cugusi L, Dvir Z, Deriu F (сентябрь 2018 г.). «Как хищнические журналы просачиваются в PubMed». CMAJ . 190 (35): E1042–E1045. doi :10.1503/cmaj.180154. PMC 6148641 . PMID  30181150. 
  11. ^ Кларк Дж., Венц Р. (сентябрь 2000 г.). «Прагматичный подход эффективен в здравоохранении, основанном на доказательствах». BMJ . 321 (7260): 566–7. doi :10.1136/bmj.321.7260.566/a. PMC 1118450 . PMID  10968827. 
  12. ^ Fatehi F, Gray LC, Wootton R (январь 2014 г.). «Как улучшить поиск в PubMed/MEDLINE: 2. настройки отображения, сложные поисковые запросы и поиск по темам». Журнал телемедицины и телеухода . 20 (1): 44–55. doi : 10.1177/1357633X13517067. PMID  24352897. S2CID  43725062.
  13. ^ Trawick B (21 января 2020 г.). «Новый и улучшенный PubMed®». NLM Musings From the Mezzanine . Архивировано из оригинала 7 октября 2023 г. Получено 23 мая 2020 г.
  14. ^ Прайс М (22 мая 2020 г.). «Они переделали PubMed, любимый сайт. Он не очень хорошо себя проявил». Наука . Архивировано из оригинала 21 мая 2022 г. Получено 30 июня 2022 г.
  15. ^ "PubMed via handhelds (PICO)". Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 2004. Архивировано из оригинала 30 мая 2023 года . Получено 7 апреля 2016 года .
  16. ^ "PubMed Mobile Beta". Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 2011. Архивировано из оригинала 11 апреля 2023 года . Получено 7 апреля 2016 года .
  17. ^ "Simple Subject Search with Quiz". NCBI. 2010. Архивировано из оригинала 11 мая 2020 года . Получено 7 апреля 2016 года .
  18. ^ Jadad AR, McQuay HJ (июль 1993 г.). «Поиск литературы. Будьте систематичны в своем поиске». BMJ . 307 (6895): 66. doi :10.1136/bmj.307.6895.66-a. PMC 1678459 . PMID  8343701. 
  19. ^ Allison JJ, Kiefe CI, Weissman NW, Carter J, Centor RM (весна 1999 г.). «Искусство и наука поиска в MEDLINE для ответа на клинические вопросы. Поиск нужного количества статей». Международный журнал оценки технологий в здравоохранении . 15 (2): 281–96. doi :10.1017/S0266462399015214. PMID  10507188. S2CID  11023273. Архивировано из оригинала 19 февраля 2022 г. Получено 13 декабря 2019 г.
  20. ^ ab Кампос-Асенсио C (2018). «Как разработать библиографическую стратегию». Enfermería Intensiva (на испанском языке). 29 (4): 182–186. дои : 10.1016/j.enfi.2018.09.001. PMID  30291015. S2CID  188132546.
  21. ^ Объяснение терминов фильтра клинических запросов. NCBI. 2010. Архивировано из оригинала 29 ноября 2022 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  22. ^ Huser V, Cimino JJ (июнь 2013 г.). «Оценка соблюдения политики Международного комитета редакторов медицинских журналов по обязательной своевременной регистрации клинических испытаний». Журнал Американской ассоциации медицинской информатики . 20 (e1): e169-74. doi :10.1136/amiajnl-2012-001501. PMC 3715364. PMID  23396544 . 
  23. ^ "Computation of Related Articles explained". NCBI. Архивировано из оригинала 18 декабря 2008 года . Получено 8 сентября 2017 года .
  24. ^ Chang AA, Heskett KM, Davidson TM (февраль 2006 г.). «Поиск литературы с использованием медицинских предметных заголовков по сравнению с текстовыми словами с помощью PubMed» (PDF) . The Laryngoscope . 116 (2): 336–40. doi : 10.1097/01.mlg.0000195371.72887.a2 . PMID  16467730. S2CID  42510351 . Получено 11 сентября 2018 г. .
  25. ^ ab Fatehi F, Gray LC, Wootton R (март 2014 г.). «Как улучшить поиск в PubMed/MEDLINE: 3. расширенный поиск, MeSH и My NCBI». Журнал телемедицины и телеухода . 20 (2): 102–12. doi :10.1177/1357633X13519036. PMID  24614997. S2CID  9948223.
  26. ^ "My NCBI Help". My NCBI explained. NCBI. 13 декабря 2010 г. Архивировано из оригинала 26 июля 2023 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  27. ^ "PubMed Cubby". Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 2000. Архивировано из оригинала 20 февраля 2023 года . Получено 7 апреля 2016 года .
  28. ^ "Обзор LinkOut". NCBI. 2010. Архивировано из оригинала 10 сентября 2023 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  29. ^ "LinkOut Participants 2011". NCBI. 2011. Архивировано из оригинала 14 октября 2017 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  30. ^ "An Updated PubMed is on its Way". Архивировано из оригинала 16 мая 2023 года . Получено 1 апреля 2019 года .
  31. ^ PubMed Commons Team (17 декабря 2015 г.). «Комментарии к PubMed: успешный пилотный проект». Архивировано из оригинала 25 октября 2017 г. Получено 29 июля 2016 г.
  32. ^ "PubMed Commons будет прекращен". NCBI Insights . 1 февраля 2018 г. Архивировано из оригинала 28 августа 2023 г. Получено 2 февраля 2018 г.
  33. ^ "PubMed закрывает функцию комментариев, PubMed Commons". Retraction Watch . 2 февраля 2018 г. Архивировано из оригинала 28 июня 2022 г. Получено 2 февраля 2018 г.
  34. ^ "askMedline". NCBI. 2005. Архивировано из оригинала 17 июля 2013 года . Получено 3 апреля 2011 года .
  35. ^ "Описания и теги полей поиска". Национальный центр биотехнологической информации. Архивировано из оригинала 11 июля 2013 г. Получено 15 июля 2013 г.
  36. ^ Кинер М. «PMID против PMCID: в чем разница?» (PDF) . Чикагский университет. Архивировано из оригинала (PDF) 6 июля 2014 г. . Получено 19 января 2014 г. .
  37. ^ "Аренда цитирований журналов из PubMed/Medline". NLM. 2011. Архивировано из оригинала 9 июля 2023 г. Получено 7 апреля 2016 г.
  38. ^ abc Lu Z (2011). "PubMed и дальше: обзор веб-инструментов для поиска биомедицинской литературы". База данных . 2011 : baq036. doi :10.1093/database/baq036. PMC 3025693. PMID  21245076 . 
  39. ^ Fontaine JF, Barbosa-Silva A, Schaefer M, Huska MR, Muro EM, Andrade-Navarro MA (июль 2009 г.). "MedlineRanker: гибкий рейтинг биомедицинской литературы". Nucleic Acids Research . 37 (выпуск веб-сервера): W141-6. doi :10.1093/nar/gkp353. PMC 2703945. PMID  19429696 . 
  40. ^ States DJ, Ade AS, Wright ZC, Bookvich AV, Athey BD (апрель 2009 г.). «MiSearch — адаптивный инструмент поиска pubMed». Биоинформатика . 25 (7): 974–6. doi :10.1093/bioinformatics/btn033. PMC 2660869. PMID  18326507 . 
  41. ^ Smalheiser NR, Zhou W, Torvik VI (февраль 2008 г.). «Anne O'Tate: инструмент для поддержки управляемого пользователем резюмирования, детализации и просмотра результатов поиска PubMed». Journal of Biomedical Discovery and Collaboration . 3 : 2. doi : 10.1186/1747-5333-3-2 . PMC 2276193. PMID  18279519 . 
  42. ^ "ClusterMed". Vivisimo Clustering Engine. 2011. Архивировано из оригинала 11 августа 2011 года . Получено 3 июля 2011 года .
  43. ^ Rebholz-Schuhmann D, Kirsch H, Arregui M, Gaudan S, Riethoven M, Stoehr P (январь 2007 г.). "EBIMed — обработка текста для сбора фактов о белках из Medline". Биоинформатика . 23 (2): e237-44. doi : 10.1093/bioinformatics/btl302 . PMID  17237098.
  44. ^ Ким Дж. Дж., Пезик П., Ребхольц-Шухманн Д. (июнь 2008 г.). «MedEvi: извлечение текстовых доказательств связей между биомедицинскими концепциями из Medline». Биоинформатика . 24 (11): 1410–2. doi :10.1093/bioinformatics/btn117. PMC 2387223. PMID  18400773 . 
  45. ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M, Schardt CM, Keitz SA (2006). "askMEDLINE: отчет о годовом опыте". AMIA ... Ежегодные труды симпозиума. Симпозиум AMIA . 2006 : 923. PMC 1839379. PMID  17238542 . 
  46. ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M (2005). "MeSH Speller + askMEDLINE: автоматически заполняет термины MeSH, а затем ищет в MEDLINE/PubMed с помощью свободных текстовых запросов на естественном языке". AMIA ... Ежегодные труды симпозиума. Симпозиум AMIA . 2005 : 957. PMC 1513542. PMID  16779244 . 
  47. ^ Fontelo P, Liu F, Leon S, Anne A, Ackerman M (2007). «PICO Linguist и BabelMeSH: разработка и частичная оценка основанных на фактических данных многоязыковых поисковых инструментов для MEDLINE/PubMed». Исследования в области медицинских технологий и информатики . 129 (Pt 1): 817–21. PMID  17911830. Архивировано из оригинала 18 октября 2023 г. Получено 31 мая 2014 г.
  48. ^ Hokamp K, Wolfe KH (июль 2004 г.). «PubCrawler: как поддерживать связь с PubMed и GenBank». Nucleic Acids Research . 32 (выпуск веб-сервера): W16-9. doi : 10.1093/nar/gkh453. PMC 441591. PMID  15215341. 
  49. ^ Эрик Сэйерс, доктор философии (24 октября 2018 г.). E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More. NCBI. Архивировано из оригинала 23 июня 2023 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  50. ^ Singhal K, Azizi S, Tu T, Mahdavi SS, Wei J, Chung HW и др. (3 августа 2023 г.). «Большие языковые модели кодируют клинические знания». Nature . 620 (7972): 172–180. arXiv : 2212.13138 . Bibcode :2023Natur.620..172S. doi :10.1038/s41586-023-06291-2. PMC 10396962 . PMID  37438534. 
  51. ^ MEDOC на GitHub
  52. ^ Дениз Вулф (7 апреля 2020 г.). «SUNY Negotiates New, Modified Agreement with Elsevier – Libraries News Center University at Buffalo Libraries». library.buffalo.edu . University at Buffalo . Архивировано из оригинала 6 декабря 2020 г. . Получено 18 апреля 2020 г. .

Внешние ссылки

Wikidata имеет свойство:
  • Идентификатор публикации PubMed (P698) (см. использование )

[[Категория:Национальная медицинская библиотека США|PubMed]