Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Аполипопротеин B ( ApoB ) — это белок , который у людей кодируется геном APOB . Его измерение обычно используется для выявления риска атеросклеротических сердечно-сосудистых заболеваний. [5] [6]
Функция
Аполипопротеин B является основным аполипопротеином хиломикронов , ЛПОНП , ЛП(а) , ЛПНП и ЛПНП (ЛПНП — обычно известный как «плохой холестерин » по отношению как к сердечным , так и к сосудистым заболеваниям в целом), который отвечает за перенос жировых молекул ( липидов ), включая холестерин , по всему телу ко всем клеткам во всех тканях . Хотя все функциональные роли ApoB в ЛПНП (и всех более крупных) частицах остаются несколько неясными, он является основным организующим белком (всей сложной оболочки, заключающей/переносящей жировые молекулы внутри) компонента частиц и абсолютно необходим для формирования этих частиц. Также ясно, что ApoB на частице ЛПНП действует как лиганд для рецепторов ЛПНП в различных клетках по всему телу (т. е., менее формально, ApoB указывает на то, что частицы, переносящие жир, готовы проникнуть в любые клетки с рецепторами ApoB и доставить жиры, переносимые внутри, в клетки).
Благодаря механизмам, которые изучены лишь частично, высокие уровни ApoB, особенно связанные с более высокими концентрациями частиц ЛПНП, являются основной причиной бляшек , вызывающих сосудистые заболевания ( атеросклероз ), обычно сначала становясь явно симптоматичными в виде заболеваний сердца , инсульта и многих других осложнений для всего организма после десятилетий прогрессирования. Имеются веские доказательства того, что концентрации ApoB [7] [8] и особенно анализ ЯМР [9] (специфичный для концентраций частиц ЛПНП) являются лучшими индикаторами физиологии, ведущей к сосудистым/сердечным заболеваниям, чем общий холестерин или холестерин ЛПНП (как долго пропагандировалось NIH, начиная с начала 1970-х годов). Однако, в первую очередь по историческим причинам стоимости/сложности, холестерин и предполагаемый холестерин ЛПНП расчетным путем остаются наиболее часто пропагандируемым липидным тестом для фактора риска атеросклероза. ApoB обычно измеряется с помощью иммуноанализов, таких как ИФА или нефелометрия . Усовершенствованные и автоматизированные методы ЯМР позволяют проводить измерения различий между множеством различных частиц ApoB.
Генетические нарушения
Высокие уровни ApoB связаны с сердечными заболеваниями. Гипобеталипопротеинемия — это генетическое заболевание , которое может быть вызвано мутацией в гене ApoB, APOB . [10] Абеталипопротеинемия обычно [ неопределенно ] вызвана мутацией в гене MTP, MTP . [11]
Мутации в гене APOB100 также могут вызывать семейную гиперхолестеринемию [12] , наследственную (аутосомно-доминантную) форму метаболического нарушения гиперхолестеринемии .
Исследования на мышах
Мыши использовались в качестве модельных организмов в исследовании ApoB, поскольку они экспрессируют эквивалентный белок, известный как мышиный ApoB (mApoB). У мышей, сверхэкспрессирующих mApoB, повышен уровень ЛПНП и снижен уровень ЛПВП . [13] Мыши, содержащие только одну функциональную копию гена mApoB, демонстрируют противоположный эффект, будучи устойчивыми к гиперхолестеринемии . Мыши, не содержащие функциональных копий гена, нежизнеспособны. [14]
Молекулярная биология
Белок встречается в плазме в двух основных изоформах, ApoB48 и ApoB100. Первая синтезируется исключительно тонким кишечником , вторая - печенью . [ 15] ApoB-100 - крупнейший из группы белков apoB, состоящий из 4563 аминокислот, включая сигнальный пептид из 27 аминокислот и зрелый белок из 4536 аминокислот. [15] Обе изоформы кодируются APOB и одним транскриптом мРНК размером более 16 кб. ApoB48 образуется, когда стоп-кодон (UAA) в остатке 2153 создается путем редактирования РНК . По-видимому, существует транс -действующий тканеспецифичный ген сплайсинга, который определяет, какая изоформа в конечном итоге будет произведена. [ необходима цитата ] В качестве альтернативы, есть некоторые доказательства того, что цис -действующий элемент, расположенный на несколько тысяч пар оснований выше по течению, определяет, какая изоформа будет произведена. [ необходима цитата ]
В результате редактирования РНК ApoB48 и ApoB100 имеют общую N-концевую последовательность, но у ApoB48 отсутствует C-концевая область связывания рецептора ЛПНП ApoB100 . Фактически, ApoB48 так называется, потому что он составляет 48% последовательности для ApoB100.
ApoB 48 — уникальный белок хиломикронов из тонкого кишечника. После того, как большая часть липидов в хиломикронах абсорбируется, ApoB48 возвращается в печень как часть остатка хиломикрона, где он эндоцитируется и деградирует.
Клиническое значение
Преимущества
Роль в системе врожденного иммунитета
Липопротеины очень низкой плотности и липопротеины низкой плотности мешают системе кворумного восприятия , которая активирует гены, необходимые для инвазивной инфекции Staphylococcus aureus . Механизм антагонизма подразумевает связывание ApoB с аутоиндуцирующим феромоном S. aureus , предотвращая передачу сигнала через его рецептор. Мыши с дефицитом ApoB более восприимчивы к инвазивной бактериальной инфекции. [16]
Побочные эффекты
Роль в резистентности к инсулину
Избыточная продукция аполипопротеина В может привести к липид-индуцированному стрессу эндоплазматического ретикулума и резистентности к инсулину в печени. [17]
Роль в липопротеинах и атеросклерозе
ApoB100 обнаружен в липопротеинах , происходящих из печени ( VLDL , IDL , LDL [18] ). Важно, что на один липопротеин, полученный из печени, приходится одна молекула ApoB100. Следовательно, используя этот факт, можно количественно определить количество частиц липопротеинов, отметив общую концентрацию ApoB100 в кровотоке. Поскольку на частицу приходится один и только один ApoB100, количество частиц отражается концентрацией ApoB100. Тот же метод можно применить к отдельным классам липопротеинов (например, LDL) и, таким образом, также подсчитать их.
Хорошо известно, что уровни ApoB100 связаны с ишемической болезнью сердца , они являются гораздо лучшим предиктором этого, чем концентрации ЛПНП-Х. [19] [20] [21] Причина: ЛПНП-Х не отражает фактическую концентрацию частиц, а холестерин не может растворяться или перемещаться (в воде) без частиц, которые его переносят. Простой способ понять это наблюдение — тот факт, что ApoB100, один на частицу, отражает фактическую концентрацию липопротеиновых частиц (независимо от их холестерина или другого липидного содержания). Таким образом, можно понять, что количество липопротеиновых частиц, содержащих ApoB100, которые могут переносить липиды в стенки артерий, является ключевым фактором, движущей силой атеросклероза и сердечных заболеваний.
Один из способов объяснить вышесказанное — учесть, что большое количество липопротеиновых частиц, и, в частности, большое количество частиц ЛПНП, приводит к конкуренции за рецептор ApoB100 (т. е. рецептор ЛПНП) периферических клеток. Поскольку такая конкуренция продлит время пребывания частиц ЛПНП в кровотоке, это может привести к большей возможности для них подвергнуться окислению и/или другим химическим модификациям. Такие модификации могут уменьшить способность частиц очищаться классическим рецептором ЛПНП и/или увеличить их способность взаимодействовать с так называемыми рецепторами «мусорщиков». Конечным результатом является шунтирование частиц ЛПНП к этим рецепторам «мусорщиков». Рецепторы «мусорщиков» обычно находятся на макрофагах , причем макрофаги, нагруженные холестерином, более известны как « пенистые клетки ». Пенистые клетки характеризуют атеросклеротические поражения. В дополнение к этому возможному механизму образования пенистых клеток, увеличение уровней химически модифицированных частиц ЛПНП также может привести к увеличению повреждения эндотелия . Это происходит в результате токсического воздействия модифицированных ЛПНП на эндотелий сосудов, а также их способности привлекать эффекторные иммунные клетки и способствовать активации тромбоцитов .
Исследование INTERHEART показало, что соотношение ApoB100/ApoA1 более эффективно для прогнозирования риска сердечного приступа у пациентов, перенесших острый инфаркт миокарда, чем измерение ApoB100 или ApoA1 по отдельности. [22] ( ApoA1 является основным белком ЛПВП. [23] ) В общей популяции это остается неясным, хотя в недавнем исследовании ApoB был самым сильным маркером риска сердечно-сосудистых событий. [24]
Средиземноморская диета рекомендуется как средство снижения уровня аполипопротеина B. [25]
Взаимодействия
Было показано, что ApoB взаимодействует с apo(a) , [26] PPIB , [27] рецептором кальцитонина [27] [28] и HSP90B1 . [27] [28] Считается, что взаимодействие ApoB с протеогликанами , коллагеном и фибронектином вызывает атеросклероз . [29] [30]
Интерактивная карта маршрутов
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. [§ 1]
- ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «Statin_Pathway_WP430».
Регулирование
Экспрессия APOB регулируется цис -регуляторными элементами в 5′ UTR и 3′ UTR APOB. [31 ]
Редактирование РНК
мРНК , кодирующая этот белок, подвергается сайт-специфическому редактированию РНК от цитидина к уридину (C к U) . ApoB100 и ApoB48 кодируются одним и тем же геном, однако различия в транслируемых белках обусловлены не альтернативным сплайсингом, а тканеспецифическим событием редактирования РНК. Редактирование мРНК ApoB было первым примером редактирования, наблюдаемым у позвоночных. [32] Редактирование мРНК ApoB происходит у всех плацентарных млекопитающих . [33] Редактирование происходит посттранскрипционно, поскольку зарождающиеся полинуклеотиды не содержат отредактированных нуклеозидов. [34]
Тип
Редактирование мРНК ApoB от C до U требует комплекса редактирования или голофермента (эдитосомы), состоящего из фермента редактирования мРНК Apolipoprotein B от C до U , каталитического полипептида 1 (ApoBEC-1), а также других вспомогательных факторов. ApoBEC-1 — это белок, который у людей кодируется геном APOBEC1 . [35] [1]Он является членом семейства цитидиндезаминаз . Одного ApoBEC-1 недостаточно для редактирования мРНК ApoB [36] и для осуществления редактирования требуется по крайней мере один из этих вспомогательных факторов, фактор комплементации APOBEC1 (A1CF) [37] . A1CF содержит 3 неидентичных повтора. Он действует как субъединица связывания РНК и направляет ApoBEC-1 к мРНК ApoB ниже по течению от отредактированного цитидина. [38] Известно, что другие вспомогательные факторы являются частью голофермента. Некоторые из этих белков были идентифицированы. Это связывающий белок CUG 2 ( CUGBP2 ), [39] SYNCRIP (богатый глицином-аргинином-тирозином РНК-связывающий белок, GRY-RBP), [40] гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин (hnRNP)-C1 ( HNRNPC ), [41] связывающий белок ApoBEC-1 ABBP1 ( HNRNPAB ), ABBP2, [42] связывающий регуляторный белок сплайсинга KH-типа ( KHSRP ), ассоциированный с Bcl-2 атаноген 4 ( BAG4 ), [43] и вспомогательный фактор (AUX)240. [44] Все эти белки были идентифицированы с помощью анализов обнаружения, и было продемонстрировано, что все они взаимодействуют либо с РНК ApoBEC-1, A1CF, либо с РНК ApoB. Функция этих вспомогательных белков в комплексе редактирования неизвестна. Помимо редактирования мРНК ApoB, эдитсома ApoBEC-1 также редактирует мРНК NF1 . Редактирование мРНК ApoB является наиболее определенным примером этого типа редактирования РНК от C до U у людей.
Расположение
Несмотря на то, что транскрипт длиной 14 000 остатков, для редактирования предназначен один цитидин. В мРНК ApoB обнаружена последовательность, состоящая из 26 нуклеотидов, необходимых для редактирования. Это известно как мотив редактирования. Эти нуклеотиды (6662–6687) были определены как необходимые с помощью экспериментов по сайт-специфическому мутагенезу. [45] Часть этой последовательности из 11 нуклеотидов на 4–5 нуклеотидов ниже по течению от сайта редактирования является важной областью, известной как последовательность швартовки. [46] Область, называемая спейсерным элементом, обнаружена на расстоянии 2–8 нуклеотидов между отредактированным нуклеозидом и этой последовательностью швартовки. [47] Также имеется регуляторная последовательность 3′ от сайта редактирования. Считается, что активный сайт ApoBEC-1, каталитический компонент редактирующего голофермента, связывается с богатой AU областью последовательности швартовки с помощью ACF при связывании комплекса с мРНК. [48]
Отредактированный остаток цитидина расположен в нуклеотиде 6666, расположенном в экзоне 26 гена. Редактирование в этом месте приводит к изменению кодона с кодона глутамина (CAA) на стоп-кодон внутри рамки считывания (UAA). [32] Компьютерное моделирование обнаружило, что для того, чтобы произошло редактирование, отредактированный цитидин находится в петле. [46] Выбор отредактированного цитидина также сильно зависит от этой вторичной структуры окружающей РНК. Есть также некоторые указания на то, что эта область петли образована между последовательностью швартовки и 3′-регуляторной областью мРНК ApoB. [49] Предполагается, что предсказанная вторичная структура, образованная мРНК ApoB, обеспечивает контакт между остатком, который будет отредактирован, и активным сайтом APOBEC1, а также для связывания ACF и других вспомогательных факторов, связанных с эдитосомой.
Регулирование
Редактирование мРНК ApoB у людей регулируется тканями, при этом ApoB48 является основным белком ApoB тонкого кишечника у людей. Он встречается в меньших количествах в толстой кишке, почках и желудке вместе с неотредактированной версией. [50]
Редактирование также регулируется развитием, при этом неотредактированная версия транслируется только на ранних стадиях развития, но отредактированная форма увеличивается в процессе развития в тканях, где может происходить редактирование. [51] [52]
Было показано, что уровни редактирования мРНК ApoB изменяются в ответ на изменения в диете, воздействие алкоголя и уровни гормонов. [53] [54] [55]
Сохранение
Редактирование мРНК ApoB также происходит у мышей и крыс. В отличие от людей, редактирование происходит в печени у мышей и крыс с частотой до 65%. [56] Это не наблюдалось у птиц или более мелких видов. [57]
Последствия
Структура
Редактирование приводит к изменению кодона, создавая стоп-кодон в рамке, что приводит к трансляции укороченного белка ApoB48. Этот стоп-кодон приводит к трансляции белка, в котором отсутствует карбоксильный конец, содержащий домен связывания LDLR белка. Полный белок ApoB100, который имеет около 4500 аминокислот, присутствует в VLDL и LDL. Поскольку многие части ApoB100 находятся в амфипатическом состоянии, структура некоторых его доменов зависит от основных липидных условий. Однако известно, что он имеет ту же общую укладку в LDL, имеющую пять основных доменов. Недавно была обнаружена первая структура LDL при температуре человеческого тела в нативном состоянии с использованием криоэлектронной микроскопии с разрешением 16 ангстрем. [58] Общая укладка ApoB-100 была подтверждена, и была картирована некоторая гетерогенность в локальной структуре его доменов. [ необходима цитата ]
Функция
Редактирование ограничено теми транскриптами, которые экспрессируются в тонком кишечнике . Эта более короткая версия белка имеет функцию, специфичную для тонкого кишечника. Основная функция полноразмерного экспрессируемого печенью ApoB100 заключается в том, чтобы быть лигандом для активации ЛПНП-Р. Однако редактирование приводит к образованию белка, лишенного этой области связывания ЛПНП-Р белка. Это изменяет функцию белка и более короткого белка ApoB48 как специфических функций относительно тонкого кишечника. ApoB48 идентичен аминоконцевым 48% ApoB100. [59] Функция этой изоформы заключается в абсорбции жира тонким кишечником и участвует в синтезе, сборке и секреции хиломикронов . Эти хиломикроны транспортируют пищевые липиды в ткани, в то время как оставшиеся хиломикроны вместе с ассоциированными остаточными липидами через 2–3 часа поглощаются печенью посредством взаимодействия аполипопротеина E (ApoE) с липопротеиновыми рецепторами. Это доминирующий белок ApoB в тонком кишечнике большинства млекопитающих. Это ключевой белок в экзогенном пути метаболизма липопротеинов. Кишечные белки, содержащие ApoB48, метаболизируются в остаточные частицы хиломикронов, которые захватываются рецепторами остатков.
Смотрите также
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000084674 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020609 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Glavinovic T, Thanassoulis G, de Graaf J, Couture P, Hegele RA, Sniderman AD (октябрь 2022 г.). «Физиологические основы превосходства аполипопротеина B над холестерином липопротеинов низкой плотности и холестерином липопротеинов невысокой плотности как маркера сердечно-сосудистого риска». Журнал Американской кардиологической ассоциации . 11 (20): e025858. doi :10.1161/JAHA.122.025858. PMC 9673669. PMID 36216435 .
- ^ Behbodikhah J, Ahmed S, Elyasi A, Kasselman LJ, De Leon J, Glass AD, Reiss AB (октябрь 2021 г.). «Аполипопротеин B и сердечно-сосудистые заболевания: биомаркеры и потенциальные терапевтическая мишень». Метаболиты . 11 (10): 690. doi : 10.3390/metabo11100690 . PMC 8540246. PMID 34677405 .
- ^ Lim JS, Lee DH, Park JY, Jin SH, Jacobs DR (2011). «Надежность измерения холестерина липопротеинов низкой плотности, холестерина липопротеинов невысокой плотности и аполипопротеина B». Журнал клинической липидологии . 5 (4): 264–272. doi :10.1016/j.jacl.2011.05.004. PMID 21784371.
- ^ Jacobson TA (2011). «Открытие нового липидного «апотекария»: включение аполипопротеинов в качестве потенциальных факторов риска и целей лечения для снижения сердечно-сосудистого риска». Mayo Clinic Proceedings . 86 (8): 762–780. doi :10.4065/mcp.2011.0128. PMC 3146376. PMID 21803958 .
- ^ Carmena R, Duriez P, Fruchart JC (2004). «Атеросклероз: развитие сосудистой биологии и клинические последствия». Циркуляция . 109 (23): III–2. doi : 10.1161/01.CIR.0000131511.50734.44 . PMID 15198959.
- ^ Young, Stephen G.; Hubl, Susan T.; Chappell, David A.; Smith, Richard S.; Claiborne, Frederica; Snyder, Steven M.; Terdiman, Joseph F. (1989-06-15). «Семейная гипобеталипопротеинемия, связанная с мутантным видом аполипопротеина B (B-46)». New England Journal of Medicine . 320 (24): 1604–1610. doi :10.1056/NEJM198906153202407. ISSN 0028-4793. PMID 2725600.
- ^ "МТТП микросомальный белок переноса триглицеридов [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 28.03.2024 .
- ^ Андерсен, Ларс Х.; Мисерез, Андре Р.; Ахмад, Захид; Андерсен, Рольф Л. (ноябрь 2016 г.). «Семейный дефектный аполипопротеин B-100: обзор». Журнал клинической липидологии . 10 (6): 1297–1302. doi :10.1016/j.jacl.2016.09.009. PMID 27919345.
- ^ McCormick SP, Ng JK, Véniant M, Borén J, Pierotti V, Flynn LM и др. (май 1996 г.). «Трансгенные мыши, которые сверхэкспрессируют мышиный аполипопротеин B. Доказательства того, что последовательности ДНК, контролирующие кишечную экспрессию гена аполипопротеина B, далеки от структурного гена». Журнал биологической химии . 271 (20): 11963–11970. doi : 10.1074/jbc.271.20.11963 . PMID 8662599.
- ^ Farese RV, Ruland SL, Flynn LM, Stokowski RP, Young SG (февраль 1995 г.). «Выключение гена аполипопротеина B у мышей приводит к эмбриональной летальности у гомозигот и защите от гиперхолестеринемии, вызванной диетой, у гетерозигот». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (5): 1774–1778. Bibcode : 1995PNAS...92.1774F. doi : 10.1073/pnas.92.5.1774 . PMC 42602. PMID 7878058 .
- ^ ab Chen SH, Yang CY, Chen PF, Setzer D, Tanimura M, Li WH, Gotto AM Jr, Chan L (1986). «Полная кДНК и аминокислотная последовательность человеческого аполипопротеина B-100». Журнал биологической химии . 261 (28): 12918–12921. doi : 10.1016/S0021-9258(18)69248-8 . PMID 3759943.
- ^ Peterson MM, Mack JL, Hall PR, Alsup AA, Alexander SM, Sully EK, Sawires YS, Cheung AL, Otto M, Gresham HD (2008). «Аполипопротеин B — врожденный барьер против инвазивной инфекции Staphylococcus aureus». Cell Host & Microbe . 4 (6): 507–509. doi :10.1016/j.chom.2008.10.001. PMC 2639768 . PMID 19064256.
- ^ Su Q, Tsai J, Xu E, Qiu W, Bereczki E, Santha M, Adeli K (2009). «Аполипопротеин B100 действует как молекулярная связь между липид-индуцированным стрессом эндоплазматического ретикулума и резистентностью печени к инсулину». Гепатология . 50 (1): 77–84. doi : 10.1002/hep.22960 . PMID 19434737. S2CID 205869807.
- ^ Энциклопедия MedlinePlus : Аполипопротеин B100
- ^ Cromwell WC, Otvos JD, Keyes MJ, Pencina MJ, Sullivan L, Vasan RS, Wilson PW, D'Agostino RB (декабрь 2007 г.). «Количество частиц ЛПНП и риск будущих сердечно-сосудистых заболеваний в исследовании потомства Фрамингема — значение для управления ЛПНП». Журнал клинической липидологии . 1 (6): 583–592. doi :10.1016/j.jacl.2007.10.001. PMC 2720529. PMID 19657464 .
- ^ Sniderman AD, Lamarche B, Contois JH, de Graaf J (декабрь 2014 г.). «Анализ несоответствий и Гордиев узел холестерина ЛПНП и не-ЛПВП по сравнению с апоB». Current Opinion in Lipidology . 25 (6): 461–467. doi :10.1097/MOL.00000000000000127. PMID 25340478. S2CID 23464159.
- ^ Glavinovic T, Thanassoulis G, Sniderman AD (2022). «Физиологические основы превосходства аполипопротеина B над холестерином липопротеинов низкой плотности и холестерином липопротеинов невысокой плотности как маркера сердечно-сосудистого риска». Журнал Американской кардиологической ассоциации . 11 (20): e025858. doi :10.1161/JAHA.122.025858. PMC 9673669. PMID 36216435 .
- ^ McQueen MJ, Hawken S, Wang X, Ounpuu S, Sniderman A, Probstfield J, Steyn K, Sanderson JE, Hasani M, Volkova E, Kazmi K, Yusuf S (июль 2008 г.). «Липиды, липопротеины и аполипопротеины как маркеры риска инфаркта миокарда в 52 странах (исследование INTERHEART): исследование случай-контроль». Lancet . 372 (9634): 224–233. doi :10.1016/S0140-6736(08)61076-4. PMID 18640459. S2CID 26567691.
- ^ van der Vorst EP (2020). «Липопротеины высокой плотности и аполипопротеин A1». Дыхательные белки позвоночных и беспозвоночных, липопротеины и другие белки жидкостей организма . Субклеточная биохимия. Т. 94. С. 399–420. doi :10.1007/978-3-030-41769-7_16. ISBN 978-3-030-41768-0. PMID 32189309. S2CID 213180689.
- ^ Benn M, Nordestgaard BG, Jensen GB, Tybjaerg-Hansen A (2007). «Улучшение прогнозирования ишемического сердечно-сосудистого заболевания у населения в целом с использованием аполипопротеина B: исследование сердца в Копенгагене». Arterioscler Thromb Vasc Biol . 27 (3): 661–670. doi : 10.1161/01.ATV.0000255580.73689.8e . PMID 17170368.
- ^ Lamantia V, Sniderman A, Faraj M (2016). «Пищевое управление гиперапоВ». Обзоры исследований в области питания . 29 (2): 202–233. doi :10.1017/S0954422416000147. PMID 27821191.
- ^ Малагуарнера М, Ваканте М, Руссо С, Малагуарнера Г, Антич Т, Малагуарнера Л, Белла Р, Пенниси Г, Гальвано Ф, Фриджиола А (2013). «Липопротеин (а) при сердечно-сосудистых заболеваниях». БиоМед Исследования Интернэшнл . 2013 (650989): 1–9. дои : 10.1155/2013/650989 . ПМК 3591100 . ПМИД 23484137.
- ^ abc Zhang J, Herscovitz H (февраль 2003 г.). «Образующийся липидированный аполипопротеин B транспортируется в аппарат Гольджи как не полностью свернутый промежуточный продукт, что подтверждается его связью с сетью молекулярных шаперонов эндоплазматического ретикулума, GRP94, ERp72, BiP, кальретикулином и циклофилином B». J. Biol. Chem . 278 (9): 7459–7468. doi : 10.1074/jbc.M207976200 . PMID 12397072.
- ^ ab Linnik KM, Herscovitz H (август 1998 г.). «Множественные молекулярные шапероны взаимодействуют с аполипопротеином B во время его созревания. Сеть шаперонов, находящихся в эндоплазматическом ретикулуме (ERp72, GRP94, кальретикулин и BiP), взаимодействует с аполипопротеином b независимо от его состояния липидизации». J. Biol. Chem . 273 (33): 21368–21373. doi : 10.1074/jbc.273.33.21368 . PMID 9694898.
- ^ Халил МФ, Вагнер ВД, Голдберг ИДЖ (2004). «Липопротеин(а) при сердечно-сосудистых заболеваниях». Артериосклероз, тромбоз и сосудистая биология . 24 (12): 2211–2218. doi : 10.1161/01.ATV.0000147163.54024.70 . PMID 15472124.
- ^ Tabas I, Williams KJ, Borén J (2007). «Субэндотелиальная задержка липопротеинов как инициирующий процесс при атеросклерозе: обновление и терапевтические последствия». Circulation . 116 (16): 1832–1844. doi : 10.1161/circulationaha.106.676890 . PMID 17938300.
- ^ Pontrelli L, Sidiropoulos KG, Adeli K (2004). «Трансляционный контроль мРНК аполипопротеина B: регуляция через цис-элементы в 5′ и 3′ нетранслируемых областях». Биохимия . 43 (21): 6734–6744. doi :10.1021/bi049887s. PMID 15157107.
- ^ ab Powell LM, Wallis SC, Pease RJ, Edwards YH, Knott TJ, Scott J (сентябрь 1987 г.). «Новая форма тканеспецифической обработки РНК производит аполипопротеин-B48 в кишечнике». Cell . 50 (6): 831–840. doi :10.1016/0092-8674(87)90510-1. PMID 3621347. S2CID 37938313.
- ^ Fujino T, Navaratnam N, Jarmuz A, von Haeseler A, Scott J (июль 1999 г.). «C→U-редактирование мРНК аполипопротеина B у сумчатых: идентификация и характеристика APOBEC-1 у американского опоссума Monodelphus domestica». Nucleic Acids Res. 27 (13): 2662–2671. doi :10.1093/nar/27.13.2662. PMC 148475 . PMID 10373583.
- ^ Lau PP, Xiong WJ, Zhu HJ, Chen SH, Chan L (октябрь 1991 г.). «Редактирование мРНК аполипопротеина B — это внутриядерное событие, которое происходит посттранскрипционно, совпадая со сплайсингом и полиаденилированием». J. Biol. Chem . 266 (30): 20550–20554. doi : 10.1016/S0021-9258(18)54960-7 . PMID 1939106.
- ^ "Ген APOBEC1 - GeneCards | Белок ABEC1 | Антитело ABEC1". Архивировано из оригинала 2011-07-26 . Получено 2011-02-24 .
- ^ Navaratnam N, Fujino T, Bayliss J, Jarmuz A, How A, Richardson N, Somasekaram A, Bhattacharya S, Carter C, Scott J (январь 1998 г.). «Цитидиндезаминаза Escherichia coli обеспечивает молекулярную модель редактирования РНК ApoB и механизм распознавания субстрата РНК». J. Mol. Biol. 275 (4): 695–714. doi :10.1006/jmbi.1997.1506. PMID 9466941.
- ^ "Ген A1CF - GeneCards | Белок A1CF | Антитело A1CF". Архивировано из оригинала 2011-07-26 . Получено 2011-02-24 .
- ^ Blanc V, Kennedy S, Davidson NO (октябрь 2003 г.). «Новый сигнал ядерной локализации во вспомогательном домене фактора комплементации apobec-1 регулирует ядерно-цитоплазматический импорт и перемещение». J. Biol. Chem . 278 (42): 41198–41204. doi : 10.1074/jbc.M302951200 . PMID 12896982.
- ^ Anant S, Henderson JO, Mukhopadhyay D, Navaratnam N, Kennedy S, Min J, Davidson NO (декабрь 2001 г.). «Новая роль РНК-связывающего белка CUGBP2 в редактировании РНК млекопитающих. CUGBP2 модулирует редактирование C в U мРНК аполипопротеина B путем взаимодействия с apobec-1 и A1CF, фактором комплементации apobec-1». J. Biol. Chem . 276 (50): 47338–47351. doi : 10.1074/jbc.M104911200 . PMID 11577082.
- ^ Blanc V, Navaratnam N, Henderson JO, Anant S, Kennedy S, Jarmuz A, Scott J, Davidson NO (март 2001 г.). «Идентификация GRY-RBP как белка, связывающего РНК аполипопротеина B, который взаимодействует как с apobec-1, так и с фактором комплементации apobec-1 для модуляции редактирования C в U». J. Biol. Chem . 276 (13): 10272–10283. doi : 10.1074/jbc.M006435200 . PMID 11134005.
- ^ Greeve J, Lellek H, Rautenberg P, Greten H (1998). «Ингибирование комплекса ферментов редактирования мРНК аполипопротеина B комплексами hnRNP C1 и 40S hnRNP». Biol. Chem. 379 (8–9): 1063–1073. doi :10.1515/bchm.1998.379.8-9.1063. PMID 9792439. S2CID 25911416.
- ^ Lau PP, Villanueva H, Kobayashi K, Nakamuta M, Chang BH, Chan L (декабрь 2001 г.). «Белок DnaJ, белок-2, связывающий apobec-1, модулирует редактирование мРНК аполипопротеина B». J. Biol. Chem . 276 (49): 46445–46452. doi : 10.1074/jbc.M109215200 . PMID 11584023.
- ^ Lau PP, Chan L (декабрь 2003 г.). «Участие регулятора шаперона, Bcl2-ассоциированного атаногена-4, в редактировании мРНК аполипопротеина B». J. Biol. Chem . 278 (52): 52988–52996. doi : 10.1074/jbc.M310153200 . PMID 14559896.
- ^ Schock D, Kuo SR, Steinburg MF, Bolognino M, Sparks JD, Sparks CE, Smith HC (февраль 1996 г.). «Вспомогательный фактор, содержащий комплекс белка 240 кДа, участвует в редактировании РНК аполипопротеина B». Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93 (3): 1097–1102. Bibcode :1996PNAS...93.1097S. doi : 10.1073/pnas.93.3.1097 . PMC 40037 . PMID 8577721.
- ^ Davies MS, Wallis SC, Driscoll DM, Wynne JK, Williams GW, Powell LM, Scott J (август 1989). «Требования к последовательности для редактирования РНК аполипопротеина B в трансфицированных клетках гепатомы крысы». J. Biol. Chem . 264 (23): 13395–13398. doi : 10.1016/S0021-9258(18)80008-4 . PMID 2760026.
- ^ ab Shah RR, Knott TJ, Legros JE, Navaratnam N, Greeve JC, Scott J (сентябрь 1991 г.). «Требования к последовательности для редактирования мРНК аполипопротеина B». J. Biol. Chem . 266 (25): 16301–16304. doi : 10.1016/S0021-9258(18)55296-0 . PMID 1885564.
- ^ Driscoll DM, Lakhe-Reddy S, Oleksa LM, Martinez D (декабрь 1993 г.). «Индукция редактирования РНК в гетерологичных сайтах последовательностями в мРНК аполипопротеина B». Mol. Cell. Biol. 13 (12): 7288–7294. doi :10.1128/MCB.13.12.7288. PMC 364799 . PMID 8246950.
- ^ Greeve J, Navaratnam N, Scott J (июль 1991 г.). «Характеристика фермента редактирования мРНК аполипопротеина B: нет сходства с предложенным механизмом редактирования РНК у кинетопластидных простейших». Nucleic Acids Res. 19 (13): 3569–3576. doi :10.1093/nar/19.13.3569. PMC 328381 . PMID 1649450.
- ^ Richardson N, Navaratnam N, Scott J (ноябрь 1998 г.). «Вторичная структура сайта редактирования мРНК аполипопротеина B. Au-связывающие белки взаимодействуют со стволовой петлей». J. Biol. Chem . 273 (48): 31707–31717. doi : 10.1074/jbc.273.48.31707 . PMID 9822632.
- ^ Teng B, Verp M, Salomon J, Davidson NO (ноябрь 1990 г.). «Редактирование РНК-мессенджера аполипопротеина B регулируется развитием и широко выражено в тканях человека». J. Biol. Chem . 265 (33): 20616–20620. doi : 10.1016/S0021-9258(17)30547-1 . PMID 2243107.
- ^ Wu JH, Semenkovich CF, Chen SH, Li WH, Chan L (июль 1990 г.). «Редактирование мРНК аполипопротеина B. Проверка чувствительного анализа и биология развития редактирования РНК у крыс». J. Biol. Chem . 265 (21): 12312–12316. doi : 10.1016/S0021-9258(19)38347-4 . PMID 2373694.
- ^ Glickman RM, Rogers M, Glickman JN (июль 1986 г.). «Синтез аполипопротеина B печенью и кишечником человека in vitro». Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83 (14): 5296–5300. Bibcode :1986PNAS...83.5296G. doi : 10.1073/pnas.83.14.5296 . PMC 323938 . PMID 3460091.
- ^ Baum CL, Teng BB, Davidson NO (ноябрь 1990 г.). «Редактирование РНК-мессенджера аполипопротеина B в печени крысы. Модуляция голоданием и повторным кормлением высокоуглеводной диетой». J. Biol. Chem . 265 (31): 19263–19270. doi : 10.1016/S0021-9258(17)30653-1 . PMID 2229075.
- ^ Lau PP, Cahill DJ, Zhu HJ, Chan L (октябрь 1995 г.). «Этанол модулирует редактирование мРНК аполипопротеина B у крыс». J. Lipid Res. 36 (10): 2069–2078. doi : 10.1016/S0022-2275(20)39192-6 . PMID 8576634.
- ^ Chan L, Chang BH, Nakamuta M, Li WH, Smith LC (март 1997). «Apobec-1 и редактирование мРНК аполипопротеина B». Biochim. Biophys. Acta . 1345 (1): 11–26. doi :10.1016/S0005-2760(96)00156-7. PMID 9084497.
- ^ Чан Л. (январь 1993 г.). «Редактирование РНК: исследование одного режима с мРНК аполипопротеина B». BioEssays . 15 (1): 33–41. doi :10.1002/bies.950150106. PMID 8466474. S2CID 314984.
- ^ Таруги П., Альбертацци Л., Николини С., Каландра С. (март 1990 г.). «Отсутствие аполипопротеина B-48 у цыпленка Gallus Domesticus». Дж. Липид Рез. 31 (3): 417–427. дои : 10.1016/S0022-2275(20)43164-5 . hdl : 11380/742118 . ПМИД 2341807.
- ^ Kumar V, Butcher SJ, Öörni K, Engelhardt P, Heikkonen J, Kaski K, Ala-Korpela M, Kovanen PT (май 2011 г.). "Трехмерная криоЭМ-реконструкция нативных частиц ЛПНП с разрешением 16Å при физиологической температуре тела". PLOS ONE . 6 (5): e18841. Bibcode :2011PLoSO...618841K. doi : 10.1371/journal.pone.0018841 . PMC 3090388 . PMID 21573056.
- ^ Knott TJ, Pease RJ, Powell LM, Wallis SC, Rall SC, Innerarity TL, Blackhart B, Taylor WH, Marcel Y, Milne R (1986). «Полная последовательность белка и идентификация структурных доменов человеческого аполипопротеина B». Nature . 323 (6090): 734–738. Bibcode :1986Natur.323..734K. doi :10.1038/323734a0. PMID 3773997. S2CID 536926.
Дальнейшее чтение
- Mahley RW, Innerarity TL, Rall SC, Weisgraber KH (1985). «Плазменные липопротеины: структура и функция аполипопротеинов». J. Lipid Res . 25 (12): 1277–1294. doi : 10.1016/S0022-2275(20)34443-6 . PMID 6099394.
- Итакура Х, Мацумото А (1995). «[Аполипопротеин Б]». Ниппон Ринсё . 52 (12): 3113–3118. ПМИД 7853698.
- Чумакова О.С., Затейщиков Д.А., Сидоренко Б.А. (2006). "[Аполипопротеин В: структура, функция, полиморфизм генов и связь с атеросклерозом]". Кардиология . 45 (6): 43–55. PMID 16007035.
- Ye J (2007). «Зависимость путей метаболизма холестерина хозяина от жизненного цикла вируса гепатита С». PLOS Pathog . 3 (8): e108. doi : 10.1371/journal.ppat.0030108 . PMC 1959368. PMID 17784784 .
Внешние ссылки
- База данных редактирования РНК (DARNED).
- Прикладные исследования аполипопротеина-B
- Расположение генома человека APOB и страница с подробностями гена APOB в браузере геномов UCSC .