Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Центросомальный белок массой 290 кДа — это белок , который у человека кодируется геном CEP290 . [ 5] [6] [7] [8] CEP290 расположен на плече Q хромосомы 12.
Функция
Ген CEP290 — это центросомный белок, который играет важную роль в развитии центросомы и ресничек . Этот ген жизненно важен для формирования первичной реснички , небольшого антенноподобного выступа клеточной мембраны, который играет важную роль в фоторецепторах на задней стороне сетчатки (которые обнаруживают свет и цвет), а также в почках, мозге и многих других органах тела. Снижение уровня транскрипта гена CEP290 привело к резкому подавлению цилиогенеза в ретинальных пигментных эпителиальных клетках в культуре, доказав, насколько важен CEP290 для формирования ресничек.
На молекулярном уровне было показано, что CEP290 играет важную регуляторную и структурную роль в формировании первичной реснички. Недавние исследования показали, что CEP290 является микротрубочковым и мембраносвязывающим белком, который может служить структурной связью между микротрубочковым ядром реснички и лежащей выше цилиарной мембраной. [9] Было показано, что нарушение домена связывания микротрубочек CEP290 в мышиной модели rd16 заболевания CEP290 [7] приводит к быстрой и резкой дегенерации сетчатки, что демонстрирует важность связывания микротрубочек CEP290 при заболевании. Роль CEP290 в содействии цилиогенезу ингибируется как ауторегуляторными доменами, обнаруженными на обоих концах белка CEP290 [9] , так и посредством взаимодействия CEP290 с ингибирующим белком CP110. [10]
Открытие гена CEP290 привело исследователей к обнаружению другого гена, играющего решающую роль в функции сетчатки, LCA5. Клинические испытания, включающие замену этих двух генов, начались в Филадельфии, где исследователи надеются, что врожденный амавроз Лебера когда-нибудь будет вылечен. [11] [12] [13]
Структура
Этот ген кодирует белок с 13 предполагаемыми доменами спиральной спирали , областью с гомологией сегрегации АТФаз SMC- хромосомы , шестью мотивами KID, тремя доменами гомологичными тропомиозину и мотивом сайта связывания АТФ/ГТФ A. Белок локализован в центросоме и ресничках и имеет сайты для N -гликозилирования , сульфатирования тирозина , фосфорилирования , N- миристоилирования и амидирования . [8]
Клиническое значение
Мутации в этом гене были связаны с синдромом Жубера и нефронофтизом , а в последнее время и с частой формой врожденного амавроза Лебера , называемой LCA10. Наличие антител против этого белка связано с несколькими формами рака. [8]
Мутация в этом гене приводит к слепоте младенцев и детей, заболеванию, известному как врожденный амавроз Лебера. На сегодняшний день 35 различных мутаций в CEP290 ответственны за возникновение LCA. Другие мутации в CEP290 также были идентифицированы как вызывающие синдром Меккеля и синдром Жубера, несколько из многих синдромов. Дефектный ген CEP290 обычно является причиной этих расстройств из-за аномальных ресничек. Неизвестно, как одна мутация в гене может вызывать так много различных типов синдромов, особенно многие из которых поражают центральную нервную систему.
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000198707 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000019971 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Го Дж, Цзинь Г, Мэн Л, Ма Х, Не Д, Ву Дж, Юань Л, Шоу С (октябрь 2004 г.). «Субклеточная локализация опухолеассоциированного антигена 3H11Ag». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 324 (2): 922–30. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.09.133. ПМИД 15474516.
- ^ Сэйер Дж.А., Отто Э.А., О'Тул Дж.Ф., Нюрнберг Г., Кеннеди М.А., Беккер С., Хеннис ХК, Хелу Дж., Аттанасио М., Фаусетт Б.В., Утч Б., Ханна Х., Лю Ю., Драммонд И., Каваками И., Кусакабе Т. , Цуда М, Ма Л, Ли Х, Ларсон Р.Г., Аллен С.Дж., Уилкинсон С.Дж., Нигг Э.А., Шу С., Лилло С., Уильямс Д.С., Хоппе Б., Кемпер М.Дж., Нойхаус Т., Паризи М.А., Гласс И.А., Петри М., Кисперт А, Глой Дж., Ганнер А., Вальц Г., Чжу Х, Гольдман Д., Нюрнберг П., Сваруп А., Леру М.Р., Хильдебрандт Ф (май 2006 г.). «Центросомальный белок нефроцистин-6 мутирует при синдроме Жубера и активирует фактор транскрипции ATF4». Nat Genet . 38 (6): 674–81. doi :10.1038/ng1786. PMID 16682973. S2CID 16941062.
- ^ ab Chang B, Khanna H, Hawes N, Jimeno D, He S, Lillo C, Parapuram SK, Cheng H, Scott A, Hurd RE, Sayer JA, Otto EA, Attanasio M, O'Toole JF, Jin G, Shou C, Hildebrandt F, Williams DS, Heckenlively JR, Swaroop A (май 2006 г.). «Внутрирамочная делеция в новом центросомальном/цилиарном белке CEP290/NPHP6 нарушает его взаимодействие с RPGR и приводит к ранней дегенерации сетчатки у мышей rd16». Hum Mol Genet . 15 (11): 1847–57. doi :10.1093/hmg/ddl107. PMC 1592550. PMID 16632484 .
- ^ abc "Ген Entrez: центросомальный белок CEP290 290 кДа".
- ^ ab Drivas TG, Holzbaur EL, Bennett J (октябрь 2013 г.). «Нарушение доменов связывания микротрубочек/мембран CEP290 вызывает дегенерацию сетчатки». J Clin Invest . 123 (10): 4525–39. doi :10.1172/JCI69448. PMC 3784542 . PMID 24051377.
- ^ Tsang WY, Bossard C, Khanna H, Peränen J, Swaroop A, Malhotra V, Dynlacht BD (август 2008 г.). «CP110 подавляет первичное формирование ресничек посредством взаимодействия с CEP290, белком, дефицитным при цилиарном заболевании человека». Dev Cell . 15 (2): 187–97. doi :10.1016/j.devcel.2008.07.004. PMC 3987787 . PMID 18694559.
- ^ Книффин, Кассандра Л. «OMIM Entry Centrosomal Protein 290-KD». [1] Архивировано 26 октября 2011 г. в Wayback Machine Np, 24 мая 2006 г. Веб. 30 марта 2013 г.
- ^ "Genetics Home Reference Gene CEP290." [2]. Национальная медицинская библиотека США, 25 марта 2013 г. Интернет. 30 марта 2013 г.
- ^ Медицинский центр Университета Макгилла. «Идентифицирован ген, ответственный за слепоту у младенцев и детей». ScienceDaily, 4 июня 2007 г. Веб-сайт. 30 марта 2013 г.
Внешние ссылки
- Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW о синдроме Барде-Бидля
- Расположение генома человека CEP290 и страница с подробностями гена CEP290 в браузере геномов UCSC .
- Расположение генома человека LCA10 и страница с подробностями гена LCA10 в браузере геномов UCSC .
Дальнейшее чтение
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
- Нагасе Т., Ишикава К., Накадзима Д. и др. (1997). «Предсказание кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». DNA Res . 4 (2): 141–50. doi : 10.1093/dnares/4.2.141 . PMID 9205841.
- Eichmuller S, Usener D, Dummer R и др. (2001). «Серологическое обнаружение антигенов, ассоциированных с кожной Т-клеточной лимфомой». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (2): 629–34. doi : 10.1073 /pnas.021386498 . PMC 14639. PMID 11149944.
- Chen D, Shou C (2001). «Молекулярное клонирование опухолеассоциированного антигена, распознаваемого моноклональным антителом 3H11». Biochem. Biophys. Res. Commun . 280 (1): 99–103. doi :10.1006/bbrc.2000.4087. PMID 11162484.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Shin BK, Wang H, Yim AM и др. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток раскрывает обилие белков с функцией шаперона». J. Biol. Chem . 278 (9): 7607–16. doi : 10.1074/jbc.M210455200 . PMID 12493773.
- Millar JK, Christie S, Porteous DJ (2004). «Двухгибридные скрининги дрожжей вовлекают DISC1 в развитие и функционирование мозга». Biochem. Biophys. Res. Commun . 311 (4): 1019–25. doi :10.1016/j.bbrc.2003.10.101. PMID 14623284.
- Andersen JS, Wilkinson CJ, Mayor T и др. (2003). «Протеомная характеристика человеческой центросомы с помощью профилирования корреляции белков». Nature . 426 (6966): 570–4. Bibcode :2003Natur.426..570A. doi :10.1038/nature02166. PMID 14654843. S2CID 4427303.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
- Scherer SE, Muzny DM, Buhay CJ и др. (2006). «Завершенная последовательность ДНК человеческой хромосомы 12». Nature . 440 (7082): 346–51. Bibcode :2006Natur.440..346S. doi : 10.1038/nature04569 . PMID 16541075.
- Valente EM, Silhavy JL, Brancati F и др. (2006). «Мутации в CEP290, который кодирует центросомный белок, вызывают плейотропные формы синдрома Жубера». Nat. Genet . 38 (6): 623–5. doi :10.1038/ng1805. PMID 16682970. S2CID 32532810.
- den Hollander AI, Koenekoop RK, Yzer S, et al. (2006). «Мутации в гене CEP290 (NPHP6) являются частой причиной врожденного амавроза Лебера». Am. J. Hum. Genet . 79 (3): 556–61. doi :10.1086/507318. PMC 1559533 . PMID 16909394.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Perrault I, Delphin N, Hanein S и др. (2007). "Спектр мутаций NPHP6/CEP290 при врожденном амаврозе Лебера и описание ассоциированного фенотипа". Hum. Mutat . 28 (4): 416. doi : 10.1002/humu.9485 . PMID 17345604. S2CID 24057475.
- Tory K, Lacoste T, Burglen L и др. (2007). «Высокая частота мутаций NPHP1 и NPHP6 у пациентов с синдромом Жубера и нефронофтисом: потенциальный эпистатический эффект мутаций NPHP6 и AHI1 у пациентов с мутациями NPHP1». J. Am. Soc. Nephrol . 18 (5): 1566–75. doi :10.1681/ASN.2006101164. PMID 17409309.
- Cideciyan AV, Aleman TS, Jacobson SG и др. (2007). «Мутации центросомально-цилиарного гена CEP290/NPHP6 приводят к слепоте с неожиданным щажением фоторецепторов и зрительного мозга: последствия для терапии врожденного амавроза Лебера». Hum. Mutat . 28 (11): 1074–83. doi :10.1002/humu.20565. hdl : 2027.42/57387 . PMID 17554762. S2CID 5130364.
- Brancati F, Barrano G, Silhavy JL и др. (2007). «Мутации CEP290 часто выявляются при окуло-ренальной форме расстройств, связанных с синдромом Жубера». Am. J. Hum. Genet . 81 (1): 104–13. doi :10.1086/519026. PMC 1950920 . PMID 17564967.