stringtranslate.com

Арабидопсис

Arabidopsis ( роккресс ) — род семейства капустных . Это небольшие цветковые растения, родственные капусте и горчице . Этот род представляет большой интерес, поскольку содержит кресс Таля ( Arabidopsis thaliana ), один из модельных организмов, используемых для изучения биологии растений, и первое растение, у которого был полностью секвенирован геном. Изменения в кресс Таля легко наблюдать, что делает его очень полезной моделью.

Статус

В настоящее время род Arabidopsis насчитывает девять видов и еще восемь подвидов. Это разграничение произошло совсем недавно и основано на морфологических и молекулярных филогениях О'Кейна и Аль-Шехбаза [1] [2] и других.

Их выводы подтверждают, что виды, ранее включенные в Arabidopsis, сделали его полифилетическим . Последняя переклассификация перемещает два вида, ранее включенных в Cardaminopsis и Hylandra , и три вида Arabis в Arabidopsis , но исключает 50, которые были перемещены в новые роды Beringia, Crucihimalaya , Ianhedgea , Olimarabidopsis и Pseudoarabidopsis .

Все виды Arabidopsis являются коренными жителями Европы , а два вида имеют обширные ареалы, простирающиеся также на территорию Северной Америки и Азии .

За последние два десятилетия Arabidopsis thaliana вызвал большой интерес у научного сообщества как модельный организм для исследований по многочисленным аспектам биологии растений. Arabidopsis Information Resource (TAIR) — это курируемый онлайн-источник информации для исследований генетики и молекулярной биологии Arabidopsis thaliana , а The Arabidopsis Book [3] — это онлайн-сборник приглашенных глав по биологии Arabidopsis thaliana . (Обратите внимание, что с 2013 года дальнейшие главы публиковаться не будут.) В Европе центром ресурсов модельных организмов для Arabidopsis thaliana по зародышевой плазме , биоинформатике и молекулярной биологии (включая GeneChips) является Nottingham Arabidopsis Stock Centre (NASC), в то время как в Северной Америке услуги по зародышевой плазме предоставляются Arabidopsis Biological Resource Center (ABRC), базирующимся в Университете штата Огайо . Система заказов для ABRC была включена в базу данных TAIR в июне 2001 года, в то время как NASC всегда (с 1991 года) имел собственную систему заказов и браузер генома.

В 1982 году экипаж советской космической станции «Салют-7» вырастил несколько Arabidopsis, став, таким образом, первыми растениями, которые зацвели и дали семена в космосе . Продолжительность их жизни составляла 40 дней. [4] Семена Arabidopsis thaliana были доставлены на Луну на посадочном модуле «Чанъэ-4» в 2019 году в рамках студенческого эксперимента. По состоянию на май 2022 года Arabidopsis thaliana успешно выращивается в образцах лунной почвы. [5]

Род Arabidopsis очень похож на род Boechera .

Список видов и подвидов

Переклассифицированные виды

Следующие виды, ранее относимые к Arabidopsis, в настоящее время не считаются частью этого рода.

Цитогенетика

Цитогенетический анализ показал, что гаплоидное число хромосом (n) является изменчивым и варьируется у разных видов в пределах рода: [6]

A. thaliana имеет n=5 [7] , и секвенирование ДНК этого вида было завершено в 2001 году. A. lyrata имеет n=8, но некоторые подвиды или популяции являются тетраплоидными. [8] Различные подвиды A. arenosa имеют n=8, но могут быть как 2n (диплоидными), так и 4n (тетраплоидными). [9] A. suecica имеет n=13 (5+8) и является амфидиплоидным видом, возникшим в результате гибридизации между A. thaliana и диплоидным A. arenosa . [10]

A. neglecta имеет n=8, как и различные подвиды A. halleri . [9]

По состоянию на 2005 год цитологические исследования A. cebennensis , A. croatica и A. pedemontana не проводились.

Ссылки

  1. ^ О'Кейн, Стив Л.; Аль-Шехбаз, Ихсан А. (1997). «Краткий обзор Arabidopsis (Brassicaceae)». Новон . 7 (3): 323. дои : 10.2307/3391949. JSTOR  3391949.
  2. ^ О'Кейн, Стив Л.; Аль-Шехбаз, Ихсан А. (2003). «Филогенетическое положение и родовые границы Arabidopsis (Brassicaceae) на основе последовательностей ядерной рибосомальной ДНК». Annals of the Missouri Botanical Garden . 90 (4): 603. doi :10.2307/3298545. JSTOR  3298545. S2CID  85316468.
  3. ^ "The Arabidopsis Book". Американское общество биологов растений . 2019-04-13 . Получено 2021-08-14 .
  4. ^ "Первый вид растения, зацветший в космосе". Книга рекордов Гиннесса . Получено 10.03.2017 .
  5. ^ Китер, Билл (2022-05-12). «Ученые выращивают растения в лунной почве». NASA . Получено 2022-05-13 .
  6. ^ Аль-Шехбаз, Ихсан А.; О'Кейн-младший, Стив Л. (2002). «Таксономия и филогения Arabidopsis (Brassicaceae)». Книга Arabidopsis. Том 1. Том 1. Американское общество биологов растений. стр. e0001. doi :10.1199/tab.0001. PMC 3243115. PMID  22303187 .  {{cite book}}: |journal=проигнорировано ( помощь )
  7. ^ Лысак, М. А.; Берр, А.; Печинка, А.; Шмидт, Р.; МакБрин, К.; Шуберт, И. (2006). «Механизмы сокращения числа хромосом у Arabidopsis thaliana и родственных видов Brassicaceae». Труды Национальной академии наук . 103 (13): 5224–5229. Bibcode : 2006PNAS..103.5224L. doi : 10.1073/pnas.0510791103 . PMC 1458822. PMID  16549785 . 
  8. ^ Дарт, Сара; Крон, Пол; Мейбл, Барбара К (2004). «Характеристика полиплоидии у Arabidopsis lyrata с использованием подсчета хромосом и проточной цитометрии». Канадский журнал ботаники . 82 (2): 185. doi :10.1139/b03-134.
  9. ^ ab Joly, Simon; Schmickl, Roswitha; Paule, Juraj; Klein, Johannes; Marhold, Karol; Koch, Marcus A. (2012). "Эволюционная история комплекса Arabidopsis arenosa: разнообразные тетраплоиды скрывают западнокарпатский центр видов и генетического разнообразия". PLOS ONE . ​​7 (8): e42691. Bibcode :2012PLoSO...742691S. doi : 10.1371/journal.pone.0042691 . ISSN  1932-6203. PMC 3411824 . PMID  22880083. 
  10. ^ Якобссон, Маттиас; Хагенблад, Дженни; Таваре, Симон; Салл, Торбьёрн; Халлден, Кристер; Линд-Халден, Кристина; Нордборг, Магнус (2006). «Уникальное недавнее происхождение аллотетраплоидного вида Arabidopsis suecica: данные по маркерам ядерной ДНК». Молекулярная биология и эволюция . 23 (6): 1217–31. дои : 10.1093/molbev/msk006 . ПМИД  16549398.

Дальнейшее чтение