stringtranslate.com

Ацинетобактер

Acinetobacter род грамотрицательных бактерий, принадлежащий к более широкому классу гаммапротеобактерий . Виды Acinetobacter оксидазо-отрицательны , демонстрируют подергивающуюся подвижность [ 7] и встречаются парами под увеличением.

Они являются важными почвенными организмами , где способствуют минерализации , например, ароматических соединений . Виды Acinetobacter являются ключевым источником инфекции у ослабленных пациентов в больнице, в частности вид Acinetobacter baumannii .

Описание

Виды рода Acinetobacter являются строго аэробными , неферментативными , грамотрицательными бациллами . На неселективном агаре они демонстрируют преимущественно коккобациллярную морфологию. В жидких средах, особенно в ранний период роста, преобладают палочки. [ нужна цитата ]

Морфология видов Acinetobacter может весьма варьировать в клинических образцах человека, окрашенных по Граму, и не может использоваться для дифференциации Acinetobacter от других распространенных причин инфекции. [ нужна цитата ]

Большинство штаммов Acinetobacter , за исключением некоторых штаммов A. lwoffii , хорошо растут на агаре МакКонки (без соли). Хотя официально они классифицируются как неферментирующие лактозу, при выращивании на агаре МакКонки они часто ферментируют лактозу частично. Они оксидазоотрицательные , каталазоположительные, индолотрицательные, неподвижные и обычно нитратотрицательные . [ нужна цитата ]

Известно, что бактерии рода Acinetobacter образуют внутриклеточные включения полигидроксиалканоатов при определенных условиях окружающей среды (например, при недостатке таких элементов, как фосфор, азот или кислород, в сочетании с избыточным поступлением источников углерода). [ нужна цитата ]

Этимология

Ацинетобактер — сложное слово научного греческого [α + κίνητο + βακτηρ(ία)], означающее неподвижный стержень. Первый элемент акинето- появляется как несколько причудливый перевод греческой морфемы ακίνητο-, которая обычно транслитерируется в английском языке как акинето- , но на самом деле происходит из французского cinetique и была заимствована непосредственно в английском языке. [ нужна цитация ] Тем не менее, французское слово также происходит от греческого приватива α + κίνησις (движение), подтверждающего то же происхождение, но по другому пути.

Таксономия

Род Acinetobacter включает 38 достоверно названных видов. [8]

Идентификация

Идентификация видов Acinetobacter осложнена отсутствием стандартных методов идентификации. Первоначально идентификация основывалась на фенотипических характеристиках, таких как температура роста, морфология колоний , среда для выращивания, источники углерода, гидролиз желатина, ферментация глюкозы и другие. Этот метод позволил идентифицировать A.calcoaceticus–A. baumannii путем образования гладких, округлых, слизистой колоний при 37 °С. Близкородственные виды не могли быть дифференцированы, а отдельные виды, такие как A. baumannii и геномный вид 3 Acinetobacter , не могли быть идентифицированы фенотипически. [ нужна цитата ]

Поскольку рутинная идентификация в клинической микробиологической лаборатории пока невозможна, изоляты Acinetobacter разделены и сгруппированы в три основных комплекса :

Различные виды бактерий этого рода можно идентифицировать с помощью флуоресценции-денитрификации лактозы, чтобы определить количество кислоты, вырабатываемой в результате метаболизма глюкозы . Другим надежным идентификационным тестом на уровне рода является анализ трансформации хромосомной ДНК. В этом анализе природный компетентный триптофан- ауксотрофный мутант Acinetobacter baylyi (BD4 trpE27) трансформируется тотальной ДНК предполагаемого изолята Acinetobacter , и трансформационную смесь высеивают на агар с инфузией мозга и сердца. Затем ростки собирают после инкубации в течение 24 часов при 30°C, высевают на минимальный агар Acinetobacter (AMA) и инкубируют при 30°C в течение 108 часов. Рост на АМА указывает на положительный анализ трансформации и подтверждает принадлежность изолята к роду Acinetobacter . E. coli HB101 и A.calcoaceticus MTCC1921T можно использовать в качестве отрицательного и положительного контроля соответственно. [9]

Некоторые из молекулярных методов, используемых для идентификации видов, включают повторяющуюся ПЦР на основе экстрагенных палиндромных последовательностей, риботипирование, гель-электрофорез в импульсном поле (PFGE), случайную амплифицированную полиморфную ДНК, полиморфизм длин амплифицированных фрагментов (AFLP), рестрикцию и анализ последовательностей тРНК и 16S- Спейсеры генов 23S рРНК и анализ рестрикции амплифицированной рибосомальной ДНК 16S (ARDRA). PFGE, AFLP и ARDRA являются проверенными распространенными методами, используемыми сегодня из-за их различительной способности. Однако самые последние методы включают мультилокусное типирование последовательностей, мультилокусную ПЦР и масс-спектрометрию с ионизацией электрораспылением, которые основаны на амплификации высококонсервативных генов «домашнего хозяйства» и могут использоваться для изучения генетического родства между различными изолятами. [10]

Естественная среда

Виды Acinetobacter широко распространены в природе и обычно встречаются в почве и воде. [11] Их способность выживать на влажных и сухих поверхностях, а также выдерживать воздействие различных распространенных дезинфицирующих средств позволяет некоторым видам Acinetobacter выживать в больничных условиях. [11] Кроме того, виды Acinetobacter могут расти в широком диапазоне температур, что позволяет им выживать в самых разных средах. [11]

Клиническое значение

Acinetobacter часто выделяется при внутрибольничных инфекциях и особенно распространен в отделениях интенсивной терапии , где распространены как спорадические случаи, так и эпидемические и эндемические случаи. A. baumannii является частой причиной внутрибольничной пневмонии , особенно вентилятор-ассоциированной пневмонии с поздним началом . Он может вызывать различные другие инфекции, включая инфекции кожи и ран, бактериемию и менингит , но за последний ответственен преимущественно A. lwoffi . [ нужна цитата ]

Из Acinetobacter A. baumannii является основной причиной заболеваний человека , поскольку он участвует в ряде внутрибольничных инфекций, таких как бактериемия, инфекции мочевыводящих путей (ИМП), вторичный менингит, инфекционный эндокардит, а также раневые и ожоговые инфекции. [12] В частности, A. baumannii часто выделяют как причину внутрибольничной пневмонии среди пациентов, поступивших в отделения интенсивной терапии . Факторы риска включают длительную интубацию и аспирацию из трахеи или легких. В большинстве случаев вентилятор-ассоциированной пневмонии оборудование, используемое для искусственной вентиляции легких, такое как эндотрахеальные трубки или бронхоскопы, служит источником инфекции и приводит к колонизации нижних дыхательных путей A. baumannii . В некоторых случаях бактерии могут попасть в кровоток, что приводит к бактериемии с уровнем смертности от 32% до 52%. ИМП, вызванные A. baumannii, по-видимому, связаны с постоянной катетеризацией, а также терапией антибиотиками. Сообщалось также, что A. baumannii инфицирует кожу и мягкие ткани при травматических повреждениях и послеоперационных ранах. A. baumannii обычно инфицирует ожоги и может приводить к осложнениям из-за трудностей в лечении и ликвидации. Хотя это и менее распространено, некоторые данные также связывают эту бактерию с менингитом, чаще всего после инвазивного хирургического вмешательства, и, в очень редких случаях, с внебольничным первичным менингитом, при котором большинство жертв были детьми. [13] Сообщения о случаях заболевания также связывают A. baumannii с эндокардитом, кератитом, перитонитом и очень редко с фатальным неонатальным сепсисом. [14]

Клиническое значение A. baumannii частично обусловлено его способностью развивать устойчивость ко многим доступным антибиотикам. Сообщения показывают, что он обладает устойчивостью к цефалоспоринам широкого спектра действия , β-лактамным антибиотикам , аминогликозидам и хинолонам . Все чаще сообщается об устойчивости к карбапенемам . [15] [16] A. baumannii может сохраняться на коже человека или сухих поверхностях в течение нескольких недель и устойчив к различным дезинфицирующим средствам, что делает его особенно легким для распространения в больничных условиях. [17] Гены устойчивости к антибиотикам часто передаются в плазмидах, а плазмиды, присутствующие в штаммах Acinetobacter , могут передаваться другим патогенным бактериям путем горизонтального переноса генов . [ нужна цитата ]

У здоровых людей наличие колоний Acinetobacter на коже коррелирует с низкой частотой возникновения аллергии ; [18] Считается, что Acinetobacter защищает от аллергии. [19]

Уход

Виды Acinetobacter врожденно устойчивы ко многим классам антибиотиков, включая пенициллин , хлорамфеникол и часто аминогликозиды . Сообщалось о развитии устойчивости к фторхинолонам во время терапии, что также приводило к повышению устойчивости к другим классам лекарств, опосредованному активным оттоком лекарств . Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) сообщили о резком увеличении устойчивости к антибиотикам у штаммов Acinetobacter , а карбапенемы признаны золотым стандартом и средством последней инстанции. [20] Виды Acinetobacter необычны тем, что они чувствительны к сульбактаму , который обычно используется для ингибирования бактериальной бета-лактамазы, но это пример антибактериальных свойств самого сульбактама. [21] Недавно сульбактам-дурлобактам, новая антибактериальная комбинация, проходящая фазу 3 испытаний, продемонстрировала хорошую активность in vitro также против устойчивых к карбапенемам изолятов A. baumannii (чувствительность 92%). [22]

В ноябре 2004 года Центр по контролю и профилактике заболеваний сообщил о росте числа инфекций кровотока, вызванных A. baumannii, у пациентов в военных медицинских учреждениях, где проходили лечение военнослужащие, получившие ранения в регионе Ирака / Кувейта во время операции «Иракская свобода» и в Афганистане во время операции «Несокрушимая свобода» . [23] Большинство из них имели множественную лекарственную устойчивость. Среди одного набора изолятов из Армейского медицинского центра Уолтера Рида 13 (35%) были чувствительны только к имипенему , а два (4%) были устойчивы ко всем протестированным препаратам. Один противомикробный агент, колистин (полимиксин Е), использовался для лечения инфекций, вызванных A. baumannii с множественной лекарственной устойчивостью ; однако тестирование чувствительности к противомикробным препаратам колистина на изолятах, описанных в этом отчете, не проводилось. Поскольку A. baumannii могут выживать на сухих поверхностях до 20 дней, они представляют высокий риск распространения и заражения в больницах, потенциально подвергая пациентов с ослабленным иммунитетом и других пациентов риску заражения устойчивыми к лекарствам инфекциями, которые часто смертельны и, как правило, дорогостоящи. обращаться. Были задокументированы испытания по внедрению вакцин для предотвращения инфекций Acinetobacter. [24] [25]

Сообщения показывают, что эта бактерия восприимчива к фаготерапии . [26]

Сообщалось также, что антисмысловые олигомеры, подавляющие гены, в форме, называемой пептид-конъюгированными фосфородиамидатными морфолиноолигомерами , ингибируют рост в тестах, проведенных на животных, инфицированных устойчивым к антибиотикам A. baumannii . [27] [28]

Сульбактам/дурлобактам (Xacduro) был одобрен для медицинского применения в США в мае 2023 года. [29]

Асептическая техника

Частота внутрибольничных инфекций в британских больницах побудила Национальную службу здравоохранения провести исследование эффективности анионов для очистки воздуха, обнаружив, что повторные воздушно-капельные инфекции Acinetobacter в палате устраняются установкой отрицательного ионизатора воздуха — уровень заражения упал до нуля. [30]

Естественная трансформация

Бактериальная трансформация включает перенос ДНК от донора к бактерии-реципиенту через промежуточную жидкую среду. Бактерии-реципиенты должны сначала войти в особое физиологическое состояние, называемое способностью получать донорскую ДНК. Способность A.calcoaceticus к естественной трансформации индуцируют путем разведения стационарной культуры в свежей питательной среде. [31] Компетентность постепенно теряется при длительном экспоненциальном росте и на период после входа в стационарное состояние. Поглощенная ДНК может быть использована для восстановления повреждений ДНК или в качестве средства обмена генетической информацией путем горизонтального переноса генов. [31] Естественная трансформация A. Calcoaceticus может защитить от воздействия повреждающих ДНК условий в естественной среде этих бактерий, как, по-видимому, и в случае с другими видами бактерий, способными к трансформации. [32]

Рекомендации

  1. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab Parte, AC "Acinetobacter". ЛПСН .
  2. ^ "Acinetobacter oryzae ANC 4261 - Проект" . Онлайн-база данных геномов (GOLD) . Объединенный институт генома (JGI) . Проверено 06 мая 2021 г.
  3. ^ «Информация — Acinetobacter oryzae ANC 4261» . Геномный портал Объединенного института генома . Проверено 06 мая 2021 г.
  4. ^ «Браузер таксономии (Acinetobacter oryzae)» . Браузер таксономии NCBI . Проверено 06 мая 2021 г.
  5. ^ «Виды: Acinetobacter oryzae» . LPSN ( Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре ) . ДСМЗ ( Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen ) . Проверено 06 мая 2021 г.
  6. ^ [2] [3] [4] [5]
  7. ^ Битриан, Мариана; Гонсалес, Родриго Х.; Пэрис, Гастон; Хеллингверф, Клаас Дж.; Нудель, Клара Б. (1 сентября 2013 г.). «Зависимое от синего света ингибирование подергивающейся моторики у Acinetobacter baylyi ADP1: аддитивное участие трех белков, содержащих BLUF-домен». Микробиология . 159 (Часть 9): 1828–1841. дои : 10.1099/mic.0.069153-0. HDL : 11336/6600 . ISSN  1465-2080. PMID  23813679. S2CID  42820743.
  8. ^ Виска П., Зайферт Х., Таунер К.Дж. (декабрь 2011 г.). «Инфекция Acinetobacter - новая угроза здоровью человека». ИУБМБ Жизнь . 63 (12): 1048–54. дои : 10.1002/iub.534 . PMID  22006724. S2CID  45593914.
  9. ^ Рохбахш-Замин, Ф.; Сачдев, Д.П.; Каземи-Пур, Н.; Инженер А.; Зинжарде, СС; Дакепхалкар, ПК; Чопаде, бакалавр (2012). «Характеристика свойств, способствующих росту растений, видов Acinetobacter, выделенных из ризосферы Pennisetum glaucum». J Микробиол Биотехнология . 21 (6): 556–566. дои : 10.4014/jmb.1012.12006. ПМИД  21715961.
  10. ^ Устойчивость к антибиотикам является основным фактором риска эпидемического поведения Acinetobacter baumannii. Инфекционный контроль Хосп Эпидемиол 2001; 22:284–288.
  11. ^ abc Дугари HJ; Ндакидеми, Пенсильвания; Человеческая ИС; Бенаде С. (2011). «Экология, биология и патогенез видов Acinetobacter: обзор». Микробы и окружающая среда . 26 (2): 101–112. дои : 10.1264/jsme2.me10179 . ПМИД  21502736.
  12. ^ Дент Лемюэль, Л; Маршалл, ДР; Пратап, С; Юлетт, РБ (2010). «Множественная лекарственная устойчивость Acinetobacter baumannii: описательное исследование в городской больнице». BMC заразить дис . 10 :196. дои : 10.1186/1471-2334-10-196 . ПМК 2909240 . ПМИД  20609238. 
  13. ^ Зигман-Игра, Ю; Бар-Йосеф, С; Горя, А; Аврам, Дж (1993). «Нозокомиальный ацинетобактерный менингит, вторичный по отношению к инвазивным процедурам: отчет о 25 случаях и обзор». Клин Инфекционный Дис . 17 (5): 843–849. doi : 10.1093/clinids/17.5.843. ПМИД  8286623.
  14. ^ Фалагас, Мэн; Карвели, Е.А.; Келесидис, я; Келесидис, Т (2007). «Внебольничные инфекции Acinetobacter». Eur J Clin Microbiol Infect Dis . 26 (12): 857–868. дои : 10.1007/s10096-007-0365-6. PMID  17701432. S2CID  25898468.
  15. ^ Ху, Кью; Ху, З; Ли, Дж; Тянь, Б; Сюй, Х; Ли, Дж (2011). «Обнаружение карбапенемаз и интегронов OXA-типа среди устойчивых к карбапенемам Acinetobactor baumannii в клинической больнице в Китае». J Базовая микробиол . 51 (5): 467–472. дои : 10.1002/jobm.201000402 . PMID  21656808. S2CID  10955468.
  16. ^ Фурнье, Пьер Эдуард; Рише, Х (2006). «Эпидемиология и борьба с Acinetobacter baumannii в медицинских учреждениях». Клин Инфекционный Дис . 42 (5): 692–699. дои : 10.1086/500202 . ПМИД  16447117.
  17. ^ Пелег А.Ю.; Зейферт Х; Патерсон Д.Л. (июль 2008 г.). «Acinetobacter baumannii: появление успешного патогена». Обзоры клинической микробиологии . 21 (3): 538–582. дои : 10.1128/CMR.00058-07. ПМК 2493088 . ПМИД  18625687. 
  18. ^ Хански, И.; Фон Герцен, Л.; Фирквист, Н.; Коскинен, К.; Торппа, К.; Лаатикайнен, Т.; Карисола, П.; Аувинен, П.; Полин, Л.; Макела, MJ; Вартиайнен, Э.; Косунен, ТУ; Алениус, Х.; Хаахтела, Т. (2012). «Биоразнообразие окружающей среды, микробиота человека и аллергия взаимосвязаны». Труды Национальной академии наук . 109 (21): 8334–8339. Бибкод : 2012PNAS..109.8334H. дои : 10.1073/pnas.1205624109 . ПМЦ 3361383 . ПМИД  22566627. 
  19. ^ Дебарри, Дж.; Ханушкевич А.; Штейн, К.; Холст, О.; Хейне, Х. (2009). «Аллергозащитные свойства Acinetobacter lwoffii F78 придают его липополисахарид». Аллергия . 65 (6): 690–697. дои : 10.1111/j.1398-9995.2009.02253.x. PMID  19909295. S2CID  28194712.
  20. ^ Рахал Дж (2006). «Новые комбинации антибиотиков против инфекций, вызываемых почти полностью устойчивыми видами Pseudomonas aeruginosa и Acinetobacter». Клин Инфекционный Дис . 43 (Приложение 2): С95–9. дои : 10.1086/504486 . ПМИД  16894522.
  21. ^ Вуд GC, Ханс С.Д., Кроче М.А., Фабиан Т.К., Баугер Б.А. (2002). «Сравнение ампициллин-сульбактама и имипенем-циластатина для лечения ацинетобактерной вентилятор-ассоциированной пневмонии». Клин Инфекционный Дис . 34 (11): 1425–30. дои : 10.1086/340055 . ПМИД  12015687.
  22. ^ Сегаторе, Бернардетта; Пиччирилли, Алессандра; Керубини, Сабрина; Принсипи, Луиджи; Аллоджия, Джованни; Меццатеста, Мария Лина; Салмери, Марио; Ди Белла, Стефано; Мильявакка, Роберта; Пьяцца, Аврора; Мерони, Элиза; Фази, Паоло; Визаджо, Даниэла; Виска, Паоло; Кортаццо, Венере (22 августа 2022 г.). «Активность сульбактама-дурлобактама in vitro против устойчивых к карбапенемам клинических изолятов Acinetobacter baumannii: многоцентровый отчет из Италии». Антибиотики . 11 (8): 1136. doi : 10.3390/antibiotics11081136 . ISSN  2079-6382. ПМК 9404735 . ПМИД  36010006. 
  23. ^ Центры по контролю и профилактике заболеваний (2004). « Инфекции Acinetobacter baumannii среди пациентов военных медицинских учреждений, лечащих раненых военнослужащих США, 2002-2004 гг.». MMWR Morb Mortal Wkly Rep . 53 (45): 1063–6. ПМИД  15549020.
  24. ^ Ахмад Т.А., Тауфик Д.М., Шевейта С.А., Харун М., Эль-Сайед Л.Х. (2016). «Разработка исследований иммунизации против Acinetobacter baumannii». Исследования в вакцинологии . 5 : 53–60. дои : 10.1016/j.trivac.2016.03.001 .
  25. ^ Тауфик Д.М., АхмадТА, Шевейта С.А., Харун М., Эль-Сайед Л.Х. (2017). «Обнаружение антигенных детерминант Acinetobacter baumannii». Письма по иммунологии . 186 : 59–67. doi :10.1016/j.imlet.2017.04.004. ПМИД  28427887.
  26. ^ Мацузаки С., Рашель М., Утияма Дж. и др. (октябрь 2005 г.). «Бактериофаготерапия: обновленная терапия против бактериальных инфекционных заболеваний». Дж. Заразить. Чематер . 11 (5): 211–9. дои : 10.1007/s10156-005-0408-9. PMID  16258815. S2CID  8107934.
  27. ^ Геллер Б.Л., Маршалл-Бэтти К., Шнелл Ф.Дж. и др. (Октябрь 2013). «Антисмысловые олигомеры, подавляющие гены, ингибируют рост Acinetobacter In Vitro и In Vivo. J. Infect. Болезни». {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  28. ^ «Помимо антибиотиков: PPMO предлагают новый подход к бактериальной инфекции» . 15 октября 2013 г. Проверено 15 октября 2013 г.
  29. ^ «FDA одобряет новое лечение пневмонии, вызванной некоторыми трудноизлечимыми бактериями» . Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (пресс-релиз). 24 мая 2023 г. Проверено 24 мая 2023 г. Всеобщее достояниеВ данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
  30. ^ «Ионизаторы воздуха уничтожают больничные инфекции» . Новый учёный . Проверено 30 августа 2006 г.
  31. ^ аб Палмен Р., Восман Б., Буйсман П., Брик К.К., Хеллингверф К.Дж. (февраль 1993 г.). «Физиологическая характеристика естественной трансформации Acinetobacter Calcoaceticus». Дж. Генерал Микробиол . 139 (2): 295–305. дои : 10.1099/00221287-139-2-295 . ПМИД  8436948.
  32. ^ Мишод Р.Э., Бернштейн Х., Недельку А.М. (май 2008 г.). «Адаптационное значение пола у микробных патогенов». Заразить. Жене. Эвол . 8 (3): 267–85. дои : 10.1016/j.meegid.2008.01.002. ПМИД  18295550.http://www.hummingbirds.arizona.edu/Faculty/Michod/Downloads/IGE%20review%20sex.pdf

дальнейшее чтение

Внешние ссылки